MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus brevis KB290 DNA

Total Repeats: 28851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020819	GTT	2	6	151	156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472405736
2	NC_020819	AAC	2	6	164	169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472405736
3	NC_020819	CAA	2	6	226	231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472405736
4	NC_020819	TGC	2	6	517	522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472405736
5	NC_020819	TGG	2	6	528	533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472405736
6	NC_020819	GAA	2	6	539	544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472405736
7	NC_020819	CTT	2	6	568	573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472405736
8	NC_020819	TGG	2	6	577	582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472405736
9	NC_020819	CAA	2	6	622	627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472405736
10	NC_020819	AGA	2	6	634	639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472405736
11	NC_020819	TTA	2	6	693	698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472405736
12	NC_020819	CTG	3	9	755	763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472405736
13	NC_020819	GAT	2	6	767	772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405736
14	NC_020819	TTC	2	6	779	784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472405736
15	NC_020819	TAA	2	6	787	792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472405736
16	NC_020819	TTC	2	6	812	817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472405736
17	NC_020819	ATG	3	9	837	845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405736
18	NC_020819	GAT	2	6	1019	1024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405736
19	NC_020819	GCT	2	6	1139	1144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472405736
20	NC_020819	TGG	2	6	1354	1359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472405736
21	NC_020819	CAA	2	6	1782	1787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472405737
22	NC_020819	ACT	2	6	1813	1818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472405737
23	NC_020819	TTA	2	6	1867	1872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472405737
24	NC_020819	TGA	2	6	1944	1949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405737
25	NC_020819	GCT	2	6	2065	2070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472405737
26	NC_020819	AAT	2	6	2098	2103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472405737
27	NC_020819	GTT	2	6	2140	2145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472405737
28	NC_020819	GAT	2	6	2376	2381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405737
29	NC_020819	CTT	2	6	2433	2438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472405737
30	NC_020819	ACG	2	6	2521	2526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472405737
31	NC_020819	TTA	2	6	2548	2553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472405737
32	NC_020819	GCA	2	6	2554	2559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472405737
33	NC_020819	AAC	2	6	2596	2601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472405737
34	NC_020819	GAA	2	6	2677	2682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472405737
35	NC_020819	TGC	2	6	2969	2974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472405738
36	NC_020819	GTG	2	6	2985	2990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472405738
37	NC_020819	GAA	2	6	3357	3362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472405739
38	NC_020819	CGG	2	6	3441	3446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472405739
39	NC_020819	ATT	2	6	3494	3499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472405739
40	NC_020819	AAT	2	6	3523	3528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472405739
41	NC_020819	GTT	2	6	3746	3751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472405740
42	NC_020819	CGG	2	6	3917	3922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472405740
43	NC_020819	AGC	2	6	4081	4086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472405740
44	NC_020819	ATT	2	6	4100	4105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472405740
45	NC_020819	GCA	2	6	4171	4176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472405740
46	NC_020819	GAA	2	6	4181	4186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472405740
47	NC_020819	GAT	2	6	4217	4222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405740
48	NC_020819	CCA	2	6	4239	4244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472405740
49	NC_020819	CGG	2	6	4248	4253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472405740
50	NC_020819	AGC	2	6	4275	4280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472405740
51	NC_020819	TGG	2	6	4311	4316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472405740
52	NC_020819	CAA	2	6	4385	4390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472405740
53	NC_020819	AGA	2	6	4438	4443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472405740
54	NC_020819	TTA	2	6	4463	4468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472405740
55	NC_020819	TGA	2	6	4471	4476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405740
56	NC_020819	GAT	2	6	4493	4498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405740
57	NC_020819	ACC	3	9	4553	4561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472405740
58	NC_020819	TGG	2	6	4629	4634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472405740
59	NC_020819	GCA	2	6	4661	4666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472405740
60	NC_020819	AGG	2	6	4671	4676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472405740
61	NC_020819	CAA	2	6	4712	4717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472405741
62	NC_020819	CGA	2	6	4800	4805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472405741
63	NC_020819	TGA	2	6	4855	4860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405741
64	NC_020819	AGA	2	6	4962	4967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472405741
65	NC_020819	GGT	2	6	5012	5017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472405741
66	NC_020819	CGG	2	6	5023	5028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472405741
67	NC_020819	GGT	2	6	5048	5053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472405741
68	NC_020819	CTT	2	6	5224	5229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472405741
