MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 50873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_020558	TCAA	2	8	240347	240354	50 %	25 %	0 %	25 %	470209012
4502	NC_020558	GATT	2	8	240445	240452	25 %	50 %	25 %	0 %	470209012
4503	NC_020558	ATC	2	6	240498	240503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209012
4504	NC_020558	GCA	2	6	240518	240523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470209012
4505	NC_020558	TTG	2	6	240600	240605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470209012
4506	NC_020558	AAGG	2	8	240617	240624	50 %	0 %	50 %	0 %	470209012
4507	NC_020558	TTG	2	6	240780	240785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470209012
4508	NC_020558	GAA	2	6	240815	240820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209012
4509	NC_020558	GGAA	2	8	240862	240869	50 %	0 %	50 %	0 %	470209012
4510	NC_020558	ACA	2	6	240954	240959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470209012
4511	NC_020558	GCG	2	6	241034	241039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470209012
4512	NC_020558	CAGT	2	8	241083	241090	25 %	25 %	25 %	25 %	470209012
4513	NC_020558	CAA	2	6	241116	241121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470209012
4514	NC_020558	TCG	2	6	241168	241173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209012
4515	NC_020558	AAC	2	6	241188	241193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470209012
4516	NC_020558	AAG	2	6	241200	241205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209012
4517	NC_020558	GAA	2	6	241315	241320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209012
4518	NC_020558	GT	3	6	241491	241496	0 %	50 %	50 %	0 %	470209013
4519	NC_020558	T	6	6	241496	241501	0 %	100 %	0 %	0 %	470209013
4520	NC_020558	TAAT	2	8	241576	241583	50 %	50 %	0 %	0 %	470209013
4521	NC_020558	TTA	2	6	241627	241632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209013
4522	NC_020558	CAAA	2	8	241779	241786	75 %	0 %	0 %	25 %	470209013
4523	NC_020558	AGT	2	6	241805	241810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209013
4524	NC_020558	GTC	2	6	241864	241869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209013
4525	NC_020558	AAAGA	2	10	241907	241916	80 %	0 %	20 %	0 %	470209013
4526	NC_020558	AGA	3	9	241922	241930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209013
4527	NC_020558	AGA	2	6	241937	241942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209013
4528	NC_020558	ATT	2	6	241983	241988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209013
4529	NC_020558	ACT	2	6	242013	242018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209013
4530	NC_020558	GGT	2	6	242036	242041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470209013
4531	NC_020558	GTT	2	6	242250	242255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470209013
4532	NC_020558	TGT	2	6	242342	242347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470209013
4533	NC_020558	GAT	2	6	242421	242426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209013
4534	NC_020558	GAT	2	6	242432	242437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209013
4535	NC_020558	TGT	2	6	242438	242443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470209013
4536	NC_020558	AGA	2	6	242444	242449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209013
4537	NC_020558	TTA	2	6	242461	242466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209013
4538	NC_020558	CAG	2	6	242509	242514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470209013
4539	NC_020558	GAA	2	6	242515	242520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209013
4540	NC_020558	T	7	7	242579	242585	0 %	100 %	0 %	0 %	470209014
4541	NC_020558	TCAT	2	8	242660	242667	25 %	50 %	0 %	25 %	470209014
4542	NC_020558	T	6	6	242679	242684	0 %	100 %	0 %	0 %	470209014
4543	NC_020558	GTT	2	6	242696	242701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470209014
4544	NC_020558	TTG	2	6	242711	242716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470209014
4545	NC_020558	TG	3	6	242715	242720	0 %	50 %	50 %	0 %	470209014
4546	NC_020558	AAG	2	6	242723	242728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209014
4547	NC_020558	GAAA	2	8	242731	242738	75 %	0 %	25 %	0 %	470209014
4548	NC_020558	ATG	2	6	242873	242878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209014
4549	NC_020558	ATT	2	6	242905	242910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209014
4550	NC_020558	ATT	2	6	242916	242921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209014
4551	NC_020558	AGTAAA	2	12	242958	242969	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470209014
4552	NC_020558	GTG	2	6	242986	242991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470209014
4553	NC_020558	CGC	2	6	243044	243049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470209014
4554	NC_020558	TAT	2	6	243175	243180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209014
4555	NC_020558	ATG	2	6	243276	243281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209015
4556	NC_020558	TTA	2	6	243309	243314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209015
4557	NC_020558	TGG	2	6	243316	243321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470209015
4558	NC_020558	CTA	2	6	243347	243352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209015
4559	NC_020558	T	6	6	243433	243438	0 %	100 %	0 %	0 %	470209015
4560	NC_020558	CTA	2	6	243543	243548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209015
4561	NC_020558	GAA	2	6	243683	243688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209015
4562	NC_020558	AAT	2	6	243723	243728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470209015
4563	NC_020558	TATT	2	8	243836	243843	25 %	75 %	0 %	0 %	470209016
4564	NC_020558	ATG	2	6	243855	243860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209016
4565	NC_020558	GAA	2	6	243917	243922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209016
4566	NC_020558	TCAA	2	8	244015	244022	50 %	25 %	0 %	25 %	470209016
