MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS6

Total Repeats: 607

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019436	CAGC	2	8	31058	31065	25 %	0 %	25 %	50 %	414075290
502	NC_019436	CTTT	2	8	31106	31113	0 %	75 %	0 %	25 %	414075290
503	NC_019436	TCC	2	6	31131	31136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414075290
504	NC_019436	GAA	2	6	31446	31451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075291
505	NC_019436	A	7	7	31450	31456	100 %	0 %	0 %	0 %	414075291
506	NC_019436	TAT	2	6	31469	31474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075291
507	NC_019436	CTG	2	6	31498	31503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075291
508	NC_019436	GTCA	2	8	31514	31521	25 %	25 %	25 %	25 %	414075291
509	NC_019436	GACC	2	8	31527	31534	25 %	0 %	25 %	50 %	414075291
510	NC_019436	TGCT	2	8	31619	31626	0 %	50 %	25 %	25 %	414075291
511	NC_019436	ATG	2	6	31691	31696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075291
512	NC_019436	ACAA	2	8	31709	31716	75 %	0 %	0 %	25 %	414075291
513	NC_019436	A	6	6	31827	31832	100 %	0 %	0 %	0 %	414075291
514	NC_019436	CGA	2	6	31908	31913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414075291
515	NC_019436	AGC	2	6	31944	31949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414075291
516	NC_019436	CGG	2	6	32010	32015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414075291
517	NC_019436	TGC	2	6	32067	32072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075291
518	NC_019436	A	6	6	32082	32087	100 %	0 %	0 %	0 %	414075291
519	NC_019436	TTA	2	6	32135	32140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075291
520	NC_019436	CAT	2	6	32232	32237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075291
521	NC_019436	TCAG	2	8	32249	32256	25 %	25 %	25 %	25 %	414075291
522	NC_019436	GAA	2	6	32262	32267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075291
523	NC_019436	AAG	2	6	32320	32325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075291
524	NC_019436	TTC	2	6	32725	32730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414075292
525	NC_019436	TA	3	6	32740	32745	50 %	50 %	0 %	0 %	414075292
526	NC_019436	TCAA	2	8	32841	32848	50 %	25 %	0 %	25 %	414075292
527	NC_019436	ATT	2	6	32849	32854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075292
528	NC_019436	TCA	2	6	32964	32969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075292
529	NC_019436	GCT	2	6	33003	33008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075292
530	NC_019436	TG	3	6	33009	33014	0 %	50 %	50 %	0 %	414075292
531	NC_019436	T	6	6	33020	33025	0 %	100 %	0 %	0 %	414075292
532	NC_019436	AAT	2	6	33076	33081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075292
533	NC_019436	T	6	6	33137	33142	0 %	100 %	0 %	0 %	414075292
534	NC_019436	TTTTTC	2	12	33144	33155	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	414075292
535	NC_019436	AGT	2	6	33168	33173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075292
536	NC_019436	TCG	2	6	33202	33207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075292
537	NC_019436	TAG	2	6	33279	33284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075292
538	NC_019436	AAT	2	6	33296	33301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075292
539	NC_019436	CTG	2	6	33308	33313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075292
540	NC_019436	ATT	2	6	33548	33553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075293
541	NC_019436	TTA	2	6	33558	33563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075293
542	NC_019436	GGAAA	2	10	33627	33636	60 %	0 %	40 %	0 %	414075293
543	NC_019436	GAAA	2	8	33641	33648	75 %	0 %	25 %	0 %	414075293
544	NC_019436	GTCTT	2	10	33723	33732	0 %	60 %	20 %	20 %	414075293
545	NC_019436	TTG	2	6	33733	33738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075293
546	NC_019436	AAT	2	6	33843	33848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075293
547	NC_019436	TGG	2	6	33869	33874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414075293
548	NC_019436	GTT	2	6	33942	33947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075293
549	NC_019436	GCA	2	6	34008	34013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414075293
550	NC_019436	A	7	7	34050	34056	100 %	0 %	0 %	0 %	414075293
551	NC_019436	A	6	6	34058	34063	100 %	0 %	0 %	0 %	414075293
552	NC_019436	CAGT	2	8	34099	34106	25 %	25 %	25 %	25 %	414075293
553	NC_019436	AC	3	6	34209	34214	50 %	0 %	0 %	50 %	414075293
