MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-2 DNA

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020821	GCAA	2	8	1027	1034	50 %	0 %	25 %	25 %	472279620
2	NC_020821	TGCT	2	8	1494	1501	0 %	50 %	25 %	25 %	472279621
3	NC_020821	ATTA	2	8	2320	2327	50 %	50 %	0 %	0 %	472279622
4	NC_020821	ATGG	2	8	2445	2452	25 %	25 %	50 %	0 %	472279622
5	NC_020821	AGCC	2	8	2840	2847	25 %	0 %	25 %	50 %	472279622
6	NC_020821	GTCA	2	8	3085	3092	25 %	25 %	25 %	25 %	472279622
7	NC_020821	ATTA	2	8	3254	3261	50 %	50 %	0 %	0 %	472279623
8	NC_020821	AGCC	2	8	3334	3341	25 %	0 %	25 %	50 %	472279623
9	NC_020821	AATC	2	8	3882	3889	50 %	25 %	0 %	25 %	472279624
10	NC_020821	ATCG	2	8	4011	4018	25 %	25 %	25 %	25 %	472279624
11	NC_020821	ACTA	2	8	4082	4089	50 %	25 %	0 %	25 %	472279624
12	NC_020821	ATTG	2	8	4746	4753	25 %	50 %	25 %	0 %	472279625
13	NC_020821	GACA	2	8	6172	6179	50 %	0 %	25 %	25 %	472279625
14	NC_020821	GATT	2	8	6500	6507	25 %	50 %	25 %	0 %	472279625
15	NC_020821	TTAT	2	8	6598	6605	25 %	75 %	0 %	0 %	472279625
16	NC_020821	ACGC	2	8	7578	7585	25 %	0 %	25 %	50 %	472279626
17	NC_020821	CGAA	2	8	7959	7966	50 %	0 %	25 %	25 %	472279627
18	NC_020821	ACAT	2	8	8645	8652	50 %	25 %	0 %	25 %	472279628
19	NC_020821	GCCG	2	8	8695	8702	0 %	0 %	50 %	50 %	472279628
20	NC_020821	ACCG	2	8	8875	8882	25 %	0 %	25 %	50 %	472279628
21	NC_020821	CAAC	2	8	8883	8890	50 %	0 %	0 %	50 %	472279628
22	NC_020821	GCAA	2	8	9417	9424	50 %	0 %	25 %	25 %	472279629
23	NC_020821	AACT	2	8	9473	9480	50 %	25 %	0 %	25 %	472279629
24	NC_020821	TTGC	2	8	9562	9569	0 %	50 %	25 %	25 %	472279629
25	NC_020821	GCAA	2	8	10900	10907	50 %	0 %	25 %	25 %	472279630
26	NC_020821	CGGT	2	8	11514	11521	0 %	25 %	50 %	25 %	472279631
27	NC_020821	TGCC	2	8	11694	11701	0 %	25 %	25 %	50 %	472279631
28	NC_020821	GCTG	2	8	11919	11926	0 %	25 %	50 %	25 %	472279631
29	NC_020821	CAAA	2	8	11938	11945	75 %	0 %	0 %	25 %	472279631
30	NC_020821	GGTT	2	8	12181	12188	0 %	50 %	50 %	0 %	472279631
31	NC_020821	CGAA	2	8	13030	13037	50 %	0 %	25 %	25 %	472279632
32	NC_020821	AATC	2	8	13409	13416	50 %	25 %	0 %	25 %	472279632
33	NC_020821	ATCG	2	8	13538	13545	25 %	25 %	25 %	25 %	472279632
34	NC_020821	ACTA	2	8	13609	13616	50 %	25 %	0 %	25 %	472279632
35	NC_020821	AATT	2	8	14686	14693	50 %	50 %	0 %	0 %	472279633
36	NC_020821	TCGA	2	8	15086	15093	25 %	25 %	25 %	25 %	472279633
