MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 3187

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020127	AAGG	2	8	1046	1053	50 %	0 %	50 %	0 %	442555262
2	NC_020127	AAAG	2	8	1718	1725	75 %	0 %	25 %	0 %	442555262
3	NC_020127	CATT	2	8	1779	1786	25 %	50 %	0 %	25 %	442555262
4	NC_020127	TTGC	2	8	1844	1851	0 %	50 %	25 %	25 %	442555263
5	NC_020127	TATT	2	8	4130	4137	25 %	75 %	0 %	0 %	442555265
6	NC_020127	TTAT	2	8	5681	5688	25 %	75 %	0 %	0 %	442555267
7	NC_020127	GATG	2	8	6306	6313	25 %	25 %	50 %	0 %	442555267
8	NC_020127	CTTC	2	8	10218	10225	0 %	50 %	0 %	50 %	442555269
9	NC_020127	TGAC	2	8	10669	10676	25 %	25 %	25 %	25 %	442555270
10	NC_020127	TGTT	2	8	10761	10768	0 %	75 %	25 %	0 %	442555270
11	NC_020127	TAAA	2	8	11168	11175	75 %	25 %	0 %	0 %	442555270
12	NC_020127	TTTG	2	8	11623	11630	0 %	75 %	25 %	0 %	442555270
13	NC_020127	TAAT	2	8	11812	11819	50 %	50 %	0 %	0 %	442555270
14	NC_020127	AGGA	2	8	11877	11884	50 %	0 %	50 %	0 %	442555270
15	NC_020127	TGTC	2	8	12639	12646	0 %	50 %	25 %	25 %	442555270
16	NC_020127	TAGT	2	8	13103	13110	25 %	50 %	25 %	0 %	442555270
17	NC_020127	TTTA	2	8	14774	14781	25 %	75 %	0 %	0 %	442555272
18	NC_020127	ATTT	2	8	14809	14816	25 %	75 %	0 %	0 %	442555272
19	NC_020127	GATT	2	8	14913	14920	25 %	50 %	25 %	0 %	442555272
20	NC_020127	GAAG	2	8	15260	15267	50 %	0 %	50 %	0 %	442555272
21	NC_020127	TTGA	2	8	15399	15406	25 %	50 %	25 %	0 %	442555272
22	NC_020127	AGGT	2	8	16185	16192	25 %	25 %	50 %	0 %	442555273
23	NC_020127	AGCA	2	8	16455	16462	50 %	0 %	25 %	25 %	442555273
24	NC_020127	TCGA	2	8	16965	16972	25 %	25 %	25 %	25 %	442555274
25	NC_020127	AATA	2	8	17262	17269	75 %	25 %	0 %	0 %	442555274
26	NC_020127	TAAA	2	8	17715	17722	75 %	25 %	0 %	0 %	442555275
27	NC_020127	TTAT	2	8	18120	18127	25 %	75 %	0 %	0 %	442555275
28	NC_020127	TAAT	2	8	18392	18399	50 %	50 %	0 %	0 %	442555275
29	NC_020127	AATA	2	8	19008	19015	75 %	25 %	0 %	0 %	442555276
30	NC_020127	ACTT	2	8	19425	19432	25 %	50 %	0 %	25 %	442555277
31	NC_020127	CCAT	2	8	19762	19769	25 %	25 %	0 %	50 %	442555277
32	NC_020127	TAAG	2	8	19989	19996	50 %	25 %	25 %	0 %	442555277
33	NC_020127	GAAA	2	8	20354	20361	75 %	0 %	25 %	0 %	442555277
34	NC_020127	AATT	2	8	21151	21158	50 %	50 %	0 %	0 %	442555278
35	NC_020127	CAAG	2	8	22740	22747	50 %	0 %	25 %	25 %	442555280
36	NC_020127	CCAA	2	8	22970	22977	50 %	0 %	0 %	50 %	442555280
37	NC_020127	CCAT	2	8	23105	23112	25 %	25 %	0 %	50 %	442555280
38	NC_020127	GTAA	2	8	24819	24826	50 %	25 %	25 %	0 %	442555282
39	NC_020127	CAAT	2	8	24975	24982	50 %	25 %	0 %	25 %	442555282
40	NC_020127	ATAG	2	8	25013	25020	50 %	25 %	25 %	0 %	442555282
41	NC_020127	TTTA	2	8	25175	25182	25 %	75 %	0 %	0 %	442555283
42	NC_020127	GTAT	2	8	26727	26734	25 %	50 %	25 %	0 %	442555284
43	NC_020127	GATT	2	8	26914	26921	25 %	50 %	25 %	0 %	442555284
44	NC_020127	AGCA	2	8	26934	26941	50 %	0 %	25 %	25 %	442555284
45	NC_020127	TGAA	2	8	26989	26996	50 %	25 %	25 %	0 %	442555284
46	NC_020127	CGAG	2	8	27001	27008	25 %	0 %	50 %	25 %	442555284
