MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus brevis KB290 DNA

Total Repeats: 1154

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020819	AATTG	2	10	2301	2310	40 %	40 %	20 %	0 %	472405737
2	NC_020819	TTGAT	2	10	4425	4434	20 %	60 %	20 %	0 %	472405740
3	NC_020819	GTATT	2	10	20339	20348	20 %	60 %	20 %	0 %	472405758
4	NC_020819	GGTAA	2	10	28304	28313	40 %	20 %	40 %	0 %	472405766
5	NC_020819	ATAGT	2	10	30146	30155	40 %	40 %	20 %	0 %	472405767
6	NC_020819	GATCT	2	10	33937	33946	20 %	40 %	20 %	20 %	472405773
7	NC_020819	CAAGT	2	10	35385	35394	40 %	20 %	20 %	20 %	472405774
8	NC_020819	ACGGT	2	10	36560	36569	20 %	20 %	40 %	20 %	472405775
9	NC_020819	ATTAA	2	10	39339	39348	60 %	40 %	0 %	0 %	472405777
10	NC_020819	TGCTA	2	10	40685	40694	20 %	40 %	20 %	20 %	472405779
11	NC_020819	AAAAC	2	10	46164	46173	80 %	0 %	0 %	20 %	472405787
12	NC_020819	CCAGT	2	10	48063	48072	20 %	20 %	20 %	40 %	472405789
13	NC_020819	GCCAA	2	10	49376	49385	40 %	0 %	20 %	40 %	472405790
14	NC_020819	AAAAG	2	10	49406	49415	80 %	0 %	20 %	0 %	472405790
15	NC_020819	TGCGT	2	10	49583	49592	0 %	40 %	40 %	20 %	472405790
16	NC_020819	ATTGA	2	10	51280	51289	40 %	40 %	20 %	0 %	472405791
17	NC_020819	TTTAG	2	10	51421	51430	20 %	60 %	20 %	0 %	472405791
18	NC_020819	CTTTG	2	10	53436	53445	0 %	60 %	20 %	20 %	472405794
19	NC_020819	GGGGC	2	10	56592	56601	0 %	0 %	80 %	20 %	472405799
20	NC_020819	CGCCC	2	10	56761	56770	0 %	0 %	20 %	80 %	472405799
21	NC_020819	GAACA	2	10	58129	58138	60 %	0 %	20 %	20 %	472405800
22	NC_020819	CCTTG	2	10	61730	61739	0 %	40 %	20 %	40 %	472405803
23	NC_020819	TTTGG	2	10	65069	65078	0 %	60 %	40 %	0 %	472405805
24	NC_020819	TTTAT	2	10	68531	68540	20 %	80 %	0 %	0 %	472405808
25	NC_020819	AACGT	2	10	70480	70489	40 %	20 %	20 %	20 %	472405810
26	NC_020819	TTACA	2	10	70619	70628	40 %	40 %	0 %	20 %	472405810
27	NC_020819	TGGAT	2	10	71305	71314	20 %	40 %	40 %	0 %	472405810
28	NC_020819	GAAGA	2	10	79811	79820	60 %	0 %	40 %	0 %	472405813
29	NC_020819	TAAAA	2	10	79857	79866	80 %	20 %	0 %	0 %	472405813
30	NC_020819	CTTTT	2	10	81077	81086	0 %	80 %	0 %	20 %	472405814
31	NC_020819	AGGTA	2	10	87729	87738	40 %	20 %	40 %	0 %	472405825
32	NC_020819	ACGCA	2	10	90158	90167	40 %	0 %	20 %	40 %	472405827
33	NC_020819	ACCAG	2	10	100627	100636	40 %	0 %	20 %	40 %	472405836
34	NC_020819	CAGCG	2	10	103716	103725	20 %	0 %	40 %	40 %	472405840
35	NC_020819	GATTA	2	10	104892	104901	40 %	40 %	20 %	0 %	472405842
36	NC_020819	TCAAA	2	10	104994	105003	60 %	20 %	0 %	20 %	472405842
37	NC_020819	GCTTT	2	10	107978	107987	0 %	60 %	20 %	20 %	472405846
38	NC_020819	GTTTG	2	10	109161	109170	0 %	60 %	40 %	0 %	472405846
39	NC_020819	TTGGC	2	10	109232	109241	0 %	40 %	40 %	20 %	472405847
40	NC_020819	CTAAA	2	10	109492	109501	60 %	20 %	0 %	20 %	472405848
41	NC_020819	AAATA	2	10	110440	110449	80 %	20 %	0 %	0 %	472405849
42	NC_020819	ATTTA	2	10	110853	110862	40 %	60 %	0 %	0 %	472405850
