MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptolyngbya sp. PCC 7376 chromosome

Total Repeats: 81277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019683	AGA	2	6	33880	33885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722050
502	NC_019683	TGG	2	6	33942	33947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722051
503	NC_019683	TGG	2	6	33988	33993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722051
504	NC_019683	CGAT	2	8	34030	34037	25 %	25 %	25 %	25 %	427722051
505	NC_019683	ATA	2	6	34080	34085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722051
506	NC_019683	GTT	2	6	34121	34126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722051
507	NC_019683	TCT	2	6	34162	34167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722051
508	NC_019683	TTG	2	6	34194	34199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722051
509	NC_019683	AGGT	2	8	34294	34301	25 %	25 %	50 %	0 %	427722051
510	NC_019683	GTT	2	6	34302	34307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722051
511	NC_019683	T	6	6	34428	34433	0 %	100 %	0 %	0 %	427722051
512	NC_019683	TTTA	2	8	34491	34498	25 %	75 %	0 %	0 %	427722051
513	NC_019683	GAGG	2	8	34536	34543	25 %	0 %	75 %	0 %	427722051
514	NC_019683	TCG	2	6	34555	34560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722051
515	NC_019683	CGC	2	6	34592	34597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427722051
516	NC_019683	TG	4	8	34773	34780	0 %	50 %	50 %	0 %	427722052
517	NC_019683	TAA	2	6	34819	34824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722052
518	NC_019683	CAT	2	6	34832	34837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722052
519	NC_019683	TAA	2	6	35100	35105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722052
520	NC_019683	TGG	2	6	35154	35159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722053
521	NC_019683	TGT	2	6	35270	35275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722053
522	NC_019683	TAAA	2	8	35294	35301	75 %	25 %	0 %	0 %	427722053
523	NC_019683	ATT	2	6	35381	35386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722053
524	NC_019683	CGA	2	6	35425	35430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722053
525	NC_019683	TGAGGA	2	12	35461	35472	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	427722053
526	NC_019683	TAAA	2	8	35515	35522	75 %	25 %	0 %	0 %	427722053
527	NC_019683	CCA	2	6	35527	35532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722053
528	NC_019683	GAG	2	6	35552	35557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427722053
529	NC_019683	TGCC	2	8	35569	35576	0 %	25 %	25 %	50 %	427722053
530	NC_019683	CAG	2	6	35618	35623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722053
531	NC_019683	TTC	2	6	35627	35632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722053
532	NC_019683	TGT	2	6	35641	35646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722053
533	NC_019683	TGT	2	6	35672	35677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722053
534	NC_019683	GCC	2	6	35678	35683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427722053
535	NC_019683	CCA	2	6	35710	35715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722053
536	NC_019683	GGT	2	6	35754	35759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722053
537	NC_019683	TGC	2	6	35837	35842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722053
538	NC_019683	CTA	2	6	36066	36071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722054
539	NC_019683	TCT	2	6	36148	36153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722054
540	NC_019683	CTG	2	6	36161	36166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722054
541	NC_019683	AGT	2	6	36207	36212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722054
542	NC_019683	TAA	2	6	36228	36233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722054
543	NC_019683	GCA	2	6	36266	36271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722054
544	NC_019683	TTCT	2	8	36306	36313	0 %	75 %	0 %	25 %	427722054
545	NC_019683	CAT	2	6	36368	36373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722054
546	NC_019683	AGA	2	6	36404	36409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722054
547	NC_019683	ACC	2	6	36441	36446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722054
548	NC_019683	CTT	2	6	36476	36481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722054
549	NC_019683	CTA	2	6	36482	36487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722054
550	NC_019683	CTG	2	6	36653	36658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722054
551	NC_019683	GTG	2	6	36662	36667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722054
552	NC_019683	CAT	2	6	36717	36722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722054
553	NC_019683	CAATGG	2	12	36752	36763	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	427722054
554	NC_019683	TTC	2	6	36786	36791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722054
555	NC_019683	GGGT	2	8	36865	36872	0 %	25 %	75 %	0 %	427722054
556	NC_019683	CCA	2	6	36899	36904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722054
557	NC_019683	TTG	2	6	37033	37038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722054
558	NC_019683	GGC	2	6	37080	37085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427722054
559	NC_019683	CTC	2	6	37097	37102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427722054
560	NC_019683	CTG	2	6	37166	37171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722054
561	NC_019683	TCG	2	6	37255	37260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722054
562	NC_019683	TCT	2	6	37420	37425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722054
