MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 31162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020127	ATA	2	6	26329	26334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555284
502	NC_020127	TTC	2	6	26367	26372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555284
503	NC_020127	CAT	2	6	26402	26407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555284
504	NC_020127	TTC	2	6	26415	26420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555284
505	NC_020127	T	7	7	26515	26521	0 %	100 %	0 %	0 %	442555284
506	NC_020127	TG	3	6	26527	26532	0 %	50 %	50 %	0 %	442555284
507	NC_020127	TTA	2	6	26551	26556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555284
508	NC_020127	TTC	2	6	26613	26618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555284
509	NC_020127	T	6	6	26625	26630	0 %	100 %	0 %	0 %	442555284
510	NC_020127	TGT	2	6	26644	26649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555284
511	NC_020127	AG	3	6	26677	26682	50 %	0 %	50 %	0 %	442555284
512	NC_020127	TTGTT	2	10	26712	26721	0 %	80 %	20 %	0 %	442555284
513	NC_020127	GTAT	2	8	26727	26734	25 %	50 %	25 %	0 %	442555284
514	NC_020127	ACA	2	6	26740	26745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555284
515	NC_020127	T	6	6	26826	26831	0 %	100 %	0 %	0 %	442555284
516	NC_020127	ACA	2	6	26875	26880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555284
517	NC_020127	TCT	2	6	26887	26892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555284
518	NC_020127	TCA	2	6	26893	26898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555284
519	NC_020127	GATT	2	8	26914	26921	25 %	50 %	25 %	0 %	442555284
520	NC_020127	AGCA	2	8	26934	26941	50 %	0 %	25 %	25 %	442555284
521	NC_020127	TGTCA	2	10	26949	26958	20 %	40 %	20 %	20 %	442555284
522	NC_020127	TGAA	2	8	26989	26996	50 %	25 %	25 %	0 %	442555284
523	NC_020127	CGAG	2	8	27001	27008	25 %	0 %	50 %	25 %	442555284
524	NC_020127	GAAG	2	8	27019	27026	50 %	0 %	50 %	0 %	442555284
525	NC_020127	CAC	2	6	27059	27064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555284
526	NC_020127	TAAGA	2	10	27086	27095	60 %	20 %	20 %	0 %	442555284
527	NC_020127	CTC	2	6	27221	27226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555284
528	NC_020127	AAT	2	6	27262	27267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555284
529	NC_020127	GATA	2	8	27317	27324	50 %	25 %	25 %	0 %	442555284
530	NC_020127	T	7	7	27464	27470	0 %	100 %	0 %	0 %	442555284
531	NC_020127	ACTT	2	8	27489	27496	25 %	50 %	0 %	25 %	442555284
532	NC_020127	TCT	2	6	27527	27532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555284
533	NC_020127	CAG	2	6	27557	27562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555284
534	NC_020127	ACG	2	6	27594	27599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555284
535	NC_020127	T	6	6	27601	27606	0 %	100 %	0 %	0 %	442555284
536	NC_020127	GAG	2	6	27611	27616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555284
537	NC_020127	TCA	2	6	27619	27624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555284
538	NC_020127	GCT	2	6	27638	27643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555284
539	NC_020127	ATA	2	6	27655	27660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555284
540	NC_020127	AG	3	6	27675	27680	50 %	0 %	50 %	0 %	442555284
541	NC_020127	AGA	2	6	27684	27689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555284
542	NC_020127	TGC	2	6	27714	27719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555284
543	NC_020127	TTC	2	6	27828	27833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555284
544	NC_020127	T	9	9	27947	27955	0 %	100 %	0 %	0 %	442555284
545	NC_020127	ATA	2	6	27958	27963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555284
546	NC_020127	TTTTGT	2	12	28125	28136	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	442555284
547	NC_020127	ATTT	2	8	28155	28162	25 %	75 %	0 %	0 %	442555284
548	NC_020127	GCT	2	6	28255	28260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555284
549	NC_020127	GTGAT	2	10	28301	28310	20 %	40 %	40 %	0 %	442555284
550	NC_020127	AGC	2	6	28311	28316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555284
551	NC_020127	CTG	2	6	28397	28402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555284
552	NC_020127	TATTT	2	10	28422	28431	20 %	80 %	0 %	0 %	442555284
553	NC_020127	GCA	2	6	28519	28524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555284
554	NC_020127	ATG	2	6	28660	28665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555284
555	NC_020127	ATT	2	6	28741	28746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555284
556	NC_020127	T	8	8	28769	28776	0 %	100 %	0 %	0 %	442555284
557	NC_020127	TCC	2	6	28779	28784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555284
558	NC_020127	TCA	2	6	28789	28794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555284
559	NC_020127	CAT	2	6	28847	28852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555284
560	NC_020127	ACAT	2	8	28864	28871	50 %	25 %	0 %	25 %	442555284
561	NC_020127	CAA	2	6	28895	28900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555284
562	NC_020127	GTT	2	6	28951	28956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555284
563	NC_020127	ATG	2	6	29039	29044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555284
564	NC_020127	AAC	2	6	29196	29201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555284
565	NC_020127	T	6	6	29253	29258	0 %	100 %	0 %	0 %	442555284
566	NC_020127	TCT	2	6	29266	29271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555284
