MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes La111 complete genome

Total Repeats: 6785

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020557	CAAT	2	8	321	328	50 %	25 %	0 %	25 %	470205642
2	NC_020557	CTTA	2	8	944	951	25 %	50 %	0 %	25 %	470205642
3	NC_020557	GACC	2	8	1056	1063	25 %	0 %	25 %	50 %	470205642
4	NC_020557	CGTT	2	8	1418	1425	0 %	50 %	25 %	25 %	470205642
5	NC_020557	TACT	2	8	2348	2355	25 %	50 %	0 %	25 %	470205643
6	NC_020557	TAAA	2	8	2498	2505	75 %	25 %	0 %	0 %	470205643
7	NC_020557	TGAT	2	8	4702	4709	25 %	50 %	25 %	0 %	470205645
8	NC_020557	AACC	2	8	4976	4983	50 %	0 %	0 %	50 %	470205646
9	NC_020557	TGCT	2	8	5002	5009	0 %	50 %	25 %	25 %	470205646
10	NC_020557	ATTT	2	8	5301	5308	25 %	75 %	0 %	0 %	470205646
11	NC_020557	TTCA	2	8	5463	5470	25 %	50 %	0 %	25 %	470205646
12	NC_020557	AATC	2	8	5611	5618	50 %	25 %	0 %	25 %	470205646
13	NC_020557	TAAA	2	8	6751	6758	75 %	25 %	0 %	0 %	470205647
14	NC_020557	ATTT	2	8	6786	6793	25 %	75 %	0 %	0 %	470205647
15	NC_020557	TAAA	2	8	7135	7142	75 %	25 %	0 %	0 %	470205647
16	NC_020557	ATTA	2	8	7538	7545	50 %	50 %	0 %	0 %	470205647
17	NC_020557	TAAA	2	8	8105	8112	75 %	25 %	0 %	0 %	470205648
18	NC_020557	ATGA	2	8	8221	8228	50 %	25 %	25 %	0 %	470205648
19	NC_020557	AATT	2	8	9248	9255	50 %	50 %	0 %	0 %	470205648
20	NC_020557	ACAA	2	8	9317	9324	75 %	0 %	0 %	25 %	470205648
21	NC_020557	ATTA	2	8	9411	9418	50 %	50 %	0 %	0 %	470205648
22	NC_020557	CTAA	2	8	9592	9599	50 %	25 %	0 %	25 %	470205648
23	NC_020557	ACTT	2	8	9827	9834	25 %	50 %	0 %	25 %	470205648
24	NC_020557	ATCT	2	8	10071	10078	25 %	50 %	0 %	25 %	470205648
25	NC_020557	AAAC	2	8	10225	10232	75 %	0 %	0 %	25 %	470205648
26	NC_020557	AATC	2	8	10790	10797	50 %	25 %	0 %	25 %	470205649
27	NC_020557	ATTA	2	8	11021	11028	50 %	50 %	0 %	0 %	470205649
28	NC_020557	ATTA	2	8	13499	13506	50 %	50 %	0 %	0 %	470205651
29	NC_020557	ATTT	2	8	13839	13846	25 %	75 %	0 %	0 %	470205652
30	NC_020557	ATGC	2	8	14389	14396	25 %	25 %	25 %	25 %	470205652
31	NC_020557	TGTA	2	8	15128	15135	25 %	50 %	25 %	0 %	470205653
32	NC_020557	ACCG	2	8	16516	16523	25 %	0 %	25 %	50 %	470205654
33	NC_020557	TACA	2	8	16650	16657	50 %	25 %	0 %	25 %	470205654
34	NC_020557	AGCT	2	8	16761	16768	25 %	25 %	25 %	25 %	470205654
35	NC_020557	CAAA	2	8	17088	17095	75 %	0 %	0 %	25 %	470205655
36	NC_020557	CTTG	2	8	17327	17334	0 %	50 %	25 %	25 %	470205656
37	NC_020557	TTTA	2	8	17468	17475	25 %	75 %	0 %	0 %	470205656
38	NC_020557	ATTA	2	8	17828	17835	50 %	50 %	0 %	0 %	470205656
39	NC_020557	GCTT	2	8	17879	17886	0 %	50 %	25 %	25 %	470205656
40	NC_020557	ACCG	2	8	18203	18210	25 %	0 %	25 %	50 %	470205656
41	NC_020557	GTTT	2	8	18528	18535	0 %	75 %	25 %	0 %	470205656
42	NC_020557	TGTC	2	8	18916	18923	0 %	50 %	25 %	25 %	470205656
43	NC_020557	ACTT	2	8	19247	19254	25 %	50 %	0 %	25 %	470205657
44	NC_020557	GGCT	2	8	19267	19274	0 %	25 %	50 %	25 %	470205657
45	NC_020557	TATT	2	8	19644	19651	25 %	75 %	0 %	0 %	470205657
