MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes serotype 7 str. SLCC2482 plasmid pLM7UG1

Total Repeats: 612

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018888	AGC	2	6	263	268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452850652
2	NC_018888	AGC	2	6	364	369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452850652
3	NC_018888	AAG	2	6	462	467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850652
4	NC_018888	GCT	2	6	469	474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452850652
5	NC_018888	CAA	2	6	581	586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452850652
6	NC_018888	ACA	2	6	616	621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452850652
7	NC_018888	TAC	2	6	691	696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452850652
8	NC_018888	TTC	2	6	857	862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850652
9	NC_018888	CTT	2	6	889	894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850652
10	NC_018888	TGA	2	6	927	932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452850652
11	NC_018888	AAT	2	6	959	964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452850652
12	NC_018888	GCA	2	6	1015	1020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452850652
13	NC_018888	GAA	2	6	1493	1498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850652
14	NC_018888	ATT	2	6	1550	1555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452850652
15	NC_018888	TTG	2	6	1680	1685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452850652
16	NC_018888	CAG	2	6	1698	1703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452850652
17	NC_018888	AGT	2	6	1859	1864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452850652
18	NC_018888	ACA	2	6	1994	1999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452850653
19	NC_018888	ATG	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452850653
20	NC_018888	TCA	2	6	2180	2185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452850654
21	NC_018888	TAT	3	9	2406	2414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452850654
22	NC_018888	AGT	2	6	2570	2575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452850654
23	NC_018888	TTA	2	6	2583	2588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452850654
24	NC_018888	TGG	2	6	2666	2671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452850654
25	NC_018888	AAT	2	6	2673	2678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452850654
26	NC_018888	GGA	2	6	2679	2684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452850654
27	NC_018888	GAA	2	6	2726	2731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850654
28	NC_018888	ATT	2	6	2747	2752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452850654
29	NC_018888	AAG	2	6	2815	2820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850654
30	NC_018888	TTG	2	6	2862	2867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452850654
31	NC_018888	GAA	2	6	2935	2940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850655
32	NC_018888	AAG	2	6	2977	2982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850655
33	NC_018888	CTT	2	6	3050	3055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850655
34	NC_018888	CGA	2	6	3073	3078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452850655
35	NC_018888	TTC	2	6	3084	3089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850655
36	NC_018888	TTC	2	6	3091	3096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850655
37	NC_018888	AGA	2	6	3468	3473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850655
38	NC_018888	CTT	2	6	3721	3726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850656
39	NC_018888	CTT	2	6	3831	3836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850656
40	NC_018888	TCG	2	6	3860	3865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452850656
41	NC_018888	TAA	2	6	4090	4095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452850656
42	NC_018888	CTT	2	6	4108	4113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850656
43	NC_018888	TTG	2	6	4225	4230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452850656
44	NC_018888	CAT	2	6	4363	4368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452850656
45	NC_018888	ATC	2	6	4403	4408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452850657
46	NC_018888	TTC	2	6	4424	4429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850657
47	NC_018888	TCT	2	6	4431	4436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850657
48	NC_018888	CTT	2	6	4579	4584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850657
49	NC_018888	TGT	2	6	4753	4758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452850657
50	NC_018888	GAC	2	6	4915	4920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452850657
51	NC_018888	TAC	2	6	4999	5004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452850657
52	NC_018888	TTC	2	6	5282	5287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850657
53	NC_018888	AAT	2	6	5399	5404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452850657
54	NC_018888	TTC	2	6	5405	5410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850657
55	NC_018888	AGG	2	6	5426	5431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452850657
56	NC_018888	ATA	2	6	5486	5491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452850657
57	NC_018888	GTA	2	6	5569	5574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452850657
58	NC_018888	TGA	2	6	6143	6148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452850659
59	NC_018888	TTC	2	6	6266	6271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850659
60	NC_018888	CAA	2	6	6514	6519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452850659
61	NC_018888	GAA	2	6	6540	6545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850660
62	NC_018888	TTC	2	6	6613	6618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850660
63	NC_018888	ATC	2	6	6668	6673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452850660
64	NC_018888	ATT	2	6	6676	6681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452850660
65	NC_018888	ATT	2	6	6691	6696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452850660
66	NC_018888	GAT	2	6	6927	6932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452850660
67	NC_018888	GTA	2	6	6942	6947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452850660
68	NC_018888	GAT	2	6	6996	7001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452850660
69	NC_018888	GAA	2	6	7008	7013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850660
70	NC_018888	TGA	2	6	7055	7060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452850660
71	NC_018888	AAC	2	6	7130	7135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452850660
72	NC_018888	AAT	2	6	7169	7174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452850660
73	NC_018888	ACA	2	6	7186	7191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452850660
