MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1 plasmid

Total Repeats: 196

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020522	CTCG	2	8	451	458	0 %	25 %	25 %	50 %	470180511
2	NC_020522	CTGG	2	8	753	760	0 %	25 %	50 %	25 %	470180511
3	NC_020522	GATG	2	8	1184	1191	25 %	25 %	50 %	0 %	470180511
4	NC_020522	TGAA	2	8	1900	1907	50 %	25 %	25 %	0 %	470180512
5	NC_020522	TAGA	2	8	1912	1919	50 %	25 %	25 %	0 %	470180512
6	NC_020522	TTTG	2	8	1921	1928	0 %	75 %	25 %	0 %	470180512
7	NC_020522	CTTC	2	8	2666	2673	0 %	50 %	0 %	50 %	470180514
8	NC_020522	ACGG	2	8	2920	2927	25 %	0 %	50 %	25 %	470180514
9	NC_020522	CTTC	2	8	3446	3453	0 %	50 %	0 %	50 %	470180514
10	NC_020522	ATCT	2	8	3546	3553	25 %	50 %	0 %	25 %	470180514
11	NC_020522	ATAA	2	8	3874	3881	75 %	25 %	0 %	0 %	470180514
12	NC_020522	ACTT	2	8	4012	4019	25 %	50 %	0 %	25 %	470180514
13	NC_020522	AAGT	2	8	4078	4085	50 %	25 %	25 %	0 %	470180514
14	NC_020522	TGCT	2	8	4497	4504	0 %	50 %	25 %	25 %	470180515
15	NC_020522	TCAA	2	8	4823	4830	50 %	25 %	0 %	25 %	470180515
16	NC_020522	ACCA	2	8	5905	5912	50 %	0 %	0 %	50 %	470180516
17	NC_020522	TTAT	2	8	5913	5920	25 %	75 %	0 %	0 %	470180516
18	NC_020522	CCAG	2	8	6145	6152	25 %	0 %	25 %	50 %	470180516
19	NC_020522	ATAA	2	8	6833	6840	75 %	25 %	0 %	0 %	470180517
20	NC_020522	ACTC	2	8	7614	7621	25 %	25 %	0 %	50 %	470180518
21	NC_020522	GTTA	2	8	7750	7757	25 %	50 %	25 %	0 %	470180518
22	NC_020522	TTGT	2	8	8350	8357	0 %	75 %	25 %	0 %	470180520
23	NC_020522	ATGA	2	8	8407	8414	50 %	25 %	25 %	0 %	470180520
24	NC_020522	AATT	2	8	8724	8731	50 %	50 %	0 %	0 %	470180521
25	NC_020522	CCTG	2	8	8896	8903	0 %	25 %	25 %	50 %	470180521
26	NC_020522	AAAG	2	8	9556	9563	75 %	0 %	25 %	0 %	470180523
27	NC_020522	CTTT	2	8	10167	10174	0 %	75 %	0 %	25 %	470180524
28	NC_020522	TTTA	2	8	10905	10912	25 %	75 %	0 %	0 %	470180526
29	NC_020522	ATGA	2	8	12439	12446	50 %	25 %	25 %	0 %	470180529
30	NC_020522	CTGG	2	8	12568	12575	0 %	25 %	50 %	25 %	470180529
31	NC_020522	CCAT	2	8	12806	12813	25 %	25 %	0 %	50 %	470180529
32	NC_020522	GTTG	2	8	13144	13151	0 %	50 %	50 %	0 %	470180530
33	NC_020522	TCCT	2	8	13633	13640	0 %	50 %	0 %	50 %	470180531
34	NC_020522	AAAT	2	8	13935	13942	75 %	25 %	0 %	0 %	470180531
35	NC_020522	ATCC	2	8	14500	14507	25 %	25 %	0 %	50 %	470180532
36	NC_020522	CATT	2	8	15033	15040	25 %	50 %	0 %	25 %	470180532
37	NC_020522	CACG	2	8	15151	15158	25 %	0 %	25 %	50 %	470180532
38	NC_020522	CGGT	2	8	15192	15199	0 %	25 %	50 %	25 %	470180532
39	NC_020522	AAGA	2	8	15300	15307	75 %	0 %	25 %	0 %	470180532
40	NC_020522	ATCA	2	8	15870	15877	50 %	25 %	0 %	25 %	470180532
41	NC_020522	ATGA	2	8	16637	16644	50 %	25 %	25 %	0 %	470180533
42	NC_020522	GAAA	2	8	16889	16896	75 %	0 %	25 %	0 %	470180533
43	NC_020522	ACGC	2	8	17056	17063	25 %	0 %	25 %	50 %	470180533
44	NC_020522	TTGC	2	8	17281	17288	0 %	50 %	25 %	25 %	470180533
45	NC_020522	TTCT	2	8	17548	17555	0 %	75 %	0 %	25 %	470180534
46	NC_020522	CAAT	2	8	18165	18172	50 %	25 %	0 %	25 %	470180534
47	NC_020522	ATTA	2	8	18413	18420	50 %	50 %	0 %	0 %	470180534
