MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS2

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019434	AGT	2	6	72	77	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075297
2	NC_019434	GAA	2	6	166	171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075297
3	NC_019434	CCA	2	6	172	177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414075297
4	NC_019434	ATG	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075297
5	NC_019434	ATT	2	6	412	417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075297
6	NC_019434	TAT	2	6	495	500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075297
7	NC_019434	CCA	2	6	596	601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414075297
8	NC_019434	GAA	2	6	694	699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075297
9	NC_019434	CTT	2	6	713	718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414075297
10	NC_019434	GAT	2	6	820	825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075297
11	NC_019434	AAG	2	6	836	841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075297
12	NC_019434	AAG	2	6	854	859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075297
13	NC_019434	GAA	2	6	865	870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075297
14	NC_019434	ATT	2	6	909	914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075297
15	NC_019434	ATG	2	6	998	1003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075297
16	NC_019434	GAA	2	6	1035	1040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075297
17	NC_019434	AAC	2	6	1154	1159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075297
18	NC_019434	ATA	2	6	1268	1273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075298
19	NC_019434	TAA	2	6	1312	1317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075298
20	NC_019434	CTT	2	6	1361	1366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414075298
21	NC_019434	CAA	2	6	1377	1382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075298
22	NC_019434	AGA	2	6	1450	1455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075298
23	NC_019434	CAA	2	6	1495	1500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075298
24	NC_019434	CAA	3	9	1538	1546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075298
25	NC_019434	GTT	2	6	1570	1575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075298
26	NC_019434	AGA	2	6	1576	1581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075298
27	NC_019434	AGA	2	6	1735	1740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075298
28	NC_019434	TGG	2	6	1760	1765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414075298
29	NC_019434	GAT	2	6	1783	1788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075298
30	NC_019434	TAT	2	6	2018	2023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075299
31	NC_019434	TAT	2	6	2045	2050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075299
32	NC_019434	TTA	2	6	2053	2058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075299
33	NC_019434	TCT	2	6	2125	2130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414075299
34	NC_019434	ATT	2	6	2169	2174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075299
35	NC_019434	ATT	2	6	2265	2270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075299
36	NC_019434	TAT	2	6	2303	2308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075299
37	NC_019434	TAA	2	6	2511	2516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075299
38	NC_019434	TGT	2	6	2524	2529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075299
39	NC_019434	ATT	2	6	2632	2637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075299
40	NC_019434	ATT	2	6	3427	3432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075300
41	NC_019434	TTC	2	6	3442	3447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414075300
42	NC_019434	AGA	2	6	3459	3464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075300
43	NC_019434	TGA	3	9	3479	3487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075300
44	NC_019434	ATT	2	6	3580	3585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075300
45	NC_019434	ATA	2	6	3629	3634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075300
46	NC_019434	GAA	3	9	4157	4165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075301
47	NC_019434	CTT	2	6	4182	4187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414075301
48	NC_019434	TGT	2	6	4398	4403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075301

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.