MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316

Total Repeats: 38576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020229	TGA	2	6	590	595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819524
2	NC_020229	TGA	4	12	599	610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819524
3	NC_020229	TCG	2	6	636	641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819524
4	NC_020229	GTT	2	6	663	668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819524
5	NC_020229	CGG	2	6	692	697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448819524
6	NC_020229	ATC	2	6	716	721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819524
7	NC_020229	CGC	2	6	762	767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448819524
8	NC_020229	GCC	2	6	799	804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448819524
9	NC_020229	TGC	2	6	819	824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819524
10	NC_020229	TGT	2	6	870	875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819524
11	NC_020229	GAT	3	9	895	903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819524
12	NC_020229	TGC	2	6	1104	1109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819524
13	NC_020229	TCC	2	6	1319	1324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	448819524
14	NC_020229	ATG	2	6	1526	1531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819524
15	NC_020229	ACT	2	6	1578	1583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819524
16	NC_020229	CTA	2	6	1676	1681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819524
17	NC_020229	ACT	3	9	1862	1870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819525
18	NC_020229	TCA	2	6	1940	1945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819525
19	NC_020229	GAA	2	6	2211	2216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448819526
20	NC_020229	CGT	3	9	2253	2261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819526
21	NC_020229	CGC	2	6	2270	2275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448819526
22	NC_020229	CCA	2	6	2353	2358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448819526
23	NC_020229	CAA	2	6	2417	2422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819526
24	NC_020229	CAA	2	6	2532	2537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819526
25	NC_020229	TCC	2	6	2538	2543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	448819526
26	NC_020229	TCA	2	6	2579	2584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819526
27	NC_020229	TAA	2	6	2657	2662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819526
28	NC_020229	CCG	2	6	2714	2719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448819526
29	NC_020229	TAA	2	6	2796	2801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819526
30	NC_020229	ATT	2	6	2994	2999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819526
31	NC_020229	CCA	2	6	3037	3042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448819526
32	NC_020229	CCG	2	6	3146	3151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448819526
33	NC_020229	CGC	2	6	3246	3251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448819526
34	NC_020229	ATC	2	6	3265	3270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819526
35	NC_020229	CTG	2	6	3341	3346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819526
36	NC_020229	GAC	2	6	3459	3464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819526
37	NC_020229	TGG	2	6	3987	3992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448819527
38	NC_020229	CCA	2	6	4005	4010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448819527
39	NC_020229	AAT	2	6	4025	4030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819527
40	NC_020229	ACG	2	6	4239	4244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819527
41	NC_020229	GTT	2	6	4257	4262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819527
42	NC_020229	GCA	2	6	4263	4268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819527
43	NC_020229	ATG	2	6	4278	4283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819527
44	NC_020229	ACA	2	6	4309	4314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819527
45	NC_020229	TGC	3	9	4319	4327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819527
46	NC_020229	CAC	2	6	4333	4338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448819527
47	NC_020229	GAC	2	6	4463	4468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819527
48	NC_020229	ATG	2	6	4476	4481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819527
49	NC_020229	GCT	2	6	4488	4493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819527
50	NC_020229	AAT	2	6	4559	4564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819527
51	NC_020229	ACA	2	6	4597	4602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819527
52	NC_020229	CAA	2	6	4610	4615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819527
53	NC_020229	AGA	2	6	4705	4710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448819527
54	NC_020229	CAT	2	6	4820	4825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819527
55	NC_020229	CGA	2	6	4858	4863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819527
56	NC_020229	ATC	2	6	4869	4874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819527
57	NC_020229	CAT	2	6	5156	5161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819527
58	NC_020229	AGA	3	9	5167	5175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448819527
59	NC_020229	AAT	2	6	5244	5249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819527
60	NC_020229	CCA	2	6	5265	5270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448819527
61	NC_020229	ATC	2	6	5642	5647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819528
62	NC_020229	GCC	2	6	5687	5692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448819528
63	NC_020229	CTT	2	6	5712	5717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819528
64	NC_020229	CAA	2	6	5740	5745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819528
65	NC_020229	CAT	2	6	5784	5789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819528
66	NC_020229	AGT	2	6	5825	5830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819528
67	NC_020229	AAC	2	6	6169	6174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819528
68	NC_020229	CAC	2	6	6247	6252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448819528
69	NC_020229	TCG	2	6	6303	6308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819528
70	NC_020229	CCA	2	6	6317	6322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448819528
71	NC_020229	TCA	2	6	6516	6521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819528
72	NC_020229	AAG	2	6	6896	6901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448819529
73	NC_020229	TGA	2	6	7029	7034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819529
74	NC_020229	AAG	2	6	7109	7114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448819529
75	NC_020229	AAG	2	6	7123	7128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448819529
76	NC_020229	GTT	2	6	7150	7155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819529
77	NC_020229	TGA	2	6	7167	7172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819529
78	NC_020229	GCG	2	6	7189	7194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448819529
79	NC_020229	ACT	2	6	7434	7439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819530
80	NC_020229	CTT	2	6	7582	7587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819530
81	NC_020229	GAT	2	6	7635	7640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819530
82	NC_020229	TGT	2	6	7727	7732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819530
83	NC_020229	AAG	2	6	7880	7885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448819530
84	NC_020229	ATC	2	6	7925	7930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819530
85	NC_020229	TGA	2	6	7940	7945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819530
