MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1 DNA

Total Repeats: 46689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_020450	TCA	2	6	1544614	1544619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285628
30003	NC_020450	T	6	6	1544664	1544669	0 %	100 %	0 %	0 %	459285628
30004	NC_020450	CCA	2	6	1544670	1544675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459285628
30005	NC_020450	ATT	2	6	1544676	1544681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459285628
30006	NC_020450	CAT	2	6	1544682	1544687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285628
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30008	NC_020450	GCA	2	6	1544762	1544767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459285629
30009	NC_020450	AAGT	2	8	1544786	1544793	50 %	25 %	25 %	0 %	459285629
30010	NC_020450	TCT	2	6	1544813	1544818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459285629
30011	NC_020450	TTCC	2	8	1544856	1544863	0 %	50 %	0 %	50 %	459285629
30012	NC_020450	CTT	2	6	1544901	1544906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459285629
30013	NC_020450	ATA	2	6	1544917	1544922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459285629
30014	NC_020450	TTA	2	6	1544943	1544948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459285629
30015	NC_020450	CAT	2	6	1545072	1545077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285629
30016	NC_020450	T	6	6	1545100	1545105	0 %	100 %	0 %	0 %	459285629
30017	NC_020450	ATA	2	6	1545139	1545144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459285629
30018	NC_020450	TCA	2	6	1545236	1545241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285629
30019	NC_020450	ATT	2	6	1545293	1545298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459285629
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30021	NC_020450	CTG	2	6	1545318	1545323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459285629
30022	NC_020450	TTG	2	6	1545343	1545348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459285629
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30024	NC_020450	T	6	6	1545487	1545492	0 %	100 %	0 %	0 %	459285629
30025	NC_020450	TTCATT	2	12	1545529	1545540	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	459285629
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30029	NC_020450	T	6	6	1545739	1545744	0 %	100 %	0 %	0 %	459285630
30030	NC_020450	T	6	6	1545798	1545803	0 %	100 %	0 %	0 %	459285630
30031	NC_020450	ATTG	2	8	1545967	1545974	25 %	50 %	25 %	0 %	459285630
30032	NC_020450	TCATT	2	10	1545989	1545998	20 %	60 %	0 %	20 %	459285630
30033	NC_020450	ATT	2	6	1546029	1546034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459285630
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30040	NC_020450	TGA	2	6	1546172	1546177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459285630
30041	NC_020450	CTT	3	9	1546196	1546204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459285630
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30052	NC_020450	TTG	2	6	1546874	1546879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459285630
30053	NC_020450	T	6	6	1546937	1546942	0 %	100 %	0 %	0 %	459285630
30054	NC_020450	CCAA	2	8	1546956	1546963	50 %	0 %	0 %	50 %	459285630
30055	NC_020450	T	6	6	1546992	1546997	0 %	100 %	0 %	0 %	459285630
30056	NC_020450	TTA	2	6	1547008	1547013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459285630
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30105	NC_020450	TG	3	6	1549243	1549248	0 %	50 %	50 %	0 %	459285633
30106	NC_020450	CTT	3	9	1549295	1549303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459285633
30107	NC_020450	TGAC	2	8	1549320	1549327	25 %	25 %	25 %	25 %	459285633
30108	NC_020450	T	6	6	1549442	1549447	0 %	100 %	0 %	0 %	459285633
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30113	NC_020450	T	7	7	1549914	1549920	0 %	100 %	0 %	0 %	459285633
30114	NC_020450	T	7	7	1550011	1550017	0 %	100 %	0 %	0 %	459285633
30115	NC_020450	AAT	2	6	1550029	1550034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459285633
30116	NC_020450	CAG	2	6	1550039	1550044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459285633
30117	NC_020450	ATC	2	6	1550053	1550058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285633
30118	NC_020450	TAA	2	6	1550102	1550107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459285633
30119	NC_020450	AGAA	2	8	1550133	1550140	75 %	0 %	25 %	0 %	459285633
30120	NC_020450	AT	3	6	1550170	1550175	50 %	50 %	0 %	0 %	459285633
30121	NC_020450	ATT	3	9	1550325	1550333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459285633
30122	NC_020450	AGTA	2	8	1550355	1550362	50 %	25 %	25 %	0 %	459285633
30123	NC_020450	TCATT	2	10	1550393	1550402	20 %	60 %	0 %	20 %	459285633
30124	NC_020450	TTTCAC	2	12	1550412	1550423	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	459285633
30125	NC_020450	CTT	3	9	1550483	1550491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459285633
30126	NC_020450	CTT	2	6	1550510	1550515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459285633
30127	NC_020450	GATT	2	8	1550525	1550532	25 %	50 %	25 %	0 %	459285633
30128	NC_020450	TCA	2	6	1550566	1550571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285633
30129	NC_020450	CTT	2	6	1550591	1550596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459285633
30130	NC_020450	AAT	2	6	1550599	1550604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459285633
30131	NC_020450	ACT	2	6	1550617	1550622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285633
