MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 20007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020127	ACA	2	6	373	378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555262
2	NC_020127	TAG	2	6	449	454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555262
3	NC_020127	ATT	2	6	474	479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555262
4	NC_020127	AGG	2	6	564	569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555262
5	NC_020127	TAA	3	9	639	647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555262
6	NC_020127	ACA	2	6	648	653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555262
7	NC_020127	AAG	2	6	696	701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555262
8	NC_020127	TGT	2	6	798	803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555262
9	NC_020127	TAA	2	6	813	818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555262
10	NC_020127	TGC	3	9	828	836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555262
11	NC_020127	GGA	2	6	987	992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555262
12	NC_020127	AGA	2	6	1109	1114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555262
13	NC_020127	GTT	2	6	1168	1173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555262
14	NC_020127	GAT	2	6	1483	1488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555262
15	NC_020127	TAT	2	6	1509	1514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555262
16	NC_020127	TGT	2	6	1584	1589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555262
17	NC_020127	AGA	2	6	1666	1671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555262
18	NC_020127	TTA	2	6	1824	1829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555263
19	NC_020127	GAT	2	6	1955	1960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555263
20	NC_020127	TTG	2	6	2058	2063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555263
21	NC_020127	AAC	2	6	2080	2085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555263
22	NC_020127	GTA	2	6	2197	2202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555263
23	NC_020127	TGA	2	6	2226	2231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555263
24	NC_020127	TCT	2	6	2281	2286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555263
25	NC_020127	TGC	2	6	2310	2315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555263
26	NC_020127	TGT	2	6	2343	2348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555263
27	NC_020127	GAC	2	6	2390	2395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555263
28	NC_020127	AAT	2	6	2424	2429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555263
29	NC_020127	CCA	2	6	2440	2445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555263
30	NC_020127	TGC	2	6	2538	2543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555263
31	NC_020127	TTC	2	6	2544	2549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555263
32	NC_020127	CCT	2	6	2551	2556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555263
33	NC_020127	AGA	2	6	2575	2580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555263
34	NC_020127	TTC	2	6	2670	2675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555263
35	NC_020127	TAA	2	6	2711	2716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555263
36	NC_020127	TGT	2	6	2737	2742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555263
37	NC_020127	AGT	2	6	2766	2771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555263
38	NC_020127	GTT	2	6	3187	3192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555264
39	NC_020127	TGA	2	6	3477	3482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555265
40	NC_020127	TTA	2	6	3533	3538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555265
41	NC_020127	TAA	2	6	3561	3566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555265
42	NC_020127	TGG	2	6	3747	3752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555265
43	NC_020127	ACA	2	6	3771	3776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555265
44	NC_020127	GAA	2	6	3904	3909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555265
45	NC_020127	ATT	3	9	3994	4002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555265
46	NC_020127	TAA	2	6	4007	4012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555265
47	NC_020127	GTA	2	6	4054	4059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555265
48	NC_020127	GTT	2	6	4141	4146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555265
49	NC_020127	TAA	2	6	4154	4159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555265
50	NC_020127	TAA	2	6	4207	4212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555265
51	NC_020127	CAC	3	9	4369	4377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555266
52	NC_020127	CAC	2	6	4411	4416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555266
53	NC_020127	CAT	2	6	4618	4623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555266
54	NC_020127	CAG	2	6	4627	4632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555266
55	NC_020127	TCC	2	6	4643	4648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555266
56	NC_020127	TCA	2	6	4767	4772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555266
57	NC_020127	TAC	2	6	4808	4813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555266
58	NC_020127	ATA	2	6	4878	4883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555266
59	NC_020127	GAA	2	6	5585	5590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555267
60	NC_020127	ATG	2	6	5666	5671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555267
61	NC_020127	GGT	2	6	5744	5749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555267
62	NC_020127	TAA	2	6	5830	5835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555267
63	NC_020127	TTG	2	6	6141	6146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555267
64	NC_020127	ATT	3	9	6179	6187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555267
65	NC_020127	TCT	2	6	6283	6288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555267
66	NC_020127	TTG	2	6	6480	6485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555267
67	NC_020127	ACT	2	6	6511	6516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555267
