MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 31162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020127	TTA	2	6	249134	249139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555459
5002	NC_020127	T	6	6	249161	249166	0 %	100 %	0 %	0 %	442555459
5003	NC_020127	GCT	2	6	249167	249172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555459
5004	NC_020127	TACA	2	8	249180	249187	50 %	25 %	0 %	25 %	442555459
5005	NC_020127	CTT	2	6	249192	249197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555459
5006	NC_020127	TAA	2	6	249246	249251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555459
5007	NC_020127	CAA	2	6	249252	249257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555459
5008	NC_020127	TTC	2	6	249297	249302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555459
5009	NC_020127	CTT	2	6	249354	249359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555459
5010	NC_020127	TTGCAA	2	12	249363	249374	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	442555459
5011	NC_020127	AGT	2	6	249427	249432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555459
5012	NC_020127	AGT	2	6	249452	249457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555459
5013	NC_020127	GTG	2	6	249461	249466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555459
5014	NC_020127	T	7	7	249553	249559	0 %	100 %	0 %	0 %	442555460
5015	NC_020127	TTG	2	6	249602	249607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555460
5016	NC_020127	CAG	2	6	249613	249618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555460
5017	NC_020127	AGTTAT	2	12	249682	249693	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	442555460
5018	NC_020127	ATA	2	6	249718	249723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555460
5019	NC_020127	CAT	2	6	249805	249810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555460
5020	NC_020127	GTT	2	6	249835	249840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555460
5021	NC_020127	CCA	2	6	249891	249896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555460
5022	NC_020127	TA	4	8	249913	249920	50 %	50 %	0 %	0 %	442555460
5023	NC_020127	AATAG	2	10	249950	249959	60 %	20 %	20 %	0 %	442555460
5024	NC_020127	GTT	2	6	250008	250013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555460
5025	NC_020127	CAA	2	6	250024	250029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555460
5026	NC_020127	GTT	2	6	250030	250035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555460
5027	NC_020127	TAC	2	6	250066	250071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555460
5028	NC_020127	TGT	2	6	250112	250117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555460
5029	NC_020127	TAA	3	9	250186	250194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555460
5030	NC_020127	A	9	9	250193	250201	100 %	0 %	0 %	0 %	442555460
5031	NC_020127	ATA	7	21	250208	250228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555460
5032	NC_020127	TTC	2	6	250398	250403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555461
5033	NC_020127	A	6	6	250442	250447	100 %	0 %	0 %	0 %	442555461
5034	NC_020127	ATA	2	6	250456	250461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555461
5035	NC_020127	AT	3	6	250477	250482	50 %	50 %	0 %	0 %	442555461
5036	NC_020127	ATA	2	6	250507	250512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555461
5037	NC_020127	A	6	6	250570	250575	100 %	0 %	0 %	0 %	442555461
5038	NC_020127	AGC	2	6	250587	250592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555461
5039	NC_020127	TCC	2	6	250653	250658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555461
5040	NC_020127	TGC	2	6	250698	250703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555461
5041	NC_020127	ACA	2	6	250756	250761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555461
5042	NC_020127	A	6	6	250764	250769	100 %	0 %	0 %	0 %	442555461
5043	NC_020127	A	6	6	250785	250790	100 %	0 %	0 %	0 %	442555461
5044	NC_020127	TAA	2	6	250796	250801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555461
5045	NC_020127	TTG	2	6	250835	250840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555461
5046	NC_020127	A	6	6	250883	250888	100 %	0 %	0 %	0 %	442555461
5047	NC_020127	AAG	2	6	250931	250936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555461
5048	NC_020127	TAA	2	6	250937	250942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555461
5049	NC_020127	TAT	2	6	250956	250961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555461
5050	NC_020127	ATA	2	6	250963	250968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555461
5051	NC_020127	AT	3	6	251005	251010	50 %	50 %	0 %	0 %	442555462
5052	NC_020127	CGA	2	6	251094	251099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555462
5053	NC_020127	CT	3	6	251117	251122	0 %	50 %	0 %	50 %	442555462
5054	NC_020127	AAC	2	6	251132	251137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555462
5055	NC_020127	AATGT	2	10	251138	251147	40 %	40 %	20 %	0 %	442555462
5056	NC_020127	CCA	2	6	251174	251179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555462
5057	NC_020127	TTG	2	6	251192	251197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555462
5058	NC_020127	AT	3	6	251202	251207	50 %	50 %	0 %	0 %	442555462
5059	NC_020127	TGT	2	6	251322	251327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555462
5060	NC_020127	GAA	2	6	251335	251340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555462
