MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes serotype 4b str. LL195

Total Repeats: 58560

< Previous12...678910111213141516...117118Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019556	TGA	2	6	254850	254855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424713096
5002	NC_019556	GAT	2	6	254857	254862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424713096
5003	NC_019556	GTT	2	6	254863	254868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	424713096
5004	NC_019556	GAAG	2	8	254931	254938	50 %	0 %	50 %	0 %	424713096
5005	NC_019556	TTG	2	6	254942	254947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	424713096
5006	NC_019556	ATA	2	6	254948	254953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	424713096
5007	NC_019556	TGA	2	6	254967	254972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424713096
5008	NC_019556	TGG	2	6	255026	255031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	424713096
5009	NC_019556	ATG	2	6	255055	255060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424713096
5010	NC_019556	GAA	2	6	255097	255102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424713096
5011	NC_019556	TAT	2	6	255111	255116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424713096
5012	NC_019556	ATT	2	6	255168	255173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424713096
5013	NC_019556	TG	3	6	255265	255270	0 %	50 %	50 %	0 %	424713096
5014	NC_019556	GC	3	6	255291	255296	0 %	0 %	50 %	50 %	424713096
5015	NC_019556	ACA	2	6	255328	255333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	424713096
5016	NC_019556	TA	3	6	255390	255395	50 %	50 %	0 %	0 %	424713096
5017	NC_019556	TGA	2	6	255596	255601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424713096
5018	NC_019556	ATT	2	6	255610	255615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424713096
5019	NC_019556	AAG	2	6	255623	255628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424713096
5020	NC_019556	A	6	6	255695	255700	100 %	0 %	0 %	0 %	424713096
5021	NC_019556	TGAA	2	8	255701	255708	50 %	25 %	25 %	0 %	424713096
5022	NC_019556	T	6	6	255732	255737	0 %	100 %	0 %	0 %	424713096
5023	NC_019556	GAGAA	2	10	255738	255747	60 %	0 %	40 %	0 %	424713096
5024	NC_019556	AGA	2	6	255771	255776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424713096
5025	NC_019556	ATG	2	6	255822	255827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424713096
5026	NC_019556	ATG	2	6	255854	255859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424713097
5027	NC_019556	AAG	2	6	255906	255911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424713097
5028	NC_019556	GAACA	2	10	255942	255951	60 %	0 %	20 %	20 %	424713097
5029	NC_019556	TTA	2	6	255956	255961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	424713097
5030	NC_019556	CT	3	6	255999	256004	0 %	50 %	0 %	50 %	424713097
5031	NC_019556	GCA	2	6	256033	256038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	424713097
5032	NC_019556	GAC	2	6	256078	256083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	424713097
5033	NC_019556	A	6	6	256106	256111	100 %	0 %	0 %	0 %	424713097
5034	NC_019556	GAACA	2	10	256164	256173	60 %	0 %	20 %	20 %	424713097
5035	NC_019556	GGC	2	6	256280	256285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	424713097
5036	NC_019556	ACAA	2	8	256309	256316	75 %	0 %	0 %	25 %	424713097
5037	NC_019556	GTC	2	6	256440	256445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	424713097
5038	NC_019556	GAA	2	6	256450	256455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424713097
5039	NC_019556	CAA	2	6	256517	256522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	424713097
5040	NC_019556	TGT	2	6	256588	256593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	424713097
5041	NC_019556	GTG	2	6	256611	256616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	424713097
5042	NC_019556	A	6	6	256634	256639	100 %	0 %	0 %	0 %	424713097
5043	NC_019556	TATT	2	8	256677	256684	25 %	75 %	0 %	0 %	424713097
5044	NC_019556	TGG	2	6	256711	256716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	424713097
5045	NC_019556	GCC	2	6	256753	256758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	424713097
5046	NC_019556	GTG	2	6	256767	256772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	424713097
5047	NC_019556	CAA	2	6	256791	256796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	424713097
5048	NC_019556	AT	3	6	256816	256821	50 %	50 %	0 %	0 %	424713097
5049	NC_019556	TGC	2	6	256831	256836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	424713097
5050	NC_019556	GA	3	6	256841	256846	50 %	0 %	50 %	0 %	424713097
