MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 3

Total Repeats: 4087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020130	GAC	2	6	79705	79710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556576
1502	NC_020130	AACA	2	8	79764	79771	75 %	0 %	0 %	25 %	442556576
1503	NC_020130	TCTA	2	8	79781	79788	25 %	50 %	0 %	25 %	442556576
1504	NC_020130	CCT	2	6	79794	79799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556576
1505	NC_020130	T	8	8	79820	79827	0 %	100 %	0 %	0 %	442556576
1506	NC_020130	GAA	2	6	79828	79833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556576
1507	NC_020130	T	6	6	79855	79860	0 %	100 %	0 %	0 %	442556576
1508	NC_020130	CAT	2	6	79870	79875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556576
1509	NC_020130	CTT	3	9	79888	79896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556576
1510	NC_020130	TTA	2	6	80031	80036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556577
1511	NC_020130	TCC	2	6	80057	80062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556577
1512	NC_020130	T	6	6	80085	80090	0 %	100 %	0 %	0 %	442556577
1513	NC_020130	CAC	2	6	80091	80096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556577
1514	NC_020130	TGC	2	6	80101	80106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556577
1515	NC_020130	TAT	2	6	80115	80120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556577
1516	NC_020130	CT	4	8	80138	80145	0 %	50 %	0 %	50 %	442556577
1517	NC_020130	TTC	2	6	80185	80190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556577
1518	NC_020130	TCT	2	6	80197	80202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556577
1519	NC_020130	CTT	2	6	80219	80224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556577
1520	NC_020130	TCT	3	9	80225	80233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556577
1521	NC_020130	CTT	2	6	80298	80303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556577
1522	NC_020130	CT	3	6	80305	80310	0 %	50 %	0 %	50 %	442556577
1523	NC_020130	C	6	6	80339	80344	0 %	0 %	0 %	100 %	442556577
1524	NC_020130	TCA	2	6	80462	80467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556577
1525	NC_020130	CTT	2	6	80494	80499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556577
1526	NC_020130	T	6	6	80507	80512	0 %	100 %	0 %	0 %	442556577
1527	NC_020130	TGTCC	2	10	80526	80535	0 %	40 %	20 %	40 %	442556577
1528	NC_020130	TAA	2	6	80578	80583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556577
1529	NC_020130	A	8	8	80582	80589	100 %	0 %	0 %	0 %	442556577
1530	NC_020130	TAT	2	6	80646	80651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556577
1531	NC_020130	TAG	2	6	80691	80696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556577
1532	NC_020130	ATT	2	6	80711	80716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556577
1533	NC_020130	TAA	2	6	81682	81687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556578
1534	NC_020130	TTA	2	6	81764	81769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556578
1535	NC_020130	TGA	2	6	81790	81795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556578
1536	NC_020130	TCTA	2	8	81825	81832	25 %	50 %	0 %	25 %	442556578
1537	NC_020130	CTT	2	6	81855	81860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556578
1538	NC_020130	CA	3	6	81869	81874	50 %	0 %	0 %	50 %	442556578
1539	NC_020130	ATT	2	6	81945	81950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556578
1540	NC_020130	TAC	2	6	82016	82021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556578
1541	NC_020130	CTT	2	6	82040	82045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556578
1542	NC_020130	TCCAT	2	10	82050	82059	20 %	40 %	0 %	40 %	442556578
1543	NC_020130	ACA	2	6	82063	82068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556578
1544	NC_020130	A	6	6	82070	82075	100 %	0 %	0 %	0 %	442556578
1545	NC_020130	CAC	2	6	82145	82150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556578
1546	NC_020130	ATA	2	6	82236	82241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556578
1547	NC_020130	CTT	2	6	82355	82360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556578
1548	NC_020130	AGAAAA	2	12	82362	82373	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	442556578
1549	NC_020130	ATTT	2	8	82376	82383	25 %	75 %	0 %	0 %	442556578
1550	NC_020130	GAT	2	6	82388	82393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556578
1551	NC_020130	TTA	2	6	82544	82549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556578
1552	NC_020130	AGA	2	6	82554	82559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556578
1553	NC_020130	CTT	2	6	82570	82575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556578
1554	NC_020130	AGT	2	6	82605	82610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556578
1555	NC_020130	TGT	2	6	82624	82629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556578
1556	NC_020130	TAA	2	6	82635	82640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556578
1557	NC_020130	GTAGT	2	10	82643	82652	20 %	40 %	40 %	0 %	442556578
1558	NC_020130	A	6	6	82737	82742	100 %	0 %	0 %	0 %	442556578
1559	NC_020130	TC	3	6	82748	82753	0 %	50 %	0 %	50 %	442556578
1560	NC_020130	C	6	6	82782	82787	0 %	0 %	0 %	100 %	442556578
1561	NC_020130	T	6	6	82805	82810	0 %	100 %	0 %	0 %	442556578
1562	NC_020130	CTGA	2	8	82817	82824	25 %	25 %	25 %	25 %	442556578
1563	NC_020130	AGA	2	6	82921	82926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556578
1564	NC_020130	CTC	2	6	82931	82936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556578
1565	NC_020130	CCTCTT	3	18	82949	82966	0 %	50 %	0 %	50 %	442556578