46	NC_020557	TTCA	2	8	19902	19909	25 %	50 %	0 %	25 %	470205658
47	NC_020557	GGAC	2	8	21582	21589	25 %	0 %	50 %	25 %	470205661
48	NC_020557	AATC	2	8	22140	22147	50 %	25 %	0 %	25 %	470205661
49	NC_020557	AAGC	2	8	22484	22491	50 %	0 %	25 %	25 %	470205661
50	NC_020557	AGCC	2	8	23571	23578	25 %	0 %	25 %	50 %	470205662
51	NC_020557	GAAC	2	8	23607	23614	50 %	0 %	25 %	25 %	470205662
52	NC_020557	ATTA	2	8	24043	24050	50 %	50 %	0 %	0 %	470205663
53	NC_020557	GTAA	2	8	24200	24207	50 %	25 %	25 %	0 %	470205663
54	NC_020557	GTTA	2	8	25696	25703	25 %	50 %	25 %	0 %	470205666
55	NC_020557	CAAA	2	8	26380	26387	75 %	0 %	0 %	25 %	470205666
56	NC_020557	GTTG	2	8	26524	26531	0 %	50 %	50 %	0 %	470205667
57	NC_020557	AAAG	2	8	26732	26739	75 %	0 %	25 %	0 %	470205667
58	NC_020557	GTTA	2	8	28170	28177	25 %	50 %	25 %	0 %	470205669
59	NC_020557	GTCC	2	8	28239	28246	0 %	25 %	25 %	50 %	470205669
60	NC_020557	TGAT	2	8	28291	28298	25 %	50 %	25 %	0 %	470205669
61	NC_020557	GAAA	2	8	29030	29037	75 %	0 %	25 %	0 %	470205670
62	NC_020557	GAAG	2	8	29166	29173	50 %	0 %	50 %	0 %	470205670
63	NC_020557	TTGG	2	8	29302	29309	0 %	50 %	50 %	0 %	470205670
64	NC_020557	GTAC	2	8	29326	29333	25 %	25 %	25 %	25 %	470205670
65	NC_020557	ATTT	2	8	30014	30021	25 %	75 %	0 %	0 %	470205670
66	NC_020557	CAAT	2	8	30731	30738	50 %	25 %	0 %	25 %	470205670
67	NC_020557	ATTA	2	8	31347	31354	50 %	50 %	0 %	0 %	470205671
68	NC_020557	ACTA	2	8	33687	33694	50 %	25 %	0 %	25 %	470205673
69	NC_020557	AATA	2	8	33726	33733	75 %	25 %	0 %	0 %	470205673
70	NC_020557	AAAC	2	8	34641	34648	75 %	0 %	0 %	25 %	470205674
71	NC_020557	TTGT	2	8	34792	34799	0 %	75 %	25 %	0 %	470205674
72	NC_020557	TTGG	2	8	34822	34829	0 %	50 %	50 %	0 %	470205674
73	NC_020557	AAAC	2	8	34837	34844	75 %	0 %	0 %	25 %	470205674
74	NC_020557	TATT	2	8	34850	34857	25 %	75 %	0 %	0 %	470205674
75	NC_020557	AACT	2	8	35095	35102	50 %	25 %	0 %	25 %	470205674
76	NC_020557	GGCT	2	8	36053	36060	0 %	25 %	50 %	25 %	470205675
77	NC_020557	GATG	2	8	36703	36710	25 %	25 %	50 %	0 %	470205675
78	NC_020557	AACA	2	8	36976	36983	75 %	0 %	0 %	25 %	470205675
79	NC_020557	TTTA	2	8	37152	37159	25 %	75 %	0 %	0 %	470205675
80	NC_020557	AAAC	2	8	37205	37212	75 %	0 %	0 %	25 %	470205675
81	NC_020557	GAAT	2	8	37572	37579	50 %	25 %	25 %	0 %	470205675
82	NC_020557	CAAT	2	8	37589	37596	50 %	25 %	0 %	25 %	470205675
83	NC_020557	GCGG	2	8	38237	38244	0 %	0 %	75 %	25 %	470205676
84	NC_020557	TTAG	2	8	38303	38310	25 %	50 %	25 %	0 %	470205676
85	NC_020557	TACC	2	8	39086	39093	25 %	25 %	0 %	50 %	470205676
86	NC_020557	CAAA	2	8	39249	39256	75 %	0 %	0 %	25 %	470205677
87	NC_020557	CAAC	2	8	39739	39746	50 %	0 %	0 %	50 %	470205677
88	NC_020557	AAAT	2	8	40187	40194	75 %	25 %	0 %	0 %	470205677
89	NC_020557	TTCT	2	8	40780	40787	0 %	75 %	0 %	25 %	470205678
90	NC_020557	ATTA	2	8	41865	41872	50 %	50 %	0 %	0 %	470205679
91	NC_020557	TTGT	2	8	41901	41908	0 %	75 %	25 %	0 %	470205679
92	NC_020557	ATTT	2	8	42090	42097	25 %	75 %	0 %	0 %	470205679
