MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1 DNA

Total Repeats: 46689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020450	AAT	2	6	259288	259293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284463
5002	NC_020450	TCAC	2	8	259431	259438	25 %	25 %	0 %	50 %	459284464
5003	NC_020450	TGG	2	6	259496	259501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284464
5004	NC_020450	TTTC	2	8	259505	259512	0 %	75 %	0 %	25 %	459284464
5005	NC_020450	ATC	2	6	259597	259602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284464
5006	NC_020450	TGG	2	6	259667	259672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284464
5007	NC_020450	TGAT	2	8	259693	259700	25 %	50 %	25 %	0 %	459284464
5008	NC_020450	AAG	2	6	259701	259706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284464
5009	NC_020450	ATT	2	6	259714	259719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284464
5010	NC_020450	A	6	6	259772	259777	100 %	0 %	0 %	0 %	459284464
5011	NC_020450	AAAAG	2	10	260110	260119	80 %	0 %	20 %	0 %	459284465
5012	NC_020450	ATT	2	6	260145	260150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284465
5013	NC_020450	GTCA	2	8	260204	260211	25 %	25 %	25 %	25 %	459284465
5014	NC_020450	A	6	6	260297	260302	100 %	0 %	0 %	0 %	459284465
5015	NC_020450	GCT	2	6	260373	260378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284465
5016	NC_020450	ATG	2	6	260380	260385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284465
5017	NC_020450	GCA	2	6	260397	260402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284465
5018	NC_020450	ATA	2	6	260407	260412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284465
5019	NC_020450	AT	3	6	260417	260422	50 %	50 %	0 %	0 %	459284465
5020	NC_020450	GAA	2	6	260472	260477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284465
5021	NC_020450	CTG	2	6	260589	260594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284465
5022	NC_020450	TGA	2	6	260615	260620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284465
5023	NC_020450	TGA	2	6	260648	260653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284465
5024	NC_020450	ATG	2	6	260692	260697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284465
5025	NC_020450	A	6	6	260836	260841	100 %	0 %	0 %	0 %	459284465
5026	NC_020450	TGA	2	6	260842	260847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284465
5027	NC_020450	CAAA	2	8	260892	260899	75 %	0 %	0 %	25 %	459284465
5028	NC_020450	T	6	6	261041	261046	0 %	100 %	0 %	0 %	459284465
5029	NC_020450	A	6	6	261061	261066	100 %	0 %	0 %	0 %	459284465
5030	NC_020450	AAG	2	6	261103	261108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284465
5031	NC_020450	AGA	2	6	261113	261118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284465
5032	NC_020450	TCA	2	6	261122	261127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284465
5033	NC_020450	A	7	7	261147	261153	100 %	0 %	0 %	0 %	459284465
5034	NC_020450	AAT	2	6	261160	261165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284465
5035	NC_020450	ATT	4	12	261189	261200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284466
5036	NC_020450	AGC	2	6	261226	261231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284466
5037	NC_020450	TCA	2	6	261236	261241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284466
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5039	NC_020450	ATTG	2	8	261361	261368	25 %	50 %	25 %	0 %	459284466
5040	NC_020450	ATT	2	6	262069	262074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284467
5041	NC_020450	AAC	2	6	262097	262102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284467
5042	NC_020450	GTG	2	6	262105	262110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284467
5043	NC_020450	GTTT	2	8	262119	262126	0 %	75 %	25 %	0 %	459284467
5044	NC_020450	TTC	2	6	262187	262192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284467
5045	NC_020450	AATCA	2	10	262241	262250	60 %	20 %	0 %	20 %	459284467
5046	NC_020450	TTTTC	2	10	262309	262318	0 %	80 %	0 %	20 %	459284467
5047	NC_020450	TCT	2	6	262353	262358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284467
5048	NC_020450	GAA	2	6	262378	262383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284467
5049	NC_020450	CAG	2	6	262465	262470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284467
5050	NC_020450	TGAA	2	8	262497	262504	50 %	25 %	25 %	0 %	459284467
5051	NC_020450	TGA	2	6	262600	262605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284467
5052	NC_020450	TTG	2	6	262628	262633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284467
5053	NC_020450	CCA	2	6	262635	262640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459284467
5054	NC_020450	TGT	2	6	262657	262662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284467
5055	NC_020450	ATAA	2	8	262673	262680	75 %	25 %	0 %	0 %	459284467
5056	NC_020450	TGA	2	6	262751	262756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284467
5057	NC_020450	TTG	2	6	263024	263029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284467
5058	NC_020450	AAT	2	6	263063	263068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284467
5059	NC_020450	ATG	2	6	263097	263102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284467
5060	NC_020450	AGAA	2	8	263162	263169	75 %	0 %	25 %	0 %	459284467
5061	NC_020450	CAG	2	6	263215	263220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284467
5062	NC_020450	GAG	2	6	263278	263283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	459284467
5063	NC_020450	CAA	2	6	263290	263295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284467
5064	NC_020450	TGAG	2	8	263315	263322	25 %	25 %	50 %	0 %	459284467
5065	NC_020450	GAA	2	6	263330	263335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284467
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5067	NC_020450	GGAAT	2	10	263488	263497	40 %	20 %	40 %	0 %	459284467
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5069	NC_020450	GTGA	2	8	263522	263529	25 %	25 %	50 %	0 %	459284467
5070	NC_020450	TAA	2	6	263600	263605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284467
5071	NC_020450	TCT	2	6	263610	263615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284467
5072	NC_020450	ATG	2	6	263637	263642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284467
5073	NC_020450	TCA	2	6	263721	263726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284467
5074	NC_020450	TTTTA	2	10	263729	263738	20 %	80 %	0 %	0 %	459284467
5075	NC_020450	TCA	2	6	263977	263982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284468
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5078	NC_020450	TAG	2	6	264062	264067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284468