43	NC_020819	GGGCG	2	10	111094	111103	0 %	0 %	80 %	20 %	472405850
44	NC_020819	GGAGC	2	10	111821	111830	20 %	0 %	60 %	20 %	472405850
45	NC_020819	CAGCA	2	10	119273	119282	40 %	0 %	20 %	40 %	472405854
46	NC_020819	ACTGG	2	10	120797	120806	20 %	20 %	40 %	20 %	472405855
47	NC_020819	GCAAC	2	10	122587	122596	40 %	0 %	20 %	40 %	472405855
48	NC_020819	ACCCA	2	10	122642	122651	40 %	0 %	0 %	60 %	472405855
49	NC_020819	TTAAT	2	10	123375	123384	40 %	60 %	0 %	0 %	472405856
50	NC_020819	TGCCA	2	10	127744	127753	20 %	20 %	20 %	40 %	472405862
51	NC_020819	AAGAT	2	10	127854	127863	60 %	20 %	20 %	0 %	472405862
52	NC_020819	TGAAA	2	10	131120	131129	60 %	20 %	20 %	0 %	472405865
53	NC_020819	AGCCA	2	10	132727	132736	40 %	0 %	20 %	40 %	472405867
54	NC_020819	GATCA	2	10	134623	134632	40 %	20 %	20 %	20 %	472405869
55	NC_020819	AGGAA	2	10	134667	134676	60 %	0 %	40 %	0 %	472405869
56	NC_020819	ATAAC	2	10	136407	136416	60 %	20 %	0 %	20 %	472405870
57	NC_020819	CCCAA	2	10	137031	137040	40 %	0 %	0 %	60 %	472405870
58	NC_020819	GTTAC	2	10	138442	138451	20 %	40 %	20 %	20 %	472405871
59	NC_020819	AACCT	2	10	144627	144636	40 %	20 %	0 %	40 %	472405874
60	NC_020819	AGCAT	2	10	144940	144949	40 %	20 %	20 %	20 %	472405874
61	NC_020819	GTGAA	2	10	145951	145960	40 %	20 %	40 %	0 %	472405876
62	NC_020819	GCAAG	2	10	147814	147823	40 %	0 %	40 %	20 %	472405877
63	NC_020819	TGGCG	2	10	152824	152833	0 %	20 %	60 %	20 %	472405881
64	NC_020819	AGACA	2	10	155418	155427	60 %	0 %	20 %	20 %	472405883
65	NC_020819	AGACA	2	10	157739	157748	60 %	0 %	20 %	20 %	472405884
66	NC_020819	CCGCA	2	10	158568	158577	20 %	0 %	20 %	60 %	472405885
67	NC_020819	TTCGG	2	10	158983	158992	0 %	40 %	40 %	20 %	472405885
68	NC_020819	AGTTC	2	10	159247	159256	20 %	40 %	20 %	20 %	472405885
69	NC_020819	CATTA	2	10	162243	162252	40 %	40 %	0 %	20 %	472405890
70	NC_020819	CGATG	2	10	162915	162924	20 %	20 %	40 %	20 %	472405891
71	NC_020819	TTGGG	2	10	164695	164704	0 %	40 %	60 %	0 %	472405894
72	NC_020819	GGATG	2	10	167758	167767	20 %	20 %	60 %	0 %	472405898
73	NC_020819	CATGC	2	10	168180	168189	20 %	20 %	20 %	40 %	472405898
74	NC_020819	TTTGA	2	10	168195	168204	20 %	60 %	20 %	0 %	472405898
75	NC_020819	GTTGC	2	10	173182	173191	0 %	40 %	40 %	20 %	472405902
76	NC_020819	GCCAG	2	10	175846	175855	20 %	0 %	40 %	40 %	472405906
77	NC_020819	TGAGT	2	10	176740	176749	20 %	40 %	40 %	0 %	472405908
78	NC_020819	TTCAT	2	10	177012	177021	20 %	60 %	0 %	20 %	472405909
79	NC_020819	TGAAC	2	10	177208	177217	40 %	20 %	20 %	20 %	472405909
80	NC_020819	TTTGA	2	10	180515	180524	20 %	60 %	20 %	0 %	472405911
81	NC_020819	TGCAT	2	10	184192	184201	20 %	40 %	20 %	20 %	472405916
82	NC_020819	AAGAT	2	10	184371	184380	60 %	20 %	20 %	0 %	472405916
83	NC_020819	GTACT	2	10	191650	191659	20 %	40 %	20 %	20 %	472405921
84	NC_020819	ATGTG	2	10	194393	194402	20 %	40 %	40 %	0 %	472405924
85	NC_020819	GGTTA	2	10	195518	195527	20 %	40 %	40 %	0 %	472405924
