MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316

Total Repeats: 52289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020229	ACC	2	6	33059	33064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448819561
502	NC_020229	AAC	2	6	33287	33292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819561
503	NC_020229	TGG	2	6	33337	33342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448819561
504	NC_020229	TTG	2	6	33343	33348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819561
505	NC_020229	TAA	2	6	33378	33383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819561
506	NC_020229	TAA	2	6	33414	33419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819561
507	NC_020229	C	6	6	33447	33452	0 %	0 %	0 %	100 %	448819561
508	NC_020229	ACCA	2	8	33469	33476	50 %	0 %	0 %	50 %	448819561
509	NC_020229	AAG	2	6	33479	33484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448819561
510	NC_020229	CCTT	2	8	33551	33558	0 %	50 %	0 %	50 %	448819561
511	NC_020229	CTG	2	6	33561	33566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819561
512	NC_020229	TCG	2	6	33573	33578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819561
513	NC_020229	ATC	2	6	33586	33591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819561
514	NC_020229	CTT	2	6	33612	33617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819561
515	NC_020229	CCG	2	6	33660	33665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448819561
516	NC_020229	TTC	2	6	33808	33813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819561
517	NC_020229	TCA	2	6	33833	33838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819561
518	NC_020229	TTGC	2	8	33846	33853	0 %	50 %	25 %	25 %	448819561
519	NC_020229	GCT	2	6	33950	33955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819561
520	NC_020229	GTG	2	6	33981	33986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448819561
521	NC_020229	ATCA	2	8	33988	33995	50 %	25 %	0 %	25 %	448819561
522	NC_020229	CAAT	2	8	33999	34006	50 %	25 %	0 %	25 %	448819561
523	NC_020229	GTC	2	6	34033	34038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819561
524	NC_020229	CAGT	2	8	34040	34047	25 %	25 %	25 %	25 %	448819561
525	NC_020229	ATG	2	6	34067	34072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819561
526	NC_020229	GCC	2	6	34100	34105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448819561
527	NC_020229	TCA	2	6	34115	34120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819561
528	NC_020229	CAG	2	6	34134	34139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819561
529	NC_020229	TAAC	2	8	34194	34201	50 %	25 %	0 %	25 %	448819561
530	NC_020229	CGT	2	6	34228	34233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819561
531	NC_020229	CAT	2	6	34234	34239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819561
532	NC_020229	CTT	2	6	34240	34245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819561
533	NC_020229	AGCC	2	8	34318	34325	25 %	0 %	25 %	50 %	448819561
534	NC_020229	TTC	2	6	34366	34371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819561
535	NC_020229	TCG	2	6	34398	34403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819561
536	NC_020229	GTC	2	6	34457	34462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819561
537	NC_020229	ATG	2	6	34586	34591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819561
538	NC_020229	TCTG	2	8	34597	34604	0 %	50 %	25 %	25 %	448819561
539	NC_020229	GAT	2	6	34642	34647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819561
540	NC_020229	ATC	2	6	34691	34696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819561
541	NC_020229	ACC	2	6	34753	34758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448819561
542	NC_020229	GCC	2	6	34800	34805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448819561
543	NC_020229	CAA	2	6	34840	34845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819561
544	NC_020229	ATC	2	6	34945	34950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819561
545	NC_020229	T	6	6	34977	34982	0 %	100 %	0 %	0 %	448819561
546	NC_020229	TCA	2	6	35015	35020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819561
547	NC_020229	TAG	2	6	35080	35085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819561
548	NC_020229	GCC	2	6	35180	35185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448819561
549	NC_020229	CTT	2	6	35205	35210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819561
550	NC_020229	TAA	2	6	35232	35237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819561
551	NC_020229	ATA	3	9	35319	35327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819561
552	NC_020229	GC	3	6	35383	35388	0 %	0 %	50 %	50 %	448819561
553	NC_020229	TTAG	2	8	35414	35421	25 %	50 %	25 %	0 %	448819561
554	NC_020229	GTC	2	6	35426	35431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819561
555	NC_020229	GTC	2	6	35799	35804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819562
556	NC_020229	TTAGTC	2	12	35823	35834	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	448819562
557	NC_020229	TCA	2	6	35851	35856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819562
558	NC_020229	TGAT	2	8	35895	35902	25 %	50 %	25 %	0 %	448819562
559	NC_020229	CCA	3	9	35950	35958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448819562
560	NC_020229	TG	3	6	36060	36065	0 %	50 %	50 %	0 %	448819562
561	NC_020229	GCC	2	6	36072	36077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448819562
562	NC_020229	GCC	2	6	36092	36097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448819562
