MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 31162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020127	AGG	2	6	49302	49307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555300
1002	NC_020127	A	6	6	49326	49331	100 %	0 %	0 %	0 %	442555300
1003	NC_020127	ACA	2	6	49356	49361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555300
1004	NC_020127	AGC	2	6	49362	49367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555300
1005	NC_020127	T	6	6	49371	49376	0 %	100 %	0 %	0 %	442555300
1006	NC_020127	AAT	2	6	49607	49612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555300
1007	NC_020127	TAT	2	6	49934	49939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555301
1008	NC_020127	ATAACG	2	12	49955	49966	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	442555301
1009	NC_020127	TTA	2	6	50002	50007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555301
1010	NC_020127	TATG	2	8	50008	50015	25 %	50 %	25 %	0 %	442555301
1011	NC_020127	GAT	3	9	50038	50046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555301
1012	NC_020127	GCA	3	9	50050	50058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555301
1013	NC_020127	CTCTT	2	10	50066	50075	0 %	60 %	0 %	40 %	442555301
1014	NC_020127	ATGAA	2	10	50165	50174	60 %	20 %	20 %	0 %	442555301
1015	NC_020127	TTC	2	6	50207	50212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555301
1016	NC_020127	TGG	2	6	50417	50422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555302
1017	NC_020127	TCT	2	6	50469	50474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555302
1018	NC_020127	GGT	2	6	50646	50651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555302
1019	NC_020127	TGA	2	6	50666	50671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555302
1020	NC_020127	CAG	2	6	50689	50694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555302
1021	NC_020127	GCA	2	6	50715	50720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555302
1022	NC_020127	TTC	2	6	50723	50728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555302
1023	NC_020127	TTC	3	9	50768	50776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555302
1024	NC_020127	GGA	2	6	50778	50783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555302
1025	NC_020127	TAA	3	9	50849	50857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555302
1026	NC_020127	ATC	2	6	50930	50935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555302
1027	NC_020127	TCT	2	6	50940	50945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555302
1028	NC_020127	ATG	2	6	50974	50979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555302
1029	NC_020127	CTA	2	6	51091	51096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555302
1030	NC_020127	GAAG	2	8	51132	51139	50 %	0 %	50 %	0 %	442555302
1031	NC_020127	GGT	2	6	51141	51146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555302
1032	NC_020127	ATA	2	6	51151	51156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555302
1033	NC_020127	GTAG	2	8	51162	51169	25 %	25 %	50 %	0 %	442555302
1034	NC_020127	TGG	2	6	51176	51181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555302
1035	NC_020127	ATCAGG	2	12	51194	51205	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	442555302
1036	NC_020127	AGG	2	6	51221	51226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555302
1037	NC_020127	GGA	3	9	51279	51287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555302
1038	NC_020127	TGC	2	6	51296	51301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555302
1039	NC_020127	TGG	2	6	51302	51307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555302
1040	NC_020127	GGA	2	6	51330	51335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555302
1041	NC_020127	CTG	2	6	51346	51351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555302
1042	NC_020127	AGC	2	6	51470	51475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555302
1043	NC_020127	GGA	2	6	51501	51506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555302
1044	NC_020127	AGG	2	6	51521	51526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555302
1045	NC_020127	AGG	2	6	51542	51547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555302
1046	NC_020127	CTG	2	6	51559	51564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555302
1047	NC_020127	GGA	2	6	51591	51596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555302
1048	NC_020127	CTG	2	6	51607	51612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555302
1049	NC_020127	AGC	2	6	51740	51745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555302
1050	NC_020127	CAG	2	6	51763	51768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555302
1051	NC_020127	TGT	2	6	51779	51784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555302
1052	NC_020127	AAG	2	6	51794	51799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555302
1053	NC_020127	AGG	2	6	51800	51805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555302
1054	NC_020127	AGA	2	6	51806	51811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555302
1055	NC_020127	GAA	2	6	51829	51834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555302
1056	NC_020127	GGA	2	6	51906	51911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555302
1057	NC_020127	AGC	2	6	51920	51925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555302
1058	NC_020127	AGC	2	6	51929	51934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555302
