MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 31162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_020127	CTG	2	6	222653	222658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555437
4502	NC_020127	GCA	2	6	222676	222681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555437
4503	NC_020127	CGA	2	6	222742	222747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555437
4504	NC_020127	ACTT	2	8	222783	222790	25 %	50 %	0 %	25 %	442555437
4505	NC_020127	GGA	2	6	222806	222811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555437
4506	NC_020127	T	6	6	222842	222847	0 %	100 %	0 %	0 %	442555437
4507	NC_020127	CAG	2	6	222848	222853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555437
4508	NC_020127	A	6	6	222873	222878	100 %	0 %	0 %	0 %	442555437
4509	NC_020127	T	7	7	222960	222966	0 %	100 %	0 %	0 %	442555438
4510	NC_020127	GAG	2	6	222973	222978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555438
4511	NC_020127	TCCCC	2	10	223032	223041	0 %	20 %	0 %	80 %	442555438
4512	NC_020127	GGA	2	6	223084	223089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555438
4513	NC_020127	CCCA	2	8	223196	223203	25 %	0 %	0 %	75 %	442555438
4514	NC_020127	CAGA	2	8	223210	223217	50 %	0 %	25 %	25 %	442555438
4515	NC_020127	AGA	2	6	223241	223246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555438
4516	NC_020127	CTG	2	6	223290	223295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555438
4517	NC_020127	GTC	2	6	223325	223330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555438
4518	NC_020127	ACTT	2	8	224033	224040	25 %	50 %	0 %	25 %	442555439
4519	NC_020127	TA	3	6	224047	224052	50 %	50 %	0 %	0 %	442555439
4520	NC_020127	CAA	2	6	224061	224066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555439
4521	NC_020127	TTC	2	6	224080	224085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555439
4522	NC_020127	AAAG	2	8	224121	224128	75 %	0 %	25 %	0 %	442555439
4523	NC_020127	TAT	2	6	224161	224166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555439
4524	NC_020127	TAC	2	6	224188	224193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555439
4525	NC_020127	AT	3	6	224213	224218	50 %	50 %	0 %	0 %	442555439
4526	NC_020127	ACC	2	6	224225	224230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555439
4527	NC_020127	TGCT	2	8	224239	224246	0 %	50 %	25 %	25 %	442555439
4528	NC_020127	GAT	2	6	224410	224415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555439
4529	NC_020127	GCT	2	6	224452	224457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555439
4530	NC_020127	TA	3	6	224526	224531	50 %	50 %	0 %	0 %	442555439
4531	NC_020127	AAG	2	6	224622	224627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555440
4532	NC_020127	CAAT	2	8	224720	224727	50 %	25 %	0 %	25 %	442555440
4533	NC_020127	TCC	2	6	224851	224856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555440
4534	NC_020127	CAG	2	6	224902	224907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555440
4535	NC_020127	CTTG	2	8	224918	224925	0 %	50 %	25 %	25 %	442555440
4536	NC_020127	CAT	2	6	225003	225008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555440
4537	NC_020127	CT	3	6	225124	225129	0 %	50 %	0 %	50 %	442555440
4538	NC_020127	ACA	3	9	225131	225139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555440
4539	NC_020127	ATA	2	6	225181	225186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555440
4540	NC_020127	GAC	2	6	225989	225994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555441
4541	NC_020127	GAT	2	6	226002	226007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555441
4542	NC_020127	CA	3	6	226051	226056	50 %	0 %	0 %	50 %	442555441
4543	NC_020127	CGGG	2	8	226108	226115	0 %	0 %	75 %	25 %	442555441
4544	NC_020127	T	6	6	226144	226149	0 %	100 %	0 %	0 %	442555441
4545	NC_020127	TGG	2	6	226166	226171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555441
4546	NC_020127	CAT	2	6	226187	226192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555441
4547	NC_020127	GA	3	6	226237	226242	50 %	0 %	50 %	0 %	442555441
4548	NC_020127	TTC	2	6	226270	226275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555441
4549	NC_020127	CCG	2	6	226316	226321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442555441
4550	NC_020127	CA	3	6	226388	226393	50 %	0 %	0 %	50 %	442555441
4551	NC_020127	CCAT	2	8	226420	226427	25 %	25 %	0 %	50 %	442555441
4552	NC_020127	ACAG	2	8	226513	226520	50 %	0 %	25 %	25 %	442555441
4553	NC_020127	GGC	2	6	226546	226551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442555441
4554	NC_020127	ATGG	2	8	226560	226567	25 %	25 %	50 %	0 %	442555441
4555	NC_020127	TAAA	2	8	226596	226603	75 %	25 %	0 %	0 %	442555441
4556	NC_020127	CTG	2	6	226622	226627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555441
4557	NC_020127	AAC	2	6	226662	226667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555441
4558	NC_020127	A	6	6	226687	226692	100 %	0 %	0 %	0 %	442555441
4559	NC_020127	GTG	2	6	226711	226716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555441
4560	NC_020127	TCG	2	6	226811	226816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555441
4561	NC_020127	GCA	2	6	226820	226825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555441
4562	NC_020127	AGGGA	2	10	226827	226836	40 %	0 %	60 %	0 %	442555441
4563	NC_020127	AT	3	6	226880	226885	50 %	50 %	0 %	0 %	442555441
4564	NC_020127	TGGA	2	8	226964	226971	25 %	25 %	50 %	0 %	442555441
4565	NC_020127	TC	3	6	226999	227004	0 %	50 %	0 %	50 %	442555441
4566	NC_020127	GCG	2	6	227116	227121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442555441
4567	NC_020127	CATC	2	8	227162	227169	25 %	25 %	0 %	50 %	442555441
4568	NC_020127	CGC	2	6	227239	227244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442555441
4569	NC_020127	TTC	2	6	227247	227252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555441
4570	NC_020127	TTCT	2	8	227262	227269	0 %	75 %	0 %	25 %	442555441
4571	NC_020127	TGAT	2	8	227273	227280	25 %	50 %	25 %	0 %	442555441
4572	NC_020127	TGA	2	6	227396	227401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555441
4573	NC_020127	TTG	2	6	227473	227478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555441