86	NC_020819	AACGG	2	10	195529	195538	40 %	0 %	40 %	20 %	472405924
87	NC_020819	TCAAT	2	10	198528	198537	40 %	40 %	0 %	20 %	472405927
88	NC_020819	CACGG	2	10	201158	201167	20 %	0 %	40 %	40 %	472405930
89	NC_020819	CCAGC	2	10	201934	201943	20 %	0 %	20 %	60 %	472405931
90	NC_020819	GTCTT	2	10	205689	205698	0 %	60 %	20 %	20 %	472405935
91	NC_020819	ACACA	2	10	210775	210784	60 %	0 %	0 %	40 %	472405941
92	NC_020819	AATCA	2	10	211081	211090	60 %	20 %	0 %	20 %	472405941
93	NC_020819	GGTGC	2	10	211192	211201	0 %	20 %	60 %	20 %	472405941
94	NC_020819	TCAAT	2	10	211736	211745	40 %	40 %	0 %	20 %	472405942
95	NC_020819	TTTGG	2	10	215724	215733	0 %	60 %	40 %	0 %	472405946
96	NC_020819	AGATG	2	10	219121	219130	40 %	20 %	40 %	0 %	472405951
97	NC_020819	GGCCA	2	10	220663	220672	20 %	0 %	40 %	40 %	472405953
98	NC_020819	GGCGA	2	10	222313	222322	20 %	0 %	60 %	20 %	472405955
99	NC_020819	CGGTT	2	10	226121	226130	0 %	40 %	40 %	20 %	472405959
100	NC_020819	ACTAG	2	10	228215	228224	40 %	20 %	20 %	20 %	472405961
101	NC_020819	GCCCA	2	10	230182	230191	20 %	0 %	20 %	60 %	472405962
102	NC_020819	AAGGT	2	10	233329	233338	40 %	20 %	40 %	0 %	472405965
103	NC_020819	TCAAG	2	10	235509	235518	40 %	20 %	20 %	20 %	472405968
104	NC_020819	CCGAT	2	10	236465	236474	20 %	20 %	20 %	40 %	472405968
105	NC_020819	GCCCA	2	10	236874	236883	20 %	0 %	20 %	60 %	472405969
106	NC_020819	ACGCC	2	10	237106	237115	20 %	0 %	20 %	60 %	472405969
107	NC_020819	CGTGA	2	10	237836	237845	20 %	20 %	40 %	20 %	472405970
108	NC_020819	CGGGG	2	10	238210	238219	0 %	0 %	80 %	20 %	472405970
109	NC_020819	TTGGC	2	10	240552	240561	0 %	40 %	40 %	20 %	472405973
110	NC_020819	TAGTA	2	10	242998	243007	40 %	40 %	20 %	0 %	472405975
111	NC_020819	TAACG	2	10	243865	243874	40 %	20 %	20 %	20 %	472405976
112	NC_020819	ACGGT	2	10	244234	244243	20 %	20 %	40 %	20 %	472405976
113	NC_020819	TGACA	2	10	244872	244881	40 %	20 %	20 %	20 %	472405976
114	NC_020819	TAGCG	2	10	246082	246091	20 %	20 %	40 %	20 %	472405977
115	NC_020819	GAACT	2	10	247581	247590	40 %	20 %	20 %	20 %	472405979
116	NC_020819	TGGGC	2	10	250881	250890	0 %	20 %	60 %	20 %	472405981
117	NC_020819	TTATG	2	10	251153	251162	20 %	60 %	20 %	0 %	472405981
118	NC_020819	TCATG	2	10	255965	255974	20 %	40 %	20 %	20 %	472405987
119	NC_020819	CGTGA	2	10	257387	257396	20 %	20 %	40 %	20 %	472405989
120	NC_020819	GGATT	2	10	258566	258575	20 %	40 %	40 %	0 %	472405990
121	NC_020819	ATTGA	2	10	258843	258852	40 %	40 %	20 %	0 %	472405990
122	NC_020819	GGTGT	2	10	259509	259518	0 %	40 %	60 %	0 %	472405990
123	NC_020819	TGGTG	2	10	262125	262134	0 %	40 %	60 %	0 %	472405993
124	NC_020819	AACGT	2	10	264115	264124	40 %	20 %	20 %	20 %	472405994
125	NC_020819	ATGAA	2	10	265830	265839	60 %	20 %	20 %	0 %	472405995
126	NC_020819	GTCCA	2	10	267607	267616	20 %	20 %	20 %	40 %	472405998
127	NC_020819	GCTGA	2	10	269774	269783	20 %	20 %	40 %	20 %	472405999
