MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1 DNA

Total Repeats: 46689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020450	TGC	2	6	285366	285371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284490
5502	NC_020450	ATA	2	6	285409	285414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284490
5503	NC_020450	TTGT	2	8	285448	285455	0 %	75 %	25 %	0 %	459284490
5504	NC_020450	CAAG	2	8	285842	285849	50 %	0 %	25 %	25 %	459284491
5505	NC_020450	AAG	2	6	285853	285858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284491
5506	NC_020450	GGT	2	6	285963	285968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284491
5507	NC_020450	CGT	2	6	285969	285974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284491
5508	NC_020450	TAC	2	6	285978	285983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284491
5509	NC_020450	ATT	2	6	286050	286055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284491
5510	NC_020450	A	6	6	286074	286079	100 %	0 %	0 %	0 %	459284491
5511	NC_020450	TAA	2	6	286088	286093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284491
5512	NC_020450	ATCA	2	8	286400	286407	50 %	25 %	0 %	25 %	459284492
5513	NC_020450	TTTA	2	8	286449	286456	25 %	75 %	0 %	0 %	459284492
5514	NC_020450	TCA	2	6	286512	286517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284492
5515	NC_020450	TCA	2	6	286532	286537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284492
5516	NC_020450	GTT	2	6	286578	286583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284492
5517	NC_020450	GGGATA	2	12	286587	286598	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	459284492
5518	NC_020450	A	7	7	286677	286683	100 %	0 %	0 %	0 %	459284492
5519	NC_020450	TTG	2	6	286732	286737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284492
5520	NC_020450	CA	3	6	286757	286762	50 %	0 %	0 %	50 %	459284492
5521	NC_020450	TGA	3	9	286774	286782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284492
5522	NC_020450	GTT	2	6	286830	286835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284492
5523	NC_020450	TGG	2	6	286863	286868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284492
5524	NC_020450	A	7	7	287029	287035	100 %	0 %	0 %	0 %	459284492
5525	NC_020450	TCAAA	2	10	287036	287045	60 %	20 %	0 %	20 %	459284492
5526	NC_020450	TGA	2	6	287051	287056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284492
5527	NC_020450	TGA	2	6	287063	287068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284492
5528	NC_020450	CAA	2	6	287191	287196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284492
5529	NC_020450	TGG	2	6	287216	287221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284492
5530	NC_020450	GGT	2	6	287274	287279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284492
5531	NC_020450	TGGTA	2	10	287303	287312	20 %	40 %	40 %	0 %	459284492
5532	NC_020450	TGA	2	6	287363	287368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284492
5533	NC_020450	ATG	2	6	287434	287439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284492
5534	NC_020450	TGG	2	6	287582	287587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284492
5535	NC_020450	GAA	2	6	287621	287626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284492
5536	NC_020450	TTC	2	6	287641	287646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284492
5537	NC_020450	TTCTC	2	10	287656	287665	0 %	60 %	0 %	40 %	459284492
5538	NC_020450	TGA	2	6	287711	287716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284492
5539	NC_020450	TGC	2	6	287729	287734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284492
5540	NC_020450	TTA	2	6	287758	287763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284492
5541	NC_020450	GAA	2	6	287796	287801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284492
5542	NC_020450	GGT	2	6	287820	287825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284492
5543	NC_020450	A	6	6	287861	287866	100 %	0 %	0 %	0 %	459284492
5544	NC_020450	AAG	2	6	287932	287937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284492
5545	NC_020450	ATT	3	9	287970	287978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284492
5546	NC_020450	TCA	2	6	287991	287996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284492
5547	NC_020450	ATA	2	6	288010	288015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284492
5548	NC_020450	TTG	2	6	288040	288045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284492
5549	NC_020450	AC	3	6	288103	288108	50 %	0 %	0 %	50 %	459284492
5550	NC_020450	AGG	2	6	288118	288123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	459284492
5551	NC_020450	CAA	2	6	288148	288153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284493
5552	NC_020450	A	8	8	288152	288159	100 %	0 %	0 %	0 %	459284493
5553	NC_020450	T	8	8	288185	288192	0 %	100 %	0 %	0 %	459284493
5554	NC_020450	A	6	6	288204	288209	100 %	0 %	0 %	0 %	459284493
5555	NC_020450	TCA	2	6	288241	288246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284493
5556	NC_020450	TGC	2	6	288248	288253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284493
5557	NC_020450	TCA	2	6	288335	288340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284493
5558	NC_020450	TGA	2	6	288347	288352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284493
5559	NC_020450	CAA	2	6	288393	288398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284493
5560	NC_020450	ACT	2	6	288495	288500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284493
5561	NC_020450	GCA	2	6	288534	288539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284493
5562	NC_020450	TTGC	2	8	288573	288580	0 %	50 %	25 %	25 %	459284493
5563	NC_020450	GT	3	6	288598	288603	0 %	50 %	50 %	0 %	459284493