93	NC_020557	ATTT	2	8	42173	42180	25 %	75 %	0 %	0 %	470205679
94	NC_020557	ACGT	2	8	43286	43293	25 %	25 %	25 %	25 %	470205680
95	NC_020557	ATTT	2	8	43591	43598	25 %	75 %	0 %	0 %	470205680
96	NC_020557	GGAA	2	8	43830	43837	50 %	0 %	50 %	0 %	470205680
97	NC_020557	CGAC	2	8	43857	43864	25 %	0 %	25 %	50 %	470205680
98	NC_020557	ATTA	2	8	43879	43886	50 %	50 %	0 %	0 %	470205680
99	NC_020557	TGGT	2	8	43985	43992	0 %	50 %	50 %	0 %	470205680
100	NC_020557	ATTA	2	8	44403	44410	50 %	50 %	0 %	0 %	470205681
101	NC_020557	ACCA	2	8	44451	44458	50 %	0 %	0 %	50 %	470205681
102	NC_020557	TCTT	2	8	44522	44529	0 %	75 %	0 %	25 %	470205681
103	NC_020557	AAAG	2	8	44923	44930	75 %	0 %	25 %	0 %	470205681
104	NC_020557	GAAG	2	8	45648	45655	50 %	0 %	50 %	0 %	470205682
105	NC_020557	AAAC	2	8	45754	45761	75 %	0 %	0 %	25 %	470205682
106	NC_020557	TTAA	2	8	46336	46343	50 %	50 %	0 %	0 %	470205683
107	NC_020557	AAAC	2	8	46605	46612	75 %	0 %	0 %	25 %	470205683
108	NC_020557	ATTT	2	8	46618	46625	25 %	75 %	0 %	0 %	470205683
109	NC_020557	TACG	2	8	46773	46780	25 %	25 %	25 %	25 %	470205683
110	NC_020557	CCAG	2	8	48399	48406	25 %	0 %	25 %	50 %	470205685
111	NC_020557	TGAA	2	8	48536	48543	50 %	25 %	25 %	0 %	470205685
112	NC_020557	GAAC	2	8	48568	48575	50 %	0 %	25 %	25 %	470205685
113	NC_020557	TTTA	2	8	48609	48616	25 %	75 %	0 %	0 %	470205685
114	NC_020557	GGCG	2	8	49936	49943	0 %	0 %	75 %	25 %	470205687
115	NC_020557	AAAT	2	8	50541	50548	75 %	25 %	0 %	0 %	470205688
116	NC_020557	AGAA	2	8	51600	51607	75 %	0 %	25 %	0 %	470205690
117	NC_020557	TAAT	2	8	51692	51699	50 %	50 %	0 %	0 %	470205690
118	NC_020557	ACTT	2	8	52128	52135	25 %	50 %	0 %	25 %	470205690
119	NC_020557	GCTT	2	8	52256	52263	0 %	50 %	25 %	25 %	470205691
120	NC_020557	ATAA	2	8	52320	52327	75 %	25 %	0 %	0 %	470205691
121	NC_020557	TAAA	2	8	53233	53240	75 %	25 %	0 %	0 %	470205692
122	NC_020557	GCTG	2	8	53309	53316	0 %	25 %	50 %	25 %	470205692
123	NC_020557	AAGC	2	8	54105	54112	50 %	0 %	25 %	25 %	470205693
124	NC_020557	ATTA	2	8	54431	54438	50 %	50 %	0 %	0 %	470205693
125	NC_020557	TGAA	2	8	54791	54798	50 %	25 %	25 %	0 %	470205694
126	NC_020557	TATT	2	8	55275	55282	25 %	75 %	0 %	0 %	470205694
127	NC_020557	AAAC	2	8	55559	55566	75 %	0 %	0 %	25 %	470205694
128	NC_020557	ATGA	2	8	55720	55727	50 %	25 %	25 %	0 %	470205694
129	NC_020557	AATG	2	8	55785	55792	50 %	25 %	25 %	0 %	470205694
130	NC_020557	GAAG	2	8	56223	56230	50 %	0 %	50 %	0 %	470205694
131	NC_020557	AATT	2	8	56552	56559	50 %	50 %	0 %	0 %	470205694
132	NC_020557	GAAA	2	8	56801	56808	75 %	0 %	25 %	0 %	470205695
133	NC_020557	GGAA	2	8	57823	57830	50 %	0 %	50 %	0 %	470205697
134	NC_020557	ACGG	2	8	57850	57857	25 %	0 %	50 %	25 %	470205697
135	NC_020557	TTTC	2	8	58736	58743	0 %	75 %	0 %	25 %	470205698
136	NC_020557	CAAA	2	8	59037	59044	75 %	0 %	0 %	25 %	470205698
137	NC_020557	ATCA	2	8	59444	59451	50 %	25 %	0 %	25 %	470205698
138	NC_020557	GGTT	2	8	59587	59594	0 %	50 %	50 %	0 %	470205698
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