MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 50873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020558	CAAC	2	8	275785	275792	50 %	0 %	0 %	50 %	470209052
5002	NC_020558	CAG	2	6	275798	275803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470209052
5003	NC_020558	GC	3	6	275819	275824	0 %	0 %	50 %	50 %	470209052
5004	NC_020558	TGG	2	6	275832	275837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470209052
5005	NC_020558	AATT	2	8	275888	275895	50 %	50 %	0 %	0 %	470209052
5006	NC_020558	GATT	2	8	275904	275911	25 %	50 %	25 %	0 %	470209052
5007	NC_020558	AAG	2	6	276251	276256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209053
5008	NC_020558	CTT	2	6	276283	276288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470209053
5009	NC_020558	CAT	2	6	276312	276317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209053
5010	NC_020558	CTT	2	6	276336	276341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470209053
5011	NC_020558	TTGA	2	8	276367	276374	25 %	50 %	25 %	0 %	470209053
5012	NC_020558	AAAT	2	8	276400	276407	75 %	25 %	0 %	0 %	470209053
5013	NC_020558	TCTTTT	2	12	276419	276430	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470209053
5014	NC_020558	CTAG	2	8	276455	276462	25 %	25 %	25 %	25 %	470209053
5015	NC_020558	CAT	2	6	276541	276546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209054
5016	NC_020558	TGCG	2	8	276673	276680	0 %	25 %	50 %	25 %	470209054
5017	NC_020558	CTA	2	6	276723	276728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209054
5018	NC_020558	ACG	2	6	276793	276798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470209054
5019	NC_020558	GTT	2	6	276845	276850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470209054
5020	NC_020558	T	6	6	276871	276876	0 %	100 %	0 %	0 %	470209054
5021	NC_020558	TGC	2	6	276906	276911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209054
5022	NC_020558	T	6	6	276913	276918	0 %	100 %	0 %	0 %	470209054
5023	NC_020558	GTT	2	6	276937	276942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470209054
5024	NC_020558	TAG	2	6	276989	276994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209054
5025	NC_020558	AGT	2	6	277028	277033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209054
5026	NC_020558	TCT	2	6	277073	277078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470209054
5027	NC_020558	CATA	2	8	277116	277123	50 %	25 %	0 %	25 %	470209054
5028	NC_020558	TCCA	2	8	277124	277131	25 %	25 %	0 %	50 %	470209054
5029	NC_020558	TTC	2	6	277147	277152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470209054
5030	NC_020558	CAT	2	6	277155	277160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209054
5031	NC_020558	GT	3	6	277206	277211	0 %	50 %	50 %	0 %	470209054
5032	NC_020558	CAA	2	6	277365	277370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470209054
5033	NC_020558	AAT	2	6	277440	277445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470209054
5034	NC_020558	TCA	2	6	277490	277495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209054
5035	NC_020558	AAT	2	6	277496	277501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470209054
5036	NC_020558	TCA	2	6	277562	277567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209054
5037	NC_020558	TTCA	2	8	277592	277599	25 %	50 %	0 %	25 %	470209054
5038	NC_020558	TCT	2	6	277686	277691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470209055
5039	NC_020558	AGT	2	6	277742	277747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209055
5040	NC_020558	TTTA	2	8	278004	278011	25 %	75 %	0 %	0 %	470209056
5041	NC_020558	CAT	2	6	278148	278153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209056
5042	NC_020558	CTT	2	6	278343	278348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470209056
5043	NC_020558	ATA	2	6	278369	278374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470209056
5044	NC_020558	ATC	2	6	278485	278490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209056
5045	NC_020558	CTT	2	6	278577	278582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470209056
5046	NC_020558	TAA	2	6	278619	278624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470209056
5047	NC_020558	AAT	2	6	278661	278666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470209056
5048	NC_020558	CAA	2	6	278676	278681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470209056
5049	NC_020558	CTT	2	6	278739	278744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470209056
5050	NC_020558	ATC	2	6	278767	278772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209056
5051	NC_020558	AGT	2	6	278777	278782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209056
5052	NC_020558	ATCAAT	2	12	278788	278799	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470209056
5053	NC_020558	AAT	2	6	278928	278933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470209057
5054	NC_020558	TG	3	6	278991	278996	0 %	50 %	50 %	0 %	470209057
