MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes serotype 4b str. LL195

Total Repeats: 58560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58501	NC_019556	TCT	2	6	2902180	2902185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	424715684
58502	NC_019556	T	6	6	2902236	2902241	0 %	100 %	0 %	0 %	424715684
58503	NC_019556	GTT	2	6	2902279	2902284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	424715684
58504	NC_019556	CTT	2	6	2902313	2902318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	424715684
58505	NC_019556	TC	3	6	2902345	2902350	0 %	50 %	0 %	50 %	424715684
58506	NC_019556	CTTT	2	8	2902352	2902359	0 %	75 %	0 %	25 %	424715684
58507	NC_019556	CCT	2	6	2902365	2902370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	424715685
58508	NC_019556	T	6	6	2902370	2902375	0 %	100 %	0 %	0 %	424715685
58509	NC_019556	GCT	2	6	2902392	2902397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	424715685
58510	NC_019556	T	6	6	2902397	2902402	0 %	100 %	0 %	0 %	424715685
58511	NC_019556	AGC	3	9	2902427	2902435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	424715685
58512	NC_019556	CCT	2	6	2902441	2902446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	424715685
58513	NC_019556	GTTT	2	8	2902453	2902460	0 %	75 %	25 %	0 %	424715685
58514	NC_019556	ATT	2	6	2902469	2902474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424715685
58515	NC_019556	ATTT	2	8	2902600	2902607	25 %	75 %	0 %	0 %	424715685
58516	NC_019556	CAT	2	6	2902622	2902627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	424715685
58517	NC_019556	TGA	2	6	2902637	2902642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424715685
58518	NC_019556	TGT	2	6	2902649	2902654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	424715685
58519	NC_019556	CAA	2	6	2902663	2902668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	424715685
58520	NC_019556	GAAT	2	8	2902715	2902722	50 %	25 %	25 %	0 %	424715685
58521	NC_019556	CTG	2	6	2902735	2902740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	424715685
58522	NC_019556	CTA	2	6	2902743	2902748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	424715685
58523	NC_019556	TAG	2	6	2902766	2902771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424715685
58524	NC_019556	TAA	2	6	2902787	2902792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	424715685
58525	NC_019556	CAT	2	6	2902805	2902810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	424715685
58526	NC_019556	TTG	2	6	2902850	2902855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	424715685
58527	NC_019556	TGTTT	2	10	2902863	2902872	0 %	80 %	20 %	0 %	424715685
58528	NC_019556	AAC	2	6	2902997	2903002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	424715685
58529	NC_019556	AAT	2	6	2903003	2903008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	424715685
58530	NC_019556	TCT	2	6	2903203	2903208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	424715685
58531	NC_019556	CACT	2	8	2903250	2903257	25 %	25 %	0 %	50 %	424715686
58532	NC_019556	GCC	2	6	2903344	2903349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	424715686
58533	NC_019556	GAT	2	6	2903361	2903366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424715686
58534	NC_019556	AT	3	6	2903368	2903373	50 %	50 %	0 %	0 %	424715686
58535	NC_019556	GATT	2	8	2903384	2903391	25 %	50 %	25 %	0 %	424715686
58536	NC_019556	GACA	2	8	2903444	2903451	50 %	0 %	25 %	25 %	424715686
58537	NC_019556	T	7	7	2903462	2903468	0 %	100 %	0 %	0 %	424715686
58538	NC_019556	CTT	2	6	2903504	2903509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	424715686
58539	NC_019556	ACA	2	6	2903524	2903529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	424715686
58540	NC_019556	T	8	8	2903584	2903591	0 %	100 %	0 %	0 %	424715686
58541	NC_019556	T	9	9	2903601	2903609	0 %	100 %	0 %	0 %	424715686
58542	NC_019556	TTC	2	6	2903719	2903724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	424715687
58543	NC_019556	ACG	3	9	2903729	2903737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	424715687
58544	NC_019556	T	7	7	2903795	2903801	0 %	100 %	0 %	0 %	424715687
58545	NC_019556	ATTA	2	8	2903835	2903842	50 %	50 %	0 %	0 %	424715687
58546	NC_019556	ATT	2	6	2904003	2904008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424715688
58547	NC_019556	AT	3	6	2904020	2904025	50 %	50 %	0 %	0 %	424715688
58548	NC_019556	TC	3	6	2904029	2904034	0 %	50 %	0 %	50 %	424715688
58549	NC_019556	CTA	2	6	2904072	2904077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	424715688
58550	NC_019556	CAG	2	6	2904111	2904116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	424715688
58551	NC_019556	TTA	2	6	2904141	2904146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424715688
58552	NC_019556	AAT	2	6	2904147	2904152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	424715688
58553	NC_019556	TTC	3	9	2904238	2904246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	424715688
58554	NC_019556	A	6	6	2904262	2904267	100 %	0 %	0 %	0 %	424715688
58555	NC_019556	T	8	8	2904284	2904291	0 %	100 %	0 %	0 %	424715688
58556	NC_019556	CTT	2	6	2904309	2904314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	424715688
58557	NC_019556	ATC	2	6	2904346	2904351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	424715688
58558	NC_019556	CTG	2	6	2904357	2904362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	424715688
58559	NC_019556	AGTA	2	8	2904383	2904390	50 %	25 %	25 %	0 %	424715688
58560	NC_019556	TC	3	6	2904443	2904448	0 %	50 %	0 %	50 %	424715688

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.