30132	NC_020450	CAT	2	6	1550723	1550728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285633
30133	NC_020450	TCA	2	6	1550771	1550776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285633
30134	NC_020450	GAT	2	6	1550825	1550830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459285633
30135	NC_020450	ACTCG	2	10	1550968	1550977	20 %	20 %	20 %	40 %	459285633
30136	NC_020450	TGA	2	6	1551172	1551177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459285633
30137	NC_020450	TCA	2	6	1551188	1551193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285633
30138	NC_020450	GATGT	2	10	1551200	1551209	20 %	40 %	40 %	0 %	459285633
30139	NC_020450	TGC	3	9	1551258	1551266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459285633
30140	NC_020450	CAG	2	6	1551272	1551277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459285633
30141	NC_020450	ATTTC	2	10	1551280	1551289	20 %	60 %	0 %	20 %	459285633
30142	NC_020450	CAC	2	6	1551349	1551354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459285633
30143	NC_020450	CTC	2	6	1551428	1551433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	459285633
30144	NC_020450	TCA	2	6	1551467	1551472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285633
30145	NC_020450	CAA	2	6	1551560	1551565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459285633
30146	NC_020450	ATC	2	6	1551603	1551608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285633
30147	NC_020450	GCT	2	6	1551655	1551660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459285633
30148	NC_020450	ACG	2	6	1551672	1551677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459285633
30149	NC_020450	AAT	2	6	1551708	1551713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459285633
30150	NC_020450	TCCA	2	8	1551720	1551727	25 %	25 %	0 %	50 %	459285633
30151	NC_020450	TCTT	2	8	1551751	1551758	0 %	75 %	0 %	25 %	459285633
30152	NC_020450	ATC	2	6	1551774	1551779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285633
30153	NC_020450	ATG	2	6	1551801	1551806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459285633
30154	NC_020450	TTC	2	6	1551807	1551812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459285633
30155	NC_020450	GA	3	6	1551848	1551853	50 %	0 %	50 %	0 %	459285633
30156	NC_020450	AAT	2	6	1551936	1551941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459285634
30157	NC_020450	CAT	2	6	1551961	1551966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285634
30158	NC_020450	T	6	6	1551998	1552003	0 %	100 %	0 %	0 %	459285634
30159	NC_020450	ATT	2	6	1552006	1552011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459285634
30160	NC_020450	TTCC	2	8	1552107	1552114	0 %	50 %	0 %	50 %	459285634
30161	NC_020450	TAA	2	6	1552193	1552198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459285634
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30169	NC_020450	TTA	2	6	1552608	1552613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459285634
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30172	NC_020450	CTTT	2	8	1552807	1552814	0 %	75 %	0 %	25 %	459285634
30173	NC_020450	GTCT	2	8	1552852	1552859	0 %	50 %	25 %	25 %	459285634
30174	NC_020450	AT	4	8	1552916	1552923	50 %	50 %	0 %	0 %	459285634
30175	NC_020450	T	7	7	1552930	1552936	0 %	100 %	0 %	0 %	459285634
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30178	NC_020450	AAAG	2	8	1553049	1553056	75 %	0 %	25 %	0 %	459285634
30179	NC_020450	TCA	2	6	1553066	1553071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285634
30180	NC_020450	AGT	2	6	1553083	1553088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459285634
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30182	NC_020450	TTC	2	6	1553140	1553145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459285634
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30185	NC_020450	GAT	2	6	1553477	1553482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459285635
30186	NC_020450	A	6	6	1553490	1553495	100 %	0 %	0 %	0 %	459285635
30187	NC_020450	TAAA	2	8	1553658	1553665	75 %	25 %	0 %	0 %	459285635
30188	NC_020450	TAT	2	6	1553698	1553703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459285635
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30190	NC_020450	GAT	2	6	1553819	1553824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459285635
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30198	NC_020450	AT	3	6	1554282	1554287	50 %	50 %	0 %	0 %	459285635
30199	NC_020450	ATT	2	6	1554290	1554295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459285635
30200	NC_020450	TGA	2	6	1554301	1554306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459285635
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30202	NC_020450	AAC	2	6	1554340	1554345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459285635
30203	NC_020450	GAA	2	6	1554372	1554377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459285635
30204	NC_020450	CAAT	2	8	1554441	1554448	50 %	25 %	0 %	25 %	459285635
30205	NC_020450	TTAA	2	8	1554449	1554456	50 %	50 %	0 %	0 %	459285635
30206	NC_020450	GAG	2	6	1554470	1554475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	459285635
30207	NC_020450	CCTT	2	8	1554549	1554556	0 %	50 %	0 %	50 %	459285636
30208	NC_020450	GAAT	2	8	1554575	1554582	50 %	25 %	25 %	0 %	459285636
30209	NC_020450	TGC	2	6	1554603	1554608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459285636
30210	NC_020450	TGG	2	6	1554619	1554624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459285636
