MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Leptolyngbya sp. PCC 7376 chromosome

Total Repeats: 56306

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019683	AAG	2	6	84	89	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722022
2	NC_019683	AAC	2	6	105	110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722022
3	NC_019683	GTT	2	6	179	184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722022
4	NC_019683	CAG	2	6	337	342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722022
5	NC_019683	ACA	2	6	348	353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722022
6	NC_019683	GCG	2	6	364	369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427722022
7	NC_019683	CCA	2	6	432	437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722022
8	NC_019683	GGT	2	6	482	487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722022
9	NC_019683	TGG	2	6	511	516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722022
10	NC_019683	CTG	2	6	681	686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722022
11	NC_019683	AAG	2	6	738	743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722022
12	NC_019683	ACA	2	6	832	837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722022
13	NC_019683	CTG	2	6	1110	1115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722022
14	NC_019683	TGG	2	6	1149	1154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722022
15	NC_019683	CGC	2	6	1187	1192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427722022
16	NC_019683	GGT	2	6	1767	1772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722023
17	NC_019683	ATT	2	6	1779	1784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722023
18	NC_019683	TTA	2	6	1920	1925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722023
19	NC_019683	GCT	2	6	1988	1993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722024
20	NC_019683	TTC	2	6	1999	2004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722024
21	NC_019683	GAG	2	6	2098	2103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427722024
22	NC_019683	ACC	2	6	2112	2117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722024
23	NC_019683	TAA	2	6	2140	2145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722024
24	NC_019683	CAA	2	6	2181	2186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722024
25	NC_019683	CAT	2	6	2212	2217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722024
26	NC_019683	GGT	2	6	2477	2482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722025
27	NC_019683	TGA	2	6	2548	2553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722025
28	NC_019683	CAC	2	6	2559	2564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722025
29	NC_019683	TTG	2	6	2586	2591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722025
30	NC_019683	AGA	2	6	2701	2706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722025
31	NC_019683	GAT	2	6	2783	2788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722025
32	NC_019683	TTA	2	6	2916	2921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722025
33	NC_019683	TAT	2	6	2941	2946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722025
34	NC_019683	AGG	2	6	2968	2973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427722025
35	NC_019683	TTG	2	6	3086	3091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722025
36	NC_019683	CAG	2	6	3212	3217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722025
37	NC_019683	AAG	2	6	3261	3266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722025
38	NC_019683	TGA	2	6	3277	3282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722025
39	NC_019683	TTA	2	6	3321	3326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722025
40	NC_019683	GCG	2	6	3353	3358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427722025
41	NC_019683	CTA	2	6	3370	3375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722025
42	NC_019683	TGG	3	9	3505	3513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722025
43	NC_019683	GCA	2	6	3532	3537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722025
44	NC_019683	AAC	2	6	3562	3567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722025
45	NC_019683	CAG	2	6	5819	5824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722026
46	NC_019683	GAT	2	6	6052	6057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722026
47	NC_019683	TAA	2	6	6110	6115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722026
48	NC_019683	CAC	2	6	6119	6124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722026
49	NC_019683	CGG	2	6	6195	6200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427722026
50	NC_019683	GCC	2	6	6270	6275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427722026
51	NC_019683	TAA	2	6	6281	6286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722026
52	NC_019683	AGC	2	6	6494	6499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722026
53	NC_019683	CTT	2	6	7437	7442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722027
54	NC_019683	TGA	2	6	7587	7592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722027
55	NC_019683	ATT	2	6	7632	7637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722027
56	NC_019683	GCT	2	6	7690	7695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722027
57	NC_019683	CAA	2	6	7860	7865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722027
58	NC_019683	GTG	2	6	7867	7872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722027
59	NC_019683	AAT	2	6	7876	7881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722027
60	NC_019683	CAA	2	6	7895	7900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722027
61	NC_019683	GAA	2	6	8056	8061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722027
62	NC_019683	TGG	2	6	8094	8099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722027
63	NC_019683	CAA	2	6	8225	8230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722027
64	NC_019683	ATT	2	6	8337	8342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722027
65	NC_019683	TGG	2	6	8378	8383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722027
66	NC_019683	TTC	2	6	8588	8593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722027
67	NC_019683	TTG	2	6	8678	8683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722027
68	NC_019683	CAG	2	6	8705	8710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722027
69	NC_019683	TGA	2	6	8730	8735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722027
70	NC_019683	GTG	2	6	8759	8764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722027
71	NC_019683	TCT	2	6	8812	8817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722027
72	NC_019683	AAC	2	6	8886	8891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722027
73	NC_019683	AGA	2	6	8954	8959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722027
74	NC_019683	ACA	2	6	9051	9056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722027
75	NC_019683	TTG	2	6	9068	9073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722027
76	NC_019683	TGT	2	6	9104	9109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722027
77	NC_019683	CTG	2	6	9155	9160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722027
