MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 31162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020127	TAG	2	6	197493	197498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555418
4002	NC_020127	TAA	2	6	197511	197516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555418
4003	NC_020127	ATT	2	6	197566	197571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555418
4004	NC_020127	AGC	2	6	197590	197595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555418
4005	NC_020127	ATA	3	9	197600	197608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555418
4006	NC_020127	ACCT	2	8	197683	197690	25 %	25 %	0 %	50 %	442555418
4007	NC_020127	CTT	2	6	197744	197749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555418
4008	NC_020127	T	6	6	197773	197778	0 %	100 %	0 %	0 %	442555418
4009	NC_020127	AGT	2	6	197826	197831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555418
4010	NC_020127	CTT	2	6	197967	197972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555419
4011	NC_020127	TATT	2	8	197973	197980	25 %	75 %	0 %	0 %	442555419
4012	NC_020127	ATT	2	6	198007	198012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555419
4013	NC_020127	GTT	2	6	198071	198076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555419
4014	NC_020127	TTTA	2	8	198145	198152	25 %	75 %	0 %	0 %	442555419
4015	NC_020127	T	7	7	198201	198207	0 %	100 %	0 %	0 %	442555419
4016	NC_020127	AGA	2	6	198227	198232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555419
4017	NC_020127	TCC	2	6	198244	198249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555419
4018	NC_020127	GTT	2	6	198279	198284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555419
4019	NC_020127	AGCT	2	8	198333	198340	25 %	25 %	25 %	25 %	442555419
4020	NC_020127	TGC	2	6	198370	198375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555419
4021	NC_020127	TCT	2	6	198443	198448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555419
4022	NC_020127	AGAA	2	8	198451	198458	75 %	0 %	25 %	0 %	442555419
4023	NC_020127	ACC	2	6	198463	198468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555419
4024	NC_020127	GTA	2	6	198494	198499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555419
4025	NC_020127	GTT	3	9	198500	198508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555419
4026	NC_020127	AAG	2	6	198580	198585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555419
4027	NC_020127	AAT	2	6	198631	198636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555419
4028	NC_020127	CTT	2	6	198702	198707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555419
4029	NC_020127	TTG	2	6	198731	198736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555419
4030	NC_020127	TCC	2	6	198802	198807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555419
4031	NC_020127	ACC	2	6	198976	198981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555419
4032	NC_020127	ATA	2	6	198982	198987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555419
4033	NC_020127	ATTT	2	8	199014	199021	25 %	75 %	0 %	0 %	442555419
4034	NC_020127	TTG	2	6	199029	199034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555419
4035	NC_020127	TAT	2	6	199150	199155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555419
4036	NC_020127	T	7	7	199245	199251	0 %	100 %	0 %	0 %	442555420
4037	NC_020127	ACC	2	6	199272	199277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555420
4038	NC_020127	GTA	2	6	199366	199371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555420
4039	NC_020127	TA	3	6	199400	199405	50 %	50 %	0 %	0 %	442555420
4040	NC_020127	ACC	2	6	199434	199439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555420
4041	NC_020127	AGC	2	6	199440	199445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555420
4042	NC_020127	TAC	2	6	199475	199480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555420
4043	NC_020127	TGT	2	6	199490	199495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555420
4044	NC_020127	T	7	7	199514	199520	0 %	100 %	0 %	0 %	442555420
4045	NC_020127	CATA	2	8	199535	199542	50 %	25 %	0 %	25 %	442555420
4046	NC_020127	T	6	6	199586	199591	0 %	100 %	0 %	0 %	442555420
4047	NC_020127	T	6	6	199609	199614	0 %	100 %	0 %	0 %	442555420
4048	NC_020127	TCT	2	6	199651	199656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555420
4049	NC_020127	CAT	2	6	199679	199684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555420
4050	NC_020127	TTC	2	6	199749	199754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555420
4051	NC_020127	CAA	2	6	199784	199789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555420
4052	NC_020127	GA	3	6	199852	199857	50 %	0 %	50 %	0 %	442555420
4053	NC_020127	TTG	2	6	199898	199903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555420
4054	NC_020127	ACC	2	6	199911	199916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555420
4055	NC_020127	GCAA	2	8	199923	199930	50 %	0 %	25 %	25 %	442555420
4056	NC_020127	AAGCAC	2	12	199985	199996	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	442555420
4057	NC_020127	ACA	2	6	200002	200007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555420
4058	NC_020127	CTT	2	6	200108	200113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555420
4059	NC_020127	ACC	2	6	200148	200153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555420