48	NC_020522	GATT	2	8	19420	19427	25 %	50 %	25 %	0 %	470180536
49	NC_020522	CTTT	2	8	20004	20011	0 %	75 %	0 %	25 %	470180536
50	NC_020522	TTAT	2	8	20106	20113	25 %	75 %	0 %	0 %	470180536
51	NC_020522	CCAT	2	8	20208	20215	25 %	25 %	0 %	50 %	470180536
52	NC_020522	AGGC	2	8	20287	20294	25 %	0 %	50 %	25 %	470180536
53	NC_020522	TTTG	2	8	20668	20675	0 %	75 %	25 %	0 %	470180536
54	NC_020522	GAAT	2	8	20938	20945	50 %	25 %	25 %	0 %	470180536
55	NC_020522	GCTC	2	8	21336	21343	0 %	25 %	25 %	50 %	470180536
56	NC_020522	TGAG	2	8	21369	21376	25 %	25 %	50 %	0 %	470180536
57	NC_020522	TTGT	2	8	21590	21597	0 %	75 %	25 %	0 %	470180536
58	NC_020522	TTCG	2	8	22385	22392	0 %	50 %	25 %	25 %	470180538
59	NC_020522	TGAG	2	8	22633	22640	25 %	25 %	50 %	0 %	470180538
60	NC_020522	GGAT	2	8	22698	22705	25 %	25 %	50 %	0 %	470180538
61	NC_020522	ACAA	2	8	22726	22733	75 %	0 %	0 %	25 %	470180538
62	NC_020522	GCTT	2	8	22878	22885	0 %	50 %	25 %	25 %	470180539
63	NC_020522	CAAT	2	8	23237	23244	50 %	25 %	0 %	25 %	470180539
64	NC_020522	TTGG	2	8	23310	23317	0 %	50 %	50 %	0 %	470180539
65	NC_020522	CCTG	2	8	23362	23369	0 %	25 %	25 %	50 %	470180539
66	NC_020522	AATG	2	8	23372	23379	50 %	25 %	25 %	0 %	470180539
67	NC_020522	AGTA	2	8	23499	23506	50 %	25 %	25 %	0 %	470180539
68	NC_020522	ATGA	2	8	23541	23548	50 %	25 %	25 %	0 %	470180540
69	NC_020522	AAGG	2	8	23726	23733	50 %	0 %	50 %	0 %	470180540
70	NC_020522	TCCT	2	8	23830	23837	0 %	50 %	0 %	50 %	470180540
71	NC_020522	GCAG	2	8	24894	24901	25 %	0 %	50 %	25 %	470180541
72	NC_020522	GGCA	2	8	25357	25364	25 %	0 %	50 %	25 %	470180541
73	NC_020522	TAAT	2	8	25477	25484	50 %	50 %	0 %	0 %	470180541
74	NC_020522	ATCA	2	8	25532	25539	50 %	25 %	0 %	25 %	470180541
75	NC_020522	AATA	2	8	26294	26301	75 %	25 %	0 %	0 %	470180541
76	NC_020522	GGTC	2	8	26422	26429	0 %	25 %	50 %	25 %	470180542
77	NC_020522	AGGA	2	8	27532	27539	50 %	0 %	50 %	0 %	470180543
78	NC_020522	GGTC	2	8	27785	27792	0 %	25 %	50 %	25 %	470180543
79	NC_020522	ATGA	2	8	27814	27821	50 %	25 %	25 %	0 %	470180543
80	NC_020522	TAGA	2	8	28612	28619	50 %	25 %	25 %	0 %	470180543
81	NC_020522	AGGT	2	8	29200	29207	25 %	25 %	50 %	0 %	470180544
82	NC_020522	AATC	2	8	29378	29385	50 %	25 %	0 %	25 %	470180544
83	NC_020522	TCAT	2	8	29390	29397	25 %	50 %	0 %	25 %	470180544
84	NC_020522	GATT	2	8	29418	29425	25 %	50 %	25 %	0 %	470180545
85	NC_020522	ACCC	2	8	29941	29948	25 %	0 %	0 %	75 %	470180545
86	NC_020522	ATCC	2	8	30246	30253	25 %	25 %	0 %	50 %	470180545
87	NC_020522	TGAT	2	8	30996	31003	25 %	50 %	25 %	0 %	470180546
88	NC_020522	TGGT	2	8	31187	31194	0 %	50 %	50 %	0 %	470180547
89	NC_020522	ATTC	2	8	31473	31480	25 %	50 %	0 %	25 %	470180547
90	NC_020522	TGAT	2	8	31807	31814	25 %	50 %	25 %	0 %	470180548
91	NC_020522	CAAA	2	8	32067	32074	75 %	0 %	0 %	25 %	470180548
92	NC_020522	TCGG	2	8	32431	32438	0 %	25 %	50 %	25 %	470180548
93	NC_020522	CTTG	2	8	32531	32538	0 %	50 %	25 %	25 %	470180548
94	NC_020522	GGGT	2	8	32806	32813	0 %	25 %	75 %	0 %	470180548
95	NC_020522	GGGC	2	8	32877	32884	0 %	0 %	75 %	25 %	470180548
