MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 3

Total Repeats: 4087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020130	CAG	2	6	54997	55002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556568
1002	NC_020130	ATT	2	6	55052	55057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556568
1003	NC_020130	TAA	2	6	55079	55084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556568
1004	NC_020130	TGT	3	9	55100	55108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556568
1005	NC_020130	TAG	2	6	55160	55165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556568
1006	NC_020130	CCA	2	6	55182	55187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556568
1007	NC_020130	CTT	3	9	55195	55203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556568
1008	NC_020130	A	6	6	55207	55212	100 %	0 %	0 %	0 %	442556568
1009	NC_020130	CCT	2	6	55215	55220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556568
1010	NC_020130	TCC	2	6	55262	55267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556568
1011	NC_020130	ATC	2	6	55280	55285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556568
1012	NC_020130	TAA	2	6	55316	55321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556568
1013	NC_020130	TCT	2	6	55323	55328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556568
1014	NC_020130	CTT	2	6	55342	55347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556568
1015	NC_020130	GCT	3	9	55389	55397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556568
1016	NC_020130	TGT	2	6	55407	55412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556568
1017	NC_020130	TCT	2	6	55437	55442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556568
1018	NC_020130	TACA	2	8	55491	55498	50 %	25 %	0 %	25 %	442556568
1019	NC_020130	A	8	8	55498	55505	100 %	0 %	0 %	0 %	442556568
1020	NC_020130	ATA	2	6	55507	55512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556568
1021	NC_020130	TATG	2	8	55552	55559	25 %	50 %	25 %	0 %	442556568
1022	NC_020130	A	7	7	55572	55578	100 %	0 %	0 %	0 %	442556568
1023	NC_020130	A	6	6	55597	55602	100 %	0 %	0 %	0 %	442556568
1024	NC_020130	TAC	2	6	56022	56027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556569
1025	NC_020130	GTT	2	6	56037	56042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556569
1026	NC_020130	GAT	2	6	56058	56063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556569
1027	NC_020130	TCTG	2	8	56086	56093	0 %	50 %	25 %	25 %	442556569
1028	NC_020130	TTTC	2	8	56121	56128	0 %	75 %	0 %	25 %	442556569
1029	NC_020130	TGTA	2	8	56262	56269	25 %	50 %	25 %	0 %	442556569
1030	NC_020130	ATTCCT	2	12	56288	56299	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	442556569
1031	NC_020130	TTG	2	6	56321	56326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556569
1032	NC_020130	ATA	2	6	56337	56342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556569
1033	NC_020130	CT	3	6	56349	56354	0 %	50 %	0 %	50 %	442556569
1034	NC_020130	TTC	2	6	56356	56361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556569
1035	NC_020130	CAA	2	6	56376	56381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556569
1036	NC_020130	AGTA	2	8	56407	56414	50 %	25 %	25 %	0 %	442556569
1037	NC_020130	AAG	2	6	56493	56498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556569
1038	NC_020130	AAC	2	6	56547	56552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556569
1039	NC_020130	A	7	7	56556	56562	100 %	0 %	0 %	0 %	442556569
1040	NC_020130	TTA	2	6	56639	56644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556569
1041	NC_020130	CTA	2	6	56661	56666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556569
1042	NC_020130	TTA	2	6	56675	56680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556569
1043	NC_020130	TGT	2	6	56759	56764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556569
1044	NC_020130	AT	4	8	56773	56780	50 %	50 %	0 %	0 %	442556569
1045	NC_020130	A	6	6	56831	56836	100 %	0 %	0 %	0 %	442556569
1046	NC_020130	CTTTT	2	10	56845	56854	0 %	80 %	0 %	20 %	442556569
1047	NC_020130	T	8	8	56851	56858	0 %	100 %	0 %	0 %	442556569
1048	NC_020130	AT	3	6	56914	56919	50 %	50 %	0 %	0 %	442556569
1049	NC_020130	GAT	2	6	56993	56998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556569
1050	NC_020130	CTC	2	6	57087	57092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556569
1051	NC_020130	CTT	2	6	57120	57125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556569
1052	NC_020130	CCT	2	6	57137	57142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556569
1053	NC_020130	GGT	2	6	57143	57148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442556569
1054	NC_020130	ATC	2	6	57152	57157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556569
1055	NC_020130	GCA	2	6	57192	57197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556569
1056	NC_020130	TTC	2	6	57229	57234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556569
1057	NC_020130	GTT	2	6	57237	57242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556569
1058	NC_020130	GT	3	6	57250	57255	0 %	50 %	50 %	0 %	442556569
1059	NC_020130	TGT	3	9	57338	57346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556569
1060	NC_020130	TTG	2	6	57409	57414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556569
1061	NC_020130	TGT	2	6	57422	57427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556569
1062	NC_020130	AATT	2	8	57430	57437	50 %	50 %	0 %	0 %	442556569
1063	NC_020130	CTTGTT	2	12	57438	57449	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	442556569
1064	NC_020130	TGTA	2	8	57452	57459	25 %	50 %	25 %	0 %	442556569
