MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptolyngbya sp. PCC 7376 chromosome

Total Repeats: 81277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_019683	TGGC	2	8	345970	345977	0 %	25 %	50 %	25 %	427722299
5502	NC_019683	AAT	2	6	345985	345990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722299
5503	NC_019683	CTG	2	6	345995	346000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722299
5504	NC_019683	TGG	2	6	346035	346040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722299
5505	NC_019683	AAT	2	6	346055	346060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722299
5506	NC_019683	CAA	2	6	346071	346076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722299
5507	NC_019683	ACT	2	6	346132	346137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722299
5508	NC_019683	A	7	7	346150	346156	100 %	0 %	0 %	0 %	427722299
5509	NC_019683	TTC	2	6	346314	346319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722300
5510	NC_019683	ACC	2	6	346425	346430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722300
5511	NC_019683	CA	3	6	346476	346481	50 %	0 %	0 %	50 %	427722300
5512	NC_019683	CT	3	6	346555	346560	0 %	50 %	0 %	50 %	427722300
5513	NC_019683	GCC	2	6	346578	346583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427722300
5514	NC_019683	GAC	2	6	346691	346696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722300
5515	NC_019683	TTTA	2	8	346710	346717	25 %	75 %	0 %	0 %	427722300
5516	NC_019683	CCA	2	6	346808	346813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722300
5517	NC_019683	CGA	2	6	346816	346821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722300
5518	NC_019683	CCATAA	2	12	346834	346845	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	427722300
5519	NC_019683	ACA	2	6	347124	347129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722300
5520	NC_019683	GCG	2	6	347166	347171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427722300
5521	NC_019683	TCT	2	6	347182	347187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722300
5522	NC_019683	GAA	2	6	348086	348091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722301
5523	NC_019683	TGA	2	6	348112	348117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722301
5524	NC_019683	TGA	2	6	348148	348153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722301
5525	NC_019683	ATT	2	6	348158	348163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722301
5526	NC_019683	CGA	2	6	348327	348332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722302
5527	NC_019683	CAG	2	6	348364	348369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722302
5528	NC_019683	AGCAA	2	10	348396	348405	60 %	0 %	20 %	20 %	427722302
5529	NC_019683	TCG	3	9	348652	348660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722303
5530	NC_019683	TGA	2	6	348687	348692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722303
5531	NC_019683	CAA	2	6	348923	348928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722303
5532	NC_019683	A	6	6	348941	348946	100 %	0 %	0 %	0 %	427722303
5533	NC_019683	GAT	2	6	349169	349174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722303
5534	NC_019683	GTC	2	6	349206	349211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722303
5535	NC_019683	CTCGAT	2	12	349229	349240	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	427722303
5536	NC_019683	CCT	2	6	349255	349260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427722303
5537	NC_019683	ACGATG	2	12	349269	349280	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	427722303
5538	NC_019683	GTT	2	6	349289	349294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722303
5539	NC_019683	TGA	2	6	349321	349326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722303
5540	NC_019683	A	6	6	349385	349390	100 %	0 %	0 %	0 %	427722303
5541	NC_019683	TAAA	2	8	349395	349402	75 %	25 %	0 %	0 %	427722303
5542	NC_019683	AAT	2	6	349595	349600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722303
5543	NC_019683	GAT	2	6	349661	349666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722303
5544	NC_019683	AGCC	2	8	349725	349732	25 %	0 %	25 %	50 %	427722303
5545	NC_019683	AAATT	2	10	349803	349812	60 %	40 %	0 %	0 %	427722303
5546	NC_019683	CAAA	2	8	350048	350055	75 %	0 %	0 %	25 %	427722303
5547	NC_019683	A	6	6	350053	350058	100 %	0 %	0 %	0 %	427722303
5548	NC_019683	AAAAGC	2	12	350131	350142	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	427722303
5549	NC_019683	ACA	2	6	350167	350172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722303
5550	NC_019683	CAT	2	6	350264	350269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722303
5551	NC_019683	AG	3	6	350326	350331	50 %	0 %	50 %	0 %	427722303
5552	NC_019683	TTCT	2	8	350394	350401	0 %	75 %	0 %	25 %	427722303
5553	NC_019683	GGC	2	6	350402	350407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427722303
5554	NC_019683	ATT	2	6	350449	350454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722303
5555	NC_019683	GCG	2	6	350508	350513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427722303
5556	NC_019683	TATGGC	2	12	350516	350527	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	427722303
5557	NC_019683	TAT	2	6	350633	350638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722303
5558	NC_019683	ACCAA	2	10	350730	350739	60 %	0 %	0 %	40 %	427722303
5559	NC_019683	TTA	2	6	350797	350802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722303
5560	NC_019683	AAGC	2	8	350814	350821	50 %	0 %	25 %	25 %	427722303
5561	NC_019683	GGC	2	6	351051	351056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427722303
5562	NC_019683	A	6	6	351113	351118	100 %	0 %	0 %	0 %	427722303
5563	NC_019683	GAT	2	6	351122	351127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722303
5564	NC_019683	TGC	2	6	351211	351216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722303