74	NC_018888	GAA	2	6	7196	7201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850660
75	NC_018888	GAA	2	6	7224	7229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850660
76	NC_018888	ATT	2	6	7239	7244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452850660
77	NC_018888	CAA	2	6	7254	7259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452850660
78	NC_018888	GAA	2	6	7293	7298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850660
79	NC_018888	ATA	2	6	7348	7353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452850660
80	NC_018888	AAG	2	6	7372	7377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850660
81	NC_018888	GCT	2	6	7386	7391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452850660
82	NC_018888	GAA	2	6	7395	7400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850660
83	NC_018888	GAA	2	6	7415	7420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850660
84	NC_018888	ATT	2	6	7847	7852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452850661
85	NC_018888	TGC	2	6	7968	7973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452850661
86	NC_018888	GGA	2	6	7977	7982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452850661
87	NC_018888	ATC	2	6	7988	7993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452850661
88	NC_018888	AAG	2	6	8006	8011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850661
89	NC_018888	ATC	2	6	8038	8043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452850661
90	NC_018888	ATT	2	6	8067	8072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452850661
91	NC_018888	TAT	2	6	8204	8209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452850662
92	NC_018888	AAC	2	6	8227	8232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452850662
93	NC_018888	GAA	2	6	8271	8276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850662
94	NC_018888	TCA	2	6	8422	8427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452850662
95	NC_018888	AGA	3	9	8438	8446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850662
96	NC_018888	ACG	2	6	8453	8458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452850662
97	NC_018888	AAG	2	6	8485	8490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850662
98	NC_018888	CAG	2	6	8549	8554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452850663
99	NC_018888	TGA	2	6	8646	8651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452850663
100	NC_018888	GAA	3	9	8698	8706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850663
101	NC_018888	AGA	3	9	8712	8720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850663
102	NC_018888	CAG	2	6	8807	8812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452850663
103	NC_018888	ATA	3	9	8855	8863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452850663
104	NC_018888	CAA	2	6	8962	8967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452850663
105	NC_018888	AGA	2	6	9003	9008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850663
106	NC_018888	AGC	2	6	9033	9038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452850663
107	NC_018888	CAA	2	6	9185	9190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452850663
108	NC_018888	GTG	2	6	9233	9238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452850663
109	NC_018888	TGA	2	6	9255	9260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452850663
110	NC_018888	CTT	2	6	9277	9282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850663
111	NC_018888	AAG	2	6	9302	9307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850663
112	NC_018888	AGA	2	6	9318	9323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850663
113	NC_018888	GGT	2	6	9417	9422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452850663
114	NC_018888	ATT	2	6	9440	9445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452850663
115	NC_018888	GCA	2	6	9450	9455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452850663
116	NC_018888	AGA	2	6	9462	9467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850663
117	NC_018888	GCA	2	6	9510	9515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452850663
118	NC_018888	TTC	2	6	9605	9610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452850663
119	NC_018888	ATT	2	6	9662	9667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452850663
120	NC_018888	CAG	2	6	9673	9678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452850663
121	NC_018888	GAA	2	6	9807	9812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850663
122	NC_018888	GAA	2	6	9826	9831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850663
123	NC_018888	GAT	2	6	9954	9959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452850664
124	NC_018888	AAG	2	6	9985	9990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850664
125	NC_018888	AGT	3	9	10013	10021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452850664
126	NC_018888	GAC	2	6	10067	10072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452850664
127	NC_018888	AGG	2	6	10095	10100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452850664
128	NC_018888	GAA	2	6	10107	10112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850664
129	NC_018888	ATT	2	6	10149	10154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452850664
130	NC_018888	AGC	2	6	10209	10214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452850664
131	NC_018888	AAT	2	6	10275	10280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452850665
132	NC_018888	TAT	2	6	10392	10397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452850665
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135	NC_018888	CAA	2	6	10657	10662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452850665
136	NC_018888	GAA	2	6	10699	10704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452850665
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152	NC_018888	TAA	2	6	11973	11978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452850667
153	NC_018888	TGA	2	6	11989	11994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452850667
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253	NC_018888	GCA	2	6	19630	19635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452850675
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255	NC_018888	CCA	2	6	19714	19719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452850675
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258	NC_018888	AGC	2	6	19797	19802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452850675
259	NC_018888	CAT	2	6	20441	20446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452850676
260	NC_018888	TCA	2	6	20449	20454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452850676
261	NC_018888	CAT	2	6	20492	20497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452850676
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