1065	NC_020130	TTG	2	6	57460	57465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556569
1066	NC_020130	ATA	2	6	57513	57518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556569
1067	NC_020130	TTA	2	6	57542	57547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556569
1068	NC_020130	ATA	2	6	57584	57589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556569
1069	NC_020130	AAAT	2	8	57609	57616	75 %	25 %	0 %	0 %	442556569
1070	NC_020130	AAT	2	6	57619	57624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556569
1071	NC_020130	TAG	2	6	57642	57647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556569
1072	NC_020130	T	6	6	57652	57657	0 %	100 %	0 %	0 %	442556569
1073	NC_020130	A	7	7	57663	57669	100 %	0 %	0 %	0 %	442556569
1074	NC_020130	T	6	6	57684	57689	0 %	100 %	0 %	0 %	442556569
1075	NC_020130	AT	7	14	57697	57710	50 %	50 %	0 %	0 %	442556569
1076	NC_020130	AT	3	6	57721	57726	50 %	50 %	0 %	0 %	442556569
1077	NC_020130	ATA	2	6	57738	57743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556569
1078	NC_020130	TA	3	6	57742	57747	50 %	50 %	0 %	0 %	442556569
1079	NC_020130	AATA	2	8	60343	60350	75 %	25 %	0 %	0 %	442556570
1080	NC_020130	T	6	6	60393	60398	0 %	100 %	0 %	0 %	442556570
1081	NC_020130	CATT	2	8	60443	60450	25 %	50 %	0 %	25 %	442556570
1082	NC_020130	TCT	2	6	60485	60490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556570
1083	NC_020130	ACC	2	6	60576	60581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556570
1084	NC_020130	T	6	6	60644	60649	0 %	100 %	0 %	0 %	442556570
1085	NC_020130	CA	3	6	60678	60683	50 %	0 %	0 %	50 %	442556570
1086	NC_020130	TG	3	6	60733	60738	0 %	50 %	50 %	0 %	442556570
1087	NC_020130	AT	3	6	60745	60750	50 %	50 %	0 %	0 %	442556570
1088	NC_020130	AACT	2	8	60758	60765	50 %	25 %	0 %	25 %	442556570
1089	NC_020130	TTC	2	6	60930	60935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556570
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1091	NC_020130	ATA	2	6	61184	61189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556570
1092	NC_020130	CTTT	2	8	61225	61232	0 %	75 %	0 %	25 %	442556570
1093	NC_020130	T	6	6	61254	61259	0 %	100 %	0 %	0 %	442556570
1094	NC_020130	CTTT	2	8	61261	61268	0 %	75 %	0 %	25 %	442556570
1095	NC_020130	T	7	7	61286	61292	0 %	100 %	0 %	0 %	442556570
1096	NC_020130	GGT	2	6	61483	61488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442556570
1097	NC_020130	GAA	3	9	61489	61497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556570
1098	NC_020130	ACT	2	6	61516	61521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556570
1099	NC_020130	TCA	2	6	61534	61539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556570
1100	NC_020130	TAG	2	6	61577	61582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556570
1101	NC_020130	CTT	2	6	61598	61603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556570
1102	NC_020130	CTT	2	6	61619	61624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556570
1103	NC_020130	GATG	2	8	61648	61655	25 %	25 %	50 %	0 %	442556570
1104	NC_020130	GAACCT	2	12	61690	61701	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	442556570
1105	NC_020130	TCT	2	6	61702	61707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556570
1106	NC_020130	AGA	2	6	61752	61757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556570
1107	NC_020130	CTT	2	6	61781	61786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556570
1108	NC_020130	CTA	2	6	61804	61809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556570
1109	NC_020130	AGA	2	6	61845	61850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556570
1110	NC_020130	TTG	5	15	61854	61868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556570
1111	NC_020130	ATAC	2	8	61901	61908	50 %	25 %	0 %	25 %	442556570
1112	NC_020130	TC	3	6	61912	61917	0 %	50 %	0 %	50 %	442556570
1113	NC_020130	GGC	2	6	61945	61950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442556570
1114	NC_020130	ATC	2	6	61956	61961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556570
1115	NC_020130	CT	3	6	61974	61979	0 %	50 %	0 %	50 %	442556570
1116	NC_020130	GAG	3	9	62018	62026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442556570
1117	NC_020130	TTG	2	6	62048	62053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556570
1118	NC_020130	CTT	2	6	62087	62092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556570
1119	NC_020130	TTG	2	6	62109	62114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556570
1120	NC_020130	CTG	2	6	62223	62228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556570
1121	NC_020130	TCTT	2	8	62241	62248	0 %	75 %	0 %	25 %	442556570
1122	NC_020130	T	9	9	62277	62285	0 %	100 %	0 %	0 %	442556570
1123	NC_020130	TAA	2	6	62294	62299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556570
1124	NC_020130	TTG	2	6	62304	62309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556570
1125	NC_020130	TTC	2	6	62316	62321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556570
1126	NC_020130	TTA	2	6	62330	62335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556570
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1128	NC_020130	A	6	6	62367	62372	100 %	0 %	0 %	0 %	442556570
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1251	NC_020130	A	7	7	66140	66146	100 %	0 %	0 %	0 %	442556572
1252	NC_020130	GA	3	6	66260	66265	50 %	0 %	50 %	0 %	442556572
1253	NC_020130	AT	3	6	66280	66285	50 %	50 %	0 %	0 %	442556572
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1381	NC_020130	AAGA	2	8	72687	72694	75 %	0 %	25 %	0 %	442556574
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