78	NC_019683	AGC	2	6	9276	9281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722027
79	NC_019683	ATG	2	6	9425	9430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722027
80	NC_019683	ATT	2	6	9564	9569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722028
81	NC_019683	ATT	2	6	9703	9708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722028
82	NC_019683	AAT	2	6	9899	9904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722028
83	NC_019683	ATG	2	6	10099	10104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722028
84	NC_019683	TAG	2	6	10117	10122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722028
85	NC_019683	TGA	2	6	10159	10164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722028
86	NC_019683	CGA	2	6	10223	10228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722028
87	NC_019683	ATT	2	6	10269	10274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722028
88	NC_019683	AAT	2	6	10350	10355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722028
89	NC_019683	TGA	2	6	10526	10531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722028
90	NC_019683	TGA	2	6	10630	10635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722028
91	NC_019683	ACA	2	6	10665	10670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722028
92	NC_019683	AGC	2	6	10723	10728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722028
93	NC_019683	TAC	2	6	10803	10808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722028
94	NC_019683	GGC	2	6	10811	10816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427722028
95	NC_019683	CCG	2	6	10999	11004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427722029
96	NC_019683	CTG	2	6	11153	11158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722029
97	NC_019683	GAA	2	6	11162	11167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722029
98	NC_019683	TCA	2	6	11325	11330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722029
99	NC_019683	ATG	2	6	11367	11372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722029
100	NC_019683	ATG	2	6	11400	11405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722029
101	NC_019683	ATG	2	6	11480	11485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722029
102	NC_019683	CGC	2	6	11521	11526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427722029
103	NC_019683	AAG	2	6	11676	11681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722029
104	NC_019683	CAT	2	6	11692	11697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722029
105	NC_019683	CAT	2	6	11746	11751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722029
106	NC_019683	TAG	2	6	11770	11775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722029
107	NC_019683	GAA	2	6	11854	11859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722029
108	NC_019683	GGT	2	6	11860	11865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722029
109	NC_019683	TTC	2	6	12051	12056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722030
110	NC_019683	TGT	2	6	12057	12062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722030
111	NC_019683	CTT	2	6	12173	12178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722030
112	NC_019683	CTC	2	6	12183	12188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427722030
113	NC_019683	GTT	2	6	12276	12281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722030
114	NC_019683	TGC	3	9	12340	12348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722030
115	NC_019683	CAG	2	6	12359	12364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722030
116	NC_019683	ATT	2	6	12447	12452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722030
117	NC_019683	TGT	2	6	12581	12586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722030
118	NC_019683	TCA	2	6	12589	12594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722030
119	NC_019683	CAG	2	6	12623	12628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722030
120	NC_019683	TAA	2	6	12723	12728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722030
121	NC_019683	TCG	2	6	12743	12748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722030
122	NC_019683	AAT	2	6	12867	12872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722030
123	NC_019683	CCA	2	6	12883	12888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722030
124	NC_019683	CCA	2	6	12898	12903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722030
125	NC_019683	CAG	2	6	12930	12935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722030
126	NC_019683	TGC	3	9	12965	12973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722030
127	NC_019683	ACC	3	9	13028	13036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722030
128	NC_019683	TGG	2	6	13047	13052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722030
129	NC_019683	TGT	2	6	13108	13113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722030
130	NC_019683	TCG	2	6	13325	13330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722030
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132	NC_019683	TGT	2	6	13849	13854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722031
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252	NC_019683	GAT	2	6	22938	22943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722039
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254	NC_019683	AGC	2	6	22969	22974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722039
255	NC_019683	GTG	2	6	23103	23108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722039
256	NC_019683	TAA	2	6	23129	23134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722039
257	NC_019683	TGG	3	9	23168	23176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722039
258	NC_019683	GGT	2	6	23298	23303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722039
259	NC_019683	GAT	2	6	23628	23633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722039
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262	NC_019683	ATC	2	6	23781	23786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722039
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264	NC_019683	CGT	2	6	23832	23837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722039
265	NC_019683	ATG	2	6	24433	24438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722040
266	NC_019683	ATT	2	6	24483	24488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722040
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286	NC_019683	GAT	2	6	27741	27746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722043
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375	NC_019683	GAG	2	6	35552	35557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427722053
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378	NC_019683	TGT	2	6	35641	35646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722053
379	NC_019683	TGT	2	6	35672	35677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722053
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500	NC_019683	TAG	2	6	44951	44956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722059

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