5564	NC_020450	CTC	2	6	288621	288626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	459284493
5565	NC_020450	CAA	2	6	288649	288654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284493
5566	NC_020450	GTTT	2	8	288670	288677	0 %	75 %	25 %	0 %	459284493
5567	NC_020450	TCA	2	6	288716	288721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284493
5568	NC_020450	GTT	2	6	288798	288803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284493
5569	NC_020450	TGC	2	6	288809	288814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284493
5570	NC_020450	CAA	2	6	288845	288850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284493
5571	NC_020450	GGC	2	6	288878	288883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459284493
5572	NC_020450	CTG	2	6	288904	288909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284493
5573	NC_020450	A	6	6	288930	288935	100 %	0 %	0 %	0 %	459284493
5574	NC_020450	ACAA	2	8	288943	288950	75 %	0 %	0 %	25 %	459284493
5575	NC_020450	AAG	3	9	288952	288960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284493
5576	NC_020450	A	6	6	288988	288993	100 %	0 %	0 %	0 %	459284493
5577	NC_020450	AAG	2	6	289030	289035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284493
5578	NC_020450	A	6	6	289074	289079	100 %	0 %	0 %	0 %	459284493
5579	NC_020450	TGC	2	6	289088	289093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284493
5580	NC_020450	TGA	2	6	289123	289128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284493
5581	NC_020450	TGG	2	6	289166	289171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284493
5582	NC_020450	GAT	2	6	289191	289196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284493
5583	NC_020450	TAC	2	6	289257	289262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284493
5584	NC_020450	TCA	2	6	289281	289286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284493
5585	NC_020450	TCAACT	2	12	289295	289306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284493
5586	NC_020450	TGA	2	6	289343	289348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284493
5587	NC_020450	AGA	2	6	289352	289357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284493
5588	NC_020450	A	6	6	289455	289460	100 %	0 %	0 %	0 %	459284493
5589	NC_020450	A	6	6	289476	289481	100 %	0 %	0 %	0 %	459284493
5590	NC_020450	ACA	2	6	289524	289529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284493
5591	NC_020450	TGA	2	6	289540	289545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284493
5592	NC_020450	TGG	2	6	289565	289570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284493
5593	NC_020450	ATA	2	6	289681	289686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284493
5594	NC_020450	AAG	2	6	289714	289719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284493
5595	NC_020450	GAT	2	6	289800	289805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284493
5596	NC_020450	TCT	2	6	289813	289818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284493
5597	NC_020450	ACA	2	6	289832	289837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284493
5598	NC_020450	AAC	2	6	289921	289926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284493
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5600	NC_020450	TTG	2	6	290017	290022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284493
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5602	NC_020450	CAAT	2	8	290105	290112	50 %	25 %	0 %	25 %	459284493
5603	NC_020450	ATA	2	6	290298	290303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284494
5604	NC_020450	A	7	7	290306	290312	100 %	0 %	0 %	0 %	459284494
5605	NC_020450	TAAT	2	8	290316	290323	50 %	50 %	0 %	0 %	459284494
5606	NC_020450	A	6	6	290365	290370	100 %	0 %	0 %	0 %	459284494
5607	NC_020450	AGT	2	6	290374	290379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284494
5608	NC_020450	TGT	2	6	290413	290418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284494
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5610	NC_020450	GAC	2	6	290514	290519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284494
5611	NC_020450	TGAT	2	8	290523	290530	25 %	50 %	25 %	0 %	459284494
5612	NC_020450	GTT	2	6	290540	290545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284494
5613	NC_020450	CCTT	2	8	290554	290561	0 %	50 %	0 %	50 %	459284494
5614	NC_020450	CTT	2	6	290586	290591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284494
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5617	NC_020450	AAG	2	6	290714	290719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284494
5618	NC_020450	AAG	4	12	290724	290735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284494
5619	NC_020450	AAC	2	6	290773	290778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284494
5620	NC_020450	TGT	2	6	290791	290796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284494
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5622	NC_020450	TGC	2	6	290866	290871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284494
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5994	NC_020450	GTT	2	6	307992	307997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284511
5995	NC_020450	TAA	2	6	308036	308041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284511
5996	NC_020450	AAG	2	6	308110	308115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284511
5997	NC_020450	ACA	2	6	308139	308144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284511
5998	NC_020450	AGAAC	2	10	308178	308187	60 %	0 %	20 %	20 %	459284511
5999	NC_020450	GAA	2	6	308211	308216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284511
6000	NC_020450	ATT	2	6	308230	308235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284511

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