MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 3

Total Repeats: 4087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020130	CAA	2	6	24182	24187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556554
502	NC_020130	TTG	2	6	24216	24221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556554
503	NC_020130	T	6	6	24229	24234	0 %	100 %	0 %	0 %	442556554
504	NC_020130	T	8	8	24295	24302	0 %	100 %	0 %	0 %	442556554
505	NC_020130	AAG	2	6	24333	24338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556554
506	NC_020130	TTTC	2	8	24350	24357	0 %	75 %	0 %	25 %	442556554
507	NC_020130	GA	3	6	24470	24475	50 %	0 %	50 %	0 %	442556554
508	NC_020130	ATT	2	6	24486	24491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556554
509	NC_020130	TAAG	3	12	24493	24504	50 %	25 %	25 %	0 %	442556554
510	NC_020130	ATA	2	6	24508	24513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556554
511	NC_020130	AATA	2	8	24519	24526	75 %	25 %	0 %	0 %	442556554
512	NC_020130	GAA	2	6	24572	24577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556554
513	NC_020130	AATG	2	8	24588	24595	50 %	25 %	25 %	0 %	442556554
514	NC_020130	TAAG	2	8	24606	24613	50 %	25 %	25 %	0 %	442556554
515	NC_020130	TAA	2	6	24621	24626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556554
516	NC_020130	AAAAAG	2	12	24651	24662	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	442556554
517	NC_020130	GAA	2	6	24700	24705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556554
518	NC_020130	CAG	2	6	24742	24747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556554
519	NC_020130	A	6	6	24756	24761	100 %	0 %	0 %	0 %	442556554
520	NC_020130	ATA	2	6	24777	24782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556554
521	NC_020130	ACA	2	6	24787	24792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556554
522	NC_020130	AAAG	2	8	24899	24906	75 %	0 %	25 %	0 %	442556554
523	NC_020130	A	6	6	24942	24947	100 %	0 %	0 %	0 %	442556554
524	NC_020130	TGA	2	6	24995	25000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556554
525	NC_020130	A	7	7	25000	25006	100 %	0 %	0 %	0 %	442556554
526	NC_020130	CAG	2	6	25037	25042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556554
527	NC_020130	AGC	2	6	25065	25070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556554
528	NC_020130	TAT	2	6	25154	25159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556554
529	NC_020130	CCAG	2	8	25161	25168	25 %	0 %	25 %	50 %	442556554
530	NC_020130	A	6	6	25191	25196	100 %	0 %	0 %	0 %	442556554
531	NC_020130	A	7	7	25206	25212	100 %	0 %	0 %	0 %	442556554
532	NC_020130	ATG	2	6	25255	25260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556554
533	NC_020130	GTT	2	6	25415	25420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556554
534	NC_020130	TAA	2	6	25505	25510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556554
535	NC_020130	TCA	2	6	25535	25540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556554
536	NC_020130	TTA	2	6	25543	25548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556554
537	NC_020130	AT	3	6	25559	25564	50 %	50 %	0 %	0 %	442556554
538	NC_020130	TGT	2	6	25572	25577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556554
539	NC_020130	A	7	7	25579	25585	100 %	0 %	0 %	0 %	442556554
540	NC_020130	TAAAA	2	10	25616	25625	80 %	20 %	0 %	0 %	442556554
541	NC_020130	A	6	6	25622	25627	100 %	0 %	0 %	0 %	442556554
542	NC_020130	ATTG	2	8	25630	25637	25 %	50 %	25 %	0 %	442556554
543	NC_020130	TA	3	6	25668	25673	50 %	50 %	0 %	0 %	442556554
544	NC_020130	AAT	2	6	25689	25694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556554
545	NC_020130	GAG	2	6	25707	25712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442556554
546	NC_020130	AAG	2	6	25713	25718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556554
547	NC_020130	T	6	6	25746	25751	0 %	100 %	0 %	0 %	442556554
548	NC_020130	ATCC	2	8	25768	25775	25 %	25 %	0 %	50 %	442556554
549	NC_020130	AGAA	2	8	25780	25787	75 %	0 %	25 %	0 %	442556554
550	NC_020130	AAG	2	6	25824	25829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556554
551	NC_020130	AGA	2	6	25857	25862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556554
552	NC_020130	AT	3	6	25866	25871	50 %	50 %	0 %	0 %	442556554
553	NC_020130	A	6	6	25884	25889	100 %	0 %	0 %	0 %	442556554
554	NC_020130	TGC	2	6	25899	25904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556554
555	NC_020130	AG	3	6	26027	26032	50 %	0 %	50 %	0 %	442556554
556	NC_020130	TA	3	6	26123	26128	50 %	50 %	0 %	0 %	442556554
557	NC_020130	TGT	2	6	26140	26145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556554
558	NC_020130	ATA	2	6	26182	26187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556554
559	NC_020130	A	8	8	26187	26194	100 %	0 %	0 %	0 %	442556554
560	NC_020130	TAA	2	6	26199	26204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556554
561	NC_020130	CCT	2	6	26254	26259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556554
562	NC_020130	A	6	6	26314	26319	100 %	0 %	0 %	0 %	442556554
563	NC_020130	TAG	2	6	26325	26330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556554
564	NC_020130	T	6	6	26375	26380	0 %	100 %	0 %	0 %	442556554
565	NC_020130	AGGGAA	2	12	26382	26393	50 %	0 %	50 %	0 %	442556554
566	NC_020130	ATT	2	6	30187	30192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556555
