MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 31162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_020127	GAA	2	6	290950	290955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555499
6003	NC_020127	GCA	2	6	290998	291003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555499
6004	NC_020127	CAA	2	6	291043	291048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555500
6005	NC_020127	TAT	2	6	291075	291080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555500
6006	NC_020127	T	8	8	291102	291109	0 %	100 %	0 %	0 %	442555500
6007	NC_020127	ATG	2	6	291263	291268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555500
6008	NC_020127	TCT	2	6	291338	291343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555500
6009	NC_020127	TA	3	6	291365	291370	50 %	50 %	0 %	0 %	442555500
6010	NC_020127	TTA	2	6	291383	291388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555500
6011	NC_020127	TA	3	6	291425	291430	50 %	50 %	0 %	0 %	442555500
6012	NC_020127	TGG	2	6	291534	291539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555500
6013	NC_020127	TTA	2	6	291542	291547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555500
6014	NC_020127	CTG	2	6	291593	291598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555500
6015	NC_020127	AAT	2	6	291898	291903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555500
6016	NC_020127	TAA	2	6	291928	291933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555500
6017	NC_020127	TAA	2	6	292003	292008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555501
6018	NC_020127	CTTTT	2	10	292033	292042	0 %	80 %	0 %	20 %	442555501
6019	NC_020127	T	6	6	292096	292101	0 %	100 %	0 %	0 %	442555501
6020	NC_020127	GTC	2	6	292142	292147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555501
6021	NC_020127	AAAGAA	2	12	292209	292220	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	442555501
6022	NC_020127	T	6	6	292227	292232	0 %	100 %	0 %	0 %	442555501
6023	NC_020127	CAA	3	9	292249	292257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555501
6024	NC_020127	CTG	2	6	292316	292321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555501
6025	NC_020127	CTTT	2	8	292341	292348	0 %	75 %	0 %	25 %	442555501
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6027	NC_020127	TAA	2	6	292494	292499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555502
6028	NC_020127	ACA	2	6	292504	292509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555502
6029	NC_020127	TTC	2	6	292545	292550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555502
6030	NC_020127	TAC	2	6	292563	292568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555502
6031	NC_020127	GTT	2	6	292598	292603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555502
6032	NC_020127	GT	3	6	292605	292610	0 %	50 %	50 %	0 %	442555502
6033	NC_020127	AAT	2	6	292629	292634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555502
6034	NC_020127	ACTG	2	8	292651	292658	25 %	25 %	25 %	25 %	442555502
6035	NC_020127	TA	3	6	292724	292729	50 %	50 %	0 %	0 %	442555502
6036	NC_020127	A	7	7	292729	292735	100 %	0 %	0 %	0 %	442555502
6037	NC_020127	TCA	2	6	292741	292746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555502
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6040	NC_020127	CAT	2	6	292847	292852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555502
6041	NC_020127	TCT	2	6	292870	292875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555502
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6045	NC_020127	CAT	2	6	292986	292991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555502
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6053	NC_020127	TAA	2	6	293295	293300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555502
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6055	NC_020127	CTC	2	6	293481	293486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555502
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6057	NC_020127	GTA	2	6	293506	293511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555502
6058	NC_020127	GGGTG	2	10	293556	293565	0 %	20 %	80 %	0 %	442555502
6059	NC_020127	ATA	2	6	293589	293594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555502
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6061	NC_020127	TAA	2	6	293691	293696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555502
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6063	NC_020127	CAA	2	6	293750	293755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555502
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6069	NC_020127	AT	3	6	293884	293889	50 %	50 %	0 %	0 %	442555502
6070	NC_020127	TAT	2	6	293891	293896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555502
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6072	NC_020127	CTA	2	6	293912	293917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555502
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6075	NC_020127	AATAC	2	10	293995	294004	60 %	20 %	0 %	20 %	442555502
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6088	NC_020127	T	6	6	294594	294599	0 %	100 %	0 %	0 %	442555502
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6094	NC_020127	TGA	2	6	294844	294849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555502
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6101	NC_020127	T	7	7	295212	295218	0 %	100 %	0 %	0 %	442555503
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6105	NC_020127	AG	3	6	295382	295387	50 %	0 %	50 %	0 %	442555503
6106	NC_020127	A	8	8	295400	295407	100 %	0 %	0 %	0 %	442555503
6107	NC_020127	A	6	6	295457	295462	100 %	0 %	0 %	0 %	442555503
6108	NC_020127	CAT	2	6	295463	295468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555503
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6113	NC_020127	GAT	2	6	295674	295679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555504
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6117	NC_020127	A	6	6	295959	295964	100 %	0 %	0 %	0 %	442555504
6118	NC_020127	TCT	2	6	295973	295978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555504
6119	NC_020127	AT	3	6	295991	295996	50 %	50 %	0 %	0 %	442555504
6120	NC_020127	CAAA	2	8	296178	296185	75 %	0 %	0 %	25 %	442555505
6121	NC_020127	TCT	2	6	296200	296205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555505
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6496	NC_020127	TCT	2	6	310549	310554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555517
6497	NC_020127	TTG	2	6	310600	310605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555517
6498	NC_020127	AAAT	2	8	310626	310633	75 %	25 %	0 %	0 %	442555517
6499	NC_020127	CGT	2	6	310636	310641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555517
6500	NC_020127	AT	3	6	310662	310667	50 %	50 %	0 %	0 %	442555517

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