MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS8

Total Repeats: 1182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019430	AGG	2	6	35361	35366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414073219
502	NC_019430	ATT	2	6	35384	35389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073219
503	NC_019430	TGA	2	6	35403	35408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073220
504	NC_019430	ATT	2	6	35416	35421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073220
505	NC_019430	TCT	2	6	35442	35447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073220
506	NC_019430	GCA	2	6	35531	35536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073220
507	NC_019430	TGG	2	6	35552	35557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414073220
508	NC_019430	TGA	2	6	35631	35636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073220
509	NC_019430	ACTT	2	8	35696	35703	25 %	50 %	0 %	25 %	414073220
510	NC_019430	TTATCT	2	12	35823	35834	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	414073220
511	NC_019430	AAT	2	6	35893	35898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073220
512	NC_019430	TTC	2	6	35931	35936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073220
513	NC_019430	TACT	2	8	35977	35984	25 %	50 %	0 %	25 %	414073220
514	NC_019430	AACA	2	8	36006	36013	75 %	0 %	0 %	25 %	414073220
515	NC_019430	GAG	2	6	36141	36146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414073220
516	NC_019430	TTA	2	6	36195	36200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073220
517	NC_019430	ATT	2	6	36219	36224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073220
518	NC_019430	TTA	2	6	36245	36250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073220
519	NC_019430	T	6	6	36256	36261	0 %	100 %	0 %	0 %	414073220
520	NC_019430	CTT	2	6	36266	36271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073220
521	NC_019430	CCT	2	6	36277	36282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414073220
522	NC_019430	A	8	8	36348	36355	100 %	0 %	0 %	0 %	414073221
523	NC_019430	TCAA	2	8	36383	36390	50 %	25 %	0 %	25 %	414073221
524	NC_019430	AGA	2	6	36391	36396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073221
525	NC_019430	A	7	7	36400	36406	100 %	0 %	0 %	0 %	414073221
526	NC_019430	GAT	2	6	36418	36423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073221
527	NC_019430	CAA	2	6	36426	36431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073221
528	NC_019430	GAC	2	6	36535	36540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073221
529	NC_019430	TGG	2	6	36565	36570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414073221
530	NC_019430	ATG	2	6	36584	36589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073221
531	NC_019430	ATG	2	6	36749	36754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073221
532	NC_019430	ATT	2	6	36758	36763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073221
533	NC_019430	ATC	2	6	36776	36781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073221
534	NC_019430	CTTT	2	8	37022	37029	0 %	75 %	0 %	25 %	414073221
535	NC_019430	TGCT	2	8	37158	37165	0 %	50 %	25 %	25 %	414073221
536	NC_019430	AGT	2	6	37365	37370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073222
537	NC_019430	AGC	2	6	37379	37384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073222
538	NC_019430	CAAGTA	2	12	37420	37431	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414073222
539	NC_019430	A	7	7	37433	37439	100 %	0 %	0 %	0 %	414073222
540	NC_019430	ATG	2	6	37564	37569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073222
541	NC_019430	TGG	2	6	37595	37600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414073222
542	NC_019430	TTC	2	6	37617	37622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073222
543	NC_019430	ACAG	2	8	37623	37630	50 %	0 %	25 %	25 %	414073222
544	NC_019430	TTA	2	6	37642	37647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073222
545	NC_019430	GAG	2	6	37651	37656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414073222
546	NC_019430	TTG	2	6	37828	37833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073222
547	NC_019430	TCA	2	6	37909	37914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073222
548	NC_019430	TGT	2	6	38084	38089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073222
549	NC_019430	A	6	6	38136	38141	100 %	0 %	0 %	0 %	414073222
550	NC_019430	GCA	2	6	38193	38198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073222
551	NC_019430	TCA	2	6	38202	38207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073222
552	NC_019430	TTA	2	6	38221	38226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073222
553	NC_019430	TAG	2	6	38237	38242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073222
554	NC_019430	ACA	2	6	38288	38293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073222
555	NC_019430	ATG	2	6	38335	38340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073222
556	NC_019430	TAA	2	6	38438	38443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073222
557	NC_019430	TCA	2	6	38511	38516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073222
558	NC_019430	TAA	2	6	38552	38557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073222
559	NC_019430	CAA	2	6	38691	38696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073222
560	NC_019430	GAA	2	6	38699	38704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073222
561	NC_019430	GAC	2	6	38771	38776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073222
562	NC_019430	TCC	2	6	38777	38782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414073222
563	NC_019430	CAA	2	6	38841	38846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073222