1566	NC_020130	TCT	2	6	82972	82977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556578
1567	NC_020130	ACT	7	21	82980	83000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556578
1568	NC_020130	AACAA	2	10	83001	83010	80 %	0 %	0 %	20 %	442556578
1569	NC_020130	ACT	2	6	83031	83036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556578
1570	NC_020130	CTA	2	6	83041	83046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556578
1571	NC_020130	ACT	2	6	83052	83057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556578
1572	NC_020130	TAC	3	9	83060	83068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556578
1573	NC_020130	CTA	3	9	83071	83079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556578
1574	NC_020130	AGA	2	6	83094	83099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556578
1575	NC_020130	ACT	2	6	83112	83117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556578
1576	NC_020130	CTT	2	6	83134	83139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556578
1577	NC_020130	CATT	2	8	83141	83148	25 %	50 %	0 %	25 %	442556578
1578	NC_020130	CTT	2	6	83165	83170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556578
1579	NC_020130	GTT	2	6	83186	83191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556578
1580	NC_020130	TAT	2	6	83210	83215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556578
1581	NC_020130	CAT	2	6	83262	83267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556578
1582	NC_020130	TAG	2	6	83288	83293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556578
1583	NC_020130	ACC	2	6	83340	83345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556578
1584	NC_020130	A	7	7	83397	83403	100 %	0 %	0 %	0 %	442556578
1585	NC_020130	TAC	2	6	83429	83434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556578
1586	NC_020130	GGT	2	6	83476	83481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442556578
1587	NC_020130	TAA	2	6	83499	83504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556578
1588	NC_020130	TGA	2	6	83547	83552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556578
1589	NC_020130	A	6	6	83585	83590	100 %	0 %	0 %	0 %	442556578
1590	NC_020130	TGC	2	6	83594	83599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556578
1591	NC_020130	ACAAA	2	10	83615	83624	80 %	0 %	0 %	20 %	442556578
1592	NC_020130	A	7	7	83622	83628	100 %	0 %	0 %	0 %	442556578
1593	NC_020130	GAC	2	6	83634	83639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556578
1594	NC_020130	AAAAG	2	10	83669	83678	80 %	0 %	20 %	0 %	442556578
1595	NC_020130	AT	3	6	83697	83702	50 %	50 %	0 %	0 %	442556578
1596	NC_020130	TGA	2	6	83704	83709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556578
1597	NC_020130	A	6	6	83711	83716	100 %	0 %	0 %	0 %	442556578
1598	NC_020130	AGA	2	6	83731	83736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556578
1599	NC_020130	T	6	6	84362	84367	0 %	100 %	0 %	0 %	442556579
1600	NC_020130	AAAG	2	8	84382	84389	75 %	0 %	25 %	0 %	442556579
1601	NC_020130	T	6	6	84398	84403	0 %	100 %	0 %	0 %	442556579
1602	NC_020130	TTTTA	2	10	84405	84414	20 %	80 %	0 %	0 %	442556579
1603	NC_020130	ATG	2	6	84482	84487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556579
1604	NC_020130	CTTT	2	8	84510	84517	0 %	75 %	0 %	25 %	442556579
1605	NC_020130	CTT	2	6	84543	84548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556579
1606	NC_020130	TTG	2	6	84638	84643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556579
1607	NC_020130	ATG	2	6	84651	84656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556579
1608	NC_020130	CAT	2	6	84759	84764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556579
1609	NC_020130	TATG	2	8	84771	84778	25 %	50 %	25 %	0 %	442556579
1610	NC_020130	TCC	2	6	84831	84836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556579
1611	NC_020130	TAC	2	6	84875	84880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556579
1612	NC_020130	CCAT	2	8	84918	84925	25 %	25 %	0 %	50 %	442556579
1613	NC_020130	CTC	2	6	84950	84955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556579
1614	NC_020130	CTG	2	6	84980	84985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556579
1615	NC_020130	CTA	2	6	85118	85123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556579
1616	NC_020130	TCT	3	9	85145	85153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556579
1617	NC_020130	GTT	2	6	85215	85220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556579
1618	NC_020130	T	6	6	85275	85280	0 %	100 %	0 %	0 %	442556579
1619	NC_020130	TGC	3	9	85296	85304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556579
1620	NC_020130	TAA	2	6	85395	85400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556579
1621	NC_020130	GAA	2	6	85433	85438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556579
1622	NC_020130	A	6	6	85437	85442	100 %	0 %	0 %	0 %	442556579
1623	NC_020130	AGA	2	6	85467	85472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556579
1624	NC_020130	TTG	2	6	85504	85509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556579
1625	NC_020130	TGGT	2	8	85533	85540	0 %	50 %	50 %	0 %	442556579
1626	NC_020130	TTG	2	6	85551	85556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556579
1627	NC_020130	CTTCAT	2	12	85586	85597	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	442556579
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1998	NC_020130	ATCC	2	8	102304	102311	25 %	25 %	0 %	50 %	442556586
1999	NC_020130	ACTT	2	8	102330	102337	25 %	50 %	0 %	25 %	442556586
2000	NC_020130	T	6	6	102362	102367	0 %	100 %	0 %	0 %	442556586

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