128	NC_020819	TAGTC	2	10	270641	270650	20 %	40 %	20 %	20 %	472406000
129	NC_020819	CGATT	2	10	272664	272673	20 %	40 %	20 %	20 %	472406003
130	NC_020819	CCACT	2	10	273122	273131	20 %	20 %	0 %	60 %	472406003
131	NC_020819	GCTGT	2	10	273187	273196	0 %	40 %	40 %	20 %	472406003
132	NC_020819	AAATG	2	10	273432	273441	60 %	20 %	20 %	0 %	472406003
133	NC_020819	CTAGC	2	10	280785	280794	20 %	20 %	20 %	40 %	472406008
134	NC_020819	CATTC	2	10	281026	281035	20 %	40 %	0 %	40 %	472406008
135	NC_020819	GTTTG	2	10	281891	281900	0 %	60 %	40 %	0 %	472406009
136	NC_020819	TAAGT	2	10	282003	282012	40 %	40 %	20 %	0 %	472406009
137	NC_020819	TCAGT	2	10	283542	283551	20 %	40 %	20 %	20 %	472406010
138	NC_020819	TAGCT	2	10	285794	285803	20 %	40 %	20 %	20 %	472406012
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141	NC_020819	GTTTA	2	10	293885	293894	20 %	60 %	20 %	0 %	472406020
142	NC_020819	GGTTG	2	10	295545	295554	0 %	40 %	60 %	0 %	472406021
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155	NC_020819	GGTCT	2	10	320404	320413	0 %	40 %	40 %	20 %	472406043
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197	NC_020819	TTTTA	2	10	419856	419865	20 %	80 %	0 %	0 %	472406145
198	NC_020819	TTAGT	2	10	419897	419906	20 %	60 %	20 %	0 %	472406145
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240	NC_020819	CAGCC	2	10	516338	516347	20 %	0 %	20 %	60 %	472406228
241	NC_020819	ATGAC	2	10	520844	520853	40 %	20 %	20 %	20 %	472406232
242	NC_020819	GCCCA	2	10	522807	522816	20 %	0 %	20 %	60 %	472406233
243	NC_020819	GTCAC	2	10	523063	523072	20 %	20 %	20 %	40 %	472406233
244	NC_020819	AGAAA	2	10	523385	523394	80 %	0 %	20 %	0 %	472406233
245	NC_020819	AGCGG	2	10	525326	525335	20 %	0 %	60 %	20 %	472406233
246	NC_020819	TAGTT	2	10	528337	528346	20 %	60 %	20 %	0 %	472406235
247	NC_020819	AGTAA	2	10	528889	528898	60 %	20 %	20 %	0 %	472406237
248	NC_020819	TAACT	2	10	531535	531544	40 %	40 %	0 %	20 %	472406241
249	NC_020819	ACATT	2	10	533247	533256	40 %	40 %	0 %	20 %	472406243
250	NC_020819	AACCA	2	10	533524	533533	60 %	0 %	0 %	40 %	472406243
251	NC_020819	AAGCA	2	10	535402	535411	60 %	0 %	20 %	20 %	472406244
252	NC_020819	TAACT	2	10	538457	538466	40 %	40 %	0 %	20 %	472406246
253	NC_020819	GATGG	2	10	541031	541040	20 %	20 %	60 %	0 %	472406249
254	NC_020819	AAAAT	2	10	546417	546426	80 %	20 %	0 %	0 %	472406252
255	NC_020819	GATGC	2	10	549672	549681	20 %	20 %	40 %	20 %	472406255
256	NC_020819	ATGCC	2	10	553012	553021	20 %	20 %	20 %	40 %	472406257
257	NC_020819	GGGTA	2	10	555732	555741	20 %	20 %	60 %	0 %	472406262
258	NC_020819	TAAAA	2	10	556373	556382	80 %	20 %	0 %	0 %	472406263
259	NC_020819	CAACG	2	10	558793	558802	40 %	0 %	20 %	40 %	472406266
260	NC_020819	ATTTG	2	10	560617	560626	20 %	60 %	20 %	0 %	472406268
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262	NC_020819	TACTT	2	10	562976	562985	20 %	60 %	0 %	20 %	472406268
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