563	NC_019683	CGAGGG	2	12	37529	37540	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	427722054
564	NC_019683	ACA	2	6	37572	37577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722054
565	NC_019683	ACCA	2	8	37578	37585	50 %	0 %	0 %	50 %	427722054
566	NC_019683	T	6	6	37590	37595	0 %	100 %	0 %	0 %	427722054
567	NC_019683	A	6	6	37599	37604	100 %	0 %	0 %	0 %	427722054
568	NC_019683	TCA	2	6	37818	37823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722055
569	NC_019683	TCG	2	6	37839	37844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722055
570	NC_019683	TTC	2	6	37853	37858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722055
571	NC_019683	TCT	2	6	37899	37904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722055
572	NC_019683	TAA	2	6	37961	37966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722055
573	NC_019683	AAT	2	6	38000	38005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722055
574	NC_019683	TCA	2	6	38016	38021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722055
575	NC_019683	GTT	2	6	38035	38040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722055
576	NC_019683	ATC	2	6	38135	38140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722055
577	NC_019683	GTG	2	6	38201	38206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722055
578	NC_019683	TTG	2	6	38215	38220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722055
579	NC_019683	ATT	2	6	38234	38239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722055
580	NC_019683	CTA	2	6	38289	38294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722055
581	NC_019683	GT	3	6	38343	38348	0 %	50 %	50 %	0 %	427722055
582	NC_019683	TTCC	2	8	38356	38363	0 %	50 %	0 %	50 %	427722055
583	NC_019683	ACGG	2	8	38375	38382	25 %	0 %	50 %	25 %	427722055
584	NC_019683	TGT	2	6	38383	38388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722055
585	NC_019683	TCG	2	6	38398	38403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722055
586	NC_019683	CTT	2	6	38632	38637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722055
587	NC_019683	CTG	2	6	38654	38659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722055
588	NC_019683	GA	3	6	38678	38683	50 %	0 %	50 %	0 %	427722055
589	NC_019683	TC	3	6	38702	38707	0 %	50 %	0 %	50 %	427722055
590	NC_019683	AATA	2	8	38782	38789	75 %	25 %	0 %	0 %	427722055
591	NC_019683	AGA	2	6	38853	38858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722055
592	NC_019683	GAG	2	6	38882	38887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427722055
593	NC_019683	AAT	2	6	38909	38914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722055
594	NC_019683	GTG	2	6	38973	38978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722055
595	NC_019683	AGA	2	6	38979	38984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722055
596	NC_019683	TCA	2	6	39018	39023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722055
597	NC_019683	A	6	6	39036	39041	100 %	0 %	0 %	0 %	427722055
598	NC_019683	TCT	2	6	39171	39176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722055
599	NC_019683	TG	3	6	39278	39283	0 %	50 %	50 %	0 %	427722055
600	NC_019683	GAG	2	6	39299	39304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427722055
601	NC_019683	CCA	2	6	39355	39360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722055
602	NC_019683	TGGA	3	12	39367	39378	25 %	25 %	50 %	0 %	427722055
603	NC_019683	ACT	2	6	39467	39472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722055
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605	NC_019683	CTG	2	6	39595	39600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722055
606	NC_019683	GAG	2	6	39605	39610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427722055
607	NC_019683	AT	3	6	39729	39734	50 %	50 %	0 %	0 %	427722055
608	NC_019683	CTTC	2	8	39838	39845	0 %	50 %	0 %	50 %	427722055
609	NC_019683	T	6	6	39875	39880	0 %	100 %	0 %	0 %	427722055
610	NC_019683	T	6	6	39905	39910	0 %	100 %	0 %	0 %	427722055
611	NC_019683	GTT	2	6	39954	39959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722055
612	NC_019683	GTT	2	6	39988	39993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722055
613	NC_019683	AAT	2	6	40019	40024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722055
614	NC_019683	CGC	2	6	40034	40039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427722055
615	NC_019683	CACT	2	8	40045	40052	25 %	25 %	0 %	50 %	427722055
616	NC_019683	T	6	6	40078	40083	0 %	100 %	0 %	0 %	427722055
617	NC_019683	CGA	2	6	40095	40100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722055
618	NC_019683	T	7	7	40167	40173	0 %	100 %	0 %	0 %	427722055
619	NC_019683	AGC	2	6	40230	40235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722055
620	NC_019683	GCC	2	6	40369	40374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427722055
621	NC_019683	AATC	2	8	40378	40385	50 %	25 %	0 %	25 %	427722055
622	NC_019683	TTC	2	6	40418	40423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722055
623	NC_019683	GGA	2	6	40438	40443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427722055
624	NC_019683	GTTT	2	8	40456	40463	0 %	75 %	25 %	0 %	427722055
625	NC_019683	ATA	2	6	40524	40529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722055
626	NC_019683	CTG	2	6	40571	40576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722055
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628	NC_019683	TTCA	2	8	40643	40650	25 %	50 %	0 %	25 %	427722055
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882	NC_019683	T	6	6	56174	56179	0 %	100 %	0 %	0 %	427722069
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