MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1 DNA

Total Repeats: 46689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020450	TGGT	2	8	50427	50434	0 %	50 %	50 %	0 %	459284266
1002	NC_020450	T	6	6	50447	50452	0 %	100 %	0 %	0 %	459284266
1003	NC_020450	TTC	2	6	50535	50540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284266
1004	NC_020450	A	6	6	50572	50577	100 %	0 %	0 %	0 %	459284266
1005	NC_020450	A	6	6	50591	50596	100 %	0 %	0 %	0 %	459284266
1006	NC_020450	ATG	2	6	50607	50612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284266
1007	NC_020450	ATT	2	6	50649	50654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284266
1008	NC_020450	ACCATT	2	12	50658	50669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284266
1009	NC_020450	TGT	2	6	50759	50764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284266
1010	NC_020450	TTG	2	6	50794	50799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284266
1011	NC_020450	CAA	2	6	50818	50823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284266
1012	NC_020450	GGCTCA	2	12	50837	50848	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	459284266
1013	NC_020450	TGTT	2	8	50863	50870	0 %	75 %	25 %	0 %	459284266
1014	NC_020450	AAT	2	6	50877	50882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284266
1015	NC_020450	ATT	2	6	50907	50912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284266
1016	NC_020450	GAC	2	6	50915	50920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284266
1017	NC_020450	CT	3	6	50935	50940	0 %	50 %	0 %	50 %	459284266
1018	NC_020450	A	6	6	51030	51035	100 %	0 %	0 %	0 %	459284266
1019	NC_020450	GGTTC	2	10	51054	51063	0 %	40 %	40 %	20 %	459284266
1020	NC_020450	CTTTA	2	10	51089	51098	20 %	60 %	0 %	20 %	459284266
1021	NC_020450	TTTAGG	2	12	51110	51121	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	459284266
1022	NC_020450	ATTT	2	8	51144	51151	25 %	75 %	0 %	0 %	459284266
1023	NC_020450	GAT	3	9	51165	51173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284266
1024	NC_020450	GTAA	2	8	51245	51252	50 %	25 %	25 %	0 %	459284266
1025	NC_020450	T	6	6	51697	51702	0 %	100 %	0 %	0 %	459284267
1026	NC_020450	T	6	6	51712	51717	0 %	100 %	0 %	0 %	459284267
1027	NC_020450	AAC	2	6	51821	51826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284267
1028	NC_020450	CAA	2	6	51841	51846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284267
1029	NC_020450	AGC	2	6	51848	51853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284267
1030	NC_020450	CCA	2	6	51855	51860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459284267
1031	NC_020450	TCA	2	6	51874	51879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284267
1032	NC_020450	T	6	6	51902	51907	0 %	100 %	0 %	0 %	459284267
1033	NC_020450	CCA	2	6	51918	51923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459284267
1034	NC_020450	GTG	2	6	51930	51935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284267
1035	NC_020450	ATG	2	6	51948	51953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284267
1036	NC_020450	TTTC	2	8	51964	51971	0 %	75 %	0 %	25 %	459284267
1037	NC_020450	TAC	2	6	52034	52039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284267
1038	NC_020450	CTT	2	6	52126	52131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284267
1039	NC_020450	TTC	2	6	52154	52159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284267
1040	NC_020450	TAA	2	6	52218	52223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284267
1041	NC_020450	GAT	2	6	52249	52254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284267
1042	NC_020450	CGG	2	6	52378	52383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459284267
1043	NC_020450	T	6	6	52433	52438	0 %	100 %	0 %	0 %	459284267
1044	NC_020450	CAG	2	6	52441	52446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284267
1045	NC_020450	T	7	7	52472	52478	0 %	100 %	0 %	0 %	459284267
1046	NC_020450	GCA	2	6	52488	52493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284267
1047	NC_020450	ATC	2	6	52499	52504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284267
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1049	NC_020450	CAA	2	6	52531	52536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284267
1050	NC_020450	TTCT	2	8	52616	52623	0 %	75 %	0 %	25 %	459284267
1051	NC_020450	TCC	2	6	52667	52672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	459284267
1052	NC_020450	ATT	2	6	52798	52803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284268
1053	NC_020450	AGAA	2	8	52853	52860	75 %	0 %	25 %	0 %	459284268
1054	NC_020450	TGC	2	6	52892	52897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284268
1055	NC_020450	AGA	2	6	52913	52918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284268