567	NC_020130	TAT	2	6	30199	30204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556555
568	NC_020130	GTT	2	6	30240	30245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556555
569	NC_020130	TCT	2	6	30255	30260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556555
570	NC_020130	T	6	6	30295	30300	0 %	100 %	0 %	0 %	442556555
571	NC_020130	ATAA	2	8	30311	30318	75 %	25 %	0 %	0 %	442556555
572	NC_020130	ATCC	2	8	30393	30400	25 %	25 %	0 %	50 %	442556555
573	NC_020130	ATC	2	6	30506	30511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556555
574	NC_020130	GT	4	8	30608	30615	0 %	50 %	50 %	0 %	442556555
575	NC_020130	TGC	2	6	30713	30718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556555
576	NC_020130	TCT	2	6	30750	30755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556555
577	NC_020130	GGTA	2	8	30758	30765	25 %	25 %	50 %	0 %	442556555
578	NC_020130	TG	4	8	30850	30857	0 %	50 %	50 %	0 %	442556555
579	NC_020130	GATG	2	8	30885	30892	25 %	25 %	50 %	0 %	442556555
580	NC_020130	AAG	2	6	30980	30985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556555
581	NC_020130	TGT	2	6	31014	31019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556555
582	NC_020130	TTA	2	6	31026	31031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556555
583	NC_020130	ATGT	2	8	31036	31043	25 %	50 %	25 %	0 %	442556555
584	NC_020130	TGA	2	6	31077	31082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556555
585	NC_020130	TAC	2	6	31111	31116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556555
586	NC_020130	TAA	2	6	31138	31143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556555
587	NC_020130	AAT	2	6	31232	31237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556556
588	NC_020130	T	6	6	31268	31273	0 %	100 %	0 %	0 %	442556556
589	NC_020130	GA	3	6	31283	31288	50 %	0 %	50 %	0 %	442556556
590	NC_020130	AATCAA	2	12	31360	31371	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	442556556
591	NC_020130	GTAA	2	8	31457	31464	50 %	25 %	25 %	0 %	442556556
592	NC_020130	ATA	2	6	31483	31488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556556
593	NC_020130	ATA	2	6	31505	31510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556556
594	NC_020130	GCG	2	6	31556	31561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442556556
595	NC_020130	T	6	6	31598	31603	0 %	100 %	0 %	0 %	442556556
596	NC_020130	TCA	2	6	31635	31640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556556
597	NC_020130	TTC	2	6	31736	31741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556556
598	NC_020130	CAA	2	6	31816	31821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556556
599	NC_020130	TAA	2	6	31822	31827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556556
600	NC_020130	T	7	7	31832	31838	0 %	100 %	0 %	0 %	442556556
601	NC_020130	CTT	2	6	31876	31881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556556
602	NC_020130	TGC	2	6	31889	31894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556556
603	NC_020130	TTC	2	6	31895	31900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556556
604	NC_020130	CTT	2	6	32443	32448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556557
605	NC_020130	TGT	2	6	32453	32458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556557
606	NC_020130	TTG	2	6	32462	32467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556557
607	NC_020130	AGAA	2	8	32498	32505	75 %	0 %	25 %	0 %	442556557
608	NC_020130	TCT	2	6	32517	32522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556557
609	NC_020130	TCA	2	6	32566	32571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556557
610	NC_020130	AAT	2	6	32759	32764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556557
611	NC_020130	TCT	2	6	32796	32801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556557
612	NC_020130	TAC	2	6	32815	32820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556557
613	NC_020130	A	6	6	32912	32917	100 %	0 %	0 %	0 %	442556557
614	NC_020130	TCC	2	6	32959	32964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556558
615	NC_020130	GCA	2	6	33011	33016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556558
616	NC_020130	ATA	2	6	33140	33145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556558
617	NC_020130	TTA	2	6	33146	33151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556558
618	NC_020130	CAT	2	6	33180	33185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556558
619	NC_020130	TGC	2	6	33262	33267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556558
620	NC_020130	A	7	7	33280	33286	100 %	0 %	0 %	0 %	442556558
621	NC_020130	ACC	2	6	33292	33297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556558
622	NC_020130	ACC	2	6	33301	33306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556558
623	NC_020130	AGC	2	6	33307	33312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556558
624	NC_020130	T	7	7	33359	33365	0 %	100 %	0 %	0 %	442556558
625	NC_020130	AAT	2	6	33375	33380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556558
626	NC_020130	GGT	2	6	33449	33454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442556558
627	NC_020130	T	6	6	33456	33461	0 %	100 %	0 %	0 %	442556558
628	NC_020130	A	7	7	33463	33469	100 %	0 %	0 %	0 %	442556558
629	NC_020130	GATA	2	8	33496	33503	50 %	25 %	25 %	0 %	442556558
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