MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 3

Total Repeats: 4087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020130	CGT	2	6	127513	127518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556600
2502	NC_020130	GAA	2	6	127947	127952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556601
2503	NC_020130	AGA	2	6	127998	128003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556601
2504	NC_020130	AG	4	8	128037	128044	50 %	0 %	50 %	0 %	442556601
2505	NC_020130	AGA	2	6	128076	128081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556601
2506	NC_020130	GA	3	6	128101	128106	50 %	0 %	50 %	0 %	442556601
2507	NC_020130	CAA	2	6	128141	128146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556601
2508	NC_020130	ATA	2	6	128150	128155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556601
2509	NC_020130	ATA	2	6	128159	128164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556601
2510	NC_020130	AAG	2	6	128174	128179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556601
2511	NC_020130	TCTT	2	8	128220	128227	0 %	75 %	0 %	25 %	442556601
2512	NC_020130	TGT	2	6	128244	128249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556601
2513	NC_020130	ATGG	2	8	128281	128288	25 %	25 %	50 %	0 %	442556601
2514	NC_020130	TA	3	6	128296	128301	50 %	50 %	0 %	0 %	442556601
2515	NC_020130	AG	3	6	128304	128309	50 %	0 %	50 %	0 %	442556601
2516	NC_020130	ATT	2	6	128355	128360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556601
2517	NC_020130	TAC	2	6	128400	128405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556601
2518	NC_020130	ATT	2	6	128421	128426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556601
2519	NC_020130	AAC	2	6	128432	128437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556601
2520	NC_020130	ACT	2	6	128458	128463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556601
2521	NC_020130	GTTA	2	8	128478	128485	25 %	50 %	25 %	0 %	442556601
2522	NC_020130	GAA	2	6	128494	128499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556601
2523	NC_020130	TAAG	2	8	128516	128523	50 %	25 %	25 %	0 %	442556601
2524	NC_020130	CTC	2	6	128526	128531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556601
2525	NC_020130	TAA	2	6	128541	128546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556601
2526	NC_020130	T	8	8	128574	128581	0 %	100 %	0 %	0 %	442556601
2527	NC_020130	T	6	6	128643	128648	0 %	100 %	0 %	0 %	442556601
2528	NC_020130	AAATAC	2	12	128661	128672	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	442556601
2529	NC_020130	ATC	2	6	128694	128699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556601
2530	NC_020130	T	6	6	128773	128778	0 %	100 %	0 %	0 %	442556601
2531	NC_020130	AAC	2	6	130524	130529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556602
2532	NC_020130	TG	3	6	130553	130558	0 %	50 %	50 %	0 %	442556602
2533	NC_020130	CTG	2	6	130619	130624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556602
2534	NC_020130	ATGG	2	8	130625	130632	25 %	25 %	50 %	0 %	442556602
2535	NC_020130	TTG	2	6	130715	130720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556602
2536	NC_020130	ACA	2	6	130842	130847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556602
2537	NC_020130	TGT	2	6	130875	130880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556602
2538	NC_020130	TGC	2	6	130986	130991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556602
2539	NC_020130	ATT	2	6	131054	131059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556602
2540	NC_020130	TAA	2	6	131106	131111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556602
2541	NC_020130	TCTCAA	2	12	131173	131184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556602
2542	NC_020130	AC	3	6	131240	131245	50 %	0 %	0 %	50 %	442556602
2543	NC_020130	ATA	2	6	131282	131287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556602
2544	NC_020130	AACA	2	8	131298	131305	75 %	0 %	0 %	25 %	442556602
2545	NC_020130	ATT	2	6	131317	131322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556602
2546	NC_020130	TTG	2	6	131375	131380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556602
2547	NC_020130	TAT	2	6	131390	131395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556602
2548	NC_020130	T	6	6	131452	131457	0 %	100 %	0 %	0 %	442556602
2549	NC_020130	GGT	2	6	131479	131484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442556602
2550	NC_020130	ATG	2	6	131618	131623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556603
2551	NC_020130	TAA	2	6	131640	131645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556603
2552	NC_020130	TTG	2	6	131651	131656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556603
2553	NC_020130	AAC	2	6	131744	131749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556603
2554	NC_020130	AATT	2	8	131810	131817	50 %	50 %	0 %	0 %	442556603
2555	NC_020130	TTC	2	6	131819	131824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556603
2556	NC_020130	TTCA	2	8	131843	131850	25 %	50 %	0 %	25 %	442556603
2557	NC_020130	CAAT	2	8	131916	131923	50 %	25 %	0 %	25 %	442556603
2558	NC_020130	GTT	2	6	131935	131940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556603
2559	NC_020130	A	6	6	131944	131949	100 %	0 %	0 %	0 %	442556603
2560	NC_020130	TTG	2	6	131957	131962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556603
2561	NC_020130	AAC	2	6	131975	131980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556603
2562	NC_020130	CAA	2	6	131993	131998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556603
2563	NC_020130	CAGA	2	8	132013	132020	50 %	0 %	25 %	25 %	442556603
2564	NC_020130	TC	4	8	132028	132035	0 %	50 %	0 %	50 %	442556603
2565	NC_020130	TC	3	6	132083	132088	0 %	50 %	0 %	50 %	442556603
2566	NC_020130	TGC	2	6	132123	132128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556603
2567	NC_020130	TGG	2	6	132156	132161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442556603
2568	NC_020130	AGG	2	6	132171	132176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442556603
2569	NC_020130	CCTC	2	8	132190	132197	0 %	25 %	0 %	75 %	442556603
2570	NC_020130	TAAG	2	8	132198	132205	50 %	25 %	25 %	0 %	442556603
2571	NC_020130	TTG	2	6	132357	132362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556604
2572	NC_020130	T	6	6	132395	132400	0 %	100 %	0 %	0 %	442556604