68	NC_020127	AAC	2	6	6565	6570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555267
69	NC_020127	ATT	2	6	6584	6589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555267
70	NC_020127	CAG	2	6	6636	6641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555267
71	NC_020127	CAA	2	6	6669	6674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555267
72	NC_020127	ATT	2	6	6695	6700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555267
73	NC_020127	TGT	2	6	6760	6765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555267
74	NC_020127	TAT	2	6	6937	6942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555267
75	NC_020127	TAG	3	9	7008	7016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555267
76	NC_020127	ATT	2	6	7028	7033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555267
77	NC_020127	CAA	2	6	7079	7084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555267
78	NC_020127	AAG	2	6	7113	7118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555267
79	NC_020127	TCT	2	6	7774	7779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555268
80	NC_020127	CAT	2	6	7851	7856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555268
81	NC_020127	AAT	2	6	7860	7865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555268
82	NC_020127	ATA	2	6	9693	9698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555269
83	NC_020127	ATA	2	6	9757	9762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555269
84	NC_020127	ATA	2	6	9837	9842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555269
85	NC_020127	TGT	2	6	9843	9848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555269
86	NC_020127	TTA	2	6	9907	9912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555269
87	NC_020127	GTA	2	6	9918	9923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555269
88	NC_020127	TTC	2	6	9929	9934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555269
89	NC_020127	TTC	2	6	9938	9943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555269
90	NC_020127	GAG	2	6	9954	9959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555269
91	NC_020127	GTT	2	6	10027	10032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555269
92	NC_020127	ACA	2	6	10055	10060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555269
93	NC_020127	AGT	2	6	10092	10097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555269
94	NC_020127	AGC	2	6	10103	10108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555269
95	NC_020127	TCA	2	6	10203	10208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555269
96	NC_020127	TAA	2	6	10235	10240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555269
97	NC_020127	AGC	2	6	10325	10330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555269
98	NC_020127	AAT	2	6	10376	10381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555269
99	NC_020127	GGA	2	6	10392	10397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555269
100	NC_020127	TAT	2	6	10408	10413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555269
101	NC_020127	TTG	3	9	10475	10483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555269
102	NC_020127	ATT	2	6	10535	10540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555270
103	NC_020127	TAA	2	6	10814	10819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555270
104	NC_020127	CTT	2	6	10844	10849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555270
105	NC_020127	ATA	2	6	10892	10897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555270
106	NC_020127	TTA	2	6	10990	10995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555270
107	NC_020127	GCA	2	6	11059	11064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555270
108	NC_020127	GAA	2	6	11072	11077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555270
109	NC_020127	AAT	2	6	11181	11186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555270
110	NC_020127	CTT	2	6	11189	11194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555270
111	NC_020127	ATG	2	6	11266	11271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555270
112	NC_020127	AAT	2	6	11322	11327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555270
113	NC_020127	ACA	2	6	11341	11346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555270
114	NC_020127	AAG	2	6	11414	11419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555270
115	NC_020127	CCA	2	6	11434	11439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555270
116	NC_020127	CAC	2	6	11515	11520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555270
117	NC_020127	TAA	2	6	11564	11569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555270
118	NC_020127	TTC	2	6	11745	11750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555270
119	NC_020127	GTA	2	6	11833	11838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555270
120	NC_020127	AAT	2	6	11896	11901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555270
121	NC_020127	CTT	2	6	11920	11925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555270
122	NC_020127	TGC	2	6	11949	11954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555270
123	NC_020127	TTG	2	6	11987	11992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555270
124	NC_020127	AAG	2	6	12138	12143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555270
125	NC_020127	TTG	2	6	12222	12227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555270
126	NC_020127	CTT	2	6	12343	12348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555270
127	NC_020127	ATG	2	6	12513	12518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555270
128	NC_020127	GTT	2	6	12602	12607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555270
129	NC_020127	TAA	2	6	12692	12697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555270
130	NC_020127	TTG	2	6	12765	12770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555270
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251	NC_020127	ATA	2	6	21482	21487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555278
252	NC_020127	CTA	2	6	21516	21521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555279
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255	NC_020127	AAG	2	6	21759	21764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555279
