MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 50873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020558	A	6	6	49459	49464	100 %	0 %	0 %	0 %	470208819
1002	NC_020558	TGT	2	6	49467	49472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208819
1003	NC_020558	ATC	2	6	49513	49518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208819
1004	NC_020558	TGA	2	6	49653	49658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208819
1005	NC_020558	AGA	2	6	49683	49688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208819
1006	NC_020558	ATG	2	6	49751	49756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208820
1007	NC_020558	GTA	2	6	49763	49768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208820
1008	NC_020558	CAA	2	6	49868	49873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208820
1009	NC_020558	TTA	2	6	49893	49898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208820
1010	NC_020558	TGT	2	6	49903	49908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208820
1011	NC_020558	GAA	2	6	49945	49950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208820
1012	NC_020558	GGCG	2	8	49960	49967	0 %	0 %	75 %	25 %	470208820
1013	NC_020558	ACG	2	6	50004	50009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208820
1014	NC_020558	AG	3	6	50041	50046	50 %	0 %	50 %	0 %	470208820
1015	NC_020558	TGGCGG	2	12	50077	50088	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	470208820
1016	NC_020558	AAC	2	6	50111	50116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208820
1017	NC_020558	AAT	2	6	50117	50122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208820
1018	NC_020558	CAA	2	6	50189	50194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208820
1019	NC_020558	TCAAAA	2	12	50197	50208	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470208820
1020	NC_020558	TAA	2	6	50221	50226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208820
1021	NC_020558	TGA	2	6	50266	50271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208820
1022	NC_020558	GGA	2	6	50337	50342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470208821
1023	NC_020558	A	6	6	50364	50369	100 %	0 %	0 %	0 %	470208821
1024	NC_020558	TTACT	2	10	50375	50384	20 %	60 %	0 %	20 %	470208821
1025	NC_020558	CTT	2	6	50424	50429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208821
1026	NC_020558	A	6	6	50430	50435	100 %	0 %	0 %	0 %	470208821
1027	NC_020558	TCG	2	6	50465	50470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208821
1028	NC_020558	TAC	2	6	50542	50547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208821
1029	NC_020558	GAA	2	6	50559	50564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208821
1030	NC_020558	AAAT	2	8	50565	50572	75 %	25 %	0 %	0 %	470208821
1031	NC_020558	A	6	6	50730	50735	100 %	0 %	0 %	0 %	470208822
1032	NC_020558	TAT	2	6	50758	50763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208822
1033	NC_020558	TAG	2	6	50764	50769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208822
1034	NC_020558	ATG	2	6	50794	50799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208822
1035	NC_020558	CAT	2	6	50809	50814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208822
1036	NC_020558	ATA	2	6	50818	50823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208822
1037	NC_020558	CAA	2	6	50825	50830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208822
1038	NC_020558	ACT	2	6	50835	50840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208822
1039	NC_020558	TAA	2	6	50855	50860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208822
1040	NC_020558	TCA	2	6	50868	50873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208822
1041	NC_020558	GAAAT	2	10	51033	51042	60 %	20 %	20 %	0 %	470208822
1042	NC_020558	AAC	2	6	51061	51066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208822
1043	NC_020558	TGA	2	6	51071	51076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208822
1044	NC_020558	CTTAG	2	10	51132	51141	20 %	40 %	20 %	20 %	470208822
1045	NC_020558	AAG	2	6	51160	51165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208822
1046	NC_020558	TTA	2	6	51239	51244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208822
1047	NC_020558	ATA	2	6	51265	51270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208822
1048	NC_020558	TTC	2	6	51310	51315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208822
1049	NC_020558	TAA	2	6	51333	51338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208822
1050	NC_020558	AGAA	2	8	51624	51631	75 %	0 %	25 %	0 %	470208823
1051	NC_020558	GAT	2	6	51667	51672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208823
1052	NC_020558	GAA	2	6	51673	51678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208823
1053	NC_020558	TAAT	2	8	51716	51723	50 %	50 %	0 %	0 %	470208823
1054	NC_020558	ACAGTG	2	12	51781	51792	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470208823
1055	NC_020558	ATG	2	6	51874	51879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208823
1056	NC_020558	TAA	2	6	51918	51923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208823
1057	NC_020558	GAA	2	6	52012	52017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208823
1058	NC_020558	GAT	2	6	52044	52049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208823
1059	NC_020558	ACTT	2	8	52152	52159	25 %	50 %	0 %	25 %	470208823
1060	NC_020558	AGG	2	6	52174	52179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470208823
1061	NC_020558	AGA	2	6	52237	52242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208824
1062	NC_020558	TTC	2	6	52264	52269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208824