69	NC_020819	GAC	2	6	5281	5286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472405741
70	NC_020819	CTT	2	6	5305	5310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472405741
71	NC_020819	TGA	2	6	5338	5343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405741
72	NC_020819	GAA	2	6	5363	5368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472405741
73	NC_020819	GAC	2	6	5504	5509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472405741
74	NC_020819	CAA	2	6	5536	5541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472405741
75	NC_020819	GAA	2	6	5570	5575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472405741
76	NC_020819	TGA	2	6	5631	5636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405741
77	NC_020819	GAT	2	6	5663	5668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405741
78	NC_020819	ATG	2	6	5807	5812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405741
79	NC_020819	TGC	2	6	5875	5880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472405741
80	NC_020819	GAA	2	6	5905	5910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472405741
81	NC_020819	TCG	2	6	5991	5996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472405741
82	NC_020819	CTG	2	6	6006	6011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472405741
83	NC_020819	GAA	2	6	6119	6124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472405741
84	NC_020819	TGA	2	6	6207	6212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405741
85	NC_020819	TGT	2	6	6249	6254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472405741
86	NC_020819	ATT	2	6	6283	6288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472405741
87	NC_020819	TGA	2	6	6367	6372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405741
88	NC_020819	CCA	2	6	6401	6406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472405741
89	NC_020819	CGG	2	6	6494	6499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472405741
90	NC_020819	ATT	2	6	6663	6668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472405742
91	NC_020819	CCG	2	6	6790	6795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472405742
92	NC_020819	GCC	2	6	7004	7009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472405742
93	NC_020819	CAA	2	6	7069	7074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472405742
94	NC_020819	ATG	2	6	7101	7106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405742
95	NC_020819	CCG	2	6	7202	7207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472405742
96	NC_020819	TCA	2	6	7224	7229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472405742
97	NC_020819	TGA	2	6	7245	7250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405742
98	NC_020819	TGG	2	6	7312	7317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472405742
99	NC_020819	CGG	2	6	7343	7348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472405742
100	NC_020819	GAA	3	9	7400	7408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472405742
101	NC_020819	AAC	2	6	7419	7424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472405742
102	NC_020819	CAA	2	6	7456	7461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472405742
103	NC_020819	CGG	2	6	7574	7579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472405742
104	NC_020819	CCT	2	6	7635	7640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472405742
105	NC_020819	TAC	2	6	7709	7714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472405742
106	NC_020819	CCG	2	6	7738	7743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472405742
107	NC_020819	ATT	2	6	7838	7843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472405742
108	NC_020819	CAA	2	6	8042	8047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472405742
109	NC_020819	CAT	2	6	8050	8055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472405742
110	NC_020819	GAA	2	6	8060	8065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472405742
111	NC_020819	GAA	2	6	8159	8164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472405742
112	NC_020819	GTG	2	6	8238	8243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472405742
113	NC_020819	GAT	3	9	8273	8281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405742
114	NC_020819	TGG	2	6	8295	8300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472405742
115	NC_020819	TTC	2	6	8327	8332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472405742
116	NC_020819	CAA	2	6	8428	8433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472405742
117	NC_020819	ACG	2	6	8504	8509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472405742
118	NC_020819	AGA	2	6	8590	8595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472405742
119	NC_020819	ATT	2	6	8618	8623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472405742
120	NC_020819	GCT	3	9	8828	8836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472405742
121	NC_020819	GAC	2	6	8917	8922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472405742
122	NC_020819	CGA	2	6	8932	8937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472405742
123	NC_020819	TGA	2	6	9043	9048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405742
124	NC_020819	CCA	2	6	9060	9065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472405742
125	NC_020819	AGT	2	6	9109	9114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405742
126	NC_020819	GTC	2	6	9149	9154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472405742
127	NC_020819	GTA	2	6	9322	9327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405743
128	NC_020819	ACT	2	6	9959	9964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472405744
129	NC_020819	CAT	2	6	9982	9987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472405744
130	NC_020819	TGA	2	6	10000	10005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405744
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132	NC_020819	TGG	2	6	10114	10119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472405744
133	NC_020819	TGA	2	6	10162	10167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405744
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240	NC_020819	AGA	2	6	20219	20224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472405758
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252	NC_020819	GTG	2	6	21149	21154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472405758
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