MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 31162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020127	TCG	2	6	270386	270391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555478
5502	NC_020127	ATG	2	6	270393	270398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555478
5503	NC_020127	TCG	2	6	270532	270537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555479
5504	NC_020127	A	6	6	270542	270547	100 %	0 %	0 %	0 %	442555479
5505	NC_020127	AT	3	6	270637	270642	50 %	50 %	0 %	0 %	442555479
5506	NC_020127	GAA	2	6	270645	270650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555479
5507	NC_020127	TCTT	2	8	270718	270725	0 %	75 %	0 %	25 %	442555479
5508	NC_020127	ATG	2	6	270734	270739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555479
5509	NC_020127	AGA	2	6	270808	270813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555479
5510	NC_020127	TAG	2	6	270825	270830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555479
5511	NC_020127	ATTA	2	8	270852	270859	50 %	50 %	0 %	0 %	442555479
5512	NC_020127	A	8	8	270982	270989	100 %	0 %	0 %	0 %	442555480
5513	NC_020127	T	6	6	271038	271043	0 %	100 %	0 %	0 %	442555480
5514	NC_020127	TGC	2	6	271062	271067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555480
5515	NC_020127	AGT	2	6	271110	271115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555480
5516	NC_020127	AAC	2	6	271191	271196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555480
5517	NC_020127	AGA	2	6	271281	271286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555480
5518	NC_020127	ACAT	2	8	271446	271453	50 %	25 %	0 %	25 %	442555480
5519	NC_020127	A	7	7	271479	271485	100 %	0 %	0 %	0 %	442555480
5520	NC_020127	ATT	2	6	271501	271506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555480
5521	NC_020127	TCA	2	6	271560	271565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555480
5522	NC_020127	TTG	3	9	271577	271585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555480
5523	NC_020127	AT	3	6	271592	271597	50 %	50 %	0 %	0 %	442555480
5524	NC_020127	T	6	6	271680	271685	0 %	100 %	0 %	0 %	442555480
5525	NC_020127	AAT	2	6	271735	271740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555480
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5527	NC_020127	TGGA	2	8	271785	271792	25 %	25 %	50 %	0 %	442555480
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5529	NC_020127	TA	3	6	271857	271862	50 %	50 %	0 %	0 %	442555480
5530	NC_020127	T	6	6	271936	271941	0 %	100 %	0 %	0 %	442555480
5531	NC_020127	TTA	2	6	272020	272025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555481
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5536	NC_020127	TAC	2	6	272304	272309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555481
5537	NC_020127	A	8	8	272331	272338	100 %	0 %	0 %	0 %	442555481
5538	NC_020127	AGAATT	2	12	272385	272396	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	442555481
5539	NC_020127	GAT	2	6	272401	272406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555481
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5541	NC_020127	AGA	2	6	272430	272435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555481
5542	NC_020127	GAG	2	6	272513	272518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555481
5543	NC_020127	A	6	6	272625	272630	100 %	0 %	0 %	0 %	442555481
5544	NC_020127	TCT	2	6	272647	272652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555481
5545	NC_020127	A	6	6	272653	272658	100 %	0 %	0 %	0 %	442555481
5546	NC_020127	TCA	2	6	272665	272670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555481
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5548	NC_020127	TGT	2	6	272766	272771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555481
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5551	NC_020127	A	6	6	272901	272906	100 %	0 %	0 %	0 %	442555481
5552	NC_020127	ATG	2	6	272939	272944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555481
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5555	NC_020127	A	6	6	273009	273014	100 %	0 %	0 %	0 %	442555481
5556	NC_020127	TAA	2	6	273144	273149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555481
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5559	NC_020127	TAT	2	6	273234	273239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555481
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5573	NC_020127	CTA	2	6	273863	273868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555481
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5589	NC_020127	A	7	7	274327	274333	100 %	0 %	0 %	0 %	442555481
5590	NC_020127	A	7	7	274366	274372	100 %	0 %	0 %	0 %	442555481
5591	NC_020127	CAAT	2	8	274389	274396	50 %	25 %	0 %	25 %	442555481
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5594	NC_020127	TA	3	6	274482	274487	50 %	50 %	0 %	0 %	442555482
5595	NC_020127	AGC	2	6	274498	274503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555482
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5598	NC_020127	TACT	2	8	274637	274644	25 %	50 %	0 %	25 %	442555482
5599	NC_020127	CAAA	2	8	274718	274725	75 %	0 %	0 %	25 %	442555482
5600	NC_020127	A	6	6	274723	274728	100 %	0 %	0 %	0 %	442555482
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5604	NC_020127	TA	4	8	274833	274840	50 %	50 %	0 %	0 %	442555482
5605	NC_020127	ACT	2	6	274846	274851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555482
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5607	NC_020127	ACA	2	6	275042	275047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555483
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5609	NC_020127	ATCTC	2	10	275103	275112	20 %	40 %	0 %	40 %	442555483
5610	NC_020127	CTG	2	6	275140	275145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555483
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5612	NC_020127	GTT	2	6	275196	275201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555483
5613	NC_020127	CCT	2	6	275254	275259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555483
5614	NC_020127	AT	3	6	275273	275278	50 %	50 %	0 %	0 %	442555483
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5622	NC_020127	TGG	2	6	275423	275428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555483
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5624	NC_020127	T	6	6	275496	275501	0 %	100 %	0 %	0 %	442555483
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5730	NC_020127	GTT	2	6	279674	279679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555487
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