MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 50873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020558	TTTATG	2	12	121400	121411	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470208900
2502	NC_020558	TAAA	2	8	121412	121419	75 %	25 %	0 %	0 %	470208900
2503	NC_020558	AGC	2	6	121502	121507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208900
2504	NC_020558	AAGTG	2	10	121509	121518	40 %	20 %	40 %	0 %	470208900
2505	NC_020558	GCT	2	6	121662	121667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208900
2506	NC_020558	A	7	7	121675	121681	100 %	0 %	0 %	0 %	470208900
2507	NC_020558	T	6	6	121704	121709	0 %	100 %	0 %	0 %	470208900
2508	NC_020558	AT	3	6	121712	121717	50 %	50 %	0 %	0 %	470208900
2509	NC_020558	GAA	2	6	121729	121734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208900
2510	NC_020558	A	6	6	121751	121756	100 %	0 %	0 %	0 %	470208900
2511	NC_020558	AGA	2	6	121882	121887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208901
2512	NC_020558	GTCAG	2	10	121954	121963	20 %	20 %	40 %	20 %	470208901
2513	NC_020558	ACG	2	6	122002	122007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208901
2514	NC_020558	AGA	2	6	122229	122234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208902
2515	NC_020558	AC	3	6	122263	122268	50 %	0 %	0 %	50 %	470208902
2516	NC_020558	ATT	3	9	122304	122312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208902
2517	NC_020558	GGT	2	6	122817	122822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208903
2518	NC_020558	TTG	2	6	122851	122856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208903
2519	NC_020558	A	7	7	122857	122863	100 %	0 %	0 %	0 %	470208903
2520	NC_020558	AAC	2	6	122884	122889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208903
2521	NC_020558	AGTT	2	8	122899	122906	25 %	50 %	25 %	0 %	470208903
2522	NC_020558	GAA	2	6	122972	122977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208903
2523	NC_020558	ATTT	3	12	122998	123009	25 %	75 %	0 %	0 %	470208903
2524	NC_020558	TGG	2	6	123026	123031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208903
2525	NC_020558	TCAT	2	8	123097	123104	25 %	50 %	0 %	25 %	470208903
2526	NC_020558	ATT	2	6	123111	123116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208903
2527	NC_020558	GAAT	2	8	123136	123143	50 %	25 %	25 %	0 %	470208903
2528	NC_020558	GAA	2	6	123247	123252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208904
2529	NC_020558	ATT	2	6	123267	123272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208904
2530	NC_020558	CAG	2	6	123288	123293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208904
2531	NC_020558	GGCA	2	8	123331	123338	25 %	0 %	50 %	25 %	470208904
2532	NC_020558	A	6	6	123429	123434	100 %	0 %	0 %	0 %	470208904
2533	NC_020558	ACT	2	6	123446	123451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208904
2534	NC_020558	A	7	7	123510	123516	100 %	0 %	0 %	0 %	470208904
2535	NC_020558	TTGTT	2	10	125087	125096	0 %	80 %	20 %	0 %	470208905
2536	NC_020558	AAC	2	6	125140	125145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208905
2537	NC_020558	CAG	2	6	125175	125180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208905
2538	NC_020558	TCA	2	6	125204	125209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208905
2539	NC_020558	TGT	2	6	125260	125265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208905
2540	NC_020558	TGTT	2	8	125340	125347	0 %	75 %	25 %	0 %	470208905
2541	NC_020558	TTG	2	6	125351	125356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208905
2542	NC_020558	CGA	2	6	125370	125375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208905
2543	NC_020558	TTTG	2	8	125425	125432	0 %	75 %	25 %	0 %	470208905
2544	NC_020558	TCA	2	6	125474	125479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208905
2545	NC_020558	T	6	6	125517	125522	0 %	100 %	0 %	0 %	470208905
2546	NC_020558	CTG	2	6	125565	125570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208905
2547	NC_020558	GCT	3	9	125783	125791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208905
2548	NC_020558	TTAC	2	8	126124	126131	25 %	50 %	0 %	25 %	470208906
2549	NC_020558	TAT	2	6	126134	126139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208906
2550	NC_020558	ATC	2	6	126170	126175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208906
2551	NC_020558	CGA	2	6	126207	126212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208906
2552	NC_020558	TGA	2	6	126238	126243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208906
2553	NC_020558	TTG	2	6	126282	126287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208906
2554	NC_020558	TCTATT	2	12	126332	126343	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470208906
2555	NC_020558	AGCA	2	8	126364	126371	50 %	0 %	25 %	25 %	470208906
2556	NC_020558	T	6	6	126385	126390	0 %	100 %	0 %	0 %	470208906
2557	NC_020558	ACA	2	6	126632	126637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208907
2558	NC_020558	ATT	3	9	126639	126647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208907
2559	NC_020558	AGT	2	6	126686	126691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208907
2560	NC_020558	AGA	2	6	126704	126709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208907
2561	NC_020558	TAT	2	6	126762	126767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208907
2562	NC_020558	A	6	6	126773	126778	100 %	0 %	0 %	0 %	470208907