86	NC_020229	TGG	2	6	8065	8070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448819530
87	NC_020229	CGC	2	6	8104	8109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448819530
88	NC_020229	GTC	2	6	8117	8122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819530
89	NC_020229	CAA	2	6	8208	8213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819530
90	NC_020229	TTA	2	6	8297	8302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819531
91	NC_020229	CAG	2	6	8347	8352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819531
92	NC_020229	GTA	2	6	8440	8445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819531
93	NC_020229	GAA	2	6	8509	8514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448819531
94	NC_020229	TCG	2	6	8524	8529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819531
95	NC_020229	TTG	2	6	8606	8611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819531
96	NC_020229	TTG	2	6	8624	8629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819531
97	NC_020229	GCC	2	6	9012	9017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448819532
98	NC_020229	AAT	2	6	9020	9025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819532
99	NC_020229	GTC	2	6	9083	9088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819532
100	NC_020229	ATC	2	6	9130	9135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819532
101	NC_020229	ACC	2	6	9237	9242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448819532
102	NC_020229	TGT	2	6	9563	9568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819533
103	NC_020229	GTT	2	6	9612	9617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819533
104	NC_020229	TAA	2	6	9630	9635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819533
105	NC_020229	TTC	2	6	10233	10238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819534
106	NC_020229	GGC	2	6	10266	10271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448819534
107	NC_020229	TAA	2	6	10316	10321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819534
108	NC_020229	CAT	2	6	10343	10348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819534
109	NC_020229	AAT	2	6	10351	10356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819534
110	NC_020229	AAC	2	6	10395	10400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819534
111	NC_020229	CTT	2	6	10418	10423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819534
112	NC_020229	GCC	2	6	10732	10737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448819535
113	NC_020229	AAT	2	6	10783	10788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819535
114	NC_020229	CCG	2	6	10795	10800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448819535
115	NC_020229	TTC	2	6	10808	10813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819535
116	NC_020229	ATC	3	9	10823	10831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819535
117	NC_020229	TCA	2	6	10906	10911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819535
118	NC_020229	TTC	2	6	10971	10976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819535
119	NC_020229	AAT	2	6	11395	11400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819535
120	NC_020229	AAC	2	6	11424	11429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819535
121	NC_020229	ATA	2	6	11489	11494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819535
122	NC_020229	CTG	2	6	11519	11524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819535
123	NC_020229	CGT	2	6	11615	11620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819535
124	NC_020229	TTG	2	6	11635	11640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819535
125	NC_020229	TTA	2	6	11860	11865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819536
126	NC_020229	ATT	2	6	11889	11894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819536
127	NC_020229	AAT	2	6	11939	11944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819536
128	NC_020229	AAT	2	6	11951	11956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819536
129	NC_020229	AAC	2	6	12055	12060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819536
130	NC_020229	CTG	2	6	12148	12153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819537
131	NC_020229	GCT	2	6	12161	12166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819537
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133	NC_020229	TCG	3	9	12345	12353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819537
134	NC_020229	TTG	3	9	12529	12537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819537
135	NC_020229	ATC	2	6	12583	12588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819537
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139	NC_020229	ATA	2	6	13020	13025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819538
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143	NC_020229	CAT	2	6	13756	13761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819539
144	NC_020229	ATT	2	6	13969	13974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819540
145	NC_020229	TTA	2	6	13977	13982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819540
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159	NC_020229	TGA	2	6	15365	15370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819542
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163	NC_020229	CTG	2	6	15918	15923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819543
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252	NC_020229	TCA	2	6	24548	24553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819551
253	NC_020229	ATT	2	6	24646	24651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819551
254	NC_020229	CTT	2	6	24714	24719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819551
255	NC_020229	TTG	3	9	24755	24763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819551
256	NC_020229	TCA	2	6	25028	25033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819551
257	NC_020229	TGA	2	6	25049	25054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819551
258	NC_020229	GCC	2	6	25285	25290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448819551
259	NC_020229	GTA	2	6	25295	25300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819551
260	NC_020229	TTA	2	6	25360	25365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819551
261	NC_020229	CTT	2	6	25379	25384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819551
262	NC_020229	TCA	2	6	25401	25406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819551
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265	NC_020229	CAT	2	6	25789	25794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819552
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273	NC_020229	ATC	2	6	26262	26267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819553
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280	NC_020229	ATT	2	6	26701	26706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819554
281	NC_020229	CAT	2	6	26737	26742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819554
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374	NC_020229	TCA	2	6	34115	34120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819561
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377	NC_020229	CAT	2	6	34234	34239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819561
378	NC_020229	CTT	2	6	34240	34245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819561
379	NC_020229	TTC	2	6	34366	34371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819561
380	NC_020229	TCG	2	6	34398	34403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819561
381	NC_020229	GTC	2	6	34457	34462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819561
382	NC_020229	ATG	2	6	34586	34591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819561
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500	NC_020229	ACA	2	6	46097	46102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819573

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