256	NC_020127	TGA	2	6	21766	21771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555279
257	NC_020127	TCA	2	6	21865	21870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555279
258	NC_020127	ATT	2	6	21993	21998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555279
259	NC_020127	AAG	2	6	22077	22082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555279
260	NC_020127	CTG	2	6	22088	22093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555279
261	NC_020127	AGA	2	6	22216	22221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555279
262	NC_020127	TGT	2	6	22234	22239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555279
263	NC_020127	TTG	2	6	22251	22256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555279
264	NC_020127	ATA	2	6	22261	22266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555279
265	NC_020127	TGC	2	6	22402	22407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555279
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268	NC_020127	ATA	2	6	22543	22548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555280
269	NC_020127	TAA	2	6	22573	22578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555280
270	NC_020127	AGA	2	6	22614	22619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555280
271	NC_020127	TAC	2	6	22702	22707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555280
272	NC_020127	AGG	2	6	22715	22720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555280
273	NC_020127	TGA	2	6	22756	22761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555280
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275	NC_020127	CTG	2	6	22808	22813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555280
276	NC_020127	AAC	2	6	22851	22856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555280
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280	NC_020127	TGC	2	6	23072	23077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555280
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282	NC_020127	ATA	2	6	23249	23254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555281
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284	NC_020127	ATC	2	6	23428	23433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555281
285	NC_020127	CTT	2	6	23562	23567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555281
286	NC_020127	ACT	2	6	23602	23607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555281
287	NC_020127	ATA	2	6	23623	23628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555281
288	NC_020127	TCA	2	6	23642	23647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555281
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292	NC_020127	TGA	2	6	24010	24015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555281
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301	NC_020127	ATA	2	6	24723	24728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555282
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324	NC_020127	TCC	2	6	25787	25792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555283
325	NC_020127	GCA	2	6	25866	25871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555283
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328	NC_020127	ATA	2	6	26329	26334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555284
329	NC_020127	TTC	2	6	26367	26372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555284
330	NC_020127	CAT	2	6	26402	26407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555284
331	NC_020127	TTC	2	6	26415	26420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555284
332	NC_020127	TTA	2	6	26551	26556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555284
333	NC_020127	TTC	2	6	26613	26618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555284
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336	NC_020127	ACA	2	6	26875	26880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555284
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342	NC_020127	TCT	2	6	27527	27532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555284
343	NC_020127	CAG	2	6	27557	27562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555284
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347	NC_020127	GCT	2	6	27638	27643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555284
348	NC_020127	ATA	2	6	27655	27660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555284
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351	NC_020127	TTC	2	6	27828	27833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555284
352	NC_020127	ATA	2	6	27958	27963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555284
353	NC_020127	GCT	2	6	28255	28260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555284
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359	NC_020127	TCC	2	6	28779	28784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555284
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362	NC_020127	CAA	2	6	28895	28900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555284
363	NC_020127	GTT	2	6	28951	28956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555284
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367	NC_020127	GCT	2	6	29275	29280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555284
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370	NC_020127	GGA	2	6	29368	29373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555284
371	NC_020127	ACA	2	6	29461	29466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555284
372	NC_020127	AAT	2	6	29532	29537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555284
373	NC_020127	ATT	2	6	29595	29600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555284
374	NC_020127	TTC	2	6	29622	29627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555284
375	NC_020127	GCA	2	6	29647	29652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555284
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379	NC_020127	AAG	2	6	29739	29744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555284
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