4567	NC_020558	AGA	3	9	244084	244092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209016
4568	NC_020558	GTC	2	6	244155	244160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209016
4569	NC_020558	AAG	2	6	244188	244193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209016
4570	NC_020558	A	6	6	244316	244321	100 %	0 %	0 %	0 %	470209016
4571	NC_020558	GAT	2	6	244358	244363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209016
4572	NC_020558	TTC	2	6	244386	244391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470209016
4573	NC_020558	CCA	2	6	244457	244462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470209016
4574	NC_020558	ATT	2	6	244529	244534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209016
4575	NC_020558	ATT	2	6	244579	244584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209016
4576	NC_020558	TTGG	2	8	244602	244609	0 %	50 %	50 %	0 %	470209016
4577	NC_020558	GAA	3	9	244622	244630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209016
4578	NC_020558	AGA	2	6	244642	244647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209016
4579	NC_020558	A	6	6	244726	244731	100 %	0 %	0 %	0 %	470209017
4580	NC_020558	ATG	2	6	244742	244747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209017
4581	NC_020558	TAG	2	6	244748	244753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209017
4582	NC_020558	CTTT	2	8	244756	244763	0 %	75 %	0 %	25 %	470209017
4583	NC_020558	CTG	2	6	244793	244798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209017
4584	NC_020558	TGA	2	6	244926	244931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209017
4585	NC_020558	AGA	2	6	244932	244937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209017
4586	NC_020558	A	6	6	244987	244992	100 %	0 %	0 %	0 %	470209017
4587	NC_020558	TTTA	2	8	245082	245089	25 %	75 %	0 %	0 %	470209017
4588	NC_020558	TAC	2	6	245102	245107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209017
4589	NC_020558	AGA	2	6	245619	245624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209018
4590	NC_020558	CAA	2	6	245630	245635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470209018
4591	NC_020558	CGA	2	6	245654	245659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470209018
4592	NC_020558	T	6	6	245665	245670	0 %	100 %	0 %	0 %	470209018
4593	NC_020558	T	6	6	245676	245681	0 %	100 %	0 %	0 %	470209018
4594	NC_020558	TGG	2	6	245707	245712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470209018
4595	NC_020558	T	7	7	245728	245734	0 %	100 %	0 %	0 %	470209018
4596	NC_020558	TTTG	2	8	245751	245758	0 %	75 %	25 %	0 %	470209018
4597	NC_020558	TAT	2	6	245765	245770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209018
4598	NC_020558	CTA	2	6	245816	245821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209018
4599	NC_020558	CAG	2	6	245873	245878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470209018
4600	NC_020558	GAT	2	6	245887	245892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209018
4601	NC_020558	CCT	2	6	246059	246064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470209018
4602	NC_020558	GTT	2	6	246095	246100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470209018
4603	NC_020558	GA	3	6	246249	246254	50 %	0 %	50 %	0 %	470209019
4604	NC_020558	GTGAA	2	10	246282	246291	40 %	20 %	40 %	0 %	470209019
4605	NC_020558	ATT	2	6	246350	246355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209019
4606	NC_020558	TCG	2	6	246370	246375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209019
4607	NC_020558	ATG	2	6	246396	246401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209019
4608	NC_020558	GAT	2	6	246431	246436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209019
4609	NC_020558	TGA	2	6	246510	246515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209019
4610	NC_020558	ATT	2	6	246576	246581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209020
4611	NC_020558	A	6	6	246651	246656	100 %	0 %	0 %	0 %	470209020
4612	NC_020558	GCA	2	6	246701	246706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470209020
4613	NC_020558	A	6	6	246852	246857	100 %	0 %	0 %	0 %	470209020
4614	NC_020558	GCGG	2	8	246885	246892	0 %	0 %	75 %	25 %	470209020
4615	NC_020558	ACT	2	6	246967	246972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209020
4616	NC_020558	A	6	6	247006	247011	100 %	0 %	0 %	0 %	470209020
4617	NC_020558	TTA	2	6	247033	247038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470209020
4618	NC_020558	ATG	2	6	247045	247050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209020
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4620	NC_020558	ATG	2	6	247126	247131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470209020
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4622	NC_020558	ATC	2	6	247192	247197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209020
4623	NC_020558	GAA	2	6	247227	247232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470209020
4624	NC_020558	AAC	2	6	247255	247260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470209020
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4987	NC_020558	CT	3	6	273467	273472	0 %	50 %	0 %	50 %	470209049
4988	NC_020558	ATTT	2	8	273706	273713	25 %	75 %	0 %	0 %	470209050
4989	NC_020558	GGAAT	2	10	273732	273741	40 %	20 %	40 %	0 %	470209050
4990	NC_020558	TACAAG	2	12	273836	273847	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470209050
4991	NC_020558	ACGC	2	8	273851	273858	25 %	0 %	25 %	50 %	470209050
4992	NC_020558	CGAAAT	2	12	273890	273901	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470209050
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4996	NC_020558	A	6	6	274220	274225	100 %	0 %	0 %	0 %	470209051
4997	NC_020558	TCG	2	6	275503	275508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470209052
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5000	NC_020558	TCA	2	6	275695	275700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470209052

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