47	NC_020127	GAAG	2	8	27019	27026	50 %	0 %	50 %	0 %	442555284
48	NC_020127	GATA	2	8	27317	27324	50 %	25 %	25 %	0 %	442555284
49	NC_020127	ACTT	2	8	27489	27496	25 %	50 %	0 %	25 %	442555284
50	NC_020127	ATTT	2	8	28155	28162	25 %	75 %	0 %	0 %	442555284
51	NC_020127	ACAT	2	8	28864	28871	50 %	25 %	0 %	25 %	442555284
52	NC_020127	ACGA	2	8	29282	29289	50 %	0 %	25 %	25 %	442555284
53	NC_020127	ATTT	2	8	29501	29508	25 %	75 %	0 %	0 %	442555284
54	NC_020127	AGGA	2	8	30406	30413	50 %	0 %	50 %	0 %	442555285
55	NC_020127	TCTT	2	8	30544	30551	0 %	75 %	0 %	25 %	442555285
56	NC_020127	GCTT	2	8	30940	30947	0 %	50 %	25 %	25 %	442555285
57	NC_020127	ATTT	2	8	31633	31640	25 %	75 %	0 %	0 %	442555286
58	NC_020127	ACTT	2	8	32488	32495	25 %	50 %	0 %	25 %	442555287
59	NC_020127	AACA	2	8	32513	32520	75 %	0 %	0 %	25 %	442555287
60	NC_020127	CAGT	2	8	32737	32744	25 %	25 %	25 %	25 %	442555287
61	NC_020127	TCCT	2	8	33241	33248	0 %	50 %	0 %	50 %	442555288
62	NC_020127	TCTT	2	8	33986	33993	0 %	75 %	0 %	25 %	442555288
63	NC_020127	TTAC	2	8	34896	34903	25 %	50 %	0 %	25 %	442555289
64	NC_020127	CTGT	2	8	35242	35249	0 %	50 %	25 %	25 %	442555289
65	NC_020127	CTTT	2	8	35340	35347	0 %	75 %	0 %	25 %	442555289
66	NC_020127	CTAG	2	8	35697	35704	25 %	25 %	25 %	25 %	442555289
67	NC_020127	TAAG	2	8	36046	36053	50 %	25 %	25 %	0 %	442555290
68	NC_020127	TAGT	2	8	37188	37195	25 %	50 %	25 %	0 %	442555291
69	NC_020127	TTGT	2	8	37312	37319	0 %	75 %	25 %	0 %	442555291
70	NC_020127	GTTT	2	8	38554	38561	0 %	75 %	25 %	0 %	442555292
71	NC_020127	TCTG	2	8	38761	38768	0 %	50 %	25 %	25 %	442555292
72	NC_020127	AAAT	2	8	38820	38827	75 %	25 %	0 %	0 %	442555292
73	NC_020127	TAAG	2	8	39086	39093	50 %	25 %	25 %	0 %	442555292
74	NC_020127	AATG	2	8	39537	39544	50 %	25 %	25 %	0 %	442555292
75	NC_020127	CTGA	2	8	40171	40178	25 %	25 %	25 %	25 %	442555292
76	NC_020127	TTGT	2	8	40212	40219	0 %	75 %	25 %	0 %	442555292
77	NC_020127	AGCC	2	8	40472	40479	25 %	0 %	25 %	50 %	442555292
78	NC_020127	GTTA	2	8	40819	40826	25 %	50 %	25 %	0 %	442555292
79	NC_020127	CTAT	2	8	40983	40990	25 %	50 %	0 %	25 %	442555293
80	NC_020127	ATAA	2	8	42178	42185	75 %	25 %	0 %	0 %	442555294
81	NC_020127	TTGC	2	8	42403	42410	0 %	50 %	25 %	25 %	442555294
82	NC_020127	CATT	2	8	42941	42948	25 %	50 %	0 %	25 %	442555295
83	NC_020127	AGTT	2	8	42960	42967	25 %	50 %	25 %	0 %	442555295
84	NC_020127	TTTA	2	8	43341	43348	25 %	75 %	0 %	0 %	442555295
85	NC_020127	GGAT	2	8	43363	43370	25 %	25 %	50 %	0 %	442555295
86	NC_020127	TTTC	2	8	44429	44436	0 %	75 %	0 %	25 %	442555296
87	NC_020127	ACTA	2	8	44572	44579	50 %	25 %	0 %	25 %	442555296
88	NC_020127	CTTT	3	12	44598	44609	0 %	75 %	0 %	25 %	442555296
89	NC_020127	CTTG	2	8	44891	44898	0 %	50 %	25 %	25 %	442555297
90	NC_020127	AGAA	2	8	44963	44970	75 %	0 %	25 %	0 %	442555297
91	NC_020127	GTTC	2	8	45422	45429	0 %	50 %	25 %	25 %	442555298
92	NC_020127	AATG	2	8	45670	45677	50 %	25 %	25 %	0 %	442555298
93	NC_020127	ATAA	2	8	45775	45782	75 %	25 %	0 %	0 %	442555298
