MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1 DNA

Total Repeats: 46689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020450	ATG	2	6	155931	155936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284365
3002	NC_020450	ATT	2	6	155948	155953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284365
3003	NC_020450	CAT	2	6	155966	155971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284365
3004	NC_020450	CTT	2	6	156005	156010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284365
3005	NC_020450	GCT	2	6	156014	156019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284365
3006	NC_020450	AAT	2	6	156068	156073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284365
3007	NC_020450	ATT	2	6	156249	156254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284365
3008	NC_020450	TTG	2	6	156311	156316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284365
3009	NC_020450	GAT	2	6	156350	156355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284365
3010	NC_020450	ATTCG	2	10	156375	156384	20 %	40 %	20 %	20 %	459284365
3011	NC_020450	GAA	2	6	156410	156415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284365
3012	NC_020450	A	6	6	156468	156473	100 %	0 %	0 %	0 %	459284365
3013	NC_020450	A	6	6	156556	156561	100 %	0 %	0 %	0 %	459284365
3014	NC_020450	A	6	6	156582	156587	100 %	0 %	0 %	0 %	459284365
3015	NC_020450	TGA	2	6	156592	156597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284365
3016	NC_020450	AG	3	6	156598	156603	50 %	0 %	50 %	0 %	459284365
3017	NC_020450	TTTG	2	8	156631	156638	0 %	75 %	25 %	0 %	459284365
3018	NC_020450	A	6	6	156659	156664	100 %	0 %	0 %	0 %	459284365
3019	NC_020450	AAATAG	2	12	156731	156742	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	459284365
3020	NC_020450	AAGT	2	8	156771	156778	50 %	25 %	25 %	0 %	459284366
3021	NC_020450	TAA	2	6	156786	156791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284366
3022	NC_020450	GTT	2	6	156826	156831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284366
3023	NC_020450	AAC	2	6	156899	156904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284366
3024	NC_020450	T	6	6	156978	156983	0 %	100 %	0 %	0 %	459284366
3025	NC_020450	ATC	2	6	157025	157030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284366
3026	NC_020450	CGG	2	6	157084	157089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459284366
3027	NC_020450	CGT	2	6	157168	157173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284366
3028	NC_020450	TGA	2	6	157203	157208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284366
3029	NC_020450	AGA	2	6	157224	157229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284366
3030	NC_020450	TCA	2	6	157246	157251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284366
3031	NC_020450	A	6	6	157321	157326	100 %	0 %	0 %	0 %	459284366
3032	NC_020450	A	6	6	157339	157344	100 %	0 %	0 %	0 %	459284366
3033	NC_020450	AG	3	6	157350	157355	50 %	0 %	50 %	0 %	459284366
3034	NC_020450	A	6	6	157369	157374	100 %	0 %	0 %	0 %	459284366
3035	NC_020450	A	6	6	157399	157404	100 %	0 %	0 %	0 %	459284366
3036	NC_020450	A	6	6	157414	157419	100 %	0 %	0 %	0 %	459284366
3037	NC_020450	A	6	6	157432	157437	100 %	0 %	0 %	0 %	459284366
3038	NC_020450	TCGTAA	2	12	157485	157496	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	459284366
3039	NC_020450	AAT	2	6	157696	157701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284367
3040	NC_020450	ATA	2	6	157712	157717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284367
3041	NC_020450	AATT	2	8	157758	157765	50 %	50 %	0 %	0 %	459284367
3042	NC_020450	GAA	2	6	157850	157855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284367
3043	NC_020450	GCT	2	6	157871	157876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284367
3044	NC_020450	ATTTT	2	10	157899	157908	20 %	80 %	0 %	0 %	459284367
3045	NC_020450	GTT	3	9	157925	157933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284367
3046	NC_020450	CTG	2	6	157941	157946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284367
3047	NC_020450	GAT	3	9	157984	157992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284367
3048	NC_020450	A	6	6	158093	158098	100 %	0 %	0 %	0 %	459284367
3049	NC_020450	CTG	2	6	158112	158117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284367
3050	NC_020450	TGA	2	6	158158	158163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284367
3051	NC_020450	CTT	2	6	158245	158250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284367
3052	NC_020450	TTA	2	6	158256	158261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284367
3053	NC_020450	ATG	2	6	158262	158267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284367
3054	NC_020450	TCACA	2	10	158293	158302	40 %	20 %	0 %	40 %	459284367
3055	NC_020450	AAT	2	6	158393	158398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284367
