MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Leptolyngbya sp. PCC 7376 chromosome

Total Repeats: 2499

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019683	AGTGA	2	10	8458	8467	40 %	20 %	40 %	0 %	427722027
2	NC_019683	TGGTG	2	10	10136	10145	0 %	40 %	60 %	0 %	427722028
3	NC_019683	GATTT	2	10	11903	11912	20 %	60 %	20 %	0 %	427722029
4	NC_019683	GGGTT	2	10	12120	12129	0 %	40 %	60 %	0 %	427722030
5	NC_019683	GGTCA	2	10	12822	12831	20 %	20 %	40 %	20 %	427722030
6	NC_019683	TGGGA	2	10	15438	15447	20 %	20 %	60 %	0 %	427722034
7	NC_019683	GTTTA	2	10	15489	15498	20 %	60 %	20 %	0 %	427722034
8	NC_019683	ATGCC	2	10	16853	16862	20 %	20 %	20 %	40 %	427722036
9	NC_019683	TAATG	2	10	18818	18827	40 %	40 %	20 %	0 %	427722037
10	NC_019683	AAAAG	2	10	20993	21002	80 %	0 %	20 %	0 %	427722039
11	NC_019683	AACCA	2	10	22014	22023	60 %	0 %	0 %	40 %	427722039
12	NC_019683	CTACT	2	10	23012	23021	20 %	40 %	0 %	40 %	427722039
13	NC_019683	GTTGG	2	10	23161	23170	0 %	40 %	60 %	0 %	427722039
14	NC_019683	CTTCT	2	10	24636	24645	0 %	60 %	0 %	40 %	427722040
15	NC_019683	TCAAC	2	10	28992	29001	40 %	20 %	0 %	40 %	427722045
16	NC_019683	ATGAA	2	10	41983	41992	60 %	20 %	20 %	0 %	427722055
17	NC_019683	TTTGG	2	10	43485	43494	0 %	60 %	40 %	0 %	427722057
18	NC_019683	TTCTT	2	10	45567	45576	0 %	80 %	0 %	20 %	427722060
19	NC_019683	CAATA	2	10	46187	46196	60 %	20 %	0 %	20 %	427722060
20	NC_019683	GACAA	2	10	52107	52116	60 %	0 %	20 %	20 %	427722064
21	NC_019683	GATCA	2	10	53262	53271	40 %	20 %	20 %	20 %	427722066
22	NC_019683	TCCAT	2	10	55742	55751	20 %	40 %	0 %	40 %	427722069
23	NC_019683	TGATT	2	10	55844	55853	20 %	60 %	20 %	0 %	427722069
24	NC_019683	TGCCA	2	10	57518	57527	20 %	20 %	20 %	40 %	427722070
25	NC_019683	ATTGG	2	10	57773	57782	20 %	40 %	40 %	0 %	427722070
26	NC_019683	AAAGC	2	10	60013	60022	60 %	0 %	20 %	20 %	427722071
27	NC_019683	TCGAC	2	10	61701	61710	20 %	20 %	20 %	40 %	427722071
28	NC_019683	AAGAC	2	10	61914	61923	60 %	0 %	20 %	20 %	427722071
29	NC_019683	CTGTG	2	10	62261	62270	0 %	40 %	40 %	20 %	427722071
30	NC_019683	TTTTG	2	10	63042	63051	0 %	80 %	20 %	0 %	427722072
31	NC_019683	TGCAA	2	10	65330	65339	40 %	20 %	20 %	20 %	427722074
32	NC_019683	CCTCA	2	10	69586	69595	20 %	20 %	0 %	60 %	427722077
33	NC_019683	AGTCG	2	10	69997	70006	20 %	20 %	40 %	20 %	427722077
34	NC_019683	TGGTT	2	10	70297	70306	0 %	60 %	40 %	0 %	427722078
35	NC_019683	TTTTC	2	10	70409	70418	0 %	80 %	0 %	20 %	427722078
36	NC_019683	TTGGC	2	10	71564	71573	0 %	40 %	40 %	20 %	427722078
37	NC_019683	AAATG	2	10	72428	72437	60 %	20 %	20 %	0 %	427722079
38	NC_019683	ATTTC	2	10	73110	73119	20 %	60 %	0 %	20 %	427722079