1059	NC_020127	AGC	2	6	51947	51952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555302
1060	NC_020127	AGC	2	6	51965	51970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555302
1061	NC_020127	CTA	2	6	51982	51987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555302
1062	NC_020127	CAG	2	6	51999	52004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555302
1063	NC_020127	TGG	2	6	52073	52078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555302
1064	NC_020127	GTA	2	6	52096	52101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555302
1065	NC_020127	TAA	2	6	52160	52165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555302
1066	NC_020127	ATGG	2	8	52184	52191	25 %	25 %	50 %	0 %	442555302
1067	NC_020127	GAT	2	6	52236	52241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555302
1068	NC_020127	ACTAC	2	10	52254	52263	40 %	20 %	0 %	40 %	442555302
1069	NC_020127	TAA	3	9	52265	52273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555302
1070	NC_020127	TGT	2	6	52325	52330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555302
1071	NC_020127	GTAT	2	8	52405	52412	25 %	50 %	25 %	0 %	442555302
1072	NC_020127	GGA	2	6	52425	52430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555302
1073	NC_020127	GTA	3	9	52432	52440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555302
1074	NC_020127	CTC	2	6	52448	52453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555302
1075	NC_020127	TGA	2	6	52460	52465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555302
1076	NC_020127	ATA	2	6	52515	52520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555302
1077	NC_020127	AATC	2	8	52536	52543	50 %	25 %	0 %	25 %	442555302
1078	NC_020127	TGG	2	6	52577	52582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555302
1079	NC_020127	GTA	3	9	52594	52602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555302
1080	NC_020127	GTG	2	6	52615	52620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555302
1081	NC_020127	GTG	2	6	52624	52629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555302
1082	NC_020127	GTA	2	6	52662	52667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555302
1083	NC_020127	CTT	2	6	52722	52727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555302
1084	NC_020127	CTG	2	6	52750	52755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555302
1085	NC_020127	ATG	2	6	52791	52796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555302
1086	NC_020127	ATG	2	6	52800	52805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555302
1087	NC_020127	AAG	2	6	52960	52965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555302
1088	NC_020127	GAAG	2	8	53049	53056	50 %	0 %	50 %	0 %	442555302
1089	NC_020127	AGT	3	9	53073	53081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555302
1090	NC_020127	TCA	2	6	53894	53899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555303
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1092	NC_020127	ATTT	2	8	53997	54004	25 %	75 %	0 %	0 %	442555303
1093	NC_020127	GAT	2	6	54020	54025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555303
1094	NC_020127	A	6	6	54026	54031	100 %	0 %	0 %	0 %	442555303
1095	NC_020127	TAT	2	6	54037	54042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555303
1096	NC_020127	T	6	6	54047	54052	0 %	100 %	0 %	0 %	442555303
1097	NC_020127	TAA	2	6	54094	54099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555303
1098	NC_020127	TCCAA	2	10	54109	54118	40 %	20 %	0 %	40 %	442555303
1099	NC_020127	CAT	2	6	54126	54131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555303
1100	NC_020127	A	7	7	54160	54166	100 %	0 %	0 %	0 %	442555303
1101	NC_020127	A	6	6	54195	54200	100 %	0 %	0 %	0 %	442555303
1102	NC_020127	ACA	2	6	54223	54228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555303
1103	NC_020127	T	6	6	54240	54245	0 %	100 %	0 %	0 %	442555303
1104	NC_020127	TA	4	8	54267	54274	50 %	50 %	0 %	0 %	442555303
1105	NC_020127	GAA	2	6	54303	54308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555303
1106	NC_020127	CAA	2	6	54342	54347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555303
1107	NC_020127	T	9	9	54376	54384	0 %	100 %	0 %	0 %	442555303
1108	NC_020127	CTT	2	6	54387	54392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555303
1109	NC_020127	TTA	2	6	54530	54535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555303
1110	NC_020127	AAAT	2	8	54574	54581	75 %	25 %	0 %	0 %	442555303
1111	NC_020127	TCA	2	6	54584	54589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555303
1112	NC_020127	GATC	2	8	54638	54645	25 %	25 %	25 %	25 %	442555303
1113	NC_020127	A	7	7	54669	54675	100 %	0 %	0 %	0 %	442555303
1114	NC_020127	TTCA	2	8	54676	54683	25 %	50 %	0 %	25 %	442555303
1115	NC_020127	CCA	2	6	54704	54709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555303
1116	NC_020127	ATT	2	6	54772	54777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555303
1117	NC_020127	G	6	6	54808	54813	0 %	0 %	100 %	0 %	442555303
1118	NC_020127	T	6	6	54889	54894	0 %	100 %	0 %	0 %	442555303
1119	NC_020127	GTG	2	6	54912	54917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555303
1120	NC_020127	TAA	2	6	54963	54968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555303
1121	NC_020127	GTAT	2	8	54999	55006	25 %	50 %	25 %	0 %	442555303
1122	NC_020127	T	6	6	55087	55092	0 %	100 %	0 %	0 %	442555303
1123	NC_020127	ATT	2	6	55129	55134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555303
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