5565	NC_019683	ATT	2	6	351416	351421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722303
5566	NC_019683	AGG	2	6	351564	351569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427722303
5567	NC_019683	GGC	2	6	351605	351610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427722303
5568	NC_019683	ATG	2	6	351830	351835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722303
5569	NC_019683	GAA	2	6	351884	351889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722303
5570	NC_019683	TGA	2	6	351915	351920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722303
5571	NC_019683	GAGCA	2	10	352008	352017	40 %	0 %	40 %	20 %	427722303
5572	NC_019683	CAG	2	6	352043	352048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722303
5573	NC_019683	TGG	2	6	352080	352085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722303
5574	NC_019683	CGA	2	6	352135	352140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722303
5575	NC_019683	C	6	6	352203	352208	0 %	0 %	0 %	100 %	427722303
5576	NC_019683	GGT	2	6	352244	352249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722303
5577	NC_019683	CAT	2	6	352251	352256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722303
5578	NC_019683	GAC	2	6	352367	352372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722303
5579	NC_019683	TGA	2	6	352405	352410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722303
5580	NC_019683	AGG	2	6	352513	352518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427722303
5581	NC_019683	AAGGT	2	10	352548	352557	40 %	20 %	40 %	0 %	427722303
5582	NC_019683	GCAA	2	8	352605	352612	50 %	0 %	25 %	25 %	427722303
5583	NC_019683	AGA	2	6	352627	352632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722303
5584	NC_019683	CAC	2	6	352705	352710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722303
5585	NC_019683	TGAAG	2	10	352750	352759	40 %	20 %	40 %	0 %	427722303
5586	NC_019683	CAC	2	6	352786	352791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722303
5587	NC_019683	ATC	2	6	352817	352822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722303
5588	NC_019683	CCCG	2	8	352910	352917	0 %	0 %	25 %	75 %	427722303
5589	NC_019683	GAT	2	6	352934	352939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722303
5590	NC_019683	CGC	2	6	352978	352983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427722303
5591	NC_019683	AAGCA	2	10	353046	353055	60 %	0 %	20 %	20 %	427722303
5592	NC_019683	GGA	2	6	353062	353067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427722303
5593	NC_019683	TGA	2	6	353116	353121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722303
5594	NC_019683	TGC	2	6	353149	353154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722303
5595	NC_019683	ACCT	2	8	353222	353229	25 %	25 %	0 %	50 %	427722303
5596	NC_019683	AACCC	2	10	353246	353255	40 %	0 %	0 %	60 %	427722303
5597	NC_019683	ATG	2	6	353364	353369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722303
5598	NC_019683	AATT	2	8	353506	353513	50 %	50 %	0 %	0 %	427722303
5599	NC_019683	CTGGTA	2	12	353524	353535	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	427722303
5600	NC_019683	ACC	2	6	353546	353551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722303
5601	NC_019683	GCCCAA	2	12	353552	353563	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	427722303
5602	NC_019683	GTCA	2	8	353606	353613	25 %	25 %	25 %	25 %	427722303
5603	NC_019683	GCTG	2	8	353764	353771	0 %	25 %	50 %	25 %	427722303
5604	NC_019683	AC	3	6	353790	353795	50 %	0 %	0 %	50 %	427722303
5605	NC_019683	AAGA	2	8	353861	353868	75 %	0 %	25 %	0 %	427722303
5606	NC_019683	AACC	2	8	353921	353928	50 %	0 %	0 %	50 %	427722303
5607	NC_019683	CCG	2	6	354117	354122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427722303
5608	NC_019683	CCA	2	6	354156	354161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722303
5609	NC_019683	CAA	2	6	354176	354181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722303
5610	NC_019683	A	6	6	354204	354209	100 %	0 %	0 %	0 %	427722303
5611	NC_019683	GTA	2	6	354357	354362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722303
5612	NC_019683	TCC	2	6	354365	354370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427722303
5613	NC_019683	GAC	2	6	354462	354467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722304
5614	NC_019683	CATCAG	2	12	354503	354514	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	427722304
5615	NC_019683	TCA	2	6	354523	354528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722304
5616	NC_019683	GA	3	6	354570	354575	50 %	0 %	50 %	0 %	427722304
5617	NC_019683	CTC	2	6	354597	354602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427722304
5618	NC_019683	GTA	2	6	354692	354697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722304
5619	NC_019683	AC	3	6	354725	354730	50 %	0 %	0 %	50 %	427722304
5620	NC_019683	GCA	2	6	354805	354810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722304
5621	NC_019683	CGT	2	6	354835	354840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722304
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5986	NC_019683	TCA	2	6	379968	379973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722326
5987	NC_019683	CT	3	6	380025	380030	0 %	50 %	0 %	50 %	427722326
5988	NC_019683	TGC	2	6	380077	380082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722326
5989	NC_019683	TTC	2	6	380114	380119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722326
5990	NC_019683	AAT	2	6	380132	380137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427722326
5991	NC_019683	AGT	2	6	380264	380269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722326
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5999	NC_019683	GCA	2	6	381142	381147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722328
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