39	NC_019683	GAAAT	2	10	75854	75863	60 %	20 %	20 %	0 %	427722082
40	NC_019683	TTGAA	2	10	76060	76069	40 %	40 %	20 %	0 %	427722082
41	NC_019683	TGAGA	2	10	76117	76126	40 %	20 %	40 %	0 %	427722082
42	NC_019683	AAATA	2	10	76192	76201	80 %	20 %	0 %	0 %	427722082
43	NC_019683	AATCG	2	10	77549	77558	40 %	20 %	20 %	20 %	427722083
44	NC_019683	CATTG	2	10	78664	78673	20 %	40 %	20 %	20 %	427722084
45	NC_019683	ATGCC	2	10	79501	79510	20 %	20 %	20 %	40 %	427722085
46	NC_019683	TGTTA	2	10	85387	85396	20 %	60 %	20 %	0 %	427722087
47	NC_019683	CTTAC	2	10	85797	85806	20 %	40 %	0 %	40 %	427722088
48	NC_019683	CAAAA	2	10	86048	86057	80 %	0 %	0 %	20 %	427722088
49	NC_019683	TTTGT	2	10	86738	86747	0 %	80 %	20 %	0 %	427722089
50	NC_019683	CAAGC	2	10	86874	86883	40 %	0 %	20 %	40 %	427722089
51	NC_019683	TTAAT	2	10	87456	87465	40 %	60 %	0 %	0 %	427722090
52	NC_019683	GAATT	2	10	88655	88664	40 %	40 %	20 %	0 %	427722091
53	NC_019683	TCCTG	2	10	91226	91235	0 %	40 %	20 %	40 %	427722093
54	NC_019683	TCATG	2	10	93507	93516	20 %	40 %	20 %	20 %	427722096
55	NC_019683	TTTAT	2	10	93961	93970	20 %	80 %	0 %	0 %	427722097
56	NC_019683	AGCAG	2	10	94474	94483	40 %	0 %	40 %	20 %	427722097
57	NC_019683	AGATC	2	10	97677	97686	40 %	20 %	20 %	20 %	427722100
58	NC_019683	TCACC	2	10	97743	97752	20 %	20 %	0 %	60 %	427722100
59	NC_019683	CAAAA	2	10	99017	99026	80 %	0 %	0 %	20 %	427722100
60	NC_019683	CCAGA	2	10	106677	106686	40 %	0 %	20 %	40 %	427722108
61	NC_019683	TTTGA	2	10	107822	107831	20 %	60 %	20 %	0 %	427722109
62	NC_019683	GAGGT	2	10	109421	109430	20 %	20 %	60 %	0 %	427722110
63	NC_019683	CCAGC	2	10	109628	109637	20 %	0 %	20 %	60 %	427722110
64	NC_019683	GCTAA	2	10	115328	115337	40 %	20 %	20 %	20 %	427722112
65	NC_019683	TGCTC	2	10	116256	116265	0 %	40 %	20 %	40 %	427722112
66	NC_019683	TCAAT	2	10	121921	121930	40 %	40 %	0 %	20 %	427722115
67	NC_019683	ATCAG	2	10	122088	122097	40 %	20 %	20 %	20 %	427722115
68	NC_019683	CAGTA	2	10	123557	123566	40 %	20 %	20 %	20 %	427722115
69	NC_019683	ATTCG	2	10	125017	125026	20 %	40 %	20 %	20 %	427722117
70	NC_019683	GATTT	2	10	125707	125716	20 %	60 %	20 %	0 %	427722118
71	NC_019683	AATCA	2	10	126118	126127	60 %	20 %	0 %	20 %	427722118
72	NC_019683	CAACC	2	10	126270	126279	40 %	0 %	0 %	60 %	427722118
73	NC_019683	CACAT	2	10	127742	127751	40 %	20 %	0 %	40 %	427722119
74	NC_019683	GTTGG	2	10	129549	129558	0 %	40 %	60 %	0 %	427722120
75	NC_019683	AATTG	2	10	132019	132028	40 %	40 %	20 %	0 %	427722122
76	NC_019683	TGAAA	2	10	139336	139345	60 %	20 %	20 %	0 %	427722129
77	NC_019683	CAATC	2	10	139825	139834	40 %	20 %	0 %	40 %	427722129