2573	NC_020130	ATA	2	6	132419	132424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556604
2574	NC_020130	CAA	2	6	132426	132431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556604
2575	NC_020130	A	6	6	132438	132443	100 %	0 %	0 %	0 %	442556604
2576	NC_020130	A	6	6	132463	132468	100 %	0 %	0 %	0 %	442556604
2577	NC_020130	GAA	2	6	132501	132506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556604
2578	NC_020130	TAC	2	6	132585	132590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556604
2579	NC_020130	ACT	2	6	132592	132597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556604
2580	NC_020130	ATAA	2	8	132639	132646	75 %	25 %	0 %	0 %	442556604
2581	NC_020130	ATA	2	6	132650	132655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556604
2582	NC_020130	CAA	3	9	132798	132806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556604
2583	NC_020130	ATTA	2	8	132808	132815	50 %	50 %	0 %	0 %	442556604
2584	NC_020130	GCTC	2	8	132842	132849	0 %	25 %	25 %	50 %	442556604
2585	NC_020130	AAG	2	6	132880	132885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556604
2586	NC_020130	CAA	2	6	132954	132959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556604
2587	NC_020130	CAA	2	6	133398	133403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556605
2588	NC_020130	CTTCAA	2	12	133404	133415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556605
2589	NC_020130	AGC	2	6	133441	133446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556605
2590	NC_020130	AAG	3	9	133475	133483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556605
2591	NC_020130	TACT	2	8	133536	133543	25 %	50 %	0 %	25 %	442556605
2592	NC_020130	ATG	2	6	133552	133557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556605
2593	NC_020130	GCT	2	6	133574	133579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556605
2594	NC_020130	TTG	2	6	133606	133611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556605
2595	NC_020130	TTG	2	6	133644	133649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556605
2596	NC_020130	AGAT	2	8	133673	133680	50 %	25 %	25 %	0 %	442556605
2597	NC_020130	ATC	2	6	134038	134043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556606
2598	NC_020130	AG	3	6	134098	134103	50 %	0 %	50 %	0 %	442556606
2599	NC_020130	TTG	2	6	134121	134126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556606
2600	NC_020130	TTG	2	6	134140	134145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556606
2601	NC_020130	TGT	2	6	134183	134188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556606
2602	NC_020130	TTC	2	6	134239	134244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556606
2603	NC_020130	TGT	2	6	134249	134254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556606
2604	NC_020130	AAT	2	6	134275	134280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556606
2605	NC_020130	TTGA	2	8	134289	134296	25 %	50 %	25 %	0 %	442556606
2606	NC_020130	AGT	2	6	134304	134309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556606
2607	NC_020130	AAG	2	6	134353	134358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556606
2608	NC_020130	AAT	2	6	134387	134392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556606
2609	NC_020130	AGG	2	6	134398	134403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442556606
2610	NC_020130	GCC	2	6	134436	134441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442556606
2611	NC_020130	ATCC	2	8	134470	134477	25 %	25 %	0 %	50 %	442556606
2612	NC_020130	CATT	2	8	134487	134494	25 %	50 %	0 %	25 %	442556606
2613	NC_020130	TGATAT	2	12	134505	134516	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	442556606
2614	NC_020130	TTCG	2	8	134589	134596	0 %	50 %	25 %	25 %	442556606
2615	NC_020130	TTG	2	6	134598	134603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556606
2616	NC_020130	ACA	2	6	134741	134746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556606
2617	NC_020130	GA	4	8	134868	134875	50 %	0 %	50 %	0 %	442556606
2618	NC_020130	TGC	2	6	134956	134961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556606
2619	NC_020130	T	6	6	134962	134967	0 %	100 %	0 %	0 %	442556606
2620	NC_020130	TGA	2	6	134990	134995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556606
2621	NC_020130	TA	3	6	135114	135119	50 %	50 %	0 %	0 %	442556607
2622	NC_020130	TTAT	2	8	135123	135130	25 %	75 %	0 %	0 %	442556607
2623	NC_020130	TGT	2	6	135135	135140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556607
2624	NC_020130	T	7	7	135157	135163	0 %	100 %	0 %	0 %	442556607
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2747	NC_020130	AAT	2	6	141949	141954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556612
2748	NC_020130	AC	3	6	141987	141992	50 %	0 %	0 %	50 %	442556612
2749	NC_020130	TAGG	2	8	142028	142035	25 %	25 %	50 %	0 %	442556612
2750	NC_020130	TAA	2	6	142038	142043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556612
2751	NC_020130	ATT	2	6	142049	142054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556612
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2853	NC_020130	TA	3	6	148950	148955	50 %	50 %	0 %	0 %	442556617
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2857	NC_020130	A	6	6	149065	149070	100 %	0 %	0 %	0 %	442556617
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2867	NC_020130	T	8	8	149333	149340	0 %	100 %	0 %	0 %	442556617
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2992	NC_020130	AGA	2	6	153546	153551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556617
2993	NC_020130	ACA	2	6	153555	153560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556617
2994	NC_020130	TGA	2	6	153564	153569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556617
2995	NC_020130	A	6	6	153610	153615	100 %	0 %	0 %	0 %	442556617
2996	NC_020130	GAGT	2	8	153650	153657	25 %	25 %	50 %	0 %	442556617
2997	NC_020130	ATG	2	6	153668	153673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556617
2998	NC_020130	GGA	3	9	153712	153720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442556617
2999	NC_020130	AAT	2	6	153721	153726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556617
3000	NC_020130	TCC	2	6	153729	153734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556617

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