MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS8

Total Repeats: 1182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019430	TTTGC	2	10	67474	67483	0 %	60 %	20 %	20 %	414073248
1002	NC_019430	ATA	2	6	67497	67502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073248
1003	NC_019430	TCT	2	6	67550	67555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073248
1004	NC_019430	TAT	2	6	67566	67571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073248
1005	NC_019430	T	6	6	67585	67590	0 %	100 %	0 %	0 %	414073248
1006	NC_019430	CTT	2	6	67619	67624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073248
1007	NC_019430	T	6	6	67627	67632	0 %	100 %	0 %	0 %	414073248
1008	NC_019430	TTTC	2	8	67674	67681	0 %	75 %	0 %	25 %	414073248
1009	NC_019430	TAT	2	6	67693	67698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073248
1010	NC_019430	TTC	2	6	67801	67806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073248
1011	NC_019430	ATAG	2	8	67853	67860	50 %	25 %	25 %	0 %	414073248
1012	NC_019430	GATT	2	8	67941	67948	25 %	50 %	25 %	0 %	414073248
1013	NC_019430	TCA	2	6	67988	67993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073248
1014	NC_019430	T	8	8	68056	68063	0 %	100 %	0 %	0 %	414073248
1015	NC_019430	AAG	2	6	68075	68080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073248
1016	NC_019430	CTGC	2	8	68103	68110	0 %	25 %	25 %	50 %	414073248
1017	NC_019430	TTGTCA	2	12	68126	68137	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414073248
1018	NC_019430	AGG	2	6	68194	68199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414073248
1019	NC_019430	GTG	2	6	68244	68249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414073248
1020	NC_019430	ACT	2	6	68294	68299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073248
1021	NC_019430	ATTC	2	8	68313	68320	25 %	50 %	0 %	25 %	414073248
1022	NC_019430	T	7	7	68342	68348	0 %	100 %	0 %	0 %	414073248
1023	NC_019430	TTAT	2	8	68748	68755	25 %	75 %	0 %	0 %	414073249
1024	NC_019430	TCT	2	6	68759	68764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073249
1025	NC_019430	ATA	2	6	68776	68781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073249
1026	NC_019430	TAA	3	9	68789	68797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073249
1027	NC_019430	ATC	2	6	68836	68841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073249
1028	NC_019430	TAC	2	6	68889	68894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073249
1029	NC_019430	CGA	2	6	68940	68945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073249
1030	NC_019430	AAT	2	6	69049	69054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073249
1031	NC_019430	TCA	2	6	69056	69061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073249
1032	NC_019430	AT	3	6	69086	69091	50 %	50 %	0 %	0 %	414073249
1033	NC_019430	A	7	7	69107	69113	100 %	0 %	0 %	0 %	414073249
1034	NC_019430	TGA	2	6	69200	69205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073249
1035	NC_019430	T	7	7	69279	69285	0 %	100 %	0 %	0 %	414073249
1036	NC_019430	TCT	2	6	69296	69301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073249
1037	NC_019430	CTG	2	6	69315	69320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073249
1038	NC_019430	CT	3	6	69367	69372	0 %	50 %	0 %	50 %	414073250
1039	NC_019430	T	7	7	69374	69380	0 %	100 %	0 %	0 %	414073250
1040	NC_019430	AAACCA	2	12	69474	69485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073250
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1042	NC_019430	T	6	6	69722	69727	0 %	100 %	0 %	0 %	414073250
1043	NC_019430	TTTC	2	8	69760	69767	0 %	75 %	0 %	25 %	414073250
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1046	NC_019430	T	6	6	69856	69861	0 %	100 %	0 %	0 %	414073250
1047	NC_019430	TTA	2	6	69882	69887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073250
1048	NC_019430	AAC	2	6	69968	69973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073250
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1050	NC_019430	TTG	2	6	70020	70025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073251
1051	NC_019430	TGT	2	6	70076	70081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073251
1052	NC_019430	ATC	2	6	70126	70131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073251
1053	NC_019430	TTTG	2	8	70145	70152	0 %	75 %	25 %	0 %	414073251
1054	NC_019430	TTG	2	6	70309	70314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073251
1055	NC_019430	GTT	2	6	70350	70355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073251
1056	NC_019430	GTTTT	2	10	70372	70381	0 %	80 %	20 %	0 %	414073251
1057	NC_019430	TC	3	6	70440	70445	0 %	50 %	0 %	50 %	414073251
1058	NC_019430	TTA	2	6	70460	70465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073251
1059	NC_019430	TTCT	2	8	70590	70597	0 %	75 %	0 %	25 %	414073251
1060	NC_019430	ATC	2	6	70603	70608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073251
1061	NC_019430	TGG	2	6	70669	70674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414073251
1062	NC_019430	TCAT	2	8	70712	70719	25 %	50 %	0 %	25 %	414073251
1063	NC_019430	TTTC	2	8	70762	70769	0 %	75 %	0 %	25 %	414073251
1064	NC_019430	ATG	2	6	70796	70801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073251
1065	NC_019430	T	6	6	70820	70825	0 %	100 %	0 %	0 %	414073251
1066	NC_019430	TTTGG	2	10	70984	70993	0 %	60 %	40 %	0 %	414073251
1067	NC_019430	CCAC	2	8	71057	71064	25 %	0 %	0 %	75 %	414073251
1068	NC_019430	T	6	6	71133	71138	0 %	100 %	0 %	0 %	414073251
1069	NC_019430	CATG	2	8	71139	71146	25 %	25 %	25 %	25 %	414073251
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1078	NC_019430	GA	3	6	71459	71464	50 %	0 %	50 %	0 %	414073252
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1084	NC_019430	CTA	2	6	72691	72696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073253
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1086	NC_019430	ACT	2	6	72802	72807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073253
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1091	NC_019430	AC	3	6	72960	72965	50 %	0 %	0 %	50 %	414073253
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1096	NC_019430	TA	3	6	73230	73235	50 %	50 %	0 %	0 %	414073253
1097	NC_019430	AAG	2	6	73248	73253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073253
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1099	NC_019430	TAT	2	6	73293	73298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073253
1100	NC_019430	ATT	2	6	74231	74236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073254
1101	NC_019430	ATC	2	6	74326	74331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073254
1102	NC_019430	A	6	6	74395	74400	100 %	0 %	0 %	0 %	414073254
1103	NC_019430	TTC	2	6	74470	74475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073254
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1105	NC_019430	AAT	2	6	74790	74795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073254
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1108	NC_019430	TAT	2	6	75110	75115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073254
1109	NC_019430	ATT	2	6	76095	76100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073255
1110	NC_019430	GAAA	2	8	76159	76166	75 %	0 %	25 %	0 %	414073255
1111	NC_019430	TAA	2	6	76169	76174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073255
1112	NC_019430	ATT	2	6	76188	76193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073255
1113	NC_019430	TAA	2	6	76196	76201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073255
1114	NC_019430	TTG	2	6	76202	76207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073255
1115	NC_019430	GTG	2	6	76210	76215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414073255
1116	NC_019430	AT	3	6	76218	76223	50 %	50 %	0 %	0 %	414073255
1117	NC_019430	CGA	2	6	76252	76257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073255
1118	NC_019430	ATT	2	6	76282	76287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073255
1119	NC_019430	TTA	2	6	76294	76299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073255
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1121	NC_019430	AT	3	6	76367	76372	50 %	50 %	0 %	0 %	414073255
1122	NC_019430	TAA	2	6	76376	76381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073255
1123	NC_019430	GAA	2	6	76486	76491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073255
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1127	NC_019430	CAT	2	6	76637	76642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073255
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