5051	NC_019556	AGA	2	6	256882	256887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424713097
5052	NC_019556	TGA	2	6	256951	256956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424713097
5053	NC_019556	GCT	2	6	256967	256972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	424713097
5054	NC_019556	TGA	2	6	257035	257040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424713097
5055	NC_019556	A	6	6	257080	257085	100 %	0 %	0 %	0 %	424713097
5056	NC_019556	A	6	6	257120	257125	100 %	0 %	0 %	0 %	424713097
5057	NC_019556	AGC	2	6	257164	257169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	424713097
5058	NC_019556	A	6	6	257198	257203	100 %	0 %	0 %	0 %	424713097
5059	NC_019556	AGA	2	6	257209	257214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424713097
5060	NC_019556	AGA	2	6	257266	257271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424713097
5061	NC_019556	TTG	2	6	257274	257279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	424713097
5062	NC_019556	GTT	2	6	257285	257290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	424713097
5063	NC_019556	TGC	2	6	257392	257397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	424713097
5064	NC_019556	CG	3	6	257516	257521	0 %	0 %	50 %	50 %	424713097
5065	NC_019556	GAT	2	6	257554	257559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424713097
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5068	NC_019556	AGT	2	6	257686	257691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424713097
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5070	NC_019556	TCA	2	6	257808	257813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	424713097
5071	NC_019556	TGA	2	6	257965	257970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424713097
5072	NC_019556	AAG	2	6	258162	258167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424713097
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5074	NC_019556	A	7	7	258262	258268	100 %	0 %	0 %	0 %	424713097
5075	NC_019556	A	6	6	258277	258282	100 %	0 %	0 %	0 %	424713097
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5078	NC_019556	AACA	2	8	258315	258322	75 %	0 %	0 %	25 %	424713097
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5081	NC_019556	A	7	7	258588	258594	100 %	0 %	0 %	0 %	424713098
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5087	NC_019556	GCGG	2	8	258867	258874	0 %	0 %	75 %	25 %	424713098
5088	NC_019556	GATT	2	8	258945	258952	25 %	50 %	25 %	0 %	424713098
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5092	NC_019556	TCA	2	6	259191	259196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	424713098
5093	NC_019556	GAA	2	6	259315	259320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424713098
5094	NC_019556	GGAA	2	8	259362	259369	50 %	0 %	50 %	0 %	424713098
5095	NC_019556	TAA	2	6	259455	259460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	424713098
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5098	NC_019556	CAGT	2	8	259583	259590	25 %	25 %	25 %	25 %	424713098
5099	NC_019556	CAA	2	6	259616	259621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	424713098
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5105	NC_019556	T	6	6	259995	260000	0 %	100 %	0 %	0 %	424713099
5106	NC_019556	TAAT	2	8	260075	260082	50 %	50 %	0 %	0 %	424713099
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5109	NC_019556	AGT	2	6	260304	260309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424713099
5110	NC_019556	GTC	2	6	260363	260368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	424713099
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5112	NC_019556	AGA	3	9	260421	260429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424713099
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5367	NC_019556	TG	3	6	273883	273888	0 %	50 %	50 %	0 %	424713118
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5369	NC_019556	TTGG	2	8	273931	273938	0 %	50 %	50 %	0 %	424713118
5370	NC_019556	GTA	2	6	273964	273969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	424713118
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5383	NC_019556	ATTGAT	2	12	274546	274557	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	424713118
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5489	NC_019556	AATG	2	8	280163	280170	50 %	25 %	25 %	0 %	424713123
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5492	NC_019556	A	6	6	280367	280372	100 %	0 %	0 %	0 %	424713123
5493	NC_019556	GAA	2	6	280409	280414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	424713123
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