78	NC_019683	TTGGT	2	10	140437	140446	0 %	60 %	40 %	0 %	427722130
79	NC_019683	TGTGC	2	10	142405	142414	0 %	40 %	40 %	20 %	427722132
80	NC_019683	CATCA	2	10	143330	143339	40 %	20 %	0 %	40 %	427722133
81	NC_019683	GCAAC	2	10	145432	145441	40 %	0 %	20 %	40 %	427722136
82	NC_019683	CTGAT	2	10	146349	146358	20 %	40 %	20 %	20 %	427722137
83	NC_019683	ATGAA	2	10	147374	147383	60 %	20 %	20 %	0 %	427722137
84	NC_019683	TACGA	2	10	147916	147925	40 %	20 %	20 %	20 %	427722138
85	NC_019683	GGCGA	2	10	149695	149704	20 %	0 %	60 %	20 %	427722139
86	NC_019683	GCTGA	2	10	151489	151498	20 %	20 %	40 %	20 %	427722141
87	NC_019683	ACTTT	2	10	152132	152141	20 %	60 %	0 %	20 %	427722141
88	NC_019683	GTAAT	2	10	155042	155051	40 %	40 %	20 %	0 %	427722144
89	NC_019683	GTTTT	2	10	155846	155855	0 %	80 %	20 %	0 %	427722144
90	NC_019683	GTTGT	2	10	156990	156999	0 %	60 %	40 %	0 %	427722145
91	NC_019683	TCGCA	2	10	159757	159766	20 %	20 %	20 %	40 %	427722147
92	NC_019683	CACGG	2	10	160283	160292	20 %	0 %	40 %	40 %	427722147
93	NC_019683	TTGAT	2	10	161151	161160	20 %	60 %	20 %	0 %	427722148
94	NC_019683	GATTT	2	10	163693	163702	20 %	60 %	20 %	0 %	427722151
95	NC_019683	AATAA	2	10	164391	164400	80 %	20 %	0 %	0 %	427722152
96	NC_019683	TGCTT	2	10	171471	171480	0 %	60 %	20 %	20 %	427722159
97	NC_019683	TGAAT	3	15	176207	176221	40 %	40 %	20 %	0 %	427722160
98	NC_019683	AATTG	2	10	178348	178357	40 %	40 %	20 %	0 %	427722160
99	NC_019683	ACCAA	2	10	179387	179396	60 %	0 %	0 %	40 %	427722160
100	NC_019683	CAAGG	2	10	183604	183613	40 %	0 %	40 %	20 %	427722163
101	NC_019683	ATTAC	2	10	183902	183911	40 %	40 %	0 %	20 %	427722163
102	NC_019683	CAGCT	2	10	185119	185128	20 %	20 %	20 %	40 %	427722164
103	NC_019683	CCATC	2	10	185341	185350	20 %	20 %	0 %	60 %	427722164
104	NC_019683	CGATG	2	10	191538	191547	20 %	20 %	40 %	20 %	427722169
105	NC_019683	AAAAC	2	10	191890	191899	80 %	0 %	0 %	20 %	427722169
106	NC_019683	CTCCA	2	10	192401	192410	20 %	20 %	0 %	60 %	427722170
107	NC_019683	AAGCC	2	10	197158	197167	40 %	0 %	20 %	40 %	427722173
108	NC_019683	TGGCG	2	10	198493	198502	0 %	20 %	60 %	20 %	427722174
109	NC_019683	CGATG	2	10	200337	200346	20 %	20 %	40 %	20 %	427722175
110	NC_019683	TGGTG	2	10	201750	201759	0 %	40 %	60 %	0 %	427722178
111	NC_019683	GCGGA	2	10	207886	207895	20 %	0 %	60 %	20 %	427722183
112	NC_019683	TCTGA	2	10	209752	209761	20 %	40 %	20 %	20 %	427722183
113	NC_019683	TTGCT	2	10	212871	212880	0 %	60 %	20 %	20 %	427722185
114	NC_019683	ACACC	2	10	216673	216682	40 %	0 %	0 %	60 %	427722189
115	NC_019683	GTAAT	2	10	217822	217831	40 %	40 %	20 %	0 %	427722191
116	NC_019683	CAAAT	2	10	220874	220883	60 %	20 %	0 %	20 %	427722193