1063	NC_020558	GCTT	2	8	52280	52287	0 %	50 %	25 %	25 %	470208824
1064	NC_020558	A	7	7	52332	52338	100 %	0 %	0 %	0 %	470208824
1065	NC_020558	ATAA	2	8	52344	52351	75 %	25 %	0 %	0 %	470208824
1066	NC_020558	ATA	2	6	53242	53247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208825
1067	NC_020558	TAAA	2	8	53257	53264	75 %	25 %	0 %	0 %	470208825
1068	NC_020558	GCTG	2	8	53333	53340	0 %	25 %	50 %	25 %	470208825
1069	NC_020558	AGT	2	6	53387	53392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208825
1070	NC_020558	GCG	2	6	53472	53477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470208825
1071	NC_020558	A	6	6	53517	53522	100 %	0 %	0 %	0 %	470208825
1072	NC_020558	ATT	2	6	53535	53540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208825
1073	NC_020558	GAA	2	6	53592	53597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208825
1074	NC_020558	GAA	2	6	53657	53662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208825
1075	NC_020558	AGA	2	6	53731	53736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208825
1076	NC_020558	AT	3	6	53807	53812	50 %	50 %	0 %	0 %	470208826
1077	NC_020558	TAT	2	6	53822	53827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208826
1078	NC_020558	T	6	6	53921	53926	0 %	100 %	0 %	0 %	470208826
1079	NC_020558	ATT	2	6	54006	54011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208826
1080	NC_020558	ACA	2	6	54018	54023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208826
1081	NC_020558	AGTTA	2	10	54031	54040	40 %	40 %	20 %	0 %	470208826
1082	NC_020558	ATT	2	6	54078	54083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208826
1083	NC_020558	TGC	2	6	54100	54105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208826
1084	NC_020558	AAGC	2	8	54129	54136	50 %	0 %	25 %	25 %	470208826
1085	NC_020558	AGA	2	6	54137	54142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208826
1086	NC_020558	AAG	2	6	54198	54203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208826
1087	NC_020558	ATT	2	6	54204	54209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208826
1088	NC_020558	T	6	6	54234	54239	0 %	100 %	0 %	0 %	470208826
1089	NC_020558	GAA	2	6	54311	54316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208826
1090	NC_020558	GTG	2	6	54411	54416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208826
1091	NC_020558	CAT	2	6	54445	54450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208826
1092	NC_020558	ATTA	2	8	54455	54462	50 %	50 %	0 %	0 %	470208826
1093	NC_020558	ATT	2	6	54709	54714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208827
1094	NC_020558	T	7	7	54733	54739	0 %	100 %	0 %	0 %	470208827
1095	NC_020558	GTG	2	6	54741	54746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208827
1096	NC_020558	GTT	3	9	54760	54768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208827
1097	NC_020558	ATT	2	6	54775	54780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208827
1098	NC_020558	TGAA	2	8	54815	54822	50 %	25 %	25 %	0 %	470208827
1099	NC_020558	GAA	3	9	54871	54879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208827
1100	NC_020558	TTG	2	6	54884	54889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208827
1101	NC_020558	CTG	2	6	54907	54912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208827
1102	NC_020558	ATG	2	6	54914	54919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208827
1103	NC_020558	GAA	2	6	54997	55002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208827
1104	NC_020558	TTA	2	6	55025	55030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208827
1105	NC_020558	ATG	2	6	55037	55042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208827
1106	NC_020558	TTTATA	2	12	55113	55124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208827
1107	NC_020558	ATG	2	6	55205	55210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208827
1108	NC_020558	GAT	2	6	55228	55233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208827
1109	NC_020558	AAT	2	6	55252	55257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208827
1110	NC_020558	TATT	2	8	55299	55306	25 %	75 %	0 %	0 %	470208827
1111	NC_020558	GGA	2	6	55347	55352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470208827
1112	NC_020558	GGA	2	6	55368	55373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470208827
1113	NC_020558	GAT	2	6	55465	55470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208827
1114	NC_020558	GCG	2	6	55523	55528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470208827
1115	NC_020558	CGG	2	6	55575	55580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470208827
1116	NC_020558	AAAC	2	8	55583	55590	75 %	0 %	0 %	25 %	470208827
1117	NC_020558	CG	4	8	55615	55622	0 %	0 %	50 %	50 %	470208827
1118	NC_020558	ATGA	2	8	55744	55751	50 %	25 %	25 %	0 %	470208827
1119	NC_020558	AATG	2	8	55809	55816	50 %	25 %	25 %	0 %	470208827
1120	NC_020558	GAA	2	6	55822	55827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208827
1121	NC_020558	GTT	3	9	55900	55908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208827
1122	NC_020558	AC	3	6	55912	55917	50 %	0 %	0 %	50 %	470208827
1123	NC_020558	TTA	2	6	55931	55936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208827
1124	NC_020558	GTT	2	6	55969	55974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208827
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1126	NC_020558	CGT	2	6	55987	55992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208827
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1132	NC_020558	TAC	2	6	56259	56264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208827
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