MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 1

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020128	ATTA	2	8	457	464	50 %	50 %	0 %	0 %	442556481
2	NC_020128	TTAG	2	8	902	909	25 %	50 %	25 %	0 %	442556481
3	NC_020128	CTTC	2	8	1373	1380	0 %	50 %	0 %	50 %	442556481
4	NC_020128	AGCA	2	8	2767	2774	50 %	0 %	25 %	25 %	442556483
5	NC_020128	AAAT	2	8	3396	3403	75 %	25 %	0 %	0 %	442556484
6	NC_020128	AGAT	2	8	3875	3882	50 %	25 %	25 %	0 %	442556484
7	NC_020128	GTAA	2	8	4045	4052	50 %	25 %	25 %	0 %	442556484
8	NC_020128	AGAA	2	8	4374	4381	75 %	0 %	25 %	0 %	442556484
9	NC_020128	TCTT	2	8	4399	4406	0 %	75 %	0 %	25 %	442556484
10	NC_020128	GAAG	2	8	4592	4599	50 %	0 %	50 %	0 %	442556484
11	NC_020128	TCTG	2	8	4768	4775	0 %	50 %	25 %	25 %	442556484
12	NC_020128	TATT	2	8	5086	5093	25 %	75 %	0 %	0 %	442556484
13	NC_020128	AAAT	2	8	5173	5180	75 %	25 %	0 %	0 %	442556484
14	NC_020128	AAAG	2	8	6095	6102	75 %	0 %	25 %	0 %	442556485
15	NC_020128	ATAA	2	8	6255	6262	75 %	25 %	0 %	0 %	442556485
16	NC_020128	TATG	2	8	7114	7121	25 %	50 %	25 %	0 %	442556486
17	NC_020128	TGGT	2	8	8743	8750	0 %	50 %	50 %	0 %	442556488
18	NC_020128	ACAA	2	8	8860	8867	75 %	0 %	0 %	25 %	442556488
19	NC_020128	TCTA	2	8	8875	8882	25 %	50 %	0 %	25 %	442556488
20	NC_020128	AGAA	2	8	9484	9491	75 %	0 %	25 %	0 %	442556488
21	NC_020128	ATAG	2	8	9937	9944	50 %	25 %	25 %	0 %	442556489
22	NC_020128	TAAA	2	8	11013	11020	75 %	25 %	0 %	0 %	442556490
23	NC_020128	TGTA	2	8	11646	11653	25 %	50 %	25 %	0 %	442556491
24	NC_020128	CTAT	2	8	12016	12023	25 %	50 %	0 %	25 %	442556491
25	NC_020128	AAAG	2	8	12486	12493	75 %	0 %	25 %	0 %	442556492
26	NC_020128	TTAG	2	8	13125	13132	25 %	50 %	25 %	0 %	442556493
27	NC_020128	AATA	2	8	13450	13457	75 %	25 %	0 %	0 %	442556493
28	NC_020128	TATT	2	8	13606	13613	25 %	75 %	0 %	0 %	442556493
29	NC_020128	TGTA	2	8	13689	13696	25 %	50 %	25 %	0 %	442556493
30	NC_020128	TGAT	2	8	13785	13792	25 %	50 %	25 %	0 %	442556493
31	NC_020128	TTTA	2	8	14440	14447	25 %	75 %	0 %	0 %	442556494
32	NC_020128	GAAA	2	8	14516	14523	75 %	0 %	25 %	0 %	442556494
33	NC_020128	TTTA	2	8	14950	14957	25 %	75 %	0 %	0 %	442556494
34	NC_020128	TATC	2	8	16297	16304	25 %	50 %	0 %	25 %	442556495
35	NC_020128	AAGG	2	8	17023	17030	50 %	0 %	50 %	0 %	442556495
36	NC_020128	ATCC	2	8	17978	17985	25 %	25 %	0 %	50 %	442556497
37	NC_020128	AACA	2	8	18208	18215	75 %	0 %	0 %	25 %	442556497
38	NC_020128	TATT	2	8	18304	18311	25 %	75 %	0 %	0 %	442556497
39	NC_020128	ATAA	2	8	18698	18705	75 %	25 %	0 %	0 %	442556498
40	NC_020128	GGGA	2	8	18738	18745	25 %	0 %	75 %	0 %	442556498
41	NC_020128	TTAA	2	8	18860	18867	50 %	50 %	0 %	0 %	442556498
42	NC_020128	CTGT	2	8	19796	19803	0 %	50 %	25 %	25 %	442556500
43	NC_020128	TTCT	2	8	20467	20474	0 %	75 %	0 %	25 %	442556501
44	NC_020128	AAAT	2	8	20544	20551	75 %	25 %	0 %	0 %	442556501
45	NC_020128	AAAT	2	8	20589	20596	75 %	25 %	0 %	0 %	442556501
46	NC_020128	TGAA	2	8	21271	21278	50 %	25 %	25 %	0 %	442556502
47	NC_020128	AAAG	2	8	21404	21411	75 %	0 %	25 %	0 %	442556502
48	NC_020128	ATCA	2	8	23442	23449	50 %	25 %	0 %	25 %	442556505
49	NC_020128	AGTT	2	8	23610	23617	25 %	50 %	25 %	0 %	442556505
50	NC_020128	GTAA	2	8	23632	23639	50 %	25 %	25 %	0 %	442556505
51	NC_020128	TTTC	2	8	23739	23746	0 %	75 %	0 %	25 %	442556505
52	NC_020128	CATT	2	8	24188	24195	25 %	50 %	0 %	25 %	442556505
53	NC_020128	TTTA	2	8	24872	24879	25 %	75 %	0 %	0 %	442556506
54	NC_020128	ATTT	2	8	25248	25255	25 %	75 %	0 %	0 %	442556506
55	NC_020128	GGCT	2	8	25390	25397	0 %	25 %	50 %	25 %	442556506
56	NC_020128	TACT	2	8	25496	25503	25 %	50 %	0 %	25 %	442556506
57	NC_020128	GTAT	2	8	25556	25563	25 %	50 %	25 %	0 %	442556506
58	NC_020128	GGTA	2	8	26036	26043	25 %	25 %	50 %	0 %	442556507
59	NC_020128	ATTG	2	8	26358	26365	25 %	50 %	25 %	0 %	442556507
60	NC_020128	CAAT	2	8	26389	26396	50 %	25 %	0 %	25 %	442556507
61	NC_020128	TAAA	2	8	26503	26510	75 %	25 %	0 %	0 %	442556507
62	NC_020128	TAGA	2	8	26563	26570	50 %	25 %	25 %	0 %	442556507
63	NC_020128	AAGT	2	8	26751	26758	50 %	25 %	25 %	0 %	442556507

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.