37	NC_020821	AATC	2	8	15699	15706	50 %	25 %	0 %	25 %	472279633
38	NC_020821	ATTG	2	8	16116	16123	25 %	50 %	25 %	0 %	472279633
39	NC_020821	TTAG	2	8	16701	16708	25 %	50 %	25 %	0 %	472279634
40	NC_020821	CGAT	2	8	16773	16780	25 %	25 %	25 %	25 %	472279634
41	NC_020821	GATT	2	8	16902	16909	25 %	50 %	25 %	0 %	472279634
42	NC_020821	TTCG	2	8	17281	17288	0 %	50 %	25 %	25 %	472279634
43	NC_020821	TGAA	2	8	17652	17659	50 %	25 %	25 %	0 %	472279635
44	NC_020821	TTTG	2	8	18226	18233	0 %	75 %	25 %	0 %	472279637
45	NC_020821	ATTT	2	8	18810	18817	25 %	75 %	0 %	0 %	472279637
46	NC_020821	GTTT	2	8	19675	19682	0 %	75 %	25 %	0 %	472279638
47	NC_020821	GTTA	2	8	20263	20270	25 %	50 %	25 %	0 %	472279638
48	NC_020821	TTTG	2	8	20422	20429	0 %	75 %	25 %	0 %	472279638
49	NC_020821	TTCT	2	8	20514	20521	0 %	75 %	0 %	25 %	472279638
50	NC_020821	CCAT	2	8	22606	22613	25 %	25 %	0 %	50 %	472279639
51	NC_020821	TAAT	2	8	22731	22738	50 %	50 %	0 %	0 %	472279639
52	NC_020821	TTTA	2	8	23096	23103	25 %	75 %	0 %	0 %	472279640
53	NC_020821	GAAC	2	8	23629	23636	50 %	0 %	25 %	25 %	472279640
54	NC_020821	TTTC	2	8	23650	23657	0 %	75 %	0 %	25 %	472279640
55	NC_020821	TGGC	2	8	24099	24106	0 %	25 %	50 %	25 %	472279640
56	NC_020821	ATAA	2	8	25528	25535	75 %	25 %	0 %	0 %	472279641
57	NC_020821	CGTT	2	8	26004	26011	0 %	50 %	25 %	25 %	472279641
58	NC_020821	TTAA	2	8	26055	26062	50 %	50 %	0 %	0 %	472279641
59	NC_020821	TTTA	2	8	26138	26145	25 %	75 %	0 %	0 %	472279641
60	NC_020821	TTAA	2	8	26229	26236	50 %	50 %	0 %	0 %	472279641
61	NC_020821	ATTG	2	8	26384	26391	25 %	50 %	25 %	0 %	472279641
62	NC_020821	GTTA	2	8	26765	26772	25 %	50 %	25 %	0 %	472279641
63	NC_020821	CCTT	2	8	27072	27079	0 %	50 %	0 %	50 %	472279641
64	NC_020821	ATTT	2	8	28163	28170	25 %	75 %	0 %	0 %	472279644
65	NC_020821	AATT	2	8	29102	29109	50 %	50 %	0 %	0 %	472279645
66	NC_020821	ATAA	2	8	30864	30871	75 %	25 %	0 %	0 %	472279647
67	NC_020821	ATTG	2	8	31022	31029	25 %	50 %	25 %	0 %	472279647
68	NC_020821	ATTA	2	8	31241	31248	50 %	50 %	0 %	0 %	472279648
69	NC_020821	ATGG	2	8	31366	31373	25 %	25 %	50 %	0 %	472279648
70	NC_020821	AGCC	2	8	31761	31768	25 %	0 %	25 %	50 %	472279648
71	NC_020821	ATCT	2	8	32668	32675	25 %	50 %	0 %	25 %	472279649
72	NC_020821	ATTT	2	8	33177	33184	25 %	75 %	0 %	0 %	472279650
73	NC_020821	CTTT	2	8	34477	34484	0 %	75 %	0 %	25 %	472279651

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.