3056	NC_020450	CAC	2	6	158436	158441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459284367
3057	NC_020450	AAC	2	6	158479	158484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284367
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3059	NC_020450	CAA	2	6	158549	158554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284367
3060	NC_020450	AAAT	2	8	158578	158585	75 %	25 %	0 %	0 %	459284367
3061	NC_020450	CAA	2	6	158646	158651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284367
3062	NC_020450	ATA	2	6	158655	158660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284367
3063	NC_020450	ATG	2	6	158673	158678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284367
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3066	NC_020450	A	6	6	159080	159085	100 %	0 %	0 %	0 %	459284368
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3071	NC_020450	GAT	2	6	159345	159350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284368
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3088	NC_020450	CGA	2	6	160076	160081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284369
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3090	NC_020450	TCAA	2	8	160226	160233	50 %	25 %	0 %	25 %	459284369
3091	NC_020450	A	7	7	160236	160242	100 %	0 %	0 %	0 %	459284369
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3095	NC_020450	A	6	6	160386	160391	100 %	0 %	0 %	0 %	459284369
3096	NC_020450	ACA	2	6	160394	160399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284369
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3098	NC_020450	TGA	2	6	160478	160483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284369
3099	NC_020450	ATG	2	6	160558	160563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284369
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3103	NC_020450	AGA	2	6	160745	160750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284369
3104	NC_020450	GAAA	2	8	160770	160777	75 %	0 %	25 %	0 %	459284369
3105	NC_020450	AAT	2	6	161003	161008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284370
3106	NC_020450	AATTG	2	10	161033	161042	40 %	40 %	20 %	0 %	459284370
3107	NC_020450	GCTT	2	8	161081	161088	0 %	50 %	25 %	25 %	459284370
3108	NC_020450	TCAG	2	8	161105	161112	25 %	25 %	25 %	25 %	459284370
3109	NC_020450	ATTT	2	8	161133	161140	25 %	75 %	0 %	0 %	459284370
3110	NC_020450	TTG	2	6	161167	161172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284370
3111	NC_020450	GAT	2	6	161217	161222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284370
3112	NC_020450	A	7	7	161227	161233	100 %	0 %	0 %	0 %	459284370
3113	NC_020450	TCA	2	6	161272	161277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284370
3114	NC_020450	CTTTTT	2	12	161291	161302	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	459284370
3115	NC_020450	ATT	2	6	161322	161327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284370
3116	NC_020450	ACT	2	6	161366	161371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284370
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3118	NC_020450	TTTG	2	8	161508	161515	0 %	75 %	25 %	0 %	459284370
3119	NC_020450	CAA	2	6	161533	161538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284370
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3121	NC_020450	AGA	3	9	161609	161617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284370
3122	NC_020450	GCA	2	6	161664	161669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284370
3123	NC_020450	TGG	2	6	161676	161681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284370
3124	NC_020450	TTG	2	6	161704	161709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284370
3125	NC_020450	TTG	3	9	161713	161721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284370
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3132	NC_020450	AAAT	2	8	161927	161934	75 %	25 %	0 %	0 %	459284371
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3371	NC_020450	TGA	2	6	174530	174535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284386
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3492	NC_020450	ATCCA	2	10	180469	180478	40 %	20 %	0 %	40 %	459284391
3493	NC_020450	TTTTAT	2	12	180496	180507	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	459284391
3494	NC_020450	TTA	2	6	180556	180561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284391
3495	NC_020450	TAT	2	6	180583	180588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284391
3496	NC_020450	A	6	6	180700	180705	100 %	0 %	0 %	0 %	459284391
3497	NC_020450	GTTG	2	8	180727	180734	0 %	50 %	50 %	0 %	459284391
3498	NC_020450	AGA	2	6	180735	180740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284391
3499	NC_020450	A	6	6	180881	180886	100 %	0 %	0 %	0 %	459284392
3500	NC_020450	TCA	2	6	180961	180966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284392

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