4574	NC_020127	TGG	2	6	227489	227494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555441
4575	NC_020127	GAACA	2	10	227520	227529	60 %	0 %	20 %	20 %	442555441
4576	NC_020127	AG	3	6	227593	227598	50 %	0 %	50 %	0 %	442555441
4577	NC_020127	AAG	2	6	227672	227677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555441
4578	NC_020127	CAG	2	6	227787	227792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555441
4579	NC_020127	GTC	2	6	227806	227811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555441
4580	NC_020127	CTG	2	6	228431	228436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555442
4581	NC_020127	CTG	2	6	228500	228505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555442
4582	NC_020127	TTG	2	6	228506	228511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555442
4583	NC_020127	GCA	2	6	228522	228527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555442
4584	NC_020127	GCT	2	6	228810	228815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555442
4585	NC_020127	CCG	2	6	228834	228839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442555442
4586	NC_020127	TCT	2	6	228856	228861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555442
4587	NC_020127	CGC	2	6	228899	228904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442555442
4588	NC_020127	TGCAC	2	10	228951	228960	20 %	20 %	20 %	40 %	442555442
4589	NC_020127	CCA	2	6	228981	228986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555443
4590	NC_020127	ACG	2	6	229090	229095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555443
4591	NC_020127	CTT	2	6	229126	229131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555443
4592	NC_020127	TCTT	2	8	229172	229179	0 %	75 %	0 %	25 %	442555443
4593	NC_020127	A	6	6	229516	229521	100 %	0 %	0 %	0 %	442555444
4594	NC_020127	CAA	2	6	229599	229604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555444
4595	NC_020127	ACC	2	6	229640	229645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555444
4596	NC_020127	ATATGA	2	12	229665	229676	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	442555444
4597	NC_020127	A	6	6	229682	229687	100 %	0 %	0 %	0 %	442555444
4598	NC_020127	A	6	6	229727	229732	100 %	0 %	0 %	0 %	442555444
4599	NC_020127	CTG	2	6	229766	229771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555444
4600	NC_020127	ATA	2	6	229826	229831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555444
4601	NC_020127	TAAA	2	8	229871	229878	75 %	25 %	0 %	0 %	442555444
4602	NC_020127	AT	3	6	229887	229892	50 %	50 %	0 %	0 %	442555444
4603	NC_020127	CAG	2	6	229919	229924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555444
4604	NC_020127	TGC	2	6	229938	229943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555444
4605	NC_020127	ACC	2	6	230031	230036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555444
4606	NC_020127	TGC	2	6	230064	230069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555444
4607	NC_020127	GTC	2	6	230108	230113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555444
4608	NC_020127	AGA	2	6	230119	230124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555444
4609	NC_020127	CGAAT	2	10	230185	230194	40 %	20 %	20 %	20 %	442555444
4610	NC_020127	A	6	6	230223	230228	100 %	0 %	0 %	0 %	442555444
4611	NC_020127	AAAC	2	8	230255	230262	75 %	0 %	0 %	25 %	442555444
4612	NC_020127	TAC	2	6	230277	230282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555445
4613	NC_020127	AT	4	8	230306	230313	50 %	50 %	0 %	0 %	442555445
4614	NC_020127	AG	3	6	230331	230336	50 %	0 %	50 %	0 %	442555445
4615	NC_020127	CTGT	2	8	230350	230357	0 %	50 %	25 %	25 %	442555445
4616	NC_020127	T	6	6	230365	230370	0 %	100 %	0 %	0 %	442555445
4617	NC_020127	AGG	2	6	230378	230383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555445
4618	NC_020127	CTT	2	6	230535	230540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555445
4619	NC_020127	GGACA	2	10	230596	230605	40 %	0 %	40 %	20 %	442555445
4620	NC_020127	CAT	2	6	230666	230671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555445
4621	NC_020127	CGG	2	6	230724	230729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442555445
4622	NC_020127	GAT	3	9	230766	230774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555445
4623	NC_020127	GCC	2	6	230781	230786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442555445
4624	NC_020127	CA	3	6	230834	230839	50 %	0 %	0 %	50 %	442555445
4625	NC_020127	GAT	2	6	230967	230972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555445
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4627	NC_020127	GCA	2	6	231053	231058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555445
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4629	NC_020127	ATG	3	9	231076	231084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555445
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4732	NC_020127	ATGG	2	8	237818	237825	25 %	25 %	50 %	0 %	442555451
4733	NC_020127	GTT	3	9	237923	237931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555451
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4866	NC_020127	GA	3	6	243152	243157	50 %	0 %	50 %	0 %	442555456
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4873	NC_020127	TTG	2	6	243525	243530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555456
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4883	NC_020127	TAT	2	6	243859	243864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555457
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4991	NC_020127	TA	3	6	248850	248855	50 %	50 %	0 %	0 %	442555459
4992	NC_020127	AAG	2	6	248905	248910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555459
4993	NC_020127	ATT	2	6	248911	248916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555459
4994	NC_020127	GAT	2	6	248921	248926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555459
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4999	NC_020127	A	7	7	249085	249091	100 %	0 %	0 %	0 %	442555459
5000	NC_020127	TTTA	2	8	249108	249115	25 %	75 %	0 %	0 %	442555459

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