MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 50873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020558	AAC	2	6	24853	24858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208797
502	NC_020558	GAA	2	6	24884	24889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208797
503	NC_020558	TTG	2	6	24966	24971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208797
504	NC_020558	AGG	2	6	25086	25091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470208797
505	NC_020558	ATA	2	6	25110	25115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208797
506	NC_020558	TGA	2	6	25156	25161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208797
507	NC_020558	GGA	2	6	25165	25170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470208797
508	NC_020558	CAA	2	6	25241	25246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208798
509	NC_020558	TTG	2	6	25283	25288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208798
510	NC_020558	ATG	2	6	25289	25294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208798
511	NC_020558	A	6	6	25302	25307	100 %	0 %	0 %	0 %	470208798
512	NC_020558	CTG	2	6	25343	25348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208798
513	NC_020558	GCA	2	6	25381	25386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208798
514	NC_020558	AAT	2	6	25387	25392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208798
515	NC_020558	AAT	2	6	25396	25401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208798
516	NC_020558	GCA	2	6	25416	25421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208798
517	NC_020558	A	7	7	25536	25542	100 %	0 %	0 %	0 %	470208798
518	NC_020558	ATT	2	6	25580	25585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208798
519	NC_020558	A	7	7	25659	25665	100 %	0 %	0 %	0 %	470208798
520	NC_020558	GTTA	2	8	25720	25727	25 %	50 %	25 %	0 %	470208799
521	NC_020558	TAA	2	6	25788	25793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208799
522	NC_020558	CGG	2	6	25888	25893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470208799
523	NC_020558	TCG	2	6	25926	25931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208799
524	NC_020558	TCAGG	2	10	25952	25961	20 %	20 %	40 %	20 %	470208799
525	NC_020558	CAG	2	6	26091	26096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208799
526	NC_020558	CG	4	8	26139	26146	0 %	0 %	50 %	50 %	470208799
527	NC_020558	TGG	2	6	26242	26247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208799
528	NC_020558	TTC	2	6	26250	26255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208799
529	NC_020558	AGT	2	6	26257	26262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208799
530	NC_020558	CAA	2	6	26292	26297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208799
531	NC_020558	TCG	2	6	26304	26309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208799
532	NC_020558	AGC	3	9	26332	26340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208799
533	NC_020558	ATC	2	6	26393	26398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208799
534	NC_020558	CAAA	2	8	26404	26411	75 %	0 %	0 %	25 %	470208799
535	NC_020558	GAG	2	6	26462	26467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470208799
536	NC_020558	AGC	2	6	26534	26539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208800
537	NC_020558	GTTG	2	8	26548	26555	0 %	50 %	50 %	0 %	470208800
538	NC_020558	ATG	2	6	26589	26594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208800
539	NC_020558	TGA	3	9	26648	26656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208800
540	NC_020558	ATG	2	6	26667	26672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208800
541	NC_020558	GGT	2	6	26712	26717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208800
542	NC_020558	AAAG	2	8	26756	26763	75 %	0 %	25 %	0 %	470208800
543	NC_020558	AAG	2	6	26770	26775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208800
544	NC_020558	CGA	2	6	26851	26856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208800
545	NC_020558	AT	3	6	26876	26881	50 %	50 %	0 %	0 %	470208800
546	NC_020558	TTTAC	2	10	26952	26961	20 %	60 %	0 %	20 %	470208800
547	NC_020558	GTC	2	6	27057	27062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208800
548	NC_020558	A	7	7	27216	27222	100 %	0 %	0 %	0 %	470208800
549	NC_020558	TTA	2	6	27243	27248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208800
550	NC_020558	ATT	2	6	27264	27269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208800
551	NC_020558	T	6	6	27336	27341	0 %	100 %	0 %	0 %	470208801
552	NC_020558	GGA	2	6	27362	27367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470208801
553	NC_020558	A	6	6	27373	27378	100 %	0 %	0 %	0 %	470208801
554	NC_020558	TCA	2	6	27395	27400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208801
555	NC_020558	AGC	2	6	27401	27406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208801
556	NC_020558	TGG	2	6	27412	27417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208801
