MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptolyngbya sp. PCC 7376 chromosome

Total Repeats: 81277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019683	AAG	2	6	84	89	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722022
2	NC_019683	AAC	2	6	105	110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722022
3	NC_019683	GTT	2	6	179	184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722022
4	NC_019683	CAG	2	6	337	342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722022
5	NC_019683	ACA	2	6	348	353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722022
6	NC_019683	GCG	2	6	364	369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427722022
7	NC_019683	A	6	6	377	382	100 %	0 %	0 %	0 %	427722022
8	NC_019683	CCA	2	6	432	437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722022
9	NC_019683	GGT	2	6	482	487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722022
10	NC_019683	TGG	2	6	511	516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722022
11	NC_019683	CATC	2	8	633	640	25 %	25 %	0 %	50 %	427722022
12	NC_019683	CTG	2	6	681	686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722022
13	NC_019683	AAG	2	6	738	743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722022
14	NC_019683	TAGC	2	8	795	802	25 %	25 %	25 %	25 %	427722022
15	NC_019683	C	6	6	808	813	0 %	0 %	0 %	100 %	427722022
16	NC_019683	ACA	2	6	832	837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722022
17	NC_019683	GATT	2	8	864	871	25 %	50 %	25 %	0 %	427722022
18	NC_019683	A	6	6	920	925	100 %	0 %	0 %	0 %	427722022
19	NC_019683	CCAC	2	8	975	982	25 %	0 %	0 %	75 %	427722022
20	NC_019683	CTG	2	6	1110	1115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722022
21	NC_019683	ATTG	2	8	1123	1130	25 %	50 %	25 %	0 %	427722022
22	NC_019683	TGG	2	6	1149	1154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722022
23	NC_019683	CGC	2	6	1187	1192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427722022
24	NC_019683	CA	3	6	1292	1297	50 %	0 %	0 %	50 %	427722022
25	NC_019683	A	6	6	1347	1352	100 %	0 %	0 %	0 %	427722022
26	NC_019683	TC	3	6	1353	1358	0 %	50 %	0 %	50 %	427722022
27	NC_019683	GGT	2	6	1767	1772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722023
28	NC_019683	ATT	2	6	1779	1784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722023
29	NC_019683	TTA	2	6	1920	1925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722023
30	NC_019683	GCT	2	6	1988	1993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722024
31	NC_019683	TTC	2	6	1999	2004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722024
32	NC_019683	T	7	7	2015	2021	0 %	100 %	0 %	0 %	427722024
33	NC_019683	GAG	2	6	2098	2103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427722024
34	NC_019683	ACC	2	6	2112	2117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722024
35	NC_019683	TAA	2	6	2140	2145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722024
36	NC_019683	CAA	2	6	2181	2186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722024
37	NC_019683	CAT	2	6	2212	2217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722024
38	NC_019683	A	6	6	2240	2245	100 %	0 %	0 %	0 %	427722024
39	NC_019683	GGT	2	6	2477	2482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722025
40	NC_019683	TGA	2	6	2548	2553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722025
41	NC_019683	CAC	2	6	2559	2564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722025
42	NC_019683	ATGG	2	8	2575	2582	25 %	25 %	50 %	0 %	427722025
43	NC_019683	TTG	2	6	2586	2591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722025
44	NC_019683	AGA	2	6	2701	2706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722025
45	NC_019683	GAT	2	6	2783	2788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722025
46	NC_019683	A	6	6	2837	2842	100 %	0 %	0 %	0 %	427722025
47	NC_019683	TTA	2	6	2916	2921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722025
48	NC_019683	TAT	2	6	2941	2946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722025
49	NC_019683	AGG	2	6	2968	2973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427722025
50	NC_019683	TTG	2	6	3086	3091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722025
51	NC_019683	TTGG	2	8	3109	3116	0 %	50 %	50 %	0 %	427722025
52	NC_019683	AGAAAG	2	12	3177	3188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722025
53	NC_019683	CAG	2	6	3212	3217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722025
54	NC_019683	AAG	2	6	3261	3266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722025
55	NC_019683	GACA	2	8	3268	3275	50 %	0 %	25 %	25 %	427722025
56	NC_019683	TGA	2	6	3277	3282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722025
57	NC_019683	TGAT	2	8	3303	3310	25 %	50 %	25 %	0 %	427722025
58	NC_019683	TTA	2	6	3321	3326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722025
59	NC_019683	GCG	2	6	3353	3358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427722025
60	NC_019683	CTA	2	6	3370	3375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722025
61	NC_019683	TGG	3	9	3505	3513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722025
62	NC_019683	GCA	2	6	3532	3537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722025
63	NC_019683	AAC	2	6	3562	3567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722025
64	NC_019683	CAG	2	6	5819	5824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722026
65	NC_019683	C	6	6	5964	5969	0 %	0 %	0 %	100 %	427722026
66	NC_019683	GAT	2	6	6052	6057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722026
67	NC_019683	TAA	2	6	6110	6115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722026
68	NC_019683	CAC	2	6	6119	6124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722026
69	NC_019683	CGG	2	6	6195	6200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427722026
70	NC_019683	GCC	2	6	6270	6275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427722026
71	NC_019683	TAA	2	6	6281	6286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722026
72	NC_019683	AATC	2	8	6398	6405	50 %	25 %	0 %	25 %	427722026
73	NC_019683	AGC	2	6	6494	6499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722026
74	NC_019683	TCCA	2	8	6581	6588	25 %	25 %	0 %	50 %	427722026
75	NC_019683	CTT	2	6	7437	7442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722027
76	NC_019683	TGA	2	6	7587	7592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722027
77	NC_019683	ATT	2	6	7632	7637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722027
78	NC_019683	GCT	2	6	7690	7695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722027
79	NC_019683	GTTC	2	8	7764	7771	0 %	50 %	25 %	25 %	427722027
80	NC_019683	CAA	2	6	7860	7865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722027