5055	NC_020558	AGA	2	6	279006	279011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209057
5056	NC_020558	TTA	2	6	279012	279017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209057
5057	NC_020558	ATGAAA	2	12	279116	279127	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470209057
5058	NC_020558	CTT	2	6	279193	279198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470209057
5059	NC_020558	TCA	2	6	279240	279245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209057
5060	NC_020558	CGG	2	6	279270	279275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470209057
5061	NC_020558	AGA	2	6	279354	279359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209057
5062	NC_020558	AGCT	2	8	279369	279376	25 %	25 %	25 %	25 %	470209057
5063	NC_020558	AAG	2	6	279392	279397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209057
5064	NC_020558	TAAA	2	8	279420	279427	75 %	25 %	0 %	0 %	470209057
5065	NC_020558	A	7	7	279425	279431	100 %	0 %	0 %	0 %	470209057
5066	NC_020558	T	7	7	279479	279485	0 %	100 %	0 %	0 %	470209058
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5069	NC_020558	AGT	2	6	279594	279599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209058
5070	NC_020558	CGT	2	6	279610	279615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209058
5071	NC_020558	GTA	2	6	279630	279635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209058
5072	NC_020558	T	6	6	279706	279711	0 %	100 %	0 %	0 %	470209058
5073	NC_020558	GTA	2	6	279736	279741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209058
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5076	NC_020558	TCTT	2	8	279821	279828	0 %	75 %	0 %	25 %	470209058
5077	NC_020558	TAAT	2	8	279837	279844	50 %	50 %	0 %	0 %	470209058
5078	NC_020558	A	6	6	279914	279919	100 %	0 %	0 %	0 %	470209058
5079	NC_020558	AT	3	6	279962	279967	50 %	50 %	0 %	0 %	470209058
5080	NC_020558	AC	3	6	279996	280001	50 %	0 %	0 %	50 %	470209058
5081	NC_020558	ATTGT	2	10	280072	280081	20 %	60 %	20 %	0 %	470209058
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5088	NC_020558	T	6	6	280468	280473	0 %	100 %	0 %	0 %	470209059
5089	NC_020558	TAA	2	6	280527	280532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470209059
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5091	NC_020558	TGCTT	2	10	280564	280573	0 %	60 %	20 %	20 %	470209059
5092	NC_020558	TACT	2	8	280596	280603	25 %	50 %	0 %	25 %	470209059
5093	NC_020558	TTTG	2	8	280658	280665	0 %	75 %	25 %	0 %	470209059
5094	NC_020558	AAGG	2	8	280681	280688	50 %	0 %	50 %	0 %	470209059
5095	NC_020558	GTT	2	6	280726	280731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470209059
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5102	NC_020558	T	7	7	281002	281008	0 %	100 %	0 %	0 %	470209059
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5107	NC_020558	T	6	6	281218	281223	0 %	100 %	0 %	0 %	470209059
5108	NC_020558	CTCTT	2	10	281235	281244	0 %	60 %	0 %	40 %	470209060
5109	NC_020558	ATGAA	2	10	281245	281254	60 %	20 %	20 %	0 %	470209060
5110	NC_020558	GAT	2	6	281302	281307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209060
5111	NC_020558	TGC	3	9	281309	281317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209060
5112	NC_020558	TAA	2	6	281404	281409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470209060
5113	NC_020558	T	7	7	281458	281464	0 %	100 %	0 %	0 %	470209060
5114	NC_020558	ATT	2	6	281492	281497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209060
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5117	NC_020558	TCA	2	6	281616	281621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209060
5118	NC_020558	GAA	2	6	281702	281707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209060
5119	NC_020558	GGT	2	6	281712	281717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470209060
5120	NC_020558	AGA	2	6	281746	281751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209060
5121	NC_020558	A	7	7	281751	281757	100 %	0 %	0 %	0 %	470209060
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5123	NC_020558	CTTCT	2	10	281804	281813	0 %	60 %	0 %	40 %	470209060
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5492	NC_020558	T	6	6	304348	304353	0 %	100 %	0 %	0 %	470209088
5493	NC_020558	ATT	2	6	304355	304360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209088
5494	NC_020558	TTG	2	6	304367	304372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470209088
5495	NC_020558	TTGGG	2	10	305500	305509	0 %	40 %	60 %	0 %	470209089
5496	NC_020558	TA	3	6	305592	305597	50 %	50 %	0 %	0 %	470209089
5497	NC_020558	TCG	2	6	305651	305656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209089
5498	NC_020558	TCAT	2	8	305662	305669	25 %	50 %	0 %	25 %	470209089
5499	NC_020558	AAT	2	6	305697	305702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470209089
5500	NC_020558	GTT	2	6	305714	305719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470209089

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