564	NC_019430	TCAGCA	2	12	38856	38867	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414073222
565	NC_019430	AGC	2	6	38960	38965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073222
566	NC_019430	AAG	2	6	38980	38985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073222
567	NC_019430	A	6	6	38994	38999	100 %	0 %	0 %	0 %	414073222
568	NC_019430	TGT	2	6	39005	39010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073222
569	NC_019430	CAA	2	6	39013	39018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073222
570	NC_019430	TCT	2	6	39111	39116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073222
571	NC_019430	CCA	2	6	39127	39132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414073222
572	NC_019430	GAT	2	6	39277	39282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073223
573	NC_019430	CTG	2	6	39329	39334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073223
574	NC_019430	TGA	2	6	39357	39362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073223
575	NC_019430	A	6	6	39372	39377	100 %	0 %	0 %	0 %	414073223
576	NC_019430	ACCT	2	8	39419	39426	25 %	25 %	0 %	50 %	414073223
577	NC_019430	TAA	2	6	39465	39470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073223
578	NC_019430	GCAA	2	8	39483	39490	50 %	0 %	25 %	25 %	414073223
579	NC_019430	A	6	6	39516	39521	100 %	0 %	0 %	0 %	414073223
580	NC_019430	AAT	2	6	39568	39573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073223
581	NC_019430	CTC	2	6	39602	39607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414073223
582	NC_019430	TTA	2	6	39702	39707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073223
583	NC_019430	ATG	2	6	39710	39715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073223
584	NC_019430	A	7	7	39726	39732	100 %	0 %	0 %	0 %	414073223
585	NC_019430	AGA	2	6	39798	39803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073223
586	NC_019430	ATC	2	6	39890	39895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073223
587	NC_019430	TTAA	2	8	39949	39956	50 %	50 %	0 %	0 %	414073223
588	NC_019430	GAA	2	6	40036	40041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073223
589	NC_019430	CTT	2	6	40094	40099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073223
590	NC_019430	TGG	2	6	40125	40130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414073223
591	NC_019430	AAG	2	6	40160	40165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073223
592	NC_019430	AAG	2	6	40167	40172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073223
593	NC_019430	A	6	6	40240	40245	100 %	0 %	0 %	0 %	414073223
594	NC_019430	AAC	2	6	40437	40442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073223
595	NC_019430	CT	4	8	40449	40456	0 %	50 %	0 %	50 %	414073223
596	NC_019430	AGA	2	6	40515	40520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073223
597	NC_019430	TTA	2	6	40566	40571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073223
598	NC_019430	CAG	2	6	40601	40606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073223
599	NC_019430	CT	3	6	40629	40634	0 %	50 %	0 %	50 %	414073223
600	NC_019430	TCA	2	6	40645	40650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073223
601	NC_019430	AAC	2	6	40708	40713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073223
602	NC_019430	AAG	2	6	40730	40735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073223
603	NC_019430	TGG	2	6	40750	40755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414073223
604	NC_019430	GAA	2	6	40780	40785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073223
605	NC_019430	AGG	2	6	40881	40886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414073223
606	NC_019430	CAG	2	6	40904	40909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073223
607	NC_019430	CTTT	2	8	40940	40947	0 %	75 %	0 %	25 %	414073223
608	NC_019430	CAA	2	6	40993	40998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073223
609	NC_019430	TCC	2	6	41049	41054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414073223
610	NC_019430	GAA	2	6	41065	41070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073223
611	NC_019430	ATC	2	6	41353	41358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073224
612	NC_019430	CAG	2	6	41376	41381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073224
613	NC_019430	GGT	2	6	41383	41388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414073224
614	NC_019430	GAAT	2	8	41400	41407	50 %	25 %	25 %	0 %	414073224
615	NC_019430	CAAT	2	8	41455	41462	50 %	25 %	0 %	25 %	414073224
616	NC_019430	A	7	7	41503	41509	100 %	0 %	0 %	0 %	414073224
617	NC_019430	GACTA	2	10	41511	41520	40 %	20 %	20 %	20 %	414073224
618	NC_019430	GATT	2	8	41538	41545	25 %	50 %	25 %	0 %	414073224
619	NC_019430	TAA	2	6	41546	41551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073224
620	NC_019430	ATC	2	6	41558	41563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073224
621	NC_019430	AAT	2	6	41613	41618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073224
622	NC_019430	TC	3	6	41670	41675	0 %	50 %	0 %	50 %	414073224
623	NC_019430	GTT	2	6	42322	42327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073225
624	NC_019430	AAG	2	6	42391	42396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073225
625	NC_019430	TCC	2	6	42430	42435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414073225
626	NC_019430	GTC	2	6	42438	42443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073225
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628	NC_019430	TCC	2	6	42635	42640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414073225
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