MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1 DNA

Total Repeats: 46689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_020450	GTTTG	2	10	232246	232255	0 %	60 %	40 %	0 %	459284440
4502	NC_020450	ATG	2	6	232279	232284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284440
4503	NC_020450	CA	3	6	232320	232325	50 %	0 %	0 %	50 %	459284440
4504	NC_020450	CAG	2	6	232352	232357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284440
4505	NC_020450	GTTCGA	2	12	232393	232404	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	459284440
4506	NC_020450	TGA	2	6	232434	232439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284440
4507	NC_020450	TGA	2	6	232563	232568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284440
4508	NC_020450	AGC	2	6	232608	232613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284440
4509	NC_020450	ATT	2	6	232630	232635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284440
4510	NC_020450	G	6	6	232636	232641	0 %	0 %	100 %	0 %	459284440
4511	NC_020450	CAA	2	6	232658	232663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284440
4512	NC_020450	CAA	2	6	232777	232782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284440
4513	NC_020450	T	6	6	232793	232798	0 %	100 %	0 %	0 %	459284440
4514	NC_020450	GAA	2	6	232849	232854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284440
4515	NC_020450	GCT	2	6	232882	232887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284440
4516	NC_020450	TCGT	2	8	232892	232899	0 %	50 %	25 %	25 %	459284440
4517	NC_020450	TGG	2	6	232950	232955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284440
4518	NC_020450	GACA	2	8	233050	233057	50 %	0 %	25 %	25 %	459284440
4519	NC_020450	ATAAAA	2	12	233090	233101	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	459284440
4520	NC_020450	GAT	3	9	233254	233262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284440
4521	NC_020450	AGG	2	6	233304	233309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	459284440
4522	NC_020450	TGA	2	6	233310	233315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284440
4523	NC_020450	ATG	2	6	233319	233324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284440
4524	NC_020450	TTTC	2	8	233393	233400	0 %	75 %	0 %	25 %	459284441
4525	NC_020450	ATT	2	6	233406	233411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284441
4526	NC_020450	AT	3	6	233423	233428	50 %	50 %	0 %	0 %	459284441
4527	NC_020450	T	6	6	233452	233457	0 %	100 %	0 %	0 %	459284441
4528	NC_020450	GTCA	2	8	233477	233484	25 %	25 %	25 %	25 %	459284441
4529	NC_020450	A	6	6	233558	233563	100 %	0 %	0 %	0 %	459284441
4530	NC_020450	CAA	2	6	233658	233663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284441
4531	NC_020450	CGT	2	6	233706	233711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284441
4532	NC_020450	A	6	6	233730	233735	100 %	0 %	0 %	0 %	459284441
4533	NC_020450	ATA	2	6	233803	233808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284441
4534	NC_020450	TTG	2	6	233863	233868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284441
4535	NC_020450	TATT	2	8	233873	233880	25 %	75 %	0 %	0 %	459284441
4536	NC_020450	TTG	2	6	233911	233916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284441
4537	NC_020450	TTG	2	6	233956	233961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284441
4538	NC_020450	AAC	2	6	233989	233994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284441
4539	NC_020450	A	7	7	233995	234001	100 %	0 %	0 %	0 %	459284441
4540	NC_020450	ATT	2	6	234008	234013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284441
4541	NC_020450	GAA	2	6	234027	234032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284441
4542	NC_020450	AAT	2	6	234180	234185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284441
4543	NC_020450	TGG	2	6	234212	234217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459284441
4544	NC_020450	CAAT	2	8	234278	234285	50 %	25 %	0 %	25 %	459284441
4545	NC_020450	CGAA	2	8	234350	234357	50 %	0 %	25 %	25 %	459284441
4546	NC_020450	TGAC	2	8	234385	234392	25 %	25 %	25 %	25 %	459284441
4547	NC_020450	A	7	7	234431	234437	100 %	0 %	0 %	0 %	459284441
4548	NC_020450	TCA	2	6	234475	234480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284441
4549	NC_020450	AATC	2	8	234513	234520	50 %	25 %	0 %	25 %	459284441
4550	NC_020450	ACA	2	6	234597	234602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284441
4551	NC_020450	GTT	2	6	234731	234736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284441
4552	NC_020450	GTC	2	6	234769	234774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459284441
4553	NC_020450	AAG	3	9	234787	234795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284441
4554	NC_020450	AGC	2	6	234803	234808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284441
4555	NC_020450	TGA	2	6	234824	234829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284441
4556	NC_020450	CAC	2	6	234836	234841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459284441
4557	NC_020450	TGAA	2	8	234868	234875	50 %	25 %	25 %	0 %	459284441
4558	NC_020450	GCAA	2	8	234879	234886	50 %	0 %	25 %	25 %	459284441
4559	NC_020450	TTA	2	6	234909	234914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284441
4560	NC_020450	GGAC	2	8	235032	235039	25 %	0 %	50 %	25 %	459284441
4561	NC_020450	CTA	2	6	235066	235071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284441
4562	NC_020450	GAG	2	6	235352	235357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	459284442
4563	NC_020450	T	6	6	235358	235363	0 %	100 %	0 %	0 %	459284442
4564	NC_020450	A	7	7	235376	235382	100 %	0 %	0 %	0 %	459284442
4565	NC_020450	AAT	2	6	235402	235407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284442
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4567	NC_020450	AGCAG	2	10	235438	235447	40 %	0 %	40 %	20 %	459284442
4568	NC_020450	TAGC	2	8	235452	235459	25 %	25 %	25 %	25 %	459284442
4569	NC_020450	ACC	2	6	235476	235481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459284442
4570	NC_020450	TGA	2	6	235486	235491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284442
4571	NC_020450	TTGG	2	8	235496	235503	0 %	50 %	50 %	0 %	459284442
4572	NC_020450	CATT	2	8	235540	235547	25 %	50 %	0 %	25 %	459284442
4573	NC_020450	CGG	2	6	235560	235565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459284442
