MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptolyngbya sp. PCC 7376 chromosome

Total Repeats: 81277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019683	CTTCT	2	10	314448	314457	0 %	60 %	0 %	40 %	427722272
5002	NC_019683	A	7	7	314466	314472	100 %	0 %	0 %	0 %	427722272
5003	NC_019683	CAT	2	6	315195	315200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722273
5004	NC_019683	AGA	2	6	315246	315251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722273
5005	NC_019683	CAG	2	6	315305	315310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722273
5006	NC_019683	TGT	2	6	315330	315335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722273
5007	NC_019683	CTC	2	6	315352	315357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427722273
5008	NC_019683	CGA	2	6	315375	315380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722273
5009	NC_019683	GT	3	6	315665	315670	0 %	50 %	50 %	0 %	427722273
5010	NC_019683	TGCT	2	8	315764	315771	0 %	50 %	25 %	25 %	427722273
5011	NC_019683	ATT	2	6	315833	315838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722273
5012	NC_019683	AGA	2	6	315861	315866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722273
5013	NC_019683	TGA	2	6	315878	315883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722273
5014	NC_019683	T	6	6	316122	316127	0 %	100 %	0 %	0 %	427722274
5015	NC_019683	CTC	2	6	316197	316202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427722274
5016	NC_019683	TGG	2	6	316235	316240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722274
5017	NC_019683	CGT	2	6	316242	316247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722274
5018	NC_019683	CGT	2	6	316346	316351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722274
5019	NC_019683	ATC	2	6	316403	316408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722274
5020	NC_019683	TGC	2	6	316412	316417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722274
5021	NC_019683	AGT	2	6	316427	316432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722274
5022	NC_019683	CTC	3	9	316435	316443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427722274
5023	NC_019683	CTG	2	6	316465	316470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722274
5024	NC_019683	A	6	6	316745	316750	100 %	0 %	0 %	0 %	427722275
5025	NC_019683	TCC	2	6	316799	316804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427722275
5026	NC_019683	GAA	2	6	316861	316866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722275
5027	NC_019683	ATG	2	6	316895	316900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722275
5028	NC_019683	CAC	2	6	316971	316976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722275
5029	NC_019683	ATC	2	6	316981	316986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722275
5030	NC_019683	GAA	2	6	317020	317025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722275
5031	NC_019683	GTT	2	6	317044	317049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722275
5032	NC_019683	GCA	2	6	317104	317109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722275
5033	NC_019683	GAA	2	6	317131	317136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722275
5034	NC_019683	A	6	6	317206	317211	100 %	0 %	0 %	0 %	427722275
5035	NC_019683	CTC	2	6	317231	317236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427722275
5036	NC_019683	CGA	2	6	317300	317305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722275
5037	NC_019683	A	7	7	317322	317328	100 %	0 %	0 %	0 %	427722275
5038	NC_019683	CCA	2	6	317357	317362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722275
5039	NC_019683	GTT	2	6	317383	317388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722275
5040	NC_019683	TTA	2	6	317397	317402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722275
5041	NC_019683	CCA	2	6	317438	317443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427722275
5042	NC_019683	AGA	2	6	317595	317600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722275
5043	NC_019683	TGA	2	6	317700	317705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722275
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5045	NC_019683	TTGGG	2	10	318025	318034	0 %	40 %	60 %	0 %	427722275
5046	NC_019683	AGA	2	6	318048	318053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722275
5047	NC_019683	TC	4	8	318181	318188	0 %	50 %	0 %	50 %	427722276
5048	NC_019683	A	8	8	318190	318197	100 %	0 %	0 %	0 %	427722276
5049	NC_019683	TGG	2	6	318204	318209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722276
5050	NC_019683	TCATT	2	10	318293	318302	20 %	60 %	0 %	20 %	427722276
5051	NC_019683	GAG	2	6	318337	318342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427722276
5052	NC_019683	GAA	2	6	318352	318357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722276
5053	NC_019683	GGT	2	6	318403	318408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722276
5054	NC_019683	A	6	6	318419	318424	100 %	0 %	0 %	0 %	427722276
5055	NC_019683	ATG	2	6	318515	318520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722276
5056	NC_019683	ATT	2	6	318532	318537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722276
5057	NC_019683	AGG	2	6	318629	318634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427722276
5058	NC_019683	T	6	6	318714	318719	0 %	100 %	0 %	0 %	427722276
5059	NC_019683	AGA	2	6	318798	318803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722276
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5061	NC_019683	TTG	2	6	318865	318870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427722276