4060	NC_020127	AAT	2	6	200169	200174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555420
4061	NC_020127	CACTAG	2	12	200231	200242	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	442555420
4062	NC_020127	CTTT	2	8	200413	200420	0 %	75 %	0 %	25 %	442555420
4063	NC_020127	ATT	2	6	200424	200429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555420
4064	NC_020127	TAC	2	6	200460	200465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555420
4065	NC_020127	T	6	6	200617	200622	0 %	100 %	0 %	0 %	442555421
4066	NC_020127	TCA	2	6	200631	200636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555421
4067	NC_020127	CTT	2	6	200656	200661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555421
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4069	NC_020127	TCT	2	6	200709	200714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555421
4070	NC_020127	CAG	2	6	200743	200748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555421
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4073	NC_020127	T	7	7	200773	200779	0 %	100 %	0 %	0 %	442555421
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4078	NC_020127	CAT	2	6	201049	201054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555422
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4080	NC_020127	AGCC	2	8	201163	201170	25 %	0 %	25 %	50 %	442555422
4081	NC_020127	TGC	3	9	201173	201181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555422
4082	NC_020127	ACCTG	2	10	201189	201198	20 %	20 %	20 %	40 %	442555422
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4087	NC_020127	TAA	2	6	201347	201352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555422
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4089	NC_020127	A	6	6	201425	201430	100 %	0 %	0 %	0 %	442555422
4090	NC_020127	ATC	2	6	201440	201445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555422
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4092	NC_020127	TAA	2	6	201544	201549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555422
4093	NC_020127	TAA	2	6	201756	201761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555423
4094	NC_020127	CCA	2	6	201795	201800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555423
4095	NC_020127	CTGA	2	8	201826	201833	25 %	25 %	25 %	25 %	442555423
4096	NC_020127	GCA	2	6	201879	201884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555423
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4098	NC_020127	AG	3	6	201935	201940	50 %	0 %	50 %	0 %	442555423
4099	NC_020127	GAA	2	6	202027	202032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555423
4100	NC_020127	TAG	2	6	202033	202038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555423
4101	NC_020127	CTT	2	6	202078	202083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555423
4102	NC_020127	TAA	2	6	202096	202101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555423
4103	NC_020127	A	6	6	202100	202105	100 %	0 %	0 %	0 %	442555423
4104	NC_020127	GTC	2	6	202109	202114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555423
4105	NC_020127	CTT	2	6	202136	202141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555423
4106	NC_020127	TCC	3	9	202148	202156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555423
4107	NC_020127	AGTA	2	8	202160	202167	50 %	25 %	25 %	0 %	442555423
4108	NC_020127	AAG	2	6	202168	202173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555423
4109	NC_020127	TTG	2	6	202219	202224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555423
4110	NC_020127	T	8	8	202231	202238	0 %	100 %	0 %	0 %	442555423
4111	NC_020127	AAG	2	6	202334	202339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555423
4112	NC_020127	T	6	6	202448	202453	0 %	100 %	0 %	0 %	442555423
4113	NC_020127	TTA	2	6	202456	202461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555423
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4116	NC_020127	TA	3	6	202607	202612	50 %	50 %	0 %	0 %	442555423
4117	NC_020127	CAATC	2	10	202639	202648	40 %	20 %	0 %	40 %	442555423
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4248	NC_020127	TCA	2	6	208837	208842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555430
4249	NC_020127	TCA	2	6	209023	209028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555430
4250	NC_020127	GA	3	6	209117	209122	50 %	0 %	50 %	0 %	442555430
4251	NC_020127	CAT	2	6	209234	209239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555430
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4492	NC_020127	TTG	2	6	222126	222131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555437
4493	NC_020127	AGT	2	6	222239	222244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555437
4494	NC_020127	GC	3	6	222275	222280	0 %	0 %	50 %	50 %	442555437
4495	NC_020127	AAC	2	6	222326	222331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555437
4496	NC_020127	GAGG	2	8	222433	222440	25 %	0 %	75 %	0 %	442555437
4497	NC_020127	A	6	6	222446	222451	100 %	0 %	0 %	0 %	442555437
4498	NC_020127	TGC	2	6	222481	222486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555437
4499	NC_020127	CAA	2	6	222522	222527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555437
4500	NC_020127	TGA	2	6	222538	222543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555437

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