554	NC_019436	A	7	7	34278	34284	100 %	0 %	0 %	0 %	414075293
555	NC_019436	A	7	7	34296	34302	100 %	0 %	0 %	0 %	414075293
556	NC_019436	A	6	6	34423	34428	100 %	0 %	0 %	0 %	414075293
557	NC_019436	AGT	2	6	34485	34490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075293
558	NC_019436	CA	3	6	34494	34499	50 %	0 %	0 %	50 %	414075293
559	NC_019436	GTG	2	6	34522	34527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414075293
560	NC_019436	AAG	2	6	34534	34539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075293
561	NC_019436	GGTT	2	8	34565	34572	0 %	50 %	50 %	0 %	414075293
562	NC_019436	GAA	2	6	34598	34603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075293
563	NC_019436	AGA	3	9	34625	34633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075293
564	NC_019436	TGAT	2	8	34636	34643	25 %	50 %	25 %	0 %	414075293
565	NC_019436	GCA	2	6	34715	34720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414075293
566	NC_019436	TGG	2	6	34740	34745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414075293
567	NC_019436	TGG	2	6	34944	34949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414075293
568	NC_019436	TAT	2	6	34976	34981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075293
569	NC_019436	A	6	6	35040	35045	100 %	0 %	0 %	0 %	414075293
570	NC_019436	A	7	7	35047	35053	100 %	0 %	0 %	0 %	414075293
571	NC_019436	ATT	2	6	35426	35431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075294
572	NC_019436	TTA	2	6	35443	35448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075294
573	NC_019436	CA	3	6	35516	35521	50 %	0 %	0 %	50 %	414075294
574	NC_019436	ATC	2	6	35562	35567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075294
575	NC_019436	GAAAAA	2	12	35572	35583	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	414075294
576	NC_019436	ATCAAA	2	12	35624	35635	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	414075294
577	NC_019436	GGAT	2	8	35671	35678	25 %	25 %	50 %	0 %	414075294
578	NC_019436	GCT	2	6	35720	35725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075294
579	NC_019436	TA	3	6	35835	35840	50 %	50 %	0 %	0 %	414075294
580	NC_019436	ACG	2	6	35908	35913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414075294
581	NC_019436	GAA	2	6	35997	36002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075294
582	NC_019436	T	6	6	36178	36183	0 %	100 %	0 %	0 %	414075295
583	NC_019436	TTA	2	6	36196	36201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075295
584	NC_019436	ATCA	2	8	36260	36267	50 %	25 %	0 %	25 %	414075295
585	NC_019436	ATA	2	6	36322	36327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075295
586	NC_019436	CAA	2	6	36337	36342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075295
587	NC_019436	GCA	2	6	36348	36353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414075295
588	NC_019436	CAA	2	6	36461	36466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075295
589	NC_019436	GACA	2	8	36653	36660	50 %	0 %	25 %	25 %	414075295
590	NC_019436	T	7	7	36816	36822	0 %	100 %	0 %	0 %	414075295
591	NC_019436	AGT	2	6	36839	36844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075295
592	NC_019436	AGC	2	6	36888	36893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414075295
593	NC_019436	ATA	2	6	36894	36899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075295
594	NC_019436	AAAAT	2	10	36902	36911	80 %	20 %	0 %	0 %	414075295
595	NC_019436	TGTT	2	8	36929	36936	0 %	75 %	25 %	0 %	414075295
596	NC_019436	TGC	2	6	36986	36991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075295
597	NC_019436	ATA	2	6	37005	37010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075295
598	NC_019436	TAA	2	6	37051	37056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075295
599	NC_019436	TTG	2	6	37057	37062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075295
600	NC_019436	GA	3	6	37116	37121	50 %	0 %	50 %	0 %	414075295
601	NC_019436	AAAG	2	8	37183	37190	75 %	0 %	25 %	0 %	414075295
602	NC_019436	T	6	6	37222	37227	0 %	100 %	0 %	0 %	414075295
603	NC_019436	GGC	2	6	37247	37252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414075295
604	NC_019436	AAG	2	6	37263	37268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075295
605	NC_019436	TTTTG	2	10	37317	37326	0 %	80 %	20 %	0 %	414075295
606	NC_019436	CAA	2	6	37399	37404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075295
607	NC_019436	TCC	2	6	37431	37436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414075295

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