MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 2

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020129	GATG	2	8	2408	2415	25 %	25 %	50 %	0 %	442556511
2	NC_020129	AAGA	2	8	3503	3510	75 %	0 %	25 %	0 %	442556512
3	NC_020129	CTTT	2	8	3531	3538	0 %	75 %	0 %	25 %	442556512
4	NC_020129	TGAT	2	8	3570	3577	25 %	50 %	25 %	0 %	442556512
5	NC_020129	ACCA	2	8	3708	3715	50 %	0 %	0 %	50 %	442556512
6	NC_020129	TGTA	2	8	5103	5110	25 %	50 %	25 %	0 %	442556513
7	NC_020129	TGTT	2	8	5446	5453	0 %	75 %	25 %	0 %	442556513
8	NC_020129	TCCA	2	8	5508	5515	25 %	25 %	0 %	50 %	442556513
9	NC_020129	GTTT	2	8	6080	6087	0 %	75 %	25 %	0 %	442556513
10	NC_020129	GGTT	2	8	6239	6246	0 %	50 %	50 %	0 %	442556513
11	NC_020129	TGAC	2	8	6980	6987	25 %	25 %	25 %	25 %	442556513
12	NC_020129	AATT	2	8	7095	7102	50 %	50 %	0 %	0 %	442556513
13	NC_020129	GTTT	2	8	7764	7771	0 %	75 %	25 %	0 %	442556513
14	NC_020129	AAGT	2	8	9097	9104	50 %	25 %	25 %	0 %	442556514
15	NC_020129	TTCA	2	8	9163	9170	25 %	50 %	0 %	25 %	442556514
16	NC_020129	CTGT	2	8	9354	9361	0 %	50 %	25 %	25 %	442556514
17	NC_020129	TAGT	2	8	10639	10646	25 %	50 %	25 %	0 %	442556515
18	NC_020129	AAAT	2	8	12497	12504	75 %	25 %	0 %	0 %	442556515
19	NC_020129	TTCC	2	8	12883	12890	0 %	50 %	0 %	50 %	442556516
20	NC_020129	AAAT	2	8	12959	12966	75 %	25 %	0 %	0 %	442556516
21	NC_020129	AATA	2	8	13476	13483	75 %	25 %	0 %	0 %	442556516
22	NC_020129	ATAA	2	8	13897	13904	75 %	25 %	0 %	0 %	442556516
23	NC_020129	AAGT	2	8	14038	14045	50 %	25 %	25 %	0 %	442556516
24	NC_020129	TAAA	2	8	14218	14225	75 %	25 %	0 %	0 %	442556516
25	NC_020129	ATGT	2	8	14410	14417	25 %	50 %	25 %	0 %	442556516
26	NC_020129	CATC	2	8	14568	14575	25 %	25 %	0 %	50 %	442556516
27	NC_020129	AGAA	2	8	15544	15551	75 %	0 %	25 %	0 %	442556518
28	NC_020129	CATT	2	8	16644	16651	25 %	50 %	0 %	25 %	442556519
29	NC_020129	GTTG	2	8	17965	17972	0 %	50 %	50 %	0 %	442556520
30	NC_020129	GAAA	2	8	18383	18390	75 %	0 %	25 %	0 %	442556520
31	NC_020129	TTAT	2	8	18624	18631	25 %	75 %	0 %	0 %	442556521
32	NC_020129	AGAT	2	8	19183	19190	50 %	25 %	25 %	0 %	442556521
33	NC_020129	GATT	2	8	19886	19893	25 %	50 %	25 %	0 %	442556522
34	NC_020129	CAGG	2	8	19936	19943	25 %	0 %	50 %	25 %	442556522
35	NC_020129	CATT	2	8	20329	20336	25 %	50 %	0 %	25 %	442556522
36	NC_020129	GACT	2	8	20907	20914	25 %	25 %	25 %	25 %	442556523
37	NC_020129	AAAT	2	8	21062	21069	75 %	25 %	0 %	0 %	442556523
38	NC_020129	TTAT	2	8	21302	21309	25 %	75 %	0 %	0 %	442556523
39	NC_020129	TTCC	2	8	21569	21576	0 %	50 %	0 %	50 %	442556523
40	NC_020129	ATTA	2	8	22218	22225	50 %	50 %	0 %	0 %	442556524
41	NC_020129	CTTA	2	8	22276	22283	25 %	50 %	0 %	25 %	442556524
42	NC_020129	TTAG	2	8	22288	22295	25 %	50 %	25 %	0 %	442556524
43	NC_020129	GGCT	2	8	22416	22423	0 %	25 %	50 %	25 %	442556524
44	NC_020129	TTTG	2	8	22840	22847	0 %	75 %	25 %	0 %	442556525
45	NC_020129	ACTA	2	8	23604	23611	50 %	25 %	0 %	25 %	442556525
46	NC_020129	CTTA	2	8	23679	23686	25 %	50 %	0 %	25 %	442556526
47	NC_020129	AGAA	2	8	24210	24217	75 %	0 %	25 %	0 %	442556526
48	NC_020129	TGGA	2	8	24265	24272	25 %	25 %	50 %	0 %	442556526
49	NC_020129	TCTT	2	8	25038	25045	0 %	75 %	0 %	25 %	442556527
50	NC_020129	AATC	2	8	26126	26133	50 %	25 %	0 %	25 %	442556527
51	NC_020129	CATA	2	8	26809	26816	50 %	25 %	0 %	25 %	442556528
52	NC_020129	CTTA	2	8	26831	26838	25 %	50 %	0 %	25 %	442556528
53	NC_020129	AATT	2	8	27637	27644	50 %	50 %	0 %	0 %	442556529
54	NC_020129	TAAT	2	8	27714	27721	50 %	50 %	0 %	0 %	442556529
55	NC_020129	ACTG	2	8	28143	28150	25 %	25 %	25 %	25 %	442556529
56	NC_020129	AGTA	2	8	28186	28193	50 %	25 %	25 %	0 %	442556529
57	NC_020129	CTTT	2	8	28317	28324	0 %	75 %	0 %	25 %	442556529
58	NC_020129	TAGA	2	8	28566	28573	50 %	25 %	25 %	0 %	442556529
59	NC_020129	ATTA	2	8	33891	33898	50 %	50 %	0 %	0 %	442556531
60	NC_020129	AGAA	2	8	34653	34660	75 %	0 %	25 %	0 %	442556531
61	NC_020129	TGGG	2	8	35952	35959	0 %	25 %	75 %	0 %	442556531
62	NC_020129	TTCT	2	8	37510	37517	0 %	75 %	0 %	25 %	442556532
63	NC_020129	GAAA	2	8	38707	38714	75 %	0 %	25 %	0 %	442556533
64	NC_020129	TTAA	2	8	38783	38790	50 %	50 %	0 %	0 %	442556533
65	NC_020129	TTAC	2	8	39233	39240	25 %	50 %	0 %	25 %	442556533
66	NC_020129	AAAG	2	8	39356	39363	75 %	0 %	25 %	0 %	442556533
67	NC_020129	CAAT	2	8	39772	39779	50 %	25 %	0 %	25 %	442556534
68	NC_020129	TTTG	2	8	39836	39843	0 %	75 %	25 %	0 %	442556534

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.