5062	NC_019683	TGA	2	6	318989	318994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722276
5063	NC_019683	CAT	2	6	319002	319007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722276
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5065	NC_019683	GATG	2	8	319038	319045	25 %	25 %	50 %	0 %	427722276
5066	NC_019683	ATGA	2	8	319072	319079	50 %	25 %	25 %	0 %	427722276
5067	NC_019683	TTGCT	2	10	319247	319256	0 %	60 %	20 %	20 %	427722276
5068	NC_019683	TGGGG	2	10	319397	319406	0 %	20 %	80 %	0 %	427722277
5069	NC_019683	CTT	2	6	319488	319493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722277
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5071	NC_019683	TCG	2	6	319676	319681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722277
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5085	NC_019683	A	6	6	320366	320371	100 %	0 %	0 %	0 %	427722277
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5089	NC_019683	CAT	2	6	320604	320609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722277
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5094	NC_019683	CTGG	2	8	321067	321074	0 %	25 %	50 %	25 %	427722278
5095	NC_019683	AAG	2	6	321091	321096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722278
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5102	NC_019683	TCA	2	6	321562	321567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722279
5103	NC_019683	CA	3	6	321602	321607	50 %	0 %	0 %	50 %	427722279
5104	NC_019683	AGC	2	6	321657	321662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722279
5105	NC_019683	CAT	2	6	321761	321766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722279
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5108	NC_019683	T	7	7	321916	321922	0 %	100 %	0 %	0 %	427722279
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5121	NC_019683	CGC	2	6	322852	322857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427722280
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5243	NC_019683	CAA	2	6	330144	330149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427722288
5244	NC_019683	TGG	3	9	330162	330170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722288
5245	NC_019683	CTA	2	6	330236	330241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722288
5246	NC_019683	CT	3	6	330283	330288	0 %	50 %	0 %	50 %	427722288
5247	NC_019683	AGTT	2	8	330368	330375	25 %	50 %	25 %	0 %	427722288
5248	NC_019683	AAG	2	6	330388	330393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722288
5249	NC_019683	GGT	2	6	330454	330459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722288
5250	NC_019683	TGG	4	12	330495	330506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722288
5251	NC_019683	GGT	2	6	330577	330582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722288
5252	NC_019683	GGT	2	6	330607	330612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427722288
5253	NC_019683	ATT	2	6	330685	330690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427722288
5254	NC_019683	TAAC	2	8	330719	330726	50 %	25 %	0 %	25 %	427722288
5255	NC_019683	GGTGCT	2	12	330727	330738	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	427722288
5256	NC_019683	TGA	2	6	330756	330761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722288
5257	NC_019683	ATG	2	6	330866	330871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427722288
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5259	NC_019683	GAG	2	6	331111	331116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427722289
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5261	NC_019683	GCA	2	6	331181	331186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722289
5262	NC_019683	GTAA	2	8	331284	331291	50 %	25 %	25 %	0 %	427722289
5263	NC_019683	TTTG	2	8	331314	331321	0 %	75 %	25 %	0 %	427722289
5264	NC_019683	AGC	2	6	331393	331398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722289
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5267	NC_019683	GAG	2	6	331573	331578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427722289
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5269	NC_019683	CGT	2	6	331819	331824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427722289
5270	NC_019683	AGA	2	6	331843	331848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427722289
5271	NC_019683	A	7	7	331908	331914	100 %	0 %	0 %	0 %	427722289
5272	NC_019683	A	6	6	332215	332220	100 %	0 %	0 %	0 %	427722290
5273	NC_019683	TTC	2	6	332251	332256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722290
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5333	NC_019683	TCT	2	6	335717	335722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722293
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5345	NC_019683	TCTT	2	8	336369	336376	0 %	75 %	0 %	25 %	427722293
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5351	NC_019683	TTC	2	6	336942	336947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427722294
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5355	NC_019683	A	6	6	337137	337142	100 %	0 %	0 %	0 %	427722294
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5359	NC_019683	CAT	2	6	337705	337710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427722295
5360	NC_019683	GCA	2	6	337716	337721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427722295
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5486	NC_019683	AAGC	2	8	345267	345274	50 %	0 %	25 %	25 %	427722299
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