MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes La111 complete genome

Total Repeats: 50906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020557	CAT	2	6	49404	49409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205686
1002	NC_020557	GAA	2	6	49423	49428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205686
1003	NC_020557	A	6	6	49435	49440	100 %	0 %	0 %	0 %	470205686
1004	NC_020557	TGT	2	6	49443	49448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470205686
1005	NC_020557	ATC	2	6	49489	49494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205686
1006	NC_020557	TGA	2	6	49629	49634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205686
1007	NC_020557	AGA	2	6	49659	49664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205686
1008	NC_020557	ATG	2	6	49727	49732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205687
1009	NC_020557	GTA	2	6	49739	49744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205687
1010	NC_020557	CAA	2	6	49844	49849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205687
1011	NC_020557	TTA	2	6	49869	49874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205687
1012	NC_020557	TGT	2	6	49879	49884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470205687
1013	NC_020557	GAA	2	6	49921	49926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205687
1014	NC_020557	GGCG	2	8	49936	49943	0 %	0 %	75 %	25 %	470205687
1015	NC_020557	ACG	2	6	49980	49985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470205687
1016	NC_020557	AG	3	6	50017	50022	50 %	0 %	50 %	0 %	470205687
1017	NC_020557	TGGCGG	2	12	50053	50064	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	470205687
1018	NC_020557	AAC	2	6	50087	50092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205687
1019	NC_020557	AAT	2	6	50093	50098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205687
1020	NC_020557	CAA	2	6	50165	50170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205687
1021	NC_020557	TCAAAA	2	12	50173	50184	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470205687
1022	NC_020557	TAA	2	6	50197	50202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205687
1023	NC_020557	TGA	2	6	50242	50247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205687
1024	NC_020557	GGA	2	6	50313	50318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470205688
1025	NC_020557	A	6	6	50340	50345	100 %	0 %	0 %	0 %	470205688
1026	NC_020557	TTACT	2	10	50351	50360	20 %	60 %	0 %	20 %	470205688
1027	NC_020557	CTT	2	6	50400	50405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470205688
1028	NC_020557	A	6	6	50406	50411	100 %	0 %	0 %	0 %	470205688
1029	NC_020557	TCG	2	6	50441	50446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470205688
1030	NC_020557	TAC	2	6	50518	50523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205688
1031	NC_020557	GAA	2	6	50535	50540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205688
1032	NC_020557	AAAT	2	8	50541	50548	75 %	25 %	0 %	0 %	470205688
1033	NC_020557	A	6	6	50706	50711	100 %	0 %	0 %	0 %	470205689
1034	NC_020557	TAT	2	6	50734	50739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205689
1035	NC_020557	TAG	2	6	50740	50745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205689
1036	NC_020557	ATG	2	6	50770	50775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205689
1037	NC_020557	CAT	2	6	50785	50790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205689
1038	NC_020557	ATA	2	6	50794	50799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205689
1039	NC_020557	CAA	2	6	50801	50806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205689
1040	NC_020557	ACT	2	6	50811	50816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205689
1041	NC_020557	TAA	2	6	50831	50836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205689
1042	NC_020557	TCA	2	6	50844	50849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205689
1043	NC_020557	GAAAT	2	10	51009	51018	60 %	20 %	20 %	0 %	470205689
1044	NC_020557	AAC	2	6	51037	51042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205689
1045	NC_020557	TGA	2	6	51047	51052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205689
1046	NC_020557	CTTAG	2	10	51108	51117	20 %	40 %	20 %	20 %	470205689
1047	NC_020557	AAG	2	6	51136	51141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205689
1048	NC_020557	TTA	2	6	51215	51220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205689
1049	NC_020557	ATA	2	6	51241	51246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205689
1050	NC_020557	TTC	2	6	51286	51291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470205689
1051	NC_020557	TAA	2	6	51309	51314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205689
1052	NC_020557	AGAA	2	8	51600	51607	75 %	0 %	25 %	0 %	470205690
1053	NC_020557	GAT	2	6	51643	51648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205690
1054	NC_020557	GAA	2	6	51649	51654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205690
1055	NC_020557	TAAT	2	8	51692	51699	50 %	50 %	0 %	0 %	470205690
1056	NC_020557	ACAGTG	2	12	51757	51768	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470205690
1057	NC_020557	ATG	2	6	51850	51855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205690
1058	NC_020557	TAA	2	6	51894	51899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205690
1059	NC_020557	GAA	2	6	51988	51993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205690
1060	NC_020557	GAT	2	6	52020	52025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205690
1061	NC_020557	ACTT	2	8	52128	52135	25 %	50 %	0 %	25 %	470205690