117	NC_019683	TTCCT	2	10	223026	223035	0 %	60 %	0 %	40 %	427722196
118	NC_019683	GCGAC	2	10	224244	224253	20 %	0 %	40 %	40 %	427722196
119	NC_019683	CATCA	2	10	225872	225881	40 %	20 %	0 %	40 %	427722198
120	NC_019683	AAATT	2	10	228664	228673	60 %	40 %	0 %	0 %	427722202
121	NC_019683	TTGAG	2	10	230826	230835	20 %	40 %	40 %	0 %	427722203
122	NC_019683	TTTCT	2	10	232123	232132	0 %	80 %	0 %	20 %	427722205
123	NC_019683	GAAAG	2	10	241998	242007	60 %	0 %	40 %	0 %	427722217
124	NC_019683	CCAAC	2	10	243864	243873	40 %	0 %	0 %	60 %	427722219
125	NC_019683	ATCGA	2	10	245075	245084	40 %	20 %	20 %	20 %	427722219
126	NC_019683	ACAGA	2	10	247649	247658	60 %	0 %	20 %	20 %	427722221
127	NC_019683	CTTGG	2	10	252359	252368	0 %	40 %	40 %	20 %	427722225
128	NC_019683	ACCTC	2	10	253842	253851	20 %	20 %	0 %	60 %	427722226
129	NC_019683	GGCAA	2	10	253897	253906	40 %	0 %	40 %	20 %	427722226
130	NC_019683	TCTCT	2	10	258612	258621	0 %	60 %	0 %	40 %	427722228
131	NC_019683	AGCAA	2	10	259648	259657	60 %	0 %	20 %	20 %	427722229
132	NC_019683	GGAAC	2	10	270353	270362	40 %	0 %	40 %	20 %	427722241
133	NC_019683	TGAAT	2	10	272175	272184	40 %	40 %	20 %	0 %	427722242
134	NC_019683	TAGCA	2	10	273230	273239	40 %	20 %	20 %	20 %	427722243
135	NC_019683	CCCAA	2	10	276648	276657	40 %	0 %	0 %	60 %	427722246
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138	NC_019683	TTGTC	2	10	281000	281009	0 %	60 %	20 %	20 %	427722248
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149	NC_019683	TGAAT	2	10	302372	302381	40 %	40 %	20 %	0 %	427722262
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152	NC_019683	TTCTC	2	10	311051	311060	0 %	60 %	0 %	40 %	427722269
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250	NC_019683	CTCAA	2	10	493674	493683	40 %	20 %	0 %	40 %	427722427
251	NC_019683	GTCGA	2	10	502963	502972	20 %	20 %	40 %	20 %	427722435
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254	NC_019683	ATTCC	2	10	506374	506383	20 %	40 %	0 %	40 %	427722439
255	NC_019683	CGAAA	2	10	510471	510480	60 %	0 %	20 %	20 %	427722443
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258	NC_019683	GGGCG	2	10	513963	513972	0 %	0 %	80 %	20 %	427722446
259	NC_019683	TTTGG	2	10	516738	516747	0 %	60 %	40 %	0 %	427722451
260	NC_019683	ACCTC	2	10	516922	516931	20 %	20 %	0 %	60 %	427722451
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262	NC_019683	AGCCG	2	10	519693	519702	20 %	0 %	40 %	40 %	427722453
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389	NC_019683	TCAGC	2	10	789903	789912	20 %	20 %	20 %	40 %	427722665
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