2563	NC_020558	TTGG	2	8	126779	126786	0 %	50 %	50 %	0 %	470208907
2564	NC_020558	ATTTT	2	10	126823	126832	20 %	80 %	0 %	0 %	470208908
2565	NC_020558	CAA	2	6	126863	126868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208908
2566	NC_020558	GCC	2	6	126879	126884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470208908
2567	NC_020558	TGT	2	6	126928	126933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208908
2568	NC_020558	GC	3	6	126950	126955	0 %	0 %	50 %	50 %	470208908
2569	NC_020558	CTT	2	6	127046	127051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208908
2570	NC_020558	GC	4	8	127098	127105	0 %	0 %	50 %	50 %	470208908
2571	NC_020558	TAG	2	6	127163	127168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208908
2572	NC_020558	TCA	2	6	127174	127179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208908
2573	NC_020558	ATG	2	6	127204	127209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208908
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2575	NC_020558	AT	3	6	127282	127287	50 %	50 %	0 %	0 %	470208909
2576	NC_020558	TTC	2	6	127296	127301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208909
2577	NC_020558	TTGC	2	8	127330	127337	0 %	50 %	25 %	25 %	470208909
2578	NC_020558	ACC	3	9	127379	127387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470208909
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2582	NC_020558	TGT	2	6	127730	127735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208910
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2586	NC_020558	GCCGT	2	10	127876	127885	0 %	20 %	40 %	40 %	470208910
2587	NC_020558	T	6	6	127916	127921	0 %	100 %	0 %	0 %	470208910
2588	NC_020558	TAA	2	6	127976	127981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208910
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2591	NC_020558	T	6	6	128166	128171	0 %	100 %	0 %	0 %	470208910
2592	NC_020558	TTG	2	6	128204	128209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208910
2593	NC_020558	TTC	2	6	128271	128276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208910
2594	NC_020558	AAAAT	2	10	128277	128286	80 %	20 %	0 %	0 %	470208910
2595	NC_020558	ATT	2	6	128290	128295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208910
2596	NC_020558	ATG	2	6	128705	128710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208911
2597	NC_020558	TAT	2	6	128763	128768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208911
2598	NC_020558	CA	3	6	128773	128778	50 %	0 %	0 %	50 %	470208911
2599	NC_020558	TGA	2	6	128784	128789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208911
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2601	NC_020558	AAG	2	6	128850	128855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208911
2602	NC_020558	AAG	2	6	128866	128871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208911
2603	NC_020558	TCT	2	6	128885	128890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208911
2604	NC_020558	GAA	2	6	129150	129155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208912
2605	NC_020558	TAG	2	6	129164	129169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208912
2606	NC_020558	GGC	2	6	129262	129267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470208912
2607	NC_020558	CAA	2	6	129346	129351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208912
2608	NC_020558	AACTT	2	10	129427	129436	40 %	40 %	0 %	20 %	470208912
2609	NC_020558	GTA	2	6	129499	129504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208912
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2611	NC_020558	GAC	2	6	129598	129603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208912
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2613	NC_020558	TTG	2	6	129758	129763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208912
2614	NC_020558	AGCG	2	8	129945	129952	25 %	0 %	50 %	25 %	470208912
2615	NC_020558	ACCA	2	8	130010	130017	50 %	0 %	0 %	50 %	470208912
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2617	NC_020558	A	6	6	130195	130200	100 %	0 %	0 %	0 %	470208912
2618	NC_020558	AAAG	2	8	130207	130214	75 %	0 %	25 %	0 %	470208912
2619	NC_020558	AACT	2	8	130235	130242	50 %	25 %	0 %	25 %	470208912
2620	NC_020558	ACA	2	6	130256	130261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208912
2621	NC_020558	CAA	3	9	130294	130302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208912
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2623	NC_020558	ACT	2	6	130388	130393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208912
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2992	NC_020558	AT	3	6	150524	150529	50 %	50 %	0 %	0 %	470208936
2993	NC_020558	GAATT	2	10	150594	150603	40 %	40 %	20 %	0 %	470208936
2994	NC_020558	GAA	2	6	150638	150643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208936
2995	NC_020558	CGT	2	6	150646	150651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208936
2996	NC_020558	TGA	2	6	150748	150753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208936
2997	NC_020558	TAA	2	6	150814	150819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208936
2998	NC_020558	T	6	6	150825	150830	0 %	100 %	0 %	0 %	470208936
2999	NC_020558	TGA	2	6	150928	150933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208936
3000	NC_020558	CTG	2	6	150976	150981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208936

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