MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 31162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_020127	CAT	2	6	1449916	1449921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556473
31003	NC_020127	TTCG	2	8	1449955	1449962	0 %	50 %	25 %	25 %	442556473
31004	NC_020127	CGG	2	6	1449993	1449998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442556473
31005	NC_020127	T	7	7	1450019	1450025	0 %	100 %	0 %	0 %	442556473
31006	NC_020127	AAAG	2	8	1450177	1450184	75 %	0 %	25 %	0 %	442556474
31007	NC_020127	T	7	7	1450238	1450244	0 %	100 %	0 %	0 %	442556474
31008	NC_020127	ACA	2	6	1450261	1450266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556474
31009	NC_020127	TTG	2	6	1450302	1450307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556474
31010	NC_020127	AGA	2	6	1450366	1450371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556474
31011	NC_020127	CTA	2	6	1450400	1450405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556474
31012	NC_020127	TCT	2	6	1450453	1450458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556474
31013	NC_020127	AT	3	6	1450464	1450469	50 %	50 %	0 %	0 %	442556474
31014	NC_020127	TTGGA	2	10	1450486	1450495	20 %	40 %	40 %	0 %	442556474
31015	NC_020127	ATTTT	2	10	1450501	1450510	20 %	80 %	0 %	0 %	442556474
31016	NC_020127	TCT	2	6	1450525	1450530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556474
31017	NC_020127	TGT	2	6	1450581	1450586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556474
31018	NC_020127	ATT	2	6	1450611	1450616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556474
31019	NC_020127	GGTA	2	8	1450626	1450633	25 %	25 %	50 %	0 %	442556474
31020	NC_020127	T	7	7	1450644	1450650	0 %	100 %	0 %	0 %	442556474
31021	NC_020127	CTT	2	6	1450787	1450792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556474
31022	NC_020127	AAT	2	6	1450795	1450800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556474
31023	NC_020127	TA	3	6	1450821	1450826	50 %	50 %	0 %	0 %	442556474
31024	NC_020127	TA	3	6	1450899	1450904	50 %	50 %	0 %	0 %	442556474
31025	NC_020127	TAA	2	6	1450974	1450979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556474
31026	NC_020127	TAAA	2	8	1451018	1451025	75 %	25 %	0 %	0 %	442556474
31027	NC_020127	TTC	2	6	1451073	1451078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556474
31028	NC_020127	TC	3	6	1451108	1451113	0 %	50 %	0 %	50 %	442556474
31029	NC_020127	ATT	2	6	1451178	1451183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556474
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31031	NC_020127	CATA	2	8	1451413	1451420	50 %	25 %	0 %	25 %	442556474
31032	NC_020127	TCT	2	6	1451485	1451490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556474
31033	NC_020127	TAG	2	6	1451505	1451510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556474
31034	NC_020127	AG	4	8	1451509	1451516	50 %	0 %	50 %	0 %	442556474
31035	NC_020127	TC	3	6	1451532	1451537	0 %	50 %	0 %	50 %	442556474
31036	NC_020127	TGT	2	6	1451557	1451562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556474
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31038	NC_020127	AGT	2	6	1451609	1451614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556474
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31040	NC_020127	GTTTT	2	10	1451636	1451645	0 %	80 %	20 %	0 %	442556474
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31043	NC_020127	CAT	2	6	1451747	1451752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556474
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31047	NC_020127	CAT	2	6	1451816	1451821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556474
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31050	NC_020127	AAT	2	6	1451916	1451921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556474
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31052	NC_020127	AAGA	2	8	1451949	1451956	75 %	0 %	25 %	0 %	442556474
31053	NC_020127	T	6	6	1451960	1451965	0 %	100 %	0 %	0 %	442556474
31054	NC_020127	CAA	2	6	1452002	1452007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556474
31055	NC_020127	TTG	2	6	1452008	1452013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556474
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31060	NC_020127	AGA	2	6	1452301	1452306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556475
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31065	NC_020127	TTC	2	6	1452409	1452414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556475
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31093	NC_020127	ACT	2	6	1454647	1454652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556476
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31100	NC_020127	AT	3	6	1455120	1455125	50 %	50 %	0 %	0 %	442556477
31101	NC_020127	TGT	2	6	1455150	1455155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556477
31102	NC_020127	T	7	7	1455185	1455191	0 %	100 %	0 %	0 %	442556477
31103	NC_020127	CTACAC	2	12	1455194	1455205	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	442556477
31104	NC_020127	TAA	2	6	1455219	1455224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556477
31105	NC_020127	AGA	3	9	1455411	1455419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556477
31106	NC_020127	AGA	2	6	1455455	1455460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556477
31107	NC_020127	TAC	2	6	1455516	1455521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556477
31108	NC_020127	TCT	2	6	1455523	1455528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556477
31109	NC_020127	T	6	6	1455551	1455556	0 %	100 %	0 %	0 %	442556477
31110	NC_020127	AT	3	6	1455560	1455565	50 %	50 %	0 %	0 %	442556477
31111	NC_020127	AGA	2	6	1455597	1455602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556477
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31114	NC_020127	TCT	2	6	1455720	1455725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556478
31115	NC_020127	TGA	2	6	1455731	1455736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556478
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31117	NC_020127	GAT	2	6	1455783	1455788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556478
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