MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 3

Total Repeats: 4087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020130	GA	3	6	189319	189324	50 %	0 %	50 %	0 %	442556628
4002	NC_020130	TATT	2	8	189326	189333	25 %	75 %	0 %	0 %	442556628
4003	NC_020130	TGA	2	6	189369	189374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556628
4004	NC_020130	CATGT	2	10	189437	189446	20 %	40 %	20 %	20 %	442556628
4005	NC_020130	AAGA	2	8	189490	189497	75 %	0 %	25 %	0 %	442556628
4006	NC_020130	TGA	2	6	189531	189536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556628
4007	NC_020130	ATG	2	6	189632	189637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556628
4008	NC_020130	TATC	2	8	189678	189685	25 %	50 %	0 %	25 %	442556628
4009	NC_020130	AAT	2	6	189794	189799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556628
4010	NC_020130	TTTCA	2	10	190358	190367	20 %	60 %	0 %	20 %	442556629
4011	NC_020130	GATT	2	8	190479	190486	25 %	50 %	25 %	0 %	442556629
4012	NC_020130	TCT	2	6	190491	190496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556629
4013	NC_020130	TTC	2	6	190511	190516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556629
4014	NC_020130	CTGA	2	8	190591	190598	25 %	25 %	25 %	25 %	442556629
4015	NC_020130	AGT	2	6	190703	190708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556629
4016	NC_020130	T	6	6	190720	190725	0 %	100 %	0 %	0 %	442556629
4017	NC_020130	TCA	2	6	190743	190748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556629
4018	NC_020130	CAA	2	6	190750	190755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556629
4019	NC_020130	AGC	2	6	190787	190792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556629
4020	NC_020130	GCA	2	6	190800	190805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556629
4021	NC_020130	GATT	2	8	190917	190924	25 %	50 %	25 %	0 %	442556629
4022	NC_020130	GAA	2	6	190998	191003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556629
4023	NC_020130	TGT	2	6	191045	191050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556629
4024	NC_020130	TTC	2	6	191057	191062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556629
4025	NC_020130	GCT	2	6	191091	191096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556629
4026	NC_020130	CAC	2	6	191107	191112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556629
4027	NC_020130	TTC	2	6	191120	191125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556629
4028	NC_020130	GAA	2	6	191154	191159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556629
4029	NC_020130	CTG	3	9	191188	191196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556629
4030	NC_020130	CTT	2	6	191239	191244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556629
4031	NC_020130	CTT	4	12	191269	191280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556629
4032	NC_020130	TGT	2	6	191301	191306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556629
4033	NC_020130	AG	3	6	191331	191336	50 %	0 %	50 %	0 %	442556629
4034	NC_020130	TCG	2	6	191376	191381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556629
4035	NC_020130	CTG	2	6	191416	191421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556629
4036	NC_020130	GTT	2	6	191442	191447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556629
4037	NC_020130	AATG	2	8	191480	191487	50 %	25 %	25 %	0 %	442556629
4038	NC_020130	AAG	3	9	191504	191512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556629
4039	NC_020130	TAA	3	9	191521	191529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556629
4040	NC_020130	GT	3	6	191557	191562	0 %	50 %	50 %	0 %	442556629
4041	NC_020130	GA	3	6	191592	191597	50 %	0 %	50 %	0 %	442556629
4042	NC_020130	AATCTA	2	12	191656	191667	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	442556629
4043	NC_020130	CTTTG	2	10	191668	191677	0 %	60 %	20 %	20 %	442556629
4044	NC_020130	T	6	6	191697	191702	0 %	100 %	0 %	0 %	442556629
4045	NC_020130	TA	3	6	191713	191718	50 %	50 %	0 %	0 %	442556629
4046	NC_020130	TCT	2	6	191760	191765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556629
4047	NC_020130	ATAG	2	8	191787	191794	50 %	25 %	25 %	0 %	442556629
4048	NC_020130	TCA	2	6	191808	191813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556629
4049	NC_020130	T	7	7	191827	191833	0 %	100 %	0 %	0 %	442556629
4050	NC_020130	CAT	2	6	191897	191902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556629
4051	NC_020130	TCA	2	6	191940	191945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556629
4052	NC_020130	ATT	2	6	191964	191969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556629
4053	NC_020130	TTC	2	6	192029	192034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556629
4054	NC_020130	T	6	6	192063	192068	0 %	100 %	0 %	0 %	442556629
4055	NC_020130	CAT	2	6	192076	192081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556629
4056	NC_020130	T	6	6	192155	192160	0 %	100 %	0 %	0 %	442556629
4057	NC_020130	TCT	2	6	192216	192221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556629
4058	NC_020130	ATA	2	6	192251	192256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556629
4059	NC_020130	CTT	2	6	192262	192267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556629
4060	NC_020130	CTTAT	2	10	192417	192426	20 %	60 %	0 %	20 %	442556629
4061	NC_020130	CGG	2	6	193038	193043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442556630
4062	NC_020130	AGAC	2	8	193049	193056	50 %	0 %	25 %	25 %	442556630
4063	NC_020130	AG	3	6	193106	193111	50 %	0 %	50 %	0 %	442556630
4064	NC_020130	CAA	2	6	193136	193141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556630
4065	NC_020130	ATG	2	6	193146	193151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556630
4066	NC_020130	T	6	6	193153	193158	0 %	100 %	0 %	0 %	442556630
4067	NC_020130	AG	3	6	193195	193200	50 %	0 %	50 %	0 %	442556630
4068	NC_020130	GCA	2	6	193236	193241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556631
4069	NC_020130	TAT	2	6	193304	193309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556631
4070	NC_020130	TTTTCG	2	12	193367	193378	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	442556631
4071	NC_020130	ATA	2	6	193420	193425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556631
4072	NC_020130	TA	6	12	193866	193877	50 %	50 %	0 %	0 %	442556632
4073	NC_020130	T	6	6	193899	193904	0 %	100 %	0 %	0 %	442556632
4074	NC_020130	AGA	2	6	193920	193925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556632
4075	NC_020130	GTT	2	6	193933	193938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556632
4076	NC_020130	T	7	7	194072	194078	0 %	100 %	0 %	0 %	442556632
4077	NC_020130	TTG	3	9	194108	194116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556632
4078	NC_020130	CTG	2	6	194143	194148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556632
4079	NC_020130	TAT	2	6	194170	194175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556632
4080	NC_020130	TTCT	2	8	194228	194235	0 %	75 %	0 %	25 %	442556632
4081	NC_020130	CAA	2	6	194266	194271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556632
4082	NC_020130	T	6	6	194272	194277	0 %	100 %	0 %	0 %	442556632
4083	NC_020130	AAT	2	6	194289	194294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556632
4084	NC_020130	A	6	6	194300	194305	100 %	0 %	0 %	0 %	442556632
4085	NC_020130	TGA	2	6	194363	194368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556632
4086	NC_020130	TGAA	2	8	194416	194423	50 %	25 %	25 %	0 %	442556632
4087	NC_020130	A	6	6	194433	194438	100 %	0 %	0 %	0 %	442556632

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