567	NC_020127	GCT	2	6	29275	29280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555284
568	NC_020127	ACGA	2	8	29282	29289	50 %	0 %	25 %	25 %	442555284
569	NC_020127	ATT	2	6	29304	29309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555284
570	NC_020127	TTC	2	6	29310	29315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555284
571	NC_020127	GGA	2	6	29368	29373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555284
572	NC_020127	ACA	2	6	29461	29466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555284
573	NC_020127	ATTT	2	8	29501	29508	25 %	75 %	0 %	0 %	442555284
574	NC_020127	AAT	2	6	29532	29537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555284
575	NC_020127	ATT	2	6	29595	29600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555284
576	NC_020127	TTC	2	6	29622	29627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555284
577	NC_020127	GCA	2	6	29647	29652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555284
578	NC_020127	TCA	2	6	29665	29670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555284
579	NC_020127	TGA	2	6	29677	29682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555284
580	NC_020127	AGA	2	6	29691	29696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555284
581	NC_020127	AAG	2	6	29739	29744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555284
582	NC_020127	TAT	2	6	29750	29755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555284
583	NC_020127	TAA	2	6	29798	29803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555284
584	NC_020127	GT	3	6	29865	29870	0 %	50 %	50 %	0 %	442555284
585	NC_020127	T	9	9	30183	30191	0 %	100 %	0 %	0 %	442555285
586	NC_020127	TAT	2	6	30238	30243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555285
587	NC_020127	TGA	2	6	30279	30284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555285
588	NC_020127	T	6	6	30296	30301	0 %	100 %	0 %	0 %	442555285
589	NC_020127	ATG	2	6	30333	30338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555285
590	NC_020127	T	6	6	30339	30344	0 %	100 %	0 %	0 %	442555285
591	NC_020127	GACTT	2	10	30379	30388	20 %	40 %	20 %	20 %	442555285
592	NC_020127	AGGA	2	8	30406	30413	50 %	0 %	50 %	0 %	442555285
593	NC_020127	GTG	2	6	30441	30446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555285
594	NC_020127	ATC	2	6	30538	30543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555285
595	NC_020127	TCTT	2	8	30544	30551	0 %	75 %	0 %	25 %	442555285
596	NC_020127	TTA	2	6	30584	30589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555285
597	NC_020127	TAC	2	6	30595	30600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555285
598	NC_020127	TATTT	2	10	30637	30646	20 %	80 %	0 %	0 %	442555285
599	NC_020127	A	6	6	30658	30663	100 %	0 %	0 %	0 %	442555285
600	NC_020127	ATT	2	6	30674	30679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555285
601	NC_020127	GCT	2	6	30680	30685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555285
602	NC_020127	TTC	2	6	30759	30764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555285
603	NC_020127	CTG	2	6	30780	30785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555285
604	NC_020127	AAT	2	6	30799	30804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555285
605	NC_020127	TGA	2	6	30862	30867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555285
606	NC_020127	TGT	2	6	30871	30876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555285
607	NC_020127	AAG	2	6	30924	30929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555285
608	NC_020127	GCTT	2	8	30940	30947	0 %	50 %	25 %	25 %	442555285
609	NC_020127	T	6	6	30968	30973	0 %	100 %	0 %	0 %	442555285
610	NC_020127	GTA	2	6	31017	31022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555285
611	NC_020127	AAT	2	6	31051	31056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555285
612	NC_020127	T	7	7	31070	31076	0 %	100 %	0 %	0 %	442555285
613	NC_020127	TTC	3	9	31219	31227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555286
614	NC_020127	TCT	2	6	31316	31321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555286
615	NC_020127	CAAGAA	2	12	31332	31343	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	442555286
616	NC_020127	TAA	2	6	31363	31368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555286
617	NC_020127	TTG	2	6	31521	31526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555286
618	NC_020127	AGA	2	6	31558	31563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555286
619	NC_020127	TGG	2	6	31606	31611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555286
620	NC_020127	GCA	2	6	31619	31624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555286
621	NC_020127	ATTT	2	8	31633	31640	25 %	75 %	0 %	0 %	442555286
622	NC_020127	CAT	2	6	31665	31670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555286
623	NC_020127	TTC	2	6	31687	31692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555286
624	NC_020127	ATT	2	6	31715	31720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555286
625	NC_020127	CAA	2	6	31725	31730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555286
626	NC_020127	CTA	2	6	31803	31808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555286
627	NC_020127	ACA	2	6	31832	31837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555286
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629	NC_020127	AAT	2	6	32044	32049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555286
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