4574	NC_020450	TTG	2	6	235569	235574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284442
4575	NC_020450	CTTG	2	8	235606	235613	0 %	50 %	25 %	25 %	459284442
4576	NC_020450	ATG	3	9	235631	235639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284442
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4578	NC_020450	GTT	3	9	235706	235714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284442
4579	NC_020450	ACA	2	6	235805	235810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284442
4580	NC_020450	ATG	2	6	235851	235856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284442
4581	NC_020450	AAT	2	6	235871	235876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284442
4582	NC_020450	A	6	6	235937	235942	100 %	0 %	0 %	0 %	459284442
4583	NC_020450	TAT	3	9	235986	235994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284443
4584	NC_020450	TAA	2	6	236068	236073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284443
4585	NC_020450	TTGA	2	8	236153	236160	25 %	50 %	25 %	0 %	459284443
4586	NC_020450	TCA	2	6	236208	236213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284443
4587	NC_020450	TTG	2	6	236246	236251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284443
4588	NC_020450	TGA	2	6	236266	236271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284443
4589	NC_020450	AGC	2	6	236315	236320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284443
4590	NC_020450	AGC	2	6	236330	236335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284443
4591	NC_020450	AGA	2	6	236361	236366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284443
4592	NC_020450	TTG	2	6	236404	236409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284443
4593	NC_020450	CTT	2	6	236428	236433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284443
4594	NC_020450	T	6	6	236594	236599	0 %	100 %	0 %	0 %	459284443
4595	NC_020450	GAA	2	6	236645	236650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284443
4596	NC_020450	T	7	7	236655	236661	0 %	100 %	0 %	0 %	459284443
4597	NC_020450	T	6	6	236730	236735	0 %	100 %	0 %	0 %	459284443
4598	NC_020450	CATAGT	2	12	236758	236769	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	459284443
4599	NC_020450	ACT	2	6	236793	236798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284443
4600	NC_020450	ATC	2	6	236810	236815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284443
4601	NC_020450	TAA	2	6	236818	236823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459284443
4602	NC_020450	TTG	2	6	236962	236967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284443
4603	NC_020450	T	6	6	237000	237005	0 %	100 %	0 %	0 %	459284443
4604	NC_020450	AGAA	2	8	237390	237397	75 %	0 %	25 %	0 %	459284444
4605	NC_020450	AGTG	2	8	237427	237434	25 %	25 %	50 %	0 %	459284444
4606	NC_020450	TCA	2	6	237493	237498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284444
4607	NC_020450	AGA	2	6	237516	237521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284444
4608	NC_020450	TCT	2	6	237541	237546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284444
4609	NC_020450	ATGCT	2	10	237646	237655	20 %	40 %	20 %	20 %	459284444
4610	NC_020450	GT	3	6	237661	237666	0 %	50 %	50 %	0 %	459284444
4611	NC_020450	AACG	2	8	237707	237714	50 %	0 %	25 %	25 %	459284444
4612	NC_020450	TG	3	6	237789	237794	0 %	50 %	50 %	0 %	459284444
4613	NC_020450	CAT	2	6	238073	238078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459284445
4614	NC_020450	AAG	2	6	238084	238089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284445
4615	NC_020450	AAG	2	6	238105	238110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284445
4616	NC_020450	CCA	2	6	238125	238130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459284445
4617	NC_020450	AAG	2	6	238138	238143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284445
4618	NC_020450	CAAC	2	8	238144	238151	50 %	0 %	0 %	50 %	459284445
4619	NC_020450	ATT	2	6	238164	238169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284445
4620	NC_020450	AGC	2	6	238180	238185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284445
4621	NC_020450	TGA	2	6	238211	238216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284445
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4623	NC_020450	GTTGAA	2	12	238266	238277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284445
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4746	NC_020450	ATTC	2	8	244587	244594	25 %	50 %	0 %	25 %	459284451
4747	NC_020450	TTC	2	6	244613	244618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459284451
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4851	NC_020450	A	6	6	251105	251110	100 %	0 %	0 %	0 %	459284458
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4853	NC_020450	TGA	2	6	251244	251249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284458
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4855	NC_020450	T	6	6	251410	251415	0 %	100 %	0 %	0 %	459284458
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4859	NC_020450	AAAT	2	8	251716	251723	75 %	25 %	0 %	0 %	459284458
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4861	NC_020450	A	7	7	251989	251995	100 %	0 %	0 %	0 %	459284459
4862	NC_020450	AGC	2	6	252036	252041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459284459
4863	NC_020450	CA	4	8	252118	252125	50 %	0 %	0 %	50 %	459284459
4864	NC_020450	ATT	2	6	252286	252291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459284459
4865	NC_020450	ATG	2	6	252328	252333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459284459
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4867	NC_020450	TGAT	2	8	252377	252384	25 %	50 %	25 %	0 %	459284459
4868	NC_020450	TGT	2	6	252525	252530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459284459
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4880	NC_020450	A	6	6	253160	253165	100 %	0 %	0 %	0 %	459284460
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4990	NC_020450	GAA	2	6	258681	258686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459284463
4991	NC_020450	A	7	7	258716	258722	100 %	0 %	0 %	0 %	459284463
4992	NC_020450	ACA	2	6	258799	258804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284463
4993	NC_020450	AAC	2	6	258838	258843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459284463
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