5061	NC_020127	ATA	2	6	251396	251401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555462
5062	NC_020127	TAC	2	6	251465	251470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555462
5063	NC_020127	A	6	6	251542	251547	100 %	0 %	0 %	0 %	442555462
5064	NC_020127	TGC	2	6	251582	251587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555462
5065	NC_020127	TAA	2	6	251590	251595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555462
5066	NC_020127	TAC	2	6	251654	251659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555462
5067	NC_020127	CTA	2	6	251710	251715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555462
5068	NC_020127	GTT	2	6	251779	251784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555462
5069	NC_020127	TCT	2	6	251799	251804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555462
5070	NC_020127	TAAG	2	8	251841	251848	50 %	25 %	25 %	0 %	442555462
5071	NC_020127	AGC	2	6	251852	251857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555462
5072	NC_020127	AG	3	6	251859	251864	50 %	0 %	50 %	0 %	442555462
5073	NC_020127	TAC	2	6	251894	251899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555462
5074	NC_020127	CAT	2	6	251902	251907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555462
5075	NC_020127	CAA	2	6	251911	251916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555462
5076	NC_020127	TAA	3	9	251923	251931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555462
5077	NC_020127	TAAA	2	8	252014	252021	75 %	25 %	0 %	0 %	442555462
5078	NC_020127	ATC	2	6	252059	252064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555462
5079	NC_020127	GCAGG	2	10	252081	252090	20 %	0 %	60 %	20 %	442555462
5080	NC_020127	CAA	2	6	252097	252102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555462
5081	NC_020127	TCCA	2	8	252109	252116	25 %	25 %	0 %	50 %	442555462
5082	NC_020127	A	7	7	252134	252140	100 %	0 %	0 %	0 %	442555462
5083	NC_020127	CAT	2	6	252142	252147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555462
5084	NC_020127	TGT	2	6	252158	252163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555462
5085	NC_020127	AAGGG	2	10	252183	252192	40 %	0 %	60 %	0 %	442555462
5086	NC_020127	AGA	2	6	252215	252220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555462
5087	NC_020127	ACA	2	6	252229	252234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555462
5088	NC_020127	GTT	2	6	252256	252261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555462
5089	NC_020127	ATG	2	6	252308	252313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555462
5090	NC_020127	ATC	2	6	252362	252367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555462
5091	NC_020127	T	6	6	252386	252391	0 %	100 %	0 %	0 %	442555462
5092	NC_020127	TTC	2	6	252455	252460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555462
5093	NC_020127	AATAG	2	10	252488	252497	60 %	20 %	20 %	0 %	442555462
5094	NC_020127	T	8	8	252500	252507	0 %	100 %	0 %	0 %	442555462
5095	NC_020127	ATAA	2	8	252523	252530	75 %	25 %	0 %	0 %	442555462
5096	NC_020127	TAA	2	6	252553	252558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555462
5097	NC_020127	TGCT	2	8	252560	252567	0 %	50 %	25 %	25 %	442555462
5098	NC_020127	T	6	6	252577	252582	0 %	100 %	0 %	0 %	442555462
5099	NC_020127	CAA	2	6	252604	252609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555462
5100	NC_020127	AT	3	6	252620	252625	50 %	50 %	0 %	0 %	442555462
5101	NC_020127	TGC	2	6	252686	252691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555462
5102	NC_020127	AAT	2	6	252752	252757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555462
5103	NC_020127	GAT	2	6	252798	252803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555462
5104	NC_020127	TGT	2	6	252828	252833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555462
5105	NC_020127	TG	3	6	252838	252843	0 %	50 %	50 %	0 %	442555462
5106	NC_020127	GAA	2	6	252895	252900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555462
5107	NC_020127	TGA	2	6	252905	252910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555462
5108	NC_020127	TATT	2	8	252916	252923	25 %	75 %	0 %	0 %	442555462
5109	NC_020127	TAA	2	6	252938	252943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555462
5110	NC_020127	ATTT	2	8	252952	252959	25 %	75 %	0 %	0 %	442555462
5111	NC_020127	TTC	2	6	252965	252970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555462
5112	NC_020127	CAAG	2	8	252978	252985	50 %	0 %	25 %	25 %	442555462
5113	NC_020127	GAG	2	6	253110	253115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555463
5114	NC_020127	TAA	2	6	253134	253139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555463
5115	NC_020127	TCC	2	6	253159	253164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555463
5116	NC_020127	A	6	6	253226	253231	100 %	0 %	0 %	0 %	442555463
5117	NC_020127	TCC	2	6	253261	253266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555463
5118	NC_020127	CAT	2	6	253272	253277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555463
5119	NC_020127	T	7	7	253285	253291	0 %	100 %	0 %	0 %	442555463
5120	NC_020127	T	6	6	253293	253298	0 %	100 %	0 %	0 %	442555463
5121	NC_020127	AGC	2	6	253327	253332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555463
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5123	NC_020127	CAT	2	6	253473	253478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555463
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