94	NC_020127	ACAG	2	8	46065	46072	50 %	0 %	25 %	25 %	442555299
95	NC_020127	TCAG	2	8	46347	46354	25 %	25 %	25 %	25 %	442555299
96	NC_020127	TTCA	2	8	46441	46448	25 %	50 %	0 %	25 %	442555299
97	NC_020127	CAAA	2	8	46544	46551	75 %	0 %	0 %	25 %	442555299
98	NC_020127	TGAC	2	8	47104	47111	25 %	25 %	25 %	25 %	442555299
99	NC_020127	AGTA	2	8	48111	48118	50 %	25 %	25 %	0 %	442555300
100	NC_020127	ATTC	2	8	48919	48926	25 %	50 %	0 %	25 %	442555300
101	NC_020127	TATG	2	8	50008	50015	25 %	50 %	25 %	0 %	442555301
102	NC_020127	GAAG	2	8	51132	51139	50 %	0 %	50 %	0 %	442555302
103	NC_020127	GTAG	2	8	51162	51169	25 %	25 %	50 %	0 %	442555302
104	NC_020127	ATGG	2	8	52184	52191	25 %	25 %	50 %	0 %	442555302
105	NC_020127	GTAT	2	8	52405	52412	25 %	50 %	25 %	0 %	442555302
106	NC_020127	AATC	2	8	52536	52543	50 %	25 %	0 %	25 %	442555302
107	NC_020127	GAAG	2	8	53049	53056	50 %	0 %	50 %	0 %	442555302
108	NC_020127	ATTT	2	8	53997	54004	25 %	75 %	0 %	0 %	442555303
109	NC_020127	AAAT	2	8	54574	54581	75 %	25 %	0 %	0 %	442555303
110	NC_020127	GATC	2	8	54638	54645	25 %	25 %	25 %	25 %	442555303
111	NC_020127	TTCA	2	8	54676	54683	25 %	50 %	0 %	25 %	442555303
112	NC_020127	GTAT	2	8	54999	55006	25 %	50 %	25 %	0 %	442555303
113	NC_020127	ATAA	2	8	55732	55739	75 %	25 %	0 %	0 %	442555303
114	NC_020127	TGTA	2	8	57116	57123	25 %	50 %	25 %	0 %	442555304
115	NC_020127	AGAT	2	8	58232	58239	50 %	25 %	25 %	0 %	442555304
116	NC_020127	AGTA	2	8	58886	58893	50 %	25 %	25 %	0 %	442555304
117	NC_020127	CTCA	2	8	59209	59216	25 %	25 %	0 %	50 %	442555304
118	NC_020127	GATG	2	8	60222	60229	25 %	25 %	50 %	0 %	442555305
119	NC_020127	TTTA	2	8	61578	61585	25 %	75 %	0 %	0 %	442555306
120	NC_020127	TGAT	2	8	61827	61834	25 %	50 %	25 %	0 %	442555306
121	NC_020127	AGTA	2	8	62090	62097	50 %	25 %	25 %	0 %	442555306
122	NC_020127	ATGT	2	8	62344	62351	25 %	50 %	25 %	0 %	442555306
123	NC_020127	AGGT	2	8	64165	64172	25 %	25 %	50 %	0 %	442555307
124	NC_020127	ATCT	2	8	66347	66354	25 %	50 %	0 %	25 %	442555309
125	NC_020127	GCTT	2	8	66395	66402	0 %	50 %	25 %	25 %	442555309
126	NC_020127	GATA	2	8	66440	66447	50 %	25 %	25 %	0 %	442555309
127	NC_020127	CAGT	2	8	67080	67087	25 %	25 %	25 %	25 %	442555309
128	NC_020127	CCAT	2	8	67107	67114	25 %	25 %	0 %	50 %	442555309
129	NC_020127	ATTT	2	8	67186	67193	25 %	75 %	0 %	0 %	442555309
130	NC_020127	GAAA	2	8	67317	67324	75 %	0 %	25 %	0 %	442555309
131	NC_020127	GAAT	2	8	67836	67843	50 %	25 %	25 %	0 %	442555309
132	NC_020127	TAAA	2	8	68329	68336	75 %	25 %	0 %	0 %	442555309
133	NC_020127	TATT	2	8	68371	68378	25 %	75 %	0 %	0 %	442555309
134	NC_020127	TAAT	2	8	68614	68621	50 %	50 %	0 %	0 %	442555309
135	NC_020127	TTGG	2	8	68710	68717	0 %	50 %	50 %	0 %	442555309
136	NC_020127	GTAT	2	8	69102	69109	25 %	50 %	25 %	0 %	442555310
137	NC_020127	TAAA	2	8	69122	69129	75 %	25 %	0 %	0 %	442555310
138	NC_020127	TGTT	2	8	69305	69312	0 %	75 %	25 %	0 %	442555310
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