563	NC_020229	ATG	2	6	36105	36110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819562
564	NC_020229	GCACC	2	10	36115	36124	20 %	0 %	20 %	60 %	448819562
565	NC_020229	AAC	2	6	36213	36218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819562
566	NC_020229	CACAT	2	10	36219	36228	40 %	20 %	0 %	40 %	448819562
567	NC_020229	GAG	2	6	36245	36250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	448819562
568	NC_020229	CGT	2	6	36301	36306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819562
569	NC_020229	GGT	2	6	36323	36328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448819562
570	NC_020229	CCA	2	6	36436	36441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448819562
571	NC_020229	ATC	2	6	36540	36545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819562
572	NC_020229	GAC	2	6	36550	36555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819562
573	NC_020229	CAAT	2	8	36624	36631	50 %	25 %	0 %	25 %	448819562
574	NC_020229	AC	3	6	36654	36659	50 %	0 %	0 %	50 %	448819562
575	NC_020229	ATC	2	6	36696	36701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819562
576	NC_020229	ATC	2	6	36720	36725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819562
577	NC_020229	TTA	2	6	36738	36743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819562
578	NC_020229	ATT	2	6	36790	36795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819562
579	NC_020229	GAC	2	6	36800	36805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819562
580	NC_020229	ACA	2	6	36820	36825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819562
581	NC_020229	CAAA	2	8	36864	36871	75 %	0 %	0 %	25 %	448819562
582	NC_020229	CGC	2	6	36907	36912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448819562
583	NC_020229	TCC	2	6	36939	36944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	448819562
584	NC_020229	GTC	2	6	37064	37069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819562
585	NC_020229	TGG	2	6	37141	37146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448819562
586	NC_020229	ACT	2	6	37224	37229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819562
587	NC_020229	CGT	2	6	37243	37248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819562
588	NC_020229	CAACG	2	10	37249	37258	40 %	0 %	20 %	40 %	448819562
589	NC_020229	GCG	2	6	37531	37536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448819563
590	NC_020229	TTG	2	6	37652	37657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819563
591	NC_020229	AC	3	6	37669	37674	50 %	0 %	0 %	50 %	448819563
592	NC_020229	ACGCC	2	10	37798	37807	20 %	0 %	20 %	60 %	448819563
593	NC_020229	GCT	2	6	37812	37817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819563
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595	NC_020229	GCC	2	6	38033	38038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448819563
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597	NC_020229	GAG	2	6	38232	38237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	448819563
598	NC_020229	AAT	2	6	38243	38248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819563
599	NC_020229	GC	3	6	38253	38258	0 %	0 %	50 %	50 %	448819563
600	NC_020229	TCC	2	6	38273	38278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	448819563
601	NC_020229	CAA	2	6	38389	38394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819563
602	NC_020229	ATC	3	9	38754	38762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819564
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604	NC_020229	ATCCG	2	10	38800	38809	20 %	20 %	20 %	40 %	448819564
605	NC_020229	TGGTAA	2	12	38823	38834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819564
606	NC_020229	AGC	2	6	39061	39066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819564
607	NC_020229	CTT	2	6	39131	39136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819564
608	NC_020229	CTT	2	6	39264	39269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819564
609	NC_020229	CAC	2	6	39335	39340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448819564
610	NC_020229	GCC	3	9	39382	39390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448819564
611	NC_020229	CAA	2	6	39479	39484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819564
612	NC_020229	TCA	2	6	39542	39547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819564
613	NC_020229	ATTT	2	8	39563	39570	25 %	75 %	0 %	0 %	448819564
614	NC_020229	TGA	2	6	39684	39689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819565
615	NC_020229	CAAC	2	8	39792	39799	50 %	0 %	0 %	50 %	448819565
616	NC_020229	TCAA	2	8	39999	40006	50 %	25 %	0 %	25 %	448819565
617	NC_020229	TGC	2	6	40141	40146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819565
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620	NC_020229	CAT	2	6	40270	40275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819565
621	NC_020229	CCGT	2	8	40323	40330	0 %	25 %	25 %	50 %	448819565
622	NC_020229	CTA	2	6	40432	40437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819565
623	NC_020229	AAC	2	6	40468	40473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819566
624	NC_020229	CTTA	2	8	40497	40504	25 %	50 %	0 %	25 %	448819566
625	NC_020229	TGC	2	6	40573	40578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819566
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627	NC_020229	GAT	2	6	40714	40719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819566
628	NC_020229	TGG	2	6	40756	40761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448819566
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