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5087	NC_020450	ATT	2	6	264368	264373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284469
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5089	NC_020450	TCA	2	6	264489	264494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284470
5090	NC_020450	A	8	8	264558	264565	100 %	0 %	0 %	0 %	459284470
5091	NC_020450	TGA	2	6	264580	264585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284470
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5093	NC_020450	TAAA	2	8	264721	264728	75 %	25 %	0 %	0 %	459284470
5094	NC_020450	TTG	2	6	264733	264738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284470
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5101	NC_020450	A	7	7	265194	265200	100 %	0 %	0 %	0 %	459284471
5102	NC_020450	TCG	2	6	265209	265214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284471
5103	NC_020450	TTGAAC	2	12	265235	265246	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	459284471
5104	NC_020450	CAGA	2	8	265277	265284	50 %	0 %	25 %	25 %	459284471
5105	NC_020450	TTG	2	6	265292	265297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284471
5106	NC_020450	TTGC	2	8	265300	265307	0 %	50 %	25 %	25 %	459284471
5107	NC_020450	TC	3	6	265349	265354	0 %	50 %	0 %	50 %	459284471
5108	NC_020450	ATG	2	6	265379	265384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284471
5109	NC_020450	AATC	2	8	265443	265450	50 %	25 %	0 %	25 %	459284471
5110	NC_020450	ACA	2	6	265506	265511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284471
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5112	NC_020450	TGA	2	6	265547	265552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284471
5113	NC_020450	A	6	6	265563	265568	100 %	0 %	0 %	0 %	459284471
5114	NC_020450	CGT	2	6	265588	265593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284471
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5118	NC_020450	TC	3	6	265724	265729	0 %	50 %	0 %	50 %	459284472
5119	NC_020450	GAA	2	6	265737	265742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284472
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5121	NC_020450	A	6	6	265755	265760	100 %	0 %	0 %	0 %	459284472
5122	NC_020450	GAA	2	6	265821	265826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284472
5123	NC_020450	ATT	2	6	265879	265884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284472
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5127	NC_020450	T	6	6	266003	266008	0 %	100 %	0 %	0 %	459284472
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5131	NC_020450	TGA	2	6	266221	266226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284473
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5240	NC_020450	ATC	2	6	271114	271119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284477
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5367	NC_020450	AGTT	2	8	277736	277743	25 %	50 %	25 %	0 %	459284484
5368	NC_020450	GTG	2	6	277844	277849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284484
5369	NC_020450	TTG	2	6	277853	277858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284484
5370	NC_020450	A	6	6	277888	277893	100 %	0 %	0 %	0 %	459284484
5371	NC_020450	ATT	2	6	278032	278037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284484
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5373	NC_020450	TAA	2	6	278142	278147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284484
5374	NC_020450	GTC	2	6	278470	278475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284484
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5385	NC_020450	CAAAC	2	10	279144	279153	60 %	0 %	0 %	40 %	459284486
5386	NC_020450	AGC	2	6	279167	279172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284486
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5390	NC_020450	TGACA	2	10	279254	279263	40 %	20 %	20 %	20 %	459284486
5391	NC_020450	TGA	2	6	279272	279277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284486
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5394	NC_020450	TGA	2	6	279404	279409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284486
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5398	NC_020450	GAA	2	6	279829	279834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284487
5399	NC_020450	GTT	2	6	279838	279843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284487
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5470	NC_020450	TTG	2	6	283787	283792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284489
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5473	NC_020450	T	6	6	283963	283968	0 %	100 %	0 %	0 %	459284489
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5479	NC_020450	TGTC	2	8	284217	284224	0 %	50 %	25 %	25 %	459284490
5480	NC_020450	AAAT	2	8	284309	284316	75 %	25 %	0 %	0 %	459284490
5481	NC_020450	ACT	2	6	284337	284342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284490
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5483	NC_020450	TGA	2	6	284465	284470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284490
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5485	NC_020450	GCA	2	6	284602	284607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284490
5486	NC_020450	GACATC	2	12	284619	284630	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	459284490
5487	NC_020450	TTC	2	6	284814	284819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284490
5488	NC_020450	TCA	2	6	284830	284835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284490
5489	NC_020450	AG	3	6	284844	284849	50 %	0 %	50 %	0 %	459284490
5490	NC_020450	ACT	2	6	284946	284951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284490
5491	NC_020450	AG	3	6	284994	284999	50 %	0 %	50 %	0 %	459284490
5492	NC_020450	TGC	2	6	285012	285017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284490
5493	NC_020450	T	7	7	285038	285044	0 %	100 %	0 %	0 %	459284490
5494	NC_020450	CAA	2	6	285101	285106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284490
5495	NC_020450	CTT	3	9	285128	285136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284490
5496	NC_020450	AGAA	2	8	285141	285148	75 %	0 %	25 %	0 %	459284490
5497	NC_020450	GATT	2	8	285219	285226	25 %	50 %	25 %	0 %	459284490
5498	NC_020450	CTG	2	6	285260	285265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284490
5499	NC_020450	ATA	2	6	285310	285315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284490
5500	NC_020450	GTT	2	6	285324	285329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284490

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