1056	NC_020450	TCAT	2	8	52944	52951	25 %	50 %	0 %	25 %	459284268
1057	NC_020450	GTT	3	9	53067	53075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284268
1058	NC_020450	AG	3	6	53087	53092	50 %	0 %	50 %	0 %	459284268
1059	NC_020450	TCTG	2	8	53093	53100	0 %	50 %	25 %	25 %	459284268
1060	NC_020450	CACG	2	8	53119	53126	25 %	0 %	25 %	50 %	459284268
1061	NC_020450	GTTG	2	8	53141	53148	0 %	50 %	50 %	0 %	459284268
1062	NC_020450	TCA	2	6	53166	53171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284268
1063	NC_020450	ATA	2	6	53207	53212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284268
1064	NC_020450	ATA	2	6	53255	53260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284268
1065	NC_020450	AAT	2	6	53284	53289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284268
1066	NC_020450	TCA	2	6	53322	53327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284268
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1069	NC_020450	CAA	2	6	53410	53415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284268
1070	NC_020450	A	6	6	53440	53445	100 %	0 %	0 %	0 %	459284268
1071	NC_020450	TCAA	2	8	53448	53455	50 %	25 %	0 %	25 %	459284268
1072	NC_020450	AGA	2	6	53474	53479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284268
1073	NC_020450	AGC	2	6	53480	53485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284268
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1075	NC_020450	T	7	7	53509	53515	0 %	100 %	0 %	0 %	459284268
1076	NC_020450	T	6	6	53531	53536	0 %	100 %	0 %	0 %	459284268
1077	NC_020450	ATC	2	6	53792	53797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284269
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1081	NC_020450	CAT	2	6	54002	54007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284269
1082	NC_020450	TTC	2	6	54068	54073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284269
1083	NC_020450	TAT	2	6	54115	54120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284269
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1085	NC_020450	AGAAT	2	10	54162	54171	60 %	20 %	20 %	0 %	459284269
1086	NC_020450	TAT	2	6	54193	54198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284269
1087	NC_020450	CAT	2	6	54271	54276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284269
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1090	NC_020450	ATGA	2	8	54354	54361	50 %	25 %	25 %	0 %	459284269
1091	NC_020450	CAA	2	6	54454	54459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284269
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1095	NC_020450	AGA	2	6	54644	54649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284269
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1100	NC_020450	AAG	2	6	54878	54883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284269
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1105	NC_020450	T	7	7	55077	55083	0 %	100 %	0 %	0 %	459284269
1106	NC_020450	CAT	2	6	55115	55120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284269
1107	NC_020450	GTG	2	6	55132	55137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284269
1108	NC_020450	TCGTAA	2	12	55146	55157	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	459284269
1109	NC_020450	GAA	2	6	55168	55173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284269
1110	NC_020450	CGTT	2	8	55182	55189	0 %	50 %	25 %	25 %	459284269
1111	NC_020450	TGT	2	6	55211	55216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284269
1112	NC_020450	T	6	6	56498	56503	0 %	100 %	0 %	0 %	459284270
1113	NC_020450	T	6	6	56507	56512	0 %	100 %	0 %	0 %	459284270
1114	NC_020450	TGCT	2	8	56517	56524	0 %	50 %	25 %	25 %	459284270
1115	NC_020450	TTC	2	6	56607	56612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284270
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1118	NC_020450	AATCA	2	10	56709	56718	60 %	20 %	0 %	20 %	459284270
1119	NC_020450	T	6	6	56724	56729	0 %	100 %	0 %	0 %	459284270
1120	NC_020450	TCTTTG	2	12	56734	56745	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	459284270
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1256	NC_020450	GGT	2	6	63672	63677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284279
1257	NC_020450	ATT	2	6	63736	63741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284279
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1285	NC_020450	TC	3	6	65628	65633	0 %	50 %	0 %	50 %	459284280
1286	NC_020450	GA	3	6	65652	65657	50 %	0 %	50 %	0 %	459284280
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1374	NC_020450	AACC	2	8	69811	69818	50 %	0 %	0 %	50 %	459284284
1375	NC_020450	TGGACG	2	12	69826	69837	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	459284284
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