96	NC_020522	AGCA	2	8	33448	33455	50 %	0 %	25 %	25 %	470180549
97	NC_020522	TTTA	2	8	33484	33491	25 %	75 %	0 %	0 %	470180549
98	NC_020522	TTTC	2	8	33929	33936	0 %	75 %	0 %	25 %	470180550
99	NC_020522	TAAA	2	8	33976	33983	75 %	25 %	0 %	0 %	470180550
100	NC_020522	TACC	2	8	35056	35063	25 %	25 %	0 %	50 %	470180551
101	NC_020522	TGTT	2	8	35169	35176	0 %	75 %	25 %	0 %	470180551
102	NC_020522	AAAT	2	8	35737	35744	75 %	25 %	0 %	0 %	470180552
103	NC_020522	CATG	2	8	36336	36343	25 %	25 %	25 %	25 %	470180552
104	NC_020522	CTCA	2	8	36595	36602	25 %	25 %	0 %	50 %	470180552
105	NC_020522	TTTC	2	8	36766	36773	0 %	75 %	0 %	25 %	470180552
106	NC_020522	CAAA	2	8	37134	37141	75 %	0 %	0 %	25 %	470180552
107	NC_020522	TGAT	2	8	37469	37476	25 %	50 %	25 %	0 %	470180552
108	NC_020522	GGTT	2	8	39138	39145	0 %	50 %	50 %	0 %	470180555
109	NC_020522	TAGA	2	8	39651	39658	50 %	25 %	25 %	0 %	470180556
110	NC_020522	AATT	2	8	39844	39851	50 %	50 %	0 %	0 %	470180557
111	NC_020522	TTGA	2	8	40071	40078	25 %	50 %	25 %	0 %	470180558
112	NC_020522	GCAG	2	8	40359	40366	25 %	0 %	50 %	25 %	470180558
113	NC_020522	TTTG	3	12	40957	40968	0 %	75 %	25 %	0 %	470180559
114	NC_020522	AGTT	2	8	40969	40976	25 %	50 %	25 %	0 %	470180559
115	NC_020522	GTAA	2	8	41336	41343	50 %	25 %	25 %	0 %	470180559
116	NC_020522	CAAG	2	8	41667	41674	50 %	0 %	25 %	25 %	470180560
117	NC_020522	TTAT	2	8	41847	41854	25 %	75 %	0 %	0 %	470180560
118	NC_020522	AGAA	2	8	42093	42100	75 %	0 %	25 %	0 %	470180560
119	NC_020522	AAAT	2	8	42137	42144	75 %	25 %	0 %	0 %	470180560
120	NC_020522	TAAA	2	8	42224	42231	75 %	25 %	0 %	0 %	470180560
121	NC_020522	AATA	2	8	42414	42421	75 %	25 %	0 %	0 %	470180561
122	NC_020522	TAAA	2	8	42453	42460	75 %	25 %	0 %	0 %	470180561
123	NC_020522	ATTA	2	8	42531	42538	50 %	50 %	0 %	0 %	470180562
124	NC_020522	TAAA	2	8	43033	43040	75 %	25 %	0 %	0 %	470180563
125	NC_020522	GTTT	2	8	43254	43261	0 %	75 %	25 %	0 %	470180563
126	NC_020522	ATTT	2	8	43892	43899	25 %	75 %	0 %	0 %	470180563
127	NC_020522	AAAT	2	8	44591	44598	75 %	25 %	0 %	0 %	470180564
128	NC_020522	GAAA	2	8	44723	44730	75 %	0 %	25 %	0 %	470180564
129	NC_020522	ATTT	2	8	44906	44913	25 %	75 %	0 %	0 %	470180565
130	NC_020522	AAAG	2	8	48145	48152	75 %	0 %	25 %	0 %	470180568
131	NC_020522	GCCA	2	8	48336	48343	25 %	0 %	25 %	50 %	470180568
132	NC_020522	GTTA	2	8	48722	48729	25 %	50 %	25 %	0 %	470180569
133	NC_020522	GGGT	2	8	49051	49058	0 %	25 %	75 %	0 %	470180569
134	NC_020522	CAAA	2	8	49202	49209	75 %	0 %	0 %	25 %	470180569
135	NC_020522	CTTA	2	8	49815	49822	25 %	50 %	0 %	25 %	470180570
136	NC_020522	CAAA	2	8	49962	49969	75 %	0 %	0 %	25 %	470180570
137	NC_020522	CGCT	2	8	50821	50828	0 %	25 %	25 %	50 %	470180572
138	NC_020522	AGAA	2	8	51259	51266	75 %	0 %	25 %	0 %	470180572
139	NC_020522	CAGG	2	8	51791	51798	25 %	0 %	50 %	25 %	470180572
140	NC_020522	CAGG	2	8	52146	52153	25 %	0 %	50 %	25 %	470180573
141	NC_020522	ATTT	2	8	52156	52163	25 %	75 %	0 %	0 %	470180573
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.