MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS8

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019430	CTGTT	2	10	1393	1402	0 %	60 %	20 %	20 %	414073194
2	NC_019430	ATCTT	2	10	1819	1828	20 %	60 %	0 %	20 %	414073195
3	NC_019430	TTTTA	2	10	2394	2403	20 %	80 %	0 %	0 %	414073196
4	NC_019430	ATTTT	2	10	2501	2510	20 %	80 %	0 %	0 %	414073196
5	NC_019430	CATGG	2	10	2587	2596	20 %	20 %	40 %	20 %	414073196
6	NC_019430	AAAGA	2	10	2746	2755	80 %	0 %	20 %	0 %	414073196
7	NC_019430	AAAGA	2	10	3058	3067	80 %	0 %	20 %	0 %	414073196
8	NC_019430	GATTG	2	10	6859	6868	20 %	40 %	40 %	0 %	414073198
9	NC_019430	ATAAA	2	10	11151	11160	80 %	20 %	0 %	0 %	414073202
10	NC_019430	TAAGA	2	10	11491	11500	60 %	20 %	20 %	0 %	414073202
11	NC_019430	AAGTG	2	10	14854	14863	40 %	20 %	40 %	0 %	414073203
12	NC_019430	AAAAT	2	10	17324	17333	80 %	20 %	0 %	0 %	414073204
13	NC_019430	TGCAA	2	10	19335	19344	40 %	20 %	20 %	20 %	414073206
14	NC_019430	TCTCT	2	10	19472	19481	0 %	60 %	0 %	40 %	414073206
15	NC_019430	TCTGT	2	10	20477	20486	0 %	60 %	20 %	20 %	414073207
16	NC_019430	ATTTC	2	10	27240	27249	20 %	60 %	0 %	20 %	414073213
17	NC_019430	TATTT	2	10	28942	28951	20 %	80 %	0 %	0 %	414073215
18	NC_019430	GACTA	2	10	41511	41520	40 %	20 %	20 %	20 %	414073224
19	NC_019430	GAATG	2	10	50652	50661	40 %	20 %	40 %	0 %	414073232
20	NC_019430	TTTCA	2	10	52254	52263	20 %	60 %	0 %	20 %	414073234
21	NC_019430	TTCTT	2	10	53396	53405	0 %	80 %	0 %	20 %	414073235
22	NC_019430	TTTGT	2	10	56683	56692	0 %	80 %	20 %	0 %	414073236
23	NC_019430	CCAAT	2	10	56994	57003	40 %	20 %	0 %	40 %	414073236
24	NC_019430	CCTTC	2	10	58304	58313	0 %	40 %	0 %	60 %	414073238
25	NC_019430	AAAAT	2	10	58388	58397	80 %	20 %	0 %	0 %	414073238
26	NC_019430	CATTC	2	10	59144	59153	20 %	40 %	0 %	40 %	414073239
27	NC_019430	ATACT	2	10	59972	59981	40 %	40 %	0 %	20 %	414073239
28	NC_019430	TAAAA	2	10	63297	63306	80 %	20 %	0 %	0 %	414073242
29	NC_019430	ATCCT	2	10	63590	63599	20 %	40 %	0 %	40 %	414073242
30	NC_019430	TATAA	2	10	63749	63758	60 %	40 %	0 %	0 %	414073242
31	NC_019430	ATTAT	2	10	64319	64328	40 %	60 %	0 %	0 %	414073243
32	NC_019430	TTTTA	2	10	66623	66632	20 %	80 %	0 %	0 %	414073247
33	NC_019430	TTTGC	2	10	67474	67483	0 %	60 %	20 %	20 %	414073248
34	NC_019430	AACAG	2	10	69622	69631	60 %	0 %	20 %	20 %	414073250
35	NC_019430	GTTTT	2	10	70372	70381	0 %	80 %	20 %	0 %	414073251
36	NC_019430	TTTGG	2	10	70984	70993	0 %	60 %	40 %	0 %	414073251
37	NC_019430	GATTT	2	10	71337	71346	20 %	60 %	20 %	0 %	414073252
38	NC_019430	TATTG	2	10	71495	71504	20 %	60 %	20 %	0 %	414073252
39	NC_019430	ATATT	2	10	76513	76522	40 %	60 %	0 %	0 %	414073255
40	NC_019430	AGAAC	2	10	79448	79457	60 %	0 %	20 %	20 %	414073259

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.