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30213	NC_020450	CA	3	6	1554751	1554756	50 %	0 %	0 %	50 %	459285636
30214	NC_020450	AGA	2	6	1554774	1554779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459285636
30215	NC_020450	TGG	2	6	1554858	1554863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459285636
30216	NC_020450	CAA	2	6	1554943	1554948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459285636
30217	NC_020450	ATT	2	6	1554976	1554981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459285636
30218	NC_020450	CTG	2	6	1555031	1555036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459285636
30219	NC_020450	TGA	2	6	1555068	1555073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459285636
30220	NC_020450	TTC	2	6	1555077	1555082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459285636
30221	NC_020450	AGC	2	6	1555101	1555106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459285636
30222	NC_020450	CAG	2	6	1555190	1555195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459285636
30223	NC_020450	T	6	6	1555235	1555240	0 %	100 %	0 %	0 %	459285636
30224	NC_020450	CAT	2	6	1555258	1555263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285636
30225	NC_020450	CAA	2	6	1555267	1555272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459285636
30226	NC_020450	A	6	6	1555352	1555357	100 %	0 %	0 %	0 %	459285636
30227	NC_020450	ACAA	2	8	1555405	1555412	75 %	0 %	0 %	25 %	459285636
30228	NC_020450	TTC	2	6	1555523	1555528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459285636
30229	NC_020450	TGA	2	6	1555545	1555550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459285636
30230	NC_020450	TGC	2	6	1555596	1555601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459285636
30231	NC_020450	A	6	6	1555651	1555656	100 %	0 %	0 %	0 %	459285636
30232	NC_020450	CGT	2	6	1555693	1555698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459285636
30233	NC_020450	CTCA	2	8	1555735	1555742	25 %	25 %	0 %	50 %	459285636
30234	NC_020450	ATT	2	6	1555784	1555789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459285636
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30337	NC_020450	TGT	2	6	1561325	1561330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459285639
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30348	NC_020450	AT	3	6	1561888	1561893	50 %	50 %	0 %	0 %	459285640
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30461	NC_020450	TGA	2	6	1567871	1567876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459285646
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30463	NC_020450	AGC	2	6	1568032	1568037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459285646
30464	NC_020450	TTGCAT	2	12	1568110	1568121	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	459285646
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30466	NC_020450	T	6	6	1568184	1568189	0 %	100 %	0 %	0 %	459285646
30467	NC_020450	ATG	2	6	1568263	1568268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459285646
30468	NC_020450	AT	3	6	1568333	1568338	50 %	50 %	0 %	0 %	459285646
30469	NC_020450	CAG	2	6	1568451	1568456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459285646
30470	NC_020450	TAA	2	6	1568477	1568482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459285646
30471	NC_020450	CTT	2	6	1568589	1568594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459285646
30472	NC_020450	GCG	2	6	1568618	1568623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459285646
30473	NC_020450	GCA	2	6	1568624	1568629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459285646
30474	NC_020450	CCA	2	6	1568639	1568644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459285646
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30477	NC_020450	T	6	6	1568788	1568793	0 %	100 %	0 %	0 %	459285646
30478	NC_020450	CTG	2	6	1568817	1568822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459285646
30479	NC_020450	ATT	2	6	1568885	1568890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459285646
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30482	NC_020450	T	6	6	1568972	1568977	0 %	100 %	0 %	0 %	459285646
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30485	NC_020450	AATG	2	8	1569098	1569105	50 %	25 %	25 %	0 %	459285646
30486	NC_020450	GTT	2	6	1569213	1569218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459285646
30487	NC_020450	CAG	2	6	1569255	1569260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459285646
30488	NC_020450	TGT	2	6	1569265	1569270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459285646
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30490	NC_020450	CATC	2	8	1569288	1569295	25 %	25 %	0 %	50 %	459285646
30491	NC_020450	ATT	3	9	1569347	1569355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459285646
30492	NC_020450	CAA	2	6	1569585	1569590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459285647
30493	NC_020450	TGC	3	9	1569619	1569627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459285647
30494	NC_020450	ATCC	2	8	1569652	1569659	25 %	25 %	0 %	50 %	459285647
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30497	NC_020450	CAAG	2	8	1569822	1569829	50 %	0 %	25 %	25 %	459285647
30498	NC_020450	GT	3	6	1569902	1569907	0 %	50 %	50 %	0 %	459285647
30499	NC_020450	CCAA	2	8	1569912	1569919	50 %	0 %	0 %	50 %	459285647
30500	NC_020450	TTTTGG	2	12	1570027	1570038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459285647

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