557	NC_020558	ACG	2	6	27433	27438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208801
558	NC_020558	ATT	2	6	27441	27446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208801
559	NC_020558	AGG	2	6	27503	27508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470208801
560	NC_020558	TTA	2	6	27526	27531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208801
561	NC_020558	CTG	2	6	27538	27543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208801
562	NC_020558	TTA	2	6	27548	27553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208801
563	NC_020558	AT	3	6	27613	27618	50 %	50 %	0 %	0 %	470208801
564	NC_020558	TTG	2	6	27700	27705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208801
565	NC_020558	CAG	2	6	27730	27735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208801
566	NC_020558	TTG	2	6	27759	27764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208801
567	NC_020558	CAA	2	6	27885	27890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208801
568	NC_020558	ACC	2	6	27935	27940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470208801
569	NC_020558	TGG	2	6	27965	27970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208801
570	NC_020558	TAA	2	6	28026	28031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208801
571	NC_020558	ATG	2	6	28080	28085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208802
572	NC_020558	AAG	2	6	28093	28098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208802
573	NC_020558	TAC	2	6	28112	28117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208802
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575	NC_020558	TGT	2	6	28217	28222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208802
576	NC_020558	GTCC	2	8	28263	28270	0 %	25 %	25 %	50 %	470208802
577	NC_020558	AGA	2	6	28298	28303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208802
578	NC_020558	TGAT	2	8	28315	28322	25 %	50 %	25 %	0 %	470208802
579	NC_020558	ATT	2	6	28415	28420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208802
580	NC_020558	GCA	2	6	28428	28433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208802
581	NC_020558	TGA	2	6	28463	28468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208802
582	NC_020558	TAG	2	6	28471	28476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208802
583	NC_020558	TGG	2	6	28541	28546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208802
584	NC_020558	GAA	2	6	28566	28571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208802
585	NC_020558	AT	3	6	28592	28597	50 %	50 %	0 %	0 %	470208802
586	NC_020558	ATT	2	6	28620	28625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208802
587	NC_020558	GGA	2	6	28635	28640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470208802
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590	NC_020558	GAAA	2	8	29054	29061	75 %	0 %	25 %	0 %	470208803
591	NC_020558	GTG	2	6	29098	29103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208803
592	NC_020558	AGT	2	6	29114	29119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208803
593	NC_020558	GAAG	2	8	29190	29197	50 %	0 %	50 %	0 %	470208803
594	NC_020558	TTGG	2	8	29326	29333	0 %	50 %	50 %	0 %	470208803
595	NC_020558	GTAC	2	8	29350	29357	25 %	25 %	25 %	25 %	470208803
596	NC_020558	CTT	2	6	29393	29398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208803
597	NC_020558	A	6	6	29427	29432	100 %	0 %	0 %	0 %	470208803
598	NC_020558	CGG	2	6	29435	29440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470208803
599	NC_020558	GGT	2	6	29466	29471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208803
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608	NC_020558	A	6	6	30099	30104	100 %	0 %	0 %	0 %	470208803
609	NC_020558	TGG	2	6	30128	30133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208803
610	NC_020558	TGG	2	6	30137	30142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208803
611	NC_020558	AT	3	6	30173	30178	50 %	50 %	0 %	0 %	470208803
612	NC_020558	CTT	2	6	30212	30217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208803
613	NC_020558	TGG	2	6	30249	30254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208803
614	NC_020558	GTA	2	6	30306	30311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208803
615	NC_020558	AGT	2	6	30401	30406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208803
616	NC_020558	CAG	2	6	30511	30516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208803
617	NC_020558	AAC	2	6	30527	30532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208803
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623	NC_020558	AAG	2	6	30790	30795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208803
624	NC_020558	AGA	2	6	30803	30808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208803
625	NC_020558	ATT	2	6	30934	30939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208804
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