81	NC_019683	GTG	2	6	7867	7872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722027
82	NC_019683	AAT	2	6	7876	7881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722027
83	NC_019683	CAA	2	6	7895	7900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722027
84	NC_019683	GAA	2	6	8056	8061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722027
85	NC_019683	TGG	2	6	8094	8099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722027
86	NC_019683	CAA	2	6	8225	8230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722027
87	NC_019683	CAGTTG	2	12	8269	8280	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	427722027
88	NC_019683	A	6	6	8314	8319	100 %	0 %	0 %	0 %	427722027
89	NC_019683	ATT	2	6	8337	8342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722027
90	NC_019683	TGG	2	6	8378	8383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722027
91	NC_019683	AGTGA	2	10	8458	8467	40 %	20 %	40 %	0 %	427722027
92	NC_019683	A	6	6	8508	8513	100 %	0 %	0 %	0 %	427722027
93	NC_019683	TTC	2	6	8588	8593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722027
94	NC_019683	TTG	2	6	8678	8683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722027
95	NC_019683	CAG	2	6	8705	8710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722027
96	NC_019683	TGA	2	6	8730	8735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722027
97	NC_019683	GTTT	2	8	8744	8751	0 %	75 %	25 %	0 %	427722027
98	NC_019683	GTG	2	6	8759	8764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722027
99	NC_019683	TCT	2	6	8812	8817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722027
100	NC_019683	AAC	2	6	8886	8891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722027
101	NC_019683	AGA	2	6	8954	8959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722027
102	NC_019683	ACA	2	6	9051	9056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722027
103	NC_019683	TTG	2	6	9068	9073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722027
104	NC_019683	TGT	2	6	9104	9109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722027
105	NC_019683	CTG	2	6	9155	9160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722027
106	NC_019683	TGGG	2	8	9208	9215	0 %	25 %	75 %	0 %	427722027
107	NC_019683	AGC	2	6	9276	9281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722027
108	NC_019683	ATG	2	6	9425	9430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722027
109	NC_019683	TCGT	2	8	9544	9551	0 %	50 %	25 %	25 %	427722028
110	NC_019683	ATT	2	6	9564	9569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722028
111	NC_019683	ATT	2	6	9703	9708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722028
112	NC_019683	GATG	2	8	9734	9741	25 %	25 %	50 %	0 %	427722028
113	NC_019683	AAT	2	6	9899	9904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722028
114	NC_019683	T	6	6	9920	9925	0 %	100 %	0 %	0 %	427722028
115	NC_019683	ATG	2	6	10099	10104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722028
116	NC_019683	TAG	2	6	10117	10122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722028
117	NC_019683	TGGTG	2	10	10136	10145	0 %	40 %	60 %	0 %	427722028
118	NC_019683	TGA	2	6	10159	10164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722028
119	NC_019683	CGA	2	6	10223	10228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722028
120	NC_019683	ATT	2	6	10269	10274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722028
121	NC_019683	AAT	2	6	10350	10355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722028
122	NC_019683	TGA	2	6	10526	10531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722028
123	NC_019683	TGA	2	6	10630	10635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722028
124	NC_019683	ACA	2	6	10665	10670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722028
125	NC_019683	AGC	2	6	10723	10728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722028
126	NC_019683	TAC	2	6	10803	10808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722028
127	NC_019683	GGC	2	6	10811	10816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427722028
128	NC_019683	CCG	2	6	10999	11004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427722029
129	NC_019683	TC	3	6	11021	11026	0 %	50 %	0 %	50 %	427722029
130	NC_019683	CTG	2	6	11153	11158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722029
131	NC_019683	GAA	2	6	11162	11167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722029
132	NC_019683	CG	4	8	11280	11287	0 %	0 %	50 %	50 %	427722029
133	NC_019683	TCA	2	6	11325	11330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722029
134	NC_019683	ATG	2	6	11367	11372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722029
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262	NC_019683	TGA	2	6	19313	19318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722037
263	NC_019683	T	6	6	19328	19333	0 %	100 %	0 %	0 %	427722037
264	NC_019683	T	6	6	19358	19363	0 %	100 %	0 %	0 %	427722037
265	NC_019683	TTC	2	6	19387	19392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722037
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373	NC_019683	CAA	2	6	25619	25624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722041
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375	NC_019683	A	6	6	25768	25773	100 %	0 %	0 %	0 %	427722041
376	NC_019683	CAA	2	6	25798	25803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722041
377	NC_019683	GTG	2	6	25970	25975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722041
378	NC_019683	ACG	2	6	25983	25988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722041
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381	NC_019683	GTC	2	6	26562	26567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722042
382	NC_019683	CA	3	6	26647	26652	50 %	0 %	0 %	50 %	427722042
383	NC_019683	TC	3	6	26668	26673	0 %	50 %	0 %	50 %	427722042
384	NC_019683	GCC	2	6	26834	26839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427722042
385	NC_019683	TAAA	2	8	26900	26907	75 %	25 %	0 %	0 %	427722042
386	NC_019683	CTG	2	6	27199	27204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722043
387	NC_019683	ACA	2	6	27230	27235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722043
388	NC_019683	GAT	2	6	27347	27352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722043
389	NC_019683	GTT	2	6	27467	27472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722043
390	NC_019683	GTC	2	6	27490	27495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722043
391	NC_019683	CTG	2	6	27562	27567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722043
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500	NC_019683	CAC	2	6	33850	33855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722050

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