1062	NC_020557	AGG	2	6	52150	52155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470205690
1063	NC_020557	AGA	2	6	52213	52218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205691
1064	NC_020557	TTC	2	6	52240	52245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470205691
1065	NC_020557	GCTT	2	8	52256	52263	0 %	50 %	25 %	25 %	470205691
1066	NC_020557	A	7	7	52308	52314	100 %	0 %	0 %	0 %	470205691
1067	NC_020557	ATAA	2	8	52320	52327	75 %	25 %	0 %	0 %	470205691
1068	NC_020557	ATA	2	6	53218	53223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205692
1069	NC_020557	TAAA	2	8	53233	53240	75 %	25 %	0 %	0 %	470205692
1070	NC_020557	GCTG	2	8	53309	53316	0 %	25 %	50 %	25 %	470205692
1071	NC_020557	AGT	2	6	53363	53368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205692
1072	NC_020557	GCG	2	6	53448	53453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470205692
1073	NC_020557	A	6	6	53493	53498	100 %	0 %	0 %	0 %	470205692
1074	NC_020557	ATT	2	6	53511	53516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205692
1075	NC_020557	GAA	2	6	53568	53573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205692
1076	NC_020557	GAA	2	6	53633	53638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205692
1077	NC_020557	AGA	2	6	53707	53712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205692
1078	NC_020557	AT	3	6	53783	53788	50 %	50 %	0 %	0 %	470205693
1079	NC_020557	TAT	2	6	53798	53803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205693
1080	NC_020557	T	6	6	53897	53902	0 %	100 %	0 %	0 %	470205693
1081	NC_020557	ATT	2	6	53982	53987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205693
1082	NC_020557	ACA	2	6	53994	53999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470205693
1083	NC_020557	AGTTA	2	10	54007	54016	40 %	40 %	20 %	0 %	470205693
1084	NC_020557	ATT	2	6	54054	54059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205693
1085	NC_020557	TGC	2	6	54076	54081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470205693
1086	NC_020557	AAGC	2	8	54105	54112	50 %	0 %	25 %	25 %	470205693
1087	NC_020557	AGA	2	6	54113	54118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205693
1088	NC_020557	AAG	2	6	54174	54179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205693
1089	NC_020557	ATT	2	6	54180	54185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205693
1090	NC_020557	T	6	6	54210	54215	0 %	100 %	0 %	0 %	470205693
1091	NC_020557	GAA	2	6	54287	54292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205693
1092	NC_020557	GTG	2	6	54387	54392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470205693
1093	NC_020557	CAT	2	6	54421	54426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470205693
1094	NC_020557	ATTA	2	8	54431	54438	50 %	50 %	0 %	0 %	470205693
1095	NC_020557	ATT	2	6	54685	54690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205694
1096	NC_020557	T	7	7	54709	54715	0 %	100 %	0 %	0 %	470205694
1097	NC_020557	GTG	2	6	54717	54722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470205694
1098	NC_020557	GTT	3	9	54736	54744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470205694
1099	NC_020557	ATT	2	6	54751	54756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205694
1100	NC_020557	TGAA	2	8	54791	54798	50 %	25 %	25 %	0 %	470205694
1101	NC_020557	GAA	3	9	54847	54855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205694
1102	NC_020557	TTG	2	6	54860	54865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470205694
1103	NC_020557	CTG	2	6	54883	54888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470205694
1104	NC_020557	ATG	2	6	54890	54895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205694
1105	NC_020557	GAA	2	6	54973	54978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205694
1106	NC_020557	TTA	2	6	55001	55006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205694
1107	NC_020557	ATG	2	6	55013	55018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205694
1108	NC_020557	TTTATA	2	12	55089	55100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205694
1109	NC_020557	ATG	2	6	55181	55186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205694
1110	NC_020557	GAT	2	6	55204	55209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205694
1111	NC_020557	AAT	2	6	55228	55233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470205694
1112	NC_020557	TATT	2	8	55275	55282	25 %	75 %	0 %	0 %	470205694
1113	NC_020557	GGA	2	6	55323	55328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470205694
1114	NC_020557	GGA	2	6	55344	55349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470205694
1115	NC_020557	GAT	2	6	55441	55446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470205694
1116	NC_020557	GCG	2	6	55499	55504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470205694
1117	NC_020557	CGG	2	6	55551	55556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470205694
1118	NC_020557	AAAC	2	8	55559	55566	75 %	0 %	0 %	25 %	470205694
1119	NC_020557	CG	4	8	55591	55598	0 %	0 %	50 %	50 %	470205694
1120	NC_020557	ATGA	2	8	55720	55727	50 %	25 %	25 %	0 %	470205694
1121	NC_020557	AATG	2	8	55785	55792	50 %	25 %	25 %	0 %	470205694
1122	NC_020557	GAA	2	6	55798	55803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470205694
1123	NC_020557	GTT	3	9	55876	55884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470205694
1124	NC_020557	AC	3	6	55888	55893	50 %	0 %	0 %	50 %	470205694
1125	NC_020557	TTA	2	6	55907	55912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